Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Система культивирования кишечных органов ex vivo для изучения взаимодействия хозяина и микробиоты

1.2K просмотров

⸱

8 июля 2025 г.

В этой статье

Аннотация

Источник: Azriel, S., et al. Система культивирования кишечных органов кишечника для анализа взаимодействий хозяина и микробиоты. J. Vis. Exp. (2021).

В этом видео мы описываем методологию создания системы культивирования кишечных органов ex vivo для изучения взаимодействий между фрагментами кишечной ткани мыши и специфическими кишечными бактериями. Устройство состоит из двух пар входных-выходных портов, первый из которых соединяет просвет кишечной ткани и подает в него специфическую бактериальную суспензию, а второй непрерывно подает среду в лунки устройства для поддержания жизнеспособности тканей ex vivo.

Протокол

Все процедуры, связанные с животными, были проверены местным институциональным комитетом по уходу за животными и ветеринарным наблюдательным советом JoVE.

1. Подготовка к эксперименту

  1. Изготовление устройства для культивирования органов кишечника (3 дня)
    1. С помощью 3D-принтера напечатайте многоразовые пластиковые формы для устройства для культивирования органов (устройство имеет 6 лунок, с 24 маленькими и большими отверстиями, а также для крышки устройства).
      ПРИМЕЧАНИЕ: Эти пластиковые формы могут использоваться для изготовления многочисленных устройств.
    2. Вставьте иглы с тупым концом (22 G и 18 G) в соответствующее положение внутри формы устройства и отлите примерно 20 г смеси полидиметилсилоксана (PDMS) (соотношение веса 1:10, основание к катализатору) для одного комплекта устройства и крышки.
    3. Поместите формы в вакуумную камеру на 30 минут, чтобы удалить пузырьки воздуха из смеси PDMS.
    4. Инкубируйте формы при температуре 55 °C в течение ночи, чтобы завершить полимеризацию PDMS.
    5. Когда PDMS будет установлена, вытащите иглы из формы и осторожно освободите устройство для культивирования и крышку от пластиковых форм.
    6. Удалите остатки PDMS с контура лунки с помощью хирургического лезвия. Прикрепите устройство PDMS и крышку устройства к защитному стеклу (микрослайды 75 мм x 50 мм) с помощью нетоксичного силиконового клея и оставьте детали на ночь (нанесите клей на гладкую сторону устройства).
    7. Вставьте двенадцать игл 22 G для просвета и двенадцать игл 18 G для лунки. Зафиксируйте все иглы на месте с помощью силикона и дайте застыть на ночь. Вставьте две иглы 18 G в крышку для обеспечения надлежащего потока воздуха внутрь и наружу устройства для культивирования органов кишечника.
    8. Проверьте все иглы на герметичность с помощью шприца, наполненного водой. Убедитесь, что из колодцев нет протечек, заполнив колодцы водой.
    9. Поместите по два хирургических узла на каждую иглу 22 G, которая будет соединена с толстой кишкой. Поместите устройство и крышку в автоклавный бумажный пакет и простерилизуйте в автоклаве.
  2. Питательная среда (0,5 ч)
    1. В биологическом колпаке смешайте следующее содержимое (в пробирке объемом 50 мл): 37 мл модифицированной среды Дульбекко от Iscove (IMDM), 10 мл заменителя сыворотки KSR, 1 мл добавки B27, 0,5 мл добавки N2, 0,5 мл 1 М буфера HEPES и 0,5 мл заменимых аминокислот.
    2. Отфильтруйте и храните всю среду при температуре 4 °C.
  3. Подготовка трубок и хирургических инструментов
    1. Отрежьте соответствующую длину трубок для входного просвета, входной ямы, выходного просвета и выходной лунки (12 коротких трубок и 12 длинных). Подсоедините соответствующий адаптер к каждой стороне трубки.
    2. Подготовьте хирургические инструменты: прямые ножницы, 4 тонких щипца и 2 острых щипца.
    3. Поместите трубки и хирургические инструменты в автоклавный бумажный пакет и простерилизуйте их с помощью автоклава.
  4. Подготовьте просветный ввод (желаемая стимуляция – бактерии, стул, лекарства и т.д.).
    1. Перед началом эксперимента определите бактериальную нагрузку бактериальной культуры путем серийного разведения и культивирования в аэробных и/или анаэробных условиях.
    2. После расчета бактериальной нагрузки разведите бактериальные культуры в стерильной питательной среде для тканей для получения необходимой концентрации бактерий. Образцы кала отфильтровать с помощью ситечка 100 мкм.
      заметка: Для небактериальной стимуляции (лекарственными препаратами, метаболитами и т.д.) разбавляют вещество до необходимой концентрации с помощью питательной среды для кишечника.

2. Подготовка к эксперименту

  1. Внутри инкубатора для культивирования органов включите нагревательный блок, и установите его на 37 °C.
  2. Настройте насосы, а также входные и выходные шприцы.
  3. Ввод среды для культивирования тканей
    1. В биологическом или ламинарном проточном колпаке заполните входную лунку шприцев полной питательной средой. Конечный объем зависит от продолжительности эксперимента и скорости потока; обычно 1 мл/ч плюс дополнительная среда для продувки.
    2. Подсоедините трубки к шприцам с помощью адаптера Luer-lock. Поместите наполненные шприцы в шприцевые насосы.
    3. Продуйте входные шприцы. Следите за тем, чтобы среда лунки вытекала из всех трубок в отработанный стакан.
  4. Люминальный вход
    1. Наполните шприцы с люминальным вводом стимулирующей обработкой (бактериями, лекарственными препаратами и т.д.). Объем зависит от продолжительности эксперимента и скорости потока (обычно 30 мкл/ч плюс дополнительная среда для продувки).
    2. Подсоедините трубки к шприцам с помощью адаптера Luer-lock. Поместите наполненные шприцы в шприцевые насосы.
    3. Продуйте входные шприцы. Следите за тем, чтобы стимуляция вытекала из всех трубок в отработанный стакан. Будьте осторожны, чтобы не загрязнить различные стимулы.
  5. Выходы
    1. Поместите пустые шприцы в выходные шприцевые насосы (установите режим помпы в положение «Вывод»).
  6. Настройка устройства
    1. Установите регулятор, регулирующий расход газовой смеси (95% O2 + 5% CO2) для равномерного минимального расхода.
    2. Осмотрите прибор в ламинарном капюшоне.
    3. Промойте иглы прибора стерильным IMDM для промывания игл.
    4. Добавьте по 500 мкл стерильной питательной среды в каждую лунку устройства.
  7. Подготовка к рассечению тканей
    1. Поместите стерильные хирургические инструменты внутрь ламинарного капюшона.
    2. Наполните шприц объемом 10 мл стерильным IMDM и подключите стерильную (автоклавированную) иглу с тупым концом 22 G для промывания толстой кишки.

3. Органные культуры

  1. Жертвоприношение мышей и вскрытие тканей
    1. В ламинарном капюшоне принесите в жертву мышей в возрасте от 12 до 14 дней путем обезглавливания. Опрыскайте мышей 70% этанолом и поместите мышей на пластиковую тарелку.
    2. С помощью острых ножниц и щипцов препарируйте мышь и выньте пищеварительный тракт от желудка к анальному отверстию, разрезав весь жир и соединительные ткани. Разрежьте двоеточие и положите его на новую тарелку.
      заметка: Свести к минимуму контакт с тканями толстой кишки. Не прикасайтесь к средней части тканей толстой кишки. Держите салфетку аккуратно и только по краям ткани.
  2. Промывка и промывка толстой кишки
    1. Под диссекционным микроскопом подготовленным шприцем объемом 10 мл аккуратно промыть содержимое толстой кишки стерильным ИМДМ (в проксимальную сторону) (шаг 2.7.2). После удаления кала из кишечной ткани поместите толстую кишку в новую 6-луночную пластину, заполненную 0,5 мл стерильного IMDM.
  3. Подключение двоеточия к устройству
    1. Возьмите ткань, аккуратно соедините ее с иглой 22 G и сделайте тугую завязку двумя нитками. На этом этапе крайне важно поддерживать правильную ориентацию толстой кишки по отношению к потоку просвета (проксимальная = вход, дистальная = выход). Повторите шаги 3.2-3.3 для всех 6 салфеток.
    2. Убедитесь, что входные фиксаторы Люэра иглы пусты от среды. Если нет, опорожните их. Добавьте стимуляции во входную иглу замка Люэра (чтобы избежать попадания пузырьков воздуха в просвет). Повторите этот шаг для каждой толстой кишки с соответствующей стимуляцией.
    3. Убедитесь, что все салфетки подключены, и наденьте крышку на верхнюю часть устройства.
  4. Подключение устройства для культивирования органов к насосам
    1. Поместите устройство в предварительно нагретую камеру с регулируемой температурой (37 °C).
  5. Подключение потока газа
    1. Подсоедините газовый адаптер к крышке крышки с помощью соответствующей входной иглы.
    2. Подключите входную и выходную трубки к устройству.
      заметка: Подсоедините проксимальную сторону ободочной кишки к входным ванночкам.
  6. Продуйте просвет с помощью входов стимуляции.
    1. Осторожно проводите световую стимуляцию через кишечник и проверяйте поток среды в выходных трубках.
    2. Промойте внешнюю среду.
    3. Промойте внешнюю среду 3 раза (установите насосы со скоростью 600 мкл/мин как для входной, так и для выходной лунки). Каждая промывка занимает 1 минуту (начиная с опорожнения колодца).
  7. Начните эксперимент.
    1. Запустите насосы со следующими скоростями:<бр/> Расход: люмен: вход - 30 мкл/ч, выход - 35 мкл/ч<бр/> Внешняя среда: вход - 1000 μл/ч, выход - 950 μл/ч<бр/> заметка: Время эксперимента может варьироваться от 30 минут до 24 часов.
  8. Окончание эксперимента (до 24 ч для посева органов толстой кишки)
    1. Отсоедините все трубки от прибора.
    2. Отсоедините салфетки от игл и продолжайте до нужных показаний.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Конфликт интересов не декларируется.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
устройство
Тупой иглой 18-го калибраМакмастер75165а754
Тупой иглы 22-го калибраМакмастер75165а758 (Английский)
Универсальный адгезивный герметик 100% силиконподпрыгивание688
Кубический вакуумный эксикатор VDC-21+ 2 полкиAAAD4021
Предметное стекло толщиной 1 ммКорнинг2947-75Х50
Мини инкубатор им-10AAH24315K
Вакуумный насос MPC 301EВИ-412711
Пластиковые быстроповоротные трубчатые муфтыМакмастерNo 51525К121
Пластиковые быстроповоротные трубные муфтыМакмастерNo 52525к211
Силиконовый эластомер Sylgard 184Индекс ДоуПолидиметилсилоксан, PDMS
трубопроводМакмастер6516т11
Zortrax M200ZortraxZortrax Z-SUITE, Autodesk Fusion 360
Zortrax M200 Материалы: z-ultrat Zortrax
Терпимая
B27 Пищевая добавка (50x), T без сывороткиThermo Fisher Scientific17504044
Модифицированная среда Дульбекко от Iscove с феноловым красным (1шт.)Thermo Fisher Scientific12440061
Буфер HEPES (1 м)Thermo Fisher Scientific15630056
Нокаутирующая сыворотка Thermo Fisher Scientific 10828028
Добавка N2 (100x) Thermo Fisher Scientific A1370701
Заменимые аминокислоты (100x) Thermo Fisher Scientific 11140035
Хирургические инструменты
Большие ножницыАсельтех11-00-10
Острые щипцыФ.С.Т11297-10
Хирургическая нить с шелковой тесьмойСМИ8010Г
Прямые ножницыФ.С.Т14091-09
Тонкие щипцыФ.С.Т11051-10
Система органов
Фильтр 0,1 мкмГен жизни
Фильтр 0,22 мкмГен жизни
Шприц с люэровским замком объемом 5 млБ-Д309649
Стереомикроскоп ГриноуЦЕЙССИмпST 305
Рециркуляционный прецизионный воздухонагреватель "CUBE"КУБ-2-ЛИС
Шприцевой насосНовая эра Памп Системс ИнкНЭП-НЭ-1600-ЭМ

Больше статей

Ткань толстой кишки мышипоток люминального стимуляторасборка устройства из ПДМСпроцедура промывания толстой кишкиактивация дендритных клетокдифференцировка Th17-клетокпровоспалительные цитокиныцелостность кишечного барьера