Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Методика экстракции нуклеиновых кислот из крови с помощью магнитных стеклянных частиц

1.2K просмотров

8 июля 2025 г.

В этой статье

Аннотация

Источник: Rosenstierne, M. W., et al. Быстрая, безопасная и простая ручная экстракция нуклеиновых кислот у постели больного для обнаружения вируса в образцах цельной крови. J. Vis. Exp. (2018).

Это видео демонстрирует метод извлечения нуклеиновых кислот из цельной человеческой крови с использованием магнитных стеклянных частиц (MGP) — маленьких магнитных шариков, покрытых диоксидом кремния. После лизиса клеток крови с помощью буфера для лизиса высвобожденные нуклеиновые кислоты связываются с поверхностью покрытых диоксидом кремния MGP, извлекая молекулы из образца.

Протокол

Все процедуры, связанные со сбором образцов, были выполнены в соответствии с рекомендациями института IRB

1. Забор крови у пациентов

ВНИМАНИЕ: Примите соответствующие меры лабораторной безопасности при сборе цельной крови пациента. Наденьте перчатки и очки. Если пациент находится в изоляции, соблюдайте процедуры 4-го уровня биобезопасности.

  1. Для внутривенного забора цельной крови пациента используйте иглу-бабочку с удлинительной трубкой малого диаметра и вакуумную трубку для сбора крови, содержащую буфер для лизиса/связывания. Положите руку пациента в положение вниз и расположите трубку для сбора ниже иглы-бабочки. Вставьте иглу-бабочку в вену пациента и прикрепите вакуумную трубку для забора крови к удлинителю малого диаметра.
    заметка: Это предотвратит обратный поток.
  2. После забора крови перемешайте содержимое пробирки, перевернув пробирку 5 - 10 раз.<бр/> заметка: Из-за оставшегося вакуума в пробирке для сбора крови, содержащей 1,6 мл буфера для лизиса/связывания, объем собранного образца автоматически составит 1,6 мл.
  3. Продезинфицируйте внешнюю сторону пробирки с помощью 70% этанола.
  4. Инкубируйте пробирки в течение 20 минут при комнатной температуре.
    заметка: Здесь протокол можно приостановить, а полные пробирки для сбора крови можно хранить при температуре -20 °C, 5 °C, 25 °C или 37 °C в течение как минимум 1 месяца.
  5. Перейдите непосредственно к упрощенному методу извлечения NA.

2. Упрощенное извлечение NA из цельной крови

  1. Чтобы очистить NA от собранной крови, инактивированной лизисом/связывающим буфером, перемешайте содержимое пробирки, перевернув вакуумную пробирку вручную 5 - 10 раз.
  2. Осторожно снимите крышку с трубки и снимите крышку.
  3. Высыпайте подготовленную аликвоту MGP (1 мл) непосредственно в пробирку для сбора крови.
  4. Наденьте новую крышку от неиспользованной пробирки для сбора крови на пробирку с образцом.
  5. Положите палец на крышку, чтобы убедиться, что пробирка плотно закрыта, и перемешайте содержимое пробирки, перевернув пробирку для сбора крови рукой 5 - 10 раз.
  6. Поместите трубку в магнитный держатель и держите палец на крышке, чтобы убедиться, что трубка плотно закрыта.
  7. Переверните магнитный держатель с трубкой несколько раз вручную, чтобы убедиться, что все MGP собраны на боковой стороне трубки с магнитом.
    заметка: Магнитный держатель может быть заменен на удлиненный магнит и резинку.
  8. Снимите крышку пробирки и выбросьте содержимое пробирки либо с помощью одноразовой пипетки, либо просто высыпав содержимое в пробирку для сбора объемом 50 мл.
    заметка: Избегайте попадания аэрозолей из пробирки объемом 50 мл, закрыв пробирку крышкой.
  9. Подготовленную аликвоту промывочного буфера-1 (WB-1, 4 мл) насыпьте непосредственно в пробирку для сбора крови.
  10. Накройте трубку крышкой и положите палец на крышку, чтобы убедиться, что трубка плотно закрыта.
  11. Извлеките трубку из магнитного держателя, надежно затянув крышку пальцем.
    заметка: Если вы используете магнит и резинку, просто снимите резинку и магнит с трубки.
  12. Восстановите суспендию MGP, перевернув пробирку для сбора крови вручную 5–10 раз.
  13. Повторите шаги 2.6 - 2.8.
  14. Залейте подготовленную аликвоту WB-2 (1,5 мл) непосредственно в пробирку для сбора крови.
  15. Наденьте крышку на трубку и извлеките трубку из магнитного держателя.
    заметка: Если вы используете магнит и резинку, просто снимите резинку и магнит с трубки.
  16. Положите палец на крышку, чтобы убедиться, что трубка плотно закрыта.
  17. Подвешивайте MGP, перевернув пробирку для сбора крови вручную на несколько секунд.
  18. Повторите шаги 2.6 - 2.8.
  19. Залейте подготовленную аликвоту WB-3 (3 мл) непосредственно в пробирку для сбора крови.
  20. Наденьте крышку на трубку и извлеките трубку из магнитного держателя.
    заметка: Если вы используете магнит и резинку, просто снимите резинку и магнит с трубки.
  21. Положите палец на крышку, чтобы убедиться, что трубка плотно закрыта.
  22. Восстановите суспендию MGP, перевернув пробирку для сбора крови вручную 5–10 раз.
  23. Повторите шаги 2.6 - 2.8.
  24. Вылейте приготовленную аликвоту элюирующего буфера (EB, 100 μл) непосредственно в пробирку для сбора крови.
  25. Наденьте крышку на трубку и извлеките трубку из магнитного держателя.
    заметка: Если вы используете магнит и резинку, просто снимите резинку и магнит с трубки.
  26. Ресуспендирование MGP в ЭБ путем постукивания пальцем по пробирке для сбора крови 5 - 10 раз.
    заметка: Здесь протокол можно приостановить, а пробирки хранить при температуре -20 °C.
  27. Перенесите одну каплю (5 - 8 мкл) ресуспендированных MGP в последующую реакционную смесь амплификации NA с помощью одноразовой пипетки объемом 1,5 мл (можно использовать любой последующий диагностический анализ амплификации NA, такой как петлевая изотермическая амплификация (LAMP) / лампа обратной транскрипции (RT-LAMP) или количественная полимеразная цепная реакция (qPCR)/RT-qPCR).
    заметка: NA будут прилипать к MGP, поэтому обязательно используйте MGP в реакции амплификации NA ниже по потоку. Перед применением смешайте суспензию MGP. После смешивания MGP будут собираться на дне пробирки.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Конфликт интересов не декларируется.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Пробирки Vacutainer K2 EDTA (4 мл)Бектон Дикинсон368861
Плюс Сбор кровиБектон Дикинсон362725
23G x 1 иглаБектон Дикинсон300800 (Английский
Шприц LUER LOK (3 мл)Бектон Дикинсон309658
Игла-бабочка с удлинительной трубкой малого диаметраЙорген Круузе А/С121714
1% ВирконНомеко А/С849265
MagNA Pure LC DNA Isolation Kit I - Лизис/связывающий буфер - ПополнениеРош Диагностика А/С3246752001
MagNA Pure LC Набор для выделения общих нуклеиновых кислотРош Диагностика А/С3038505001
Криогенные пробирки Nunc™ Biobanking и клеточных культур (1,8 мл)Thermo Fisher Scientific375418
Криогенные пробирки Nunc™ Biobanking и клеточных культур (3,6 мл)Thermo Fisher Scientific379189
Криогенные пробирки Nunc™ Biobanking и Cell Culture (4,5 мл)Thermo Fisher Scientific379146
Магнит DynaMag-5™Thermo Fisher Scientific12303D
Трансферная пипетка (3,5 мл)Сарштедт86.1171.010
Переводные пипетки Samco™ с тонким наконечником от Thermo Scientific™ (1,5 мл)Thermo Fisher Scientific231
Thermo Scientific™ Nunc™ 50 мл Конические стерильные полипропиленовые центрифужные пробиркиThermo Fisher Scientific339652
)

Теги