- Жизнеспособность золотистого стафилококка (S. aureus) после фотолиза ФМН (Рисунок 1)
- Перенесите колонию S. aureus (BCRC 10451) из культивируемого планшета в 10 мл бульона Lysogeny, взятого в 15 мл пробирки с завинчивающейся крышкой. Культивировать в шейкере при температуре 37°C в течение 16 часов.
- Перенесите 0,5 мл культуры в центрифужную пробирку объемом 1,5 мл. Добавьте стерилизованную воду в центрифужную пробирку, чтобы разбавить культуру до оптической плотности 0,5 при 600 нм (наружный диаметр600) (~6 x 107 колониеобразующая единица [КОЕ]/мл).
- Перелейте 0,5 мл культуры в центрифужную пробирку объемом 1,5 мл, центрифугируйте при 14 000 x g в течение 10 минут и сцедите надосадочную жидкость для получения клеточной гранулы.
- Добавьте 1 мл рибофлавин-5'-фосфата (или флавинмононуклеотида; ФМН) - буферизованный раствор (30, 60 и 120 мкМ ФМН в калий-фосфатном буфере [ПБ]) к клеточным гранулам, полученным как на стадии 1.3, и вортекс. Для контроля облучения добавьте 1 мл PB отдельно.
- Перенесите по 1 мл растворов жизнеспособных бактериальных клеток, содержащих 30 мкМ ФМН и ПБ в отдельности, в стеклянные пробирки и облучите их фиолетовым светом со скоростью 10 Вт/м2 в течение 30 мин.
- Перенесите по 1 мл каждого из жизнеспособных растворов бактериальных клеток, содержащих 30, 60 и 120 мкМ ФМН и ПБ, в стеклянные пробирки и облучайте их синим светом со скоростью 20 Вт/м2 в течение 120 мин. Установите еще одну стеклянную пробирку с 1 мл раствора жизнеспособных бактериальных клеток, содержащего 120 мкМ ФМН, и облучайте ее синим светом со скоростью 20 Вт/м2 в течение 60 минут.
- Установите пробирки, как описано в шагах 1.5 и 1.6 , и накройте их толстой алюминиевой фольгой. Эти трубки служат в качестве темных регуляторов.
- Камеру облучения (а также темные регуляторы) следует хранить в холодном помещении при температуре 9 ± 1 °C в течение 30-120 минут облучения.
ЗАМЕТКА: Нельзя игнорировать тепло, выделяемое светодиодными лампами (LED), так как светодиодные чипы, размещенные внутри чашки, могут нагревать систему фотореакции во время экспериментов по облучению. Поэтому эксперименты проводились в холодной комнате, поддерживаемой при температуре 9 ± 1 °C. - После облучения перенесите 0,2 мл из каждого из реакционных растворов на пластину с агаром Лурия (ЛК). Распределите бактерии по тарелке с помощью L-образного стеклянного стержня и инкубируйте в течение ночи при температуре 37 °C.
- Рассчитайте количество жизнеспособных пластин и скорость инактивации S. aureus после ночного роста.
ЗАМЕТКА: Скорость инактивации S. aureus рассчитывается как процентное восстановление, которое равно [1 -I/D] ×100%, где I и D обозначают, соответственно, количество КОЕ в облучаемом образце и темновом контроле. Процентное снижение определяется как отрицательное значение скорости инактивации.