Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Рост бактерий на микрофлюидном чипе для изучения лекарственной устойчивости к антибиотикам

495 просмотров

26 сентября 2025 г.

В этой статье

Аннотация

Источник: Liu, P.C., et al. Разработка и использование недорогого автоматизированного морбиостата для адаптивной эволюции бактерий при подборе антибиотиков. J. Vis. Exp. (2016)

В этом видео демонстрируется использование микрофлюидного чипа для визуализации и сравнения роста и морфологии штаммов E. coli дикого типа и устойчивых к триметоприму штаммов кишечной палочки в условиях стресса антибиотиком триметоприма.

Протокол

1. Эксперимент по выращиванию чипа

  1. Перед загрузкой в микрофлюидное устройство промойте его деионизированной водой в течение 1 часа и средой M9 в течение 1 часа.
  2. Ежедневно замороженный образец разморозьте при комнатной температуре в течение 5 минут и закиньте в новую пробирку свежей средой M9. Поместите образец в шейкер при температуре 37 °C на ночь.
  3. Разбавьте микробный образец в 10 раз средой M9 и загрузите его в микрофлюидное устройство, нагнетая давление в контейнер с микробным образцом под давлением 5 фунтов на квадратный дюйм. Затем загрузите среду триметоприма (TMP) в чип, нагнетая давление в контейнер с лекарственной средой под давлением 5 фунтов на квадратный дюйм. Выполните смешивание между микробом и лекарственным препаратом, приводя в действие микромеханический клапан между двумя камерами на микрофлюидном чипе в течение 15 минут.
  4. Поместите микрофлюидный чип в микроскоп-инкубатор, установленный на инвертированном микроскопе. Получайте изображение клетки в ростовой камере каждый час в течение 8 часов с помощью ПЗС-камеры, установленной на инвертированном микроскопе.
  5. Используйте пользовательский программный скрипт для вычисления номеров ячеек с помощью алгоритма пороговых значений на основе данных изображения ячейки. Обратите внимание, что данные о количестве клеток обычно усредняются по трем микрофлюидным камерам.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Инвертированный микроскопLeica MicrosystemsLeica DMI-LEDиспользуется для микрофлюидных измерений Используйте объектив X40 NA=0,55
Микроскоп-инкубаторИнструмент Live CellCU-109используется для микрофлюидных измерений
Электромагнитные клапаныПневмодинС10ММ-31-12-3Нормально разомкнутый 1,3 Вт 12 В постоянного тока
Интерфейсная плата USBХобби ИнженерияМодуль цифрового ввода-вывода USBIO24-Rдля измерения микрофлюидики
Воздушный компрессорРокер СайентиалКОРОМЫСЛО 440Источник давления для микрофлюидов макс. давление 80 фунтов на квадратный дюйм
Фитинги с наружной резьбой luer-lock для заусенцев 1/8"ValuePlastics.comMTLL230-1используется для микрофлюидного контроля
Заусеница 1/8" к резьбовому порту 10-32ValuePlastics.comВ-1используется для микрофлюидного контроля
Фитинги с внутренним люэровским замком к резьбовому порту 10-32ValuePlastics.comКФТЛ-1используется для микрофлюидного контроля
NPN дарлингтонский транзистор 500мА, 40В (2N6427)DigiKey.com2Н6427ГОС-НДиспользуется для микрофлюидного контроля
10 кОм, углеродный пленочный резистор, 0,25 ВтDigiKey.comP10KBACT-NDиспользуется для микрофлюидного контроля
Танталовый конденсатор, 10мкФ, 25В, 10%DigiKey.com478-1841-НДиспользуется для микрофлюидного контроля
ПЗС-камера AndorАндорZyla 4.2 Plus SCMOSИспользуется для микрофлюидной визуализации на чипе
ТриметопримСигма  
Difco M9 минимальная соль 5xБД Терпимая

Теги

E coli