Этот протокол описывает простую клей-ленты на основе подход к отбору проб из помидоров и другой свежей поверхности продукции, с последующим быстрым целом обнаружения ячейки Сальмонеллы С помощью флуоресцентной На месте Гибридизации (FISH).
Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.
Методическая статья
Этот протокол описывает простую клей-ленты на основе подход к отбору проб из помидоров и другой свежей поверхности продукции, с последующим быстрым целом обнаружения ячейки Сальмонеллы С помощью флуоресцентной На месте Гибридизации (FISH).
Этот протокол описывает простой подход для клея-ленты на основе выборки из помидоров и других свежих поверхностей производят, а затем на ленту флуоресценции в гибридизация (FISH) для быстрого культуры независимой обнаружения бактерии рода сальмонелла. Сотовые заряженные ленты могут также быть помещены лицевой стороной вниз на селективном агаре для твердофазной обогащения до обнаружения. Кроме того, низкие объемы жидкости обогащения (жидкие miniculture поверхности) могут быть выполнены на поверхности ленты в неселективных бульон, а затем FISH и анализ с помощью проточной цитометрии. Во-первых, стерильные клейкой ленты приводят в контакт со свежими продуктами, нежное давление применяется, и лента удаляется, физически извлечения микробы присутствуют на этих поверхностях. Ленты крепятся липкой стороной вверх на предметные стекла микроскопа и стекла пробы клетки фиксировали 10%-ного формалина (30 мин) и обезвоженной использованием градуированных серии этаноле (50, 80 и 95%; 3 мин каждой концентрации). Затем клетка заряженные ленты пятнистый с буфером, содержащим Salmonella ориентированных коктейль ДНК-зонда и гибридизовали в течение 15 - 30 мин при 55 ° С с последующим кратким полоскания в стиральной буфера для удаления несвязанного зонда. Приверженец, FISH-меченых клеток, затем контрастно с ДНК красителя 4 ',6-diamidino-2-фенилиндола (DAPI), а результаты просматривать с помощью флуоресцентной микроскопии. Для твердой фазы обогащения, сотовые заряженные ленты расположены лицевой стороной вниз на подходящей поверхности селективного агара и инкубировали, чтобы на месте рост сальмонелл микроколоний, а затем FISH и микроскопии, как описано выше. Для жидких miniculture поверхности клеточной взимается ленты размещены липкой стороной вверх и камеры силиконовые перфузии применяется таким образом, чтобы лента и стекло микроскопа форма нижней части водонепроницаемую камеру, в которой малый объем (≤ 500 мкл) Trypticase Соевый Отвар (БСЭ) вводится. Впускные отверстия герметизируются и камер инкубируют при 35 - 37 ° C, что позволяет на основе роста усиления ленты экстрагировали микробов. После инкубации, впускные порты распечатал, клетки отделяются и смешивается с энергичным и обратно пипетки, собранных с помощью центрифугирования и фиксировали в 10% нейтральный буферный формалин. Наконец, образцы гибридизированных и исследовали с помощью проточной цитометрии выявить наличие бактерии рода сальмонелла. Как описано здесь, наш «Лента-FISH" подход может обеспечить простой и быстрый отбора проб и обнаружения сальмонеллы в томатном поверхностей. Кроме того, мы использовали этот подход для отбора проб другие виды свежих продуктов, включая шпинат и халапеньо перец.
1. Поверхность выборки с Стерильные клейкая лента
2. Твердофазные обогащению и жидких Miniculture поверхности
3. Фиксация и обезвоживание
4. Гибридизация
5. Обнаружение
6. Представитель Результаты

Рисунок 1. Использование клейкой ленты для отбора проб бактерии рода сальмонелла. с поверхности искусственно загрязненных помидор.

Рисунок 2. Типичные результаты для прямой-лента отбора проб и FISH обнаружения сальмонеллы Typhimurium АТСС 14028 от поверхности томатный (100 X нефти цель). Двухзондовой коктейль из Texas Red-меченых зондов (Sal3/Salm-63) был использован для обозначения этих клеток.

Рисунок 3. Микроколонии сальмонеллы Typhimurium АТСС 14028 формируются на поверхности Ксилоза Лизин Tergitol-4 (XLT-4) агара после 8 часов на ленту обогащения при температуре 37 ° C. начального инокулята был пробы с поверхности искусственно загрязненных помидор. Твердофазные обогащение увеличивает количество клеток для обнаружения, а также повышает клеточный содержание рРНК.

Рисунок 4. Использование клейкой ленты для отбора проб С. enterica серовар Typhimurium от поверхности искусственно загрязненных помидор, а затем с помощью прямого анализа FISH и проточной цитометрии (панель) или после 5 часов неселективным жидким обогащения miniculture поверхности в перфузионной камере, наполненной 500 мкл Trypticase соевом бульоне (группа В ).
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Простые и быстрые методы для обнаружения патогенов на производство поверхности могут помочь смягчить болезней пищевого происхождения путем предоставления своевременной и актуальной информации. Скотч основе методов выборки были использованы в экологические, клинические и микробиологии пищевых продуктов с 1950-х годов и включают нажатием "скотч" стиле ленту к поверхности для удаления микроорганизмов с последующей прямой микроскопии или передача приверженцем микроорганизмов твердых сред для роста (Барнетсон и Мил...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Финансирование этих работ было предоставлено расти Айова Значения фонда награду BFBS.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| Пробоотборная лента Fungi-Tape | Лаборатория научного приборостроения | 745 | http://www.scientificdevice.com/ |
| пробоотборная лента Con-Tact-It | Birko Corporation, Денвер, штат Колорадо | http://www.birkocorp.com/ | |
| Прозрачная офисная клейкая лента, универсальная | Разное | Должен быть оптически прозрачным и обладать низкой собственной флуоресценцией | |
| Поверхность пищевых продуктов | Местный продуктовый магазин | Томат–s (красный томат–на лозе, не подвергавшиеся обработке воском или маслом) использованные здесь | |
| Соево-казеиновый бульон с трипсином | Difco Laboratories | 211768 | Для неселективного обогащения минкультур в жидкой среде на поверхности |
| Базовая среда агар с ксилозой, лизином и Тергитолом 4 | Difco Laboratories | 223420 | Для <электронная микроскопия>Salmonellaселективный агар (XLT-4) |
| Добавка к агару с ксилозой, лизином и Tergitol 4 | Difco Laboratories | 235310 | Для<электронная микроскопия> Salmonellaселективный агар (XLT-4) |
| Раствор формалина | Sigma-Aldrich | HT5011 | 10% раствор, нейтральный, буферизированный (фиксатор для клеток) |
| Абсолютный этанол | Sigma-Aldrich | E7023 | Степень чистоты для молекулярной биологии (дегидратация перед гибридизацией) |
| микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл | Разное | без РНаз и ДНаз | |
| Предметные стекла и покровные стекла для микроскопа | Thermo Fisher Scientific, Inc. | ||
| раствор NaCl | Sigma-Aldrich | S5150 | Раствор молекулярно-биологической чистоты, 5 М (компонент гибридизационного буфера) |
| Буферный раствор Трис-ЭДТА (100-кратный концентрат) | Sigma-Aldrich | T9285 | 1M Трис [pH 8,0], 0,1M ЭДТА (компонент гибридизационного буфера) |
| Раствор додецилсульфата натрия | Sigma-Aldrich | L4522 | 10% раствор в воде с удельным сопротивлением 18 МОм (компонент гибридизационного буфера) |
| Олигонуклеотидные зонды Sal3 и Salm-63 | Integrated DNA Technologies | 5’-меченный 6-карбоксифлуоресцеином (FAM) или Texas Red (для микроскопии) или Cy5 (для цитометрии), очищенный методом ВЭЖХ | |
| Микроцентрифуга с регулируемой скоростью вращения | Разное | Используйте диаметр ротора для расчета числа оборотов в минуту (RPM), необходимого для достижения значений относительного центрифугирования (RCF), указанных в протоколе. | |
| Перфузионная камера CoverWell | Grace Bio-Lab Inc. | PC1R-2.0 | Нестерильный |
| Наконечники для пипеток для нанесения проб в гель (FS MultiFlex) | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 05-408-151 | Длинные тонкие наконечники для легкого доступа к малым портам отбора проб и маневренности внутри камеры |
| Алюминиевый термоблок или станция нагрева с прецизионным контролем температуры | Разное | Здесь используется шейкер с функцией нагрева и охлаждения с сухим блоком Eppendorf Thermomixer R | |
| Мини-печь для гибридизации Bambino | Boekel Scientific | Модель 230300 | Предметные стекла помещают в полипропиленовые центрифужные пробирки объемом 50 мл для проведения гибридизации; теплопередача осуществляется не прямым способом. |
| Гибридизатор для предметных стекол с канавками (Moat slide hybridizer) | Boekel Scientific | Модель 240000 | Обеспечивает быструю прямую передачу тепла через предметное стекло |
| среда для заключения препаратов Vectashield H-1200 с 4’4',6-диамидино-2-фенилинол (DAPI) | Vector Laboratories | H-1200 | Минимизирует тушение флуоресценции при микроскопии, обеспечивает контрастирование с помощью DAPI |
| Флуоресцентный микроскоп | Разное | Здесь использован микроскоп Leitz Laborlux S | |
| Цифровая камера | Разное | Здесь используется камера Canon PowerShot A640 | |
| Программное обеспечение для сбора изображений | Разное | Использовалось программное обеспечение Axiovision v. 4.6 (Carl Zeiss) | |
| Adobe Photoshop | Adobe | Для минимальной обработки изображений (наложение изображений, полученных в разных каналах) | |
| Проточный цитометр | Разное | использовался проточный цитометр FACSCanto (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния) с красным возбуждающим светом (647 нм) | |
| Программное обеспечение для анализа данных проточной цитометрии | Различные | Использовалось программное обеспечение FlowJo v. 8.7.1 (Tree Star, Inc.) |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.