Выслеживание свободно гуляющих мух: метод оценки локомоции дрозофилы

Аннотация

Источник: Сан, М. и Чен, Л. Л. Новый метод моделирования хронической травматической энцефалопатии у дрозофил. J. Vis. Exp. (2017).

Это видео описывает, как отслеживать свободно гуляющих мух, чтобы оценить их общую способность к передвижению. Представленный протокол демонстрирует настройку анализа и анализ данных с помощью программного обеспечения для видеослежения.

Протокол

Этот протокол является выдержкой из книги Sun and Chen, A Novel Method to Modeling Chronic Traumatic Encephalopathy in Drosophila, J. Vis. Exp. (2017).

1. Видеоотслеживание движений

1. Заполните чашку Петри диаметром 6 см прозрачным силиконовым эластомером, чтобы получилась арена слежения. Оставьте расстояние 3 мм между силиконом и крышкой посуды, чтобы мухи могли свободно ходить, но не летать.
2. Каждый раз обезболивайте четырех мух из фиктивной или обработанной группы и помещайте их на арену. Оставьте мух при температуре 22 °C на 1 час.
3. Расположите камеру устройства с зарядовой связью (ПЗС) над аренами и ведите запись в течение 5 минут.
4. Анализируйте записанные траектории движения с помощью программного обеспечения Ctrax (доступно бесплатно в Калифорнийском технологическом институте). Экспортируйте отслеживаемые данные в формат, совместимый с языком программирования (например, Matlab), и анализируйте данные на основе пройденного расстояния за кадр. Вычислите среднее расстояние ходьбы для каждой мухи и объедините его со всеми другими зарегистрированными мухами/группами, чтобы получить среднее совокупное расстояние, пройденное совокупностью файлов в одной группе.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье

Имя	Компания	Каталожный номер	Комментарии
Чашки Петри 60 мм	Научный центр Фишера	FB0875713A	Используется в качестве трекинговых арен
Регулятор расхода	Дженеси Сайентиал	59-122WC
Тонкая кисть	Дженеси Сайентиал	59-204
Флайпад	Дженеси Сайентиал	59-114
Силиконовый эластомер Sylgard	Индекс Dow Corning	4019862
ПЗС-камера	Майкрософт	ХД-5000
Трекер для ходячих мух Ctrax	Калифорнийский технологический институт	Ктракс 0.2.11
Набор инструментов для обработки изображений MATLAB	МАТЛАБ	R2015b