1. Производство αDEC-205 из гибридомной клеточной линии NLDC-145
- Для получения антител необходимо разморозить криоконсервированные клетки NLDC-145, продуцирующие αDEC-205 при 37 °C, на водяной бане. Расширяйте ячейки при 37 °C и 5%CO2. Для начала выработки антител понадобятся два флакона размером 75 см2 дюйма. Процедуры культивирования клеток следует проводить в защитном шкафу, чтобы обеспечить безопасные условия работы и предотвратить контаминацию культур.
- Ресуспендировать 1 мл размороженных клеток (1 x 106 - 5 x 106 клеток/мл) в 9 мл среды ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина (предварительно подогретого до 37 °С) в колбу для клеточных культур (25 см2). Поместите колбу горизонтально в инкубатор для клеточных культур при температуре 37 °C, 5%CO2.
- Культивируйте клетки при 37 °C и 5%CO2 до 70% слияния. Обычно это должно быть достигнуто через 24 - 48 часов.
- После того как клетки слились на 70%, перенесите полную клеточную суспензию NLDC-145 (10 мл) в коническую центрифужную пробирку объемом 15 мл с помощью контроллера пипетки с пипеткой в диапазоне объемов от 1 до 10 мл. Гранулируйте клетки центрифугированием при плотности 250 х г в течение 10 минут при комнатной температуре.
- Предварительно подогреть среду ISF-1 до 37 °C на водяной бане и повторно суспендировать гранулу в 12 мл среды ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина. Переложите ресуспендированную клеточную суспензию в колбу для свежей клеточной культуры (75 см2 ).
- Культивируйте и расширяйте клетки в среде ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина при 37 °C и 5%CO2 до 70% конфлюентности и 99% жизнеспособности. Обычно это должно быть достигнуто через 48 - 72 ч.
- Разделите ячейки на две колбы по75 см 2. Для этого сначала промойте дно колбы для клеточных культур/поверхность культивальной суспензии, чтобы удалить все клетки NLDC-145 с поверхности. Переложите по 6 мл клеточной суспензии NLDC-145 в один из двух свежих флаконов 75 см2 и добавьте предварительно подогретую среду ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина до 12 мл.<бр/>
заметка: Не обновляйте среду для культивирования клеток, так как клетки NLDC-145 будут кондиционировать среду. Перенесите клетки вместе с их средой и заполните культуру до нужного объема свежей средой. Это имеет решающее значение для жизнеспособности и максимальной выработки антител клетками NLDC-145.
- Расширяйте клеточные культуры при 37 °C и 5%CO2 до примерно 70% конфлюента, что обычно достигается через 48 - 72 ч.
- После того, как клетки слились на 70%, перелейте по 10 мл расширенной клеточной суспензии NLDC-145 из каждого флакона размером 75 см2 в один роликовый флакон PETG (полиэтилентерефталатгликоль) (1050 см2). Для этого промойте дно колбы/поверхность клеточной культуры клеточной суспензией, чтобы удалить все клетки с поверхности с помощью контроллера пипетки и пипетки объемом 10 мл.
- Добавьте 140 мл среды ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина (предварительно подогретого до 37 °C) непосредственно из флакона со средой в каждый из флаконов NLDC-145, содержащих ролики, наполнив их до отметки 150 мл><.
заметка: Смотрите примечание в шаге 1.1.6.
- Заквашивайте роликовые бутылки при температуре 37 °C, 5%CO2 и 25 оборотов/мин в течение трех дней.
- Добавьте по 150 мл среды ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина (предварительно подогретого до 37 °С) в каждый из флаконов NLDC-145, содержащих ролики, заполнив их до отметки 300 мл.
- Закваливайте роликовые флаконы, содержащие по 300 мл культуры каждая, при 37 °C, 5%CO2 и 25 раундах/мин в течение еще трех дней.
- Добавьте еще 100 мл среды ISF-1 с добавлением 1% пенициллина/стрептомицина (предварительно подогретого до 37 °C) в каждый из роликовых флаконов NLDC-145, тем самым заполнив их до отметки 400 мл.
- Заквашивайте роликовые флаконы, содержащие по 400 мл культуры каждый при 37 °C, 5%CO2 и 25 раундах/мин в течение еще семи дней.
заметка: В течение этой недели культура становится очень плотной (до 95% плотности), а жизнеспособность снижается (до 50%), что позволяет максимально высвобождать антитела.
- Для очистки αDEC-205 от надосадочной жидкости культуры вливают клеточную суспензию NLDC-145 (из обоих роликовых флаконов) непосредственно в автоклавные центрифугирующие флаконы объемом 500 мл.
заметка: Общий объем культуры должен быть собран в объеме 800 мл.
- Центрифугируйте культуру в течение 30 минут при 8 600 x g и 4 °C для удаления клеток и мусора.
- Соберите надосадочную жидкость, отбросив гранулы и объединив ее в стерильный флакон с реагентом.
заметка: Очистку αDEC-205 можно начинать немедленно (стадия 2) или хранить надосадочную жидкость в течение короткого времени при температуре 4 °C.
2. Выделение антитела αDEC-205 из надосадочной жидкости NLDC-145
ПРИМЕЧАНИЕ: Из надосадочной жидкости NLDC-145 αDEC-205 очищается с помощью колонки из белка G Sepharose (многоразовой). Размеры колонки составляют 15 мм x 74 мм, а в каждой колонке содержится 5 мл белка G сефарозы.
- Для приготовления и промывки колонки белка G сефарозы на верхнее отверстие колонки белка G сефарозы надевают герметичную резиновую пробку. Проколите резиновую пробку двумя стерильными канюлями (20 G x 1 1/2", 0,90 x 40 мм).
- Подсоедините шприц объемом 10 мл к одной из двух канюль и гибкую силиконовую трубку (длиной примерно 100 см, диаметром 2,5 - 3 мм) с соединительным трубкой ко второй канюле.
заметка: Конструкция шприца/резиновой пробки является многоразовой и обеспечивает вакуум, что приводит к непрерывному потоку большого объема надосадочной жидкости культуры в колонку сефарозы белка G. С этой целью слегка оттяните поршень шприца, чтобы обеспечить непрерывный поток жидкости на следующих этапах.
- Промойте колонку 50 мл 0,1 М ледяной уксусной кислоты (pH 2) для удаления потенциально оставшихся антител от любой предыдущей очистки антителами. Поместите конец силиконовой трубки в бутылку с реагентом, наполненную ледяной уксусной кислотой (pH 2) 0,1 М. В результате индуцированного вакуума 50 мл 0,1 М ледяной уксусной кислоты (pH 2) по каплям протекают через колонку сефарозы белка G.
ПРИМЕЧАНИЕ: 0,1 М ледяной уксусной кислоты (pH 2) следует хранить во флаконе с реагентом или в свежезалитой стакане.
- Промойте колонку 100-200 мл фосфатно-солевого буфера (PBS). Поместите конец силиконовой трубки в наполненную PBS бутылку с реагентом или стакан. Пропустите 100-200 мл PBS по каплям через колонку сефарозы белка G.
- Для очистки антител из надосадочной жидкости NLDC-145 загрузите в колонку 800 мл надосадочной жидкости NLDC-145 (полученной на шаге 1.2.2). Вставьте конец силиконовой трубки в флакон с реагентом NLDC-145, наполненный надосадочной жидкостью. Дайте 800 мл надосадочной жидкости NLDC-145 протекать по капле через колонку.
- Промойте колонку 500 мл PBS. Поместите конец силиконовой трубки в наполненный PBS флакон с реагентом или стакан. Пусть 500 мл PBS проходит по каплям через колонку.
- Для элюирования используйте 20 пробирок объемом 1,5 мл и пипетку по 100 мкл 1,5 М Tris-HCl (pH 8,8) в каждую пробирку объемом 1,5 мл. Снимите резиновую пробку с колонки и пипеткой внесите 1 мл 0,1 М глицина (pH 3) в верхнюю камеру колонки белка G Sepharose для выведения антитела из колонки. Соберите проточный воздух непосредственно в виде элюата в одну из подготовленных пробирок объемом 1,5 мл.
- Повторите этап элюирования (2.2.2.) для всех 20 пробирок (1,5 мл).
- Определить оптическую плотность всех фракций элюирования на длине волны 280 нм (OD280) с помощью спектрофотометра с целью идентификации фракций, содержащих антитела.
заметка: Используйте первую фракцию элюирования в качестве пустой.
- Объедините все фракции с OD280 больше 0,5 (примерно 10 дробей).
- Храните белок G сефарозный столбик, заполненный 20% этанолом при температуре 4 °C.
- Диализируйте объединенные элюции в дозе 1000 мл PBS (в стакане объемом 2000 мл) при температуре 4 °C в течение ночи с помощью диализных трубок с молекулярной массой (MWCO) 12 - 14 кДа.
- Разрежьте диализную трубку на кусочки по 20 см. Прокипятите диализную трубку в 500-800 мл 10 мМ ЭДТА (pH 7,5) в течение 30 минут в стакане, используя горячую пластину для удаления загрязнений. Слейте 10 мМ раствор ЭДТА (pH 7,5) и прокипятите диализную трубку в деионизированной воде в течение 10 мин.<бр/>
заметка: Диализную трубку можно использовать непосредственно или хранить в 0,01% растворе азида натрия (NaN3)/H2O при температуре 4 °C до следующего использования.
- Закройте дно диализной трубки подходящей крышкой диализной трубки/цельным шарнирным зажимом и осторожно наведите элюирование антител в диализную трубку. Закройте верхнюю часть диализной трубки вторым зажимом.
- Закрепите верхний зажим диализной трубки на плавающей подставке, вставьте его вместе с магнитной мешалкой в стакан, наполненный PBS, и поместите стакан на магнитную мешалку.
- Диализируйте в течение ночи, помешивая при 4 °C.
- Чтобы увеличить концентрацию αDEC-205, загрузите полный диализат в центробежный концентратор с мощностью 10 кДа MWCO. Откройте один зажим трубки и осторожно отпидайте весь диализат из диализной трубки в центробежный концентратор (10 кДа MWCO).
заметка: Не касайтесь наконечником пипетки нижней части концентратора.
- Центрифуга в течение 30 минут при 693 x g (2 000 об/мин) и 4 °C.
- Загрузите в центробежный концентратор 10 мл PBS и центрифугу при 693 x g (2000 об/мин) и 4 °C до тех пор, пока конечный объем раствора антитела не составит 1-1,5 мл
заметка: При необходимости повторите этап центрифугирования, описанный в пункте 2.4.1. , чтобы отрегулировать до нужного количества.
- С помощью спектрофотометра определить оптическую плотность концентрированного раствора αDEC-205 при длине волны 280 нм (наружный диаметр280). Используйте PBS в качестве пустого.
- Рассчитайте концентрацию αDEC-205 по следующей формуле:
концентрация [мг/мл] = OD280/1,4.
- Отфильтруйте раствор αDEC-205 с помощью шприцевого фильтрующего блока длиной 0,22 мкм.
заметка: Очистка αDEC-205 из супернатанта гибридомных клеток NLDC-145 также может быть достигнута с помощью FPLC (быстрой белковой жидкостной хроматографии). Очищенный αDEC-205 можно хранить при температуре 4 °C или при -18 °C для длительного хранения.
3. Химическая конъюгация OVA с αDEC-205
ПРИМЕЧАНИЕ: Для оптимальной химической конъюгации требуется соотношение 0,5 мг белка OVA к 2,5 мг αDEC-205 (1:5). Однако это соотношение может варьироваться для других белков и антител и должно быть оптимизировано для альтернативных конъюгатов. Восстановление дисульфидных связей белка OVA осуществляется путем инкубации с 30 мМ TCEP-HCl, в результате которой сульфгидриль-группы для химической конъюгации подвергаются воздействию αDEC-205, а на этапе 3.2 необходимо ввести 240 мкл TCEP-HCl. Оба этапа, индуцированное TCEP снижение OVA (этап 3.1.) и сульфо-SMCC-активация αDEC-205 (этап 3.2.) предпочтительно должны выполняться параллельно.
- Приготовьте свежеприготовленный раствор TCEP-HCl с концентрацией 125 мМ (pH 7,0). Взвесьте желаемое количество TCEP-HCl и растворите TCEP-HCl в 0,9 М трис-основании (pH 8,8). С помощью индикаторных полосок проверьте pH раствора TCEP-HCl 125 мМ (который должен быть нейтральным) и отрегулируйте pH с помощью основания Tris (pH 8,8).
- Пипеткой 200 мкл раствора белка OVA (содержащего 0,5 мг OVA) в стерильную пробирку объемом 1,5 мл. Добавьте 240 мкл 125 мМ TCEP-HCl и 560 мкл стерильной сверхчистой воды к белку OVA с помощью пипетки до конечной концентрации 0,5 мг/мл белка OVA и 30 мМ TCEP-HCl (OVA/TCEP-HCl).
ПРИМЕЧАНИЕ: 2,5 мг EndoGrade OVA (лиофилизированная) растворяют в 1 мл PBS, что дает раствор OVA 2,5 мг/мл.
- Инкубируйте полученный OVA/TCEP-HCl при комнатной температуре в течение 1,5 ч.<бр/>
заметка: Не продлевайте этот этап инкубации.
- Чтобы активировать αDEC-205 для конъюгации, растворите 2 мг сульфо-SMCC в 100 μл сверхчистой воды.
заметка: Сульфо-СМХК подвержен гидролизу. Таким образом, следует быстро обрабатывать большие количества нерастворенного сульфо-SMCC или использовать доступные аликвоты в дозе 2 мг.
- Разведите αDEC-205 в PBS так, чтобы 2,5 мг содержалось в 900 μл.
- Смешайте 2,5 мг αDEC-205 (объем 900 мкл; получено на стадии 3.2.1.) и 100 мкл сульфо-SMCC (получено на стадии 3.2.) в пробирке объемом 1,5 мл, в результате чего общий объем составит 1 мл.
- Инкубируйте раствор αDEC-205/sulfo-SMCC в течение 30 минут при 37 °C и 550 об/мин в нагревательном блоке.
- После такой инкубации избыток сульфо-SMCC и TCEP-HCl немедленно удаляется из растворов с помощью обессоливающих колонн (MWCO 7 кДа; объем колонки 5 мл).
- Открутите нижнее закрытие колонны (MWCO 7 кДа), ослабьте крышку и поместите колонну в коническую трубку объемом 15 мл.
- Центрифуга в течение 2 мин при 1 000 x g при комнатной температуре, чтобы удалить жидкость.
- Поместите колонку в свежую пробирку и снимите крышку. Медленно загружайте антитело/сульфо-SMCC и OVA/TCEP-HCl, соответственно, в центр слоя компактной смолы из одной колонки каждый.
- Центрифуга в течение 2 мин при 1 000 x g при комнатной температуре.
- Выбросьте столбцы после использования. Растворы, содержащие антитела и OVA, подготовленные к конъюгации, находятся в пробирках.
- Немедленно смешайте оба раствора с помощью пипетирования для конъюгации αDEC-205 и OVA.
- Полученную смесь αDEC-205 и OVA инкубировать в течение ночи при температуре 4°C.
- После конъюгации избыток несвязанной OVA удаляют из раствора и концентрируют связанную αDEC-205/OVA с помощью центробежного белкового концентратора (MWCO 150 кДа).
- Предварительно промойте центробежный белковый концентратор (MWCO 150 кДа) путем пипетирования 12 мл PBS на колонке и центрифугирования в течение 2 минут при температуре 2 000 x g при комнатной температуре.
заметка: При необходимости повторяют этап центрифугирования (3.4.1) до тех пор, пока через колонку не пройдет объем около 5 мл.
- Перед загрузкой αDEC-205/OVA в центробежный белковый концентратор сохраните 20 мкл образца неконцентрированного αDEC-205/OVA для вестерн-блоттинга. Храните эту аликвоту при температуре 4 °C до анализа.
- Загрузите αDEC-205/OVA в центробежный белковый концентратор с помощью пипетирования.
заметка: Избегайте любого контакта со станиной верхней камеры центробежного концентратора.
- Заполните концентратор до 15 мл PBS и центрифугируйте концентратор в течение 5 минут при температуре 2 000 x g при комнатной температуре.
- Сохраните образец проточного потока (проточный I) для анализа вестерн-блоттинга и отбросьте оставшийся проточный поток.
- Заполните концентратор до 10 мл PBS и центрифугируйте концентратор в течение не менее 8 минут при температуре 2 000 x g при комнатной температуре.
- Сохраните образец для второго проточного потока (Flow-through II) для анализа вестерн-блоттинга и отбросьте оставшийся проток.
- После достижения желаемого обогащения (около 1,5 мл раствора αDEC-205/OVA следует оставить в верхней камере) осторожно отсасывайте концентрированный образец><.
заметка: Если в верхней камере осталось слишком много жидкости, центрифугирование можно повторить, но оно должно быть как можно короче.
- Определить концентрацию белка полученного αDEC-205/OVA с помощью микрообъемного спектрофотометра. Используйте PBS в качестве пустого.
- Отфильтруйте αDEC-205/OVA с помощью шприцевого фильтрующего блока длиной 0,22 мкм.
заметка: Для последующего анализа и экспериментов in vivo αDEC-205/OVA можно хранить при температуре 4 °C или -18 °C.
4. Проверка химического сопряжения методом ИФА
- Выполните ИФА для дальнейшей проверки успешной химической конъюгации, приводящей к αDEC-205/OVA.
- Покройте соответствующий 96-луночный планшет методом ИФА 100 мкл/лунка 3 нг/мкл антитела αOVA кролика в буфере для покрытия (0,1 М бикарбоната натрия (NaHCO3) pH 9,6, разбавленного в H2O).
- Инкубируйте тарелку в течение ночи при температуре 4 °C.
- После нанесения покрытия трижды промойте пластину с помощью PBS, например, с помощью ИФА-шайбы.
- Заблокируйте планшет пипетированием 200 μL блокирующего буфера (10% FCS в PBS) в каждую лунку планшета и инкубируйте планшет в течение 30 минут при комнатной температуре.
- Последовательно разбавляют αDEC-205/OVA (полученную на стадии 3.6.) в соотношении 1:2 в блокирующем буфере (10% FCS в PBS) с получением разведений в диапазоне от 6 г/мл до 93,8 нг/мл αDEC-205/OVA и добавляют 100 мкл/лунку этих уменьшающихся количеств αDEC-205/OVA в лунки.
- Выдержать тарелку в течение 1 ч при комнатной температуре.
- Трижды вымойте тарелку с помощью PBS, например, с помощью ИФА-мойки.
- Добавьте 100 мкл козьего антитела αrat-IgG+IgM(H+L)-HRPO (разведенного до 1:2000 в блокирующем буфере (10% FCS в PBS)) в каждую лунку планшета.
- Выдерживать в течение 1 ч при комнатной температуре.
- Вымойте тарелку три раза с помощью PBS, например, с помощью ИФА-шайбы.
- Добавьте в лунки 50 мкл HRPO-субстрата. При наблюдении прозрачной цветовой реакции следует остановить реакцию добавлением 150 мкл останавливающего раствора (1М Н2SO4) на лунку.
- Через 5 мин считывание поглощения на длине волны 450 нм с помощью считывателя ELISA.