1. Подготовка образцов микроскопии
Заметка: Клетки, предназначенные для микроскопии, помещаются на микроскопическое покрытие, а затем покрываются агарозной подушечкой с питательными веществами. Накладка приклеена к пластиковой или металлической раме для механической поддержки. В подготовке к микроскопии заранее следует подготовить большую площадку с 1% агарозой/TPM/0,2% CTT, как описано в шагах 2.1–2.3. Пожалуйста, также ознакомьтесь с Таблицей материалов для конкретных используемых здесь продуктов.
1. Подготовьте 500 мл буфера TPM (10 мМ Tris-HCl pH 7,6, 1 мМ KH2PO4 pH 7,6, 8 мМ MgSO4) и стерилизуйте автоклав или фильтр с помощью фильтра с крышкой бутылки.
ЗАМЕТКА: Стерильный буфер можно хранить несколько месяцев при комнатной температуре.
2. Приготовьте 1% агарозный микроскопический раствор, содержащий 0,2% КТТ (смешайте 1 г агарозы с 80 мл буфера TPM и 20 мл среды 1% КТТ). Разогревайте в микроволновке до расплавления агарозы.
ЗАМЕТКА: КТТ 0,2% достаточно, чтобы клетки могли расти и предотвратить голодание. Более высокие концентрации КТТ в микроскопической среде приводят к высокой фоновой флуоресценции.
3. Наполните чашку Петри расплавленной агарозой толщиной 0,5 см (для чашки Петри размером 11,5 см на 11,5 см требуется примерно 60 мл расплавленной агарозы) и дайте ей остыть до комнатной температуры.
ЗАМЕТКА: Агарозная подушечка может храниться при 4 °C во влажной среде до 2 дней.
1. Предварительно прогрейте 1% агарозу/TPM/0,2% CTT при 32 °C не менее 15 минут перед использованием.
ЗАМЕТКА: Чтобы подготовить клетки к микроскопии, следуйте шагам 2.4–2.8.
4. Разместить стерильную стеклянную накладку (60 мм x 22 мм, толщина: 0,7 мм) на пластиковую или металлическую раму с отверстием посередине (рисунок 1A); Эта рама служит механической опорой для тонкого скольжения и помогает уменьшить дрейф во время микроскопии. Прикрепите обложку к раме скотчем.
1. Для подготовки рамы вырежьте раму диаметром 75 мм × 25 мм из металлической пластины толщиной 1 мм, затем вырежьте отверстие соответствующего размера (20 мм × 30 мм в этом эксперименте) в центре.
5. Добавьте 10–20 мкл экспоненциально выращенных клеток M. xanthus на покрытие.
6. Добавить флуоресцентные микросферы 0,5 мкм в качестве фидуциальных маркеров к клеткам для упрощения отслеживания клеток или белков в таймлапс-записях.
1. Разбавить микросферы в буфере TPM 1:100 и хранить при 4 °C до нескольких месяцев. Тщательно встряхните перед использованием и добавьте 5–10 мкл разбавленных микросфер в клетки.
ЗАМЕТКА: Здесь использовались микросферы, флуоресцентные во всех распространённых синих, зелёных, жёлтых и красных люминесцентных каналах.
7. Вырежьте небольшую подушечку примерно размером с покрытие большого предварительно нагретого 1% агарозы/TPM/0,2% CTT и разместите её поверх ячеек (рисунок 1B). Положите покров сверху на агарозную прокладку 1% агарозы/TPM/0,2% CTT, чтобы предотвратить испарение и поддерживать клетки во влажной среде.
ЗАМЕТКА: Само покрытие предотвращает значительное испарение как минимум на 2 часа. Для более длительных таймлапс-записей 1% агароза/TPM/0,2% CTT pad и сэндвич с ковлзом должны быть запечатаны парафиновой пленкой, чтобы предотвратить испарение.
8. Инкубировать микроскопический образец при 32 °C в течение 15–20 минут, чтобы клетки прикрепились к дну агарозного подушечника. Затем начните записи таймлапс-микроскопии.