1. Производство и очистка спор Bacillus subtilis
- Для производства спор перенесите 5 мл на ночь культуры соответствующего штамма B. subtilis , дополненного соответствующими антибиотиками, в 200 мл жидкой среды для спороношения Шеффера двойной концентрации (на литр 16 г питательного бульона, KCl (хлорид калия) 2 г, 0,5 г MgSO4*7 H2O (гептагидрат сульфата магния), 2 мл 1 M Ca(NO3)2 (кальциевая селитра), 2 мл 0,1 М MnCl2 *• 4 H2O (тетрагидрат хлорида марганца), 2 мл 1 мМ FeSO4 (сульфат железа), 2 мл 50% (w/v) глюкозы18) и культивируют его с интенсивной аэрацией при 37 °C в течение 72 ч или до тех пор> пока 95% культуры не проспорует. Используются споры следующих штаммов: B. subtilis PY79 (дикий тип) B. subtilis PY79ΔrecA::neo (дефицит белка репарации ДНК RecA) B. subtilis PY79 recA-yfp::cat (RecA слитый с желтым флуоресцентным белком [YFP]).
- Соберите споры центрифугированием в течение 15 минут при плотности 3000 x g в пробирках объемом 50 мл и очистите образцы путем повторной промывки (до 15 раз) с использованием стерильного дистиллированногоH2Oи проверьте чистоту и состояние прорастания с помощью фазово-контрастной микроскопии. Убедитесь, что споровые суспензии состоят из спор с яркой фазой (> 99%) и не содержат вегетативных клеток (палочек), пророщенных спор (черный/серый цвет) и клеточных остатков; В противном случае дальнейшие эксперименты с микроскопией могут быть нарушены. Промойте образец до тех пор, пока не будет достигнута желаемая чистота.
- Определите титр спор путем выделения 50 мкл 10-кратных серийных разведений на LB (luria-bertani)-агаре (т.е.: используйте образец 30 мкл + 270 мкл стерильной воды для разведения в соотношении 1:10). Возьмите 30 мкл от конкретного разведения до 270 мкл H2O для разведения 1:100 и т. д.) для расчета КОЕ (колониеобразующих единиц) и инкубируйте планшеты при 37 °C в течение ночи. После определения КОЕ отрегулируйте пробу до10-9 спор на мл путем концентрирования или разбавления стерильной водой.
2. Пробоподготовка спор Bacillus subtilis , осажденных аэрозолем
ЗАМЕТКА: Накопление и перекрытие спор может привести к эффекту затенения во время лечения, что в конечном итоге приводит к фальсификации кинетики инактивации. Чтобы свести к минимуму эту проблему, подготавливайте образцы спор методом аэрозольного осаждения. Вкратце, управляйте высокоточным двухкомпонентным соплом с электрическим таймером, который регулирует производительность жидкости в соответствии с потоком газа-носителя под давлением (здесь N2). Диспергируйте впрыскиваемый жидкий образец через выходное отверстие сопла с помощью потока газообразного азота.
- Поместите носитель образца в виде стерилизованных микроскопических стекол (для кинетики выживания) или круглых покровных стекол диаметром 25 мм (для флуоресцентного отслеживания процессов репарации ДНК/cLSM; конфокальная лазерная сканирующая микроскопия) внутрь аэрозольного распылителя с электрическим приводом в соответствии с соплом. Используемая концентрация спор должна в сто раз превышать желаемую конечную концентрацию.
- Перенесите 1 мл культуры спор на вход жидкости форсунки и начните процесс распыления продолжительностью 0,1 с под давлением 1,3 бар. Распыленная споровая суспензия (1 x 107) образует тонкую пленку на микроскопическом предметном стекле, которая быстро высыхает в течение нескольких секунд, образуя равномерно распределенный монослой спор. Обработанные носители образцов хранить в стерильном контейнере при комнатной температуре.