Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Скрининговый анализ низкомолекулярных нематицидов: метод скрининга потенциальных нематицидов против Ditylenchus dipsaci со средней пропускной способностью

847 просмотров

8 июля 2025 г.

В этой статье

Аннотация

Источник: Cammalleri, S. R., et al. Культивирование и скрининг паразитической нематоды растений Ditylenchus dipsaci. J. Vis. Exp. (2022).

В этом видео мы демонстрируем скрининговый анализ для определения эффективности низкомолекулярных нематоцидов против нематод. Нематоциды считаются эффективными, если они вызывают снижение количества подвижных нематод в образце после воздействия.

Протокол

Все процедуры, связанные с животными моделями, были рассмотрены местным комитетом по уходу за животными и ветеринарным наблюдательным советом JoVE

1. Скрининг малых молекул in vitro

  1. Подготовьте пластины для анализа, следуя приведенным ниже инструкциям.
    1. Налейте автоклавированную дистиллированную воду в стерильное корыто и с помощью многоканальной пипетки выдайте 40 мкл дистиллированной воды из корыта в каждую лунку 96-луночного планшета с плоским дном.
  2. Подготовьте инструмент для прикалывания и добавьте химикаты.
    1. Установите лотки для пиннеров (см. Таблицу материалов) рядом с пламенем горелки Бунзена на лабораторном столе. Добавьте в последовательные лотки для пиннеров: 25 мл раствора для очистки штифтов, 35 мл 50% ДМСО (в воде), 45 мл дистиллированной воды, 55 мл 70% этина и 65 мл 95% этиленоксида. Положите по одному листу промокательной бумаги перед каждым лотком.
    2. Очистите инструмент для установки штифтов, погрузив штифты в чистящий раствор и переместив штифты вверх и вниз три раза (3 раза) в растворе. В этом протоколе «3x» и «10x» определяются как перемещение штифта вверх и вниз в растворе три или десять раз соответственно. Промокните булавки на промокательной бумаге. Повторите эту процедуру еще раз.
      1. Затем промойте булавки 3 раза в дистиллированной воде, после чего промокните булавки. Повторите процедуру еще раз.
      2. Наконец, промойте булавки 3 раза в 95% EtOH, а затем промокните булавки. Повторите еще раз. Разожгите шпильку и дайте этанолу испариться.
    3. Добавьте химикаты из 96-луночных химических планшетов в пробирные пластины, приколов 3x к химическому планшету, а затем перенеся штифты 10X в пробирную пластину. Промокните на бумаге перед чистящим раствором.
    4. Очистите инструмент для прикалывания между пластинами, промыв в следующем порядке, промокнув между ними на промокательной бумаге: 3 раза в 50% ДМСО (один раз), 3 раза в дистиллированной воде (один раз), 3 раза в 75% EtOH (один раз), 3 раза в 95% EtOH (дважды). Разогрейте пиндер и дайте этанолу испариться.
    5. Повторите шаг 1.2.2, когда все закрепления будут завершены.
      заметка: Скрининг проводили при конечной концентрации 60 мкМ.
  3. Добавление червей
    1. Подсчитайте количество нематод из коллекции, сначала суспендируя, а затем пипетируя 5 мкл с помощью наконечников с низким удержанием на предметное стекло для наблюдения. Подсчитайте количество нематод в 5 мкл с помощью диссекционного микроскопа.
      1. Отрегулируйте концентрацию до 2 червей/мкл с помощью стерильной дистиллированной воды. С помощью многоканальной пипетки и корыта добавьте по 10 мкл (~20 червей) в каждую лунку из 96-луночных планшетов.
        заметка: Приблизительно 15 000 нематод D. dipsaci будут собраны на одну культуральную пластину с использованием описанного метода культуры и сбора. На одну скважину используется двадцать червей, так как малое их количество способствует четкой визуализации и учету подвижных и неподвижных.
    2. Запечатайте пластины в лабораторную упаковочную пленку и оберните влажным бумажным полотенцем. Поместите в коробку и закрепите на липкой прокладке при температуре 20°C встряхивающий инкубатор, установленный на 200 оборотов в минуту. Убедитесь, что пластины стабилизированы в коробке, добавив дополнительное влажное бумажное полотенце, чтобы обеспечить минимальное перемещение тарелок.

2. Сбор и анализ данных

  1. Понаблюдайте за планшетами на 5-й день под препарирующим микроскопом. Подсчитайте количество подвижных и общее количество D. dipsaci в контрольных растворителях ДМСО и лунках, обработанных лекарственными препаратами.
    1. Если черви относительно неподвижны, добавьте в лунку 2 мкл 1 М NaOH до конечной концентрации 40 мМ, чтобы стимулировать движение><. заметка: После добавления NaOH черви будут перемещаться мгновенно, и их нужно будет рассмотреть в течение 5 минут. Количество мобильных червей и общее количество червей будут использоваться для расчета доли мобильных червей. Продолжительность анализа может меняться в зависимости от направления ситона.
  2. Рассчитайте долю мобильных червей. На грохотах D. dipsaci скважины, которые воспроизводимо дали 0% подвижных червей, классифицируются как сильные попадания.
    заметка: Длительная экспозиция пластин на столешнице диссекционных микроскопов избегается, поскольку источник света может нагревать пластины и вызывать переменные эффекты на биопробу.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Конфликт интересов не декларируется.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Стакан объемом 50 млпирексCLS100050
Планшет на 96 лунокСарштедт83.3924
Алюминиевая фольгаАлкан Плюс
Область рассеченияЛейкаЛейка MZ75
ДмсоСигма-Олдрич472301-500МЛ
Предметное стеклоМАГНА60-1200
Безворсовая промокательная бумагаНаучно-исследовательская компания V&PВП 522-100
Наконечники для пипеток с низким удержанием (200 мкл)ЛАБФОРС1159М44
многоканальный пипеткаEppendorf research plus3125000036
НаОХСигма-ОлдричС8045-500Г
ПарафильмБемисПМ-996
Решения для очистки штифтовНаучно-исследовательская компания V&PВП110А
пиннерНаучно-исследовательская компания V&PВП381Н
Лотки для ополаскивания пиннеромНаучно-исследовательская компания V&PВП 421
Резервуар для реагентов с крышкой для многоканальных пипетокСигма-ОлдричBR703459
Встряхивающий инкубаторНаучный центр Нью-БрансуикаИ26
См.

Теги

Скрининг малых молекуланализ подвижности нематоднаблюдение с помощью диссекционного микроскопастимуляция гидроксидом натрияанализ на 96-луночном планшетеперенос стоковых растворов химических веществкорректировка концентрации нематоддоля подвижных червей