Все процедуры, связанные со сбором образцов, были выполнены в соответствии с рекомендациями института IRB.
1. Культура паразитов
ПРИМЕЧАНИЕ: Следуйте местным правилам обращения с человеческими патогенами.
- Поддерживайте содержание паразитов Plasmodium falciparum в соответствии со стандартным протоколом, описанным ранее в среде для культивирования паразитов (см. Таблицу материалов).
- Поддерживайте плотную синхронизацию паразитов, используя обработку сорбитолом, как описано ранее.
- Чтобы обеспечить экспрессию VAR2CSA на поверхности инфицированных Plasmodium falciparum эритроцитов (ИЭ), проведите повторные раунды иммуномагнитного отбора с использованием антитела против VAR2CSA (например, антитела PAM1.4, перекрестно-реактивного человеческого моноклонального VAR2CSA-специфичного IgG), связанного с белком G-магнитных шариков.
- Короче говоря, инкубируйте трофозоит-ИЭ на поздних стадиях с магнитными шариками, соединенными с антителом против VAR2CSA, и положительно отбирайте с помощью магнита.
- Разверните выбранных паразитов в культуре на несколько циклов, пока паразитемия не составит не менее 5%.
- В качестве альтернативы можно выбрать паразитов, которые связываются с иммобилизованным пластиком CSA (рецептором для VAR2CSA), как описано ранее.
- Для проверки экспрессии VAR2CSA выбранных паразитов проводят проточную цитометрию, как описано ранее.
- Короче говоря, пометьте трофозоит-ИЭ на поздней стадии тем же антителом, которое использовалось для магнитного отбора (шаг 1.3), а затем флуоресцентно меченным вторичным антителом.
- Измерьте поверхностную реактивность ИЭ с помощью проточной цитометрии. Успешный отбор антител обычно приводит к тому, что популяция паразитов экспрессирует VAR2CSA у большинства паразитов (≈80%).
- Для анализа на фагоцитоз используйте очищенные трофозоиты-ИЭ средней и поздней стадии. Выполните очистку с помощью магнитной сепарации, как описано ранее.
заметка: Чтобы точно определить стадию появления паразитов, проводят окрашивание по шкале Гимзы по мазкам крови с последующим наблюдением под световой микроскопией. Следуйте стандартным процедурам и морфологическим рекомендациям, как описано выше. Очистка на поздней стадии также может быть выполнена с использованием среды с градиентом плотности. Выход ИЭ, однако, по нашему опыту, ниже, и, следовательно, магнитная очистка предпочтительнее.
- Для магнитной сепарации культуру паразита (5-10% паразитемии) вращают при 500 х г в течение 10 мин при комнатной температуре. Удалите надосадочную жидкость и повторно суспендируйте клеточную гранулу в 10 мл питательной среды для паразитов.
- Добавьте суспензию паразита в кремнезем Claricep Flash Silica, CS-колонку, соединенную с магнитом (см. Таблицу материалов), и дайте ей медленно пройти через колонку. Трофозоит-ИЭ являются парамагнитными (благодаря присутствию гемозоина) и остаются в сетке колонны.
- Промойте колонку 50 мл питательной среды для паразитов и вымывайте ИЭ из магнитной колонки, используя 50 мл среды для культивирования паразитов.
- Вращайте элюат от 1.5.3 при 500 x g в течение 10 минут при комнатной температуре. Осторожно выбросьте надосадочную жидкость и повторно суспендируйте ее в 1 мл среды для культивирования паразитов.
- С помощью гемоцитометра подсчитайте количество ИЭ (легко идентифицируемых с помощью световой микроскопии как эритроциты с пигментом темным гемозоином) и общее количество клеток для расчета итоговой паразитемии (процент ИЭ).
заметка: Используйте только паразитов с чистотой не менее 80% (80% ИЭ).
- Основываясь на количестве образцов сыворотки/антител, запланированных для тестирования, оцените общее количество необходимых ИЭ и соответственно увеличьте масштаб популяций паразитов. Колба для культуры размером 75 см2 с 25 мл культуры с 5% гематокрита и 5-10% паразитемии должна дать достаточное количество ИЭ для работы полного 96-луночного планшета. Для полного планшета (42 образца плюс 6 контрольных образцов в двух экземплярах) требуется минимум 1,5 мл суспензии паразита в концентрации 3,3 x 107 ИЭ/мл.
2. Клетки THP-1
ПРИМЕЧАНИЕ: В этом анализе используется клеточная линия THP-1. Эта линия моноцитарных клеток получена от пациента с моноцитарным лейкозом и может быть приобретена в Американской коллекции типовых культур (ATCC). Поддерживайте клеточную линию в соответствии с инструкциями поставщика в культуральной среде THP-1 (см. Таблицу материалов).
- Для регулярного поддержания начинайте культивирование клеток THP-1 при концентрации 2-4 x 105 клеток/мл и субкультуру, когда концентрация клеток достигает 8 x 105 клеток/мл.
заметка: Не допускайте, чтобы концентрация клеток превышала 1 x 106 клеток/мл и следите за количеством проходов. Избегайте использования ячеек, которые находятся за пределами прохода 25. Среднее время удвоения клеточной линии THP-1 колеблется в пределах 19-50 ч. Определите время удвоения партии клеток до начала экспериментов по фагоцитозу. Это поможет приблизительно оценить необходимое количество культуры, необходимое для определенного количества образцов сыворотки, подлежащих исследованию (например, для полного 96-луночного планшета требуется 10 мл культуры при концентрации 5 x 105 клеток/мл).
- Периодически проверяйте клетки THP-1 на поверхностную экспрессию Fcγ-рецепторов I (CD64), II (CD32) и III (CD16), как описано ранее.
- Короче говоря, окрашивание клеток THP-1 (отдельно) флуоресцентно мечеными антителами анти-CD64, анти-CD32 и анти-CD16 (Таблица материалов) в течение 30 минут при комнатной температуре (разведение 1:100, приготовленное в 2% фетальной бычьей сыворотке (FBS) в фосфатно-физиологическом буфере (PBS).
- Промыть три раза 2% FBS в PBS и измерить окрашивание поверхности с помощью проточной цитометрии.
заметка: Клетки THP-1 отрицательны на CD16 и положительны на CD32 и CD64, как сообщалось ранее (Рисунок 1).
- Для анализа фагоцитоза за день до эксперимента установите колбу с клеточной культурой THP-1 с концентрацией 2,5 x 105 клеток/мл, чтобы получить около 5 x 105 клеток/мл в день анализа.
заметка: Убедитесь, что в день анализа присутствует 4-6 x 105 клеток/мл.
3. Анализ на фагоцитоз (Рисунок 2)
- Перед началом анализа заблокируйте (>1 ч) два 96-луночных планшета с круглым дном (один для опсонизации, а другой для фагоцитоза) с использованием 150 мкл стерильного 2% FBS в PBS на лунку.
заметка: Пометьте пластину 1 как пластину для опсонизации и используйте ее как для окрашивания бромидом этидия (EtBr), так и для опсонизации. Пометьте пластину 2 как планшет для фагоцитоза и используйте как для покрытия клеток THP-1, так и для этапа фагоцитоза.
- Окрашивание паразитами и опсонизация
- Возьмите суспензию ИЭ, приготовленную в 1,6, и отрегулируйте количество клеток до 3,3 x 107 ИЭ/мл путем добавления питательной среды паразита и бромида этидия (EtBr) для достижения конечной концентрации 2,5 мкг/мл (разведение 1:40, из бульона 0,1 мг/мл).
заметка: EtBr окрашивает ДНК паразита, что позволяет обнаруживать его с помощью проточной цитометрии.
осторожность: EtBr является мутагеном и раздражителем кожи, глаз и дыхательных путей. Используйте соответствующие средства защиты и утилизируйте отходы в соответствии с местными правилами.
- Удалите блокирующий раствор с одной из 96 луночных пластин (пластина для опсонизации), перелистывая пластину и удаляя излишки жидкости с листа полотенцесушителя.
- Добавьте 30 мкл на лунку приготовленной выше суспензии IE в верхнюю половину пластины. Оставьте одну лунку пустой и добавьте 30 мкл питательной среды для паразитов (без ИЭ только для контроля THP-1). (Рисунок 3А). Выдерживать в течение 10 минут при комнатной температуре в защищенном от света месте.
- Добавьте 170 мкл на лунку питательной среды для паразитов. Вращайте пластину при температуре 500 x g в течение 3 минут при комнатной температуре и удалите надосадочную жидкость, перебросив пластину над подходящим контейнером для отходов.
- Промойте ИЭ, меченные EtBr, еще два раза, используя 200 мкл на лунку питательной среды паразитов, вращая планшет при 500 х г в течение 3 минут при комнатной температуре. Надосадочную жидкость с первой стирки можно удалить, щелкнув пластиной. Осторожно удалите надосадочную жидкость из второй промывки с помощью многоканальной пипетки, чтобы убедиться, что весь объем промывочного средства удален. Не тревожьте гранулы.
- Повторно суспендируйте меченые EtBr ИЭ в 30 мкл раствора антитела/плазмы/сыворотки, приготовленного в желаемых концентрациях в среде для культивирования паразитов.
- Всегда включайте следующие контрольные группы (рис. 3B): контроль без контроля клеток IEs/THP-1 (питательная среда паразита); контроль без антител или плазмы/сыворотки (неопсонизированный контроль); положительный контроль с использованием коммерчески доступных антител к эритроцитам кролика против человека в разведении 1:100 (см. Таблицу материалов).); два контрольных показателя в плазме/сыворотке с отрицательным результатом в соотношении 1:5 (пул без малярии и пул от мужчин, подвергшихся воздействию малярии); и положительный контроль сыворотки крови при разведении 1:5 (пул от женщин, подвергшихся воздействию малярии, которые ранее были беременны (предпочтительно мультигравидае)).
заметка: Разведение в соотношении 1:100 для положительного контроля, по-видимому, работает последовательно для разных партий приобретенных антител (данные не показаны). Тем не менее, рекомендуется исключить различия между партиями, тестируя несколько разведений каждый раз при использовании новой партии антител.
- Инкубировать в течение 45 минут в темноте при температуре 37 °C.
- Получение клеток THP-1 и фагоцитоз
- Пока происходит опсонанизация ИЭ (3.2.8), начните подготовку ячеек THP-1.
- Извлеките клетки THP-1 из колбы с культурой, открутите их (500 x g в течение 5 мин при комнатной температуре), сцедите надосадочную жидкость и повторно суспендируйте гранулу в среде для культивирования клеток THP-1.
- Снова отжмите (500 x g в течение 5 мин при комнатной температуре), сцедите надосадочную жидкость и повторно суспендируйте клеточную гранулу в 1 мл среды для культивирования клеток THP-1.
- Определите количество клеток в приготовленном выше растворе и добавьте больше среды, чтобы получить конечную концентрацию 5 x 105 клеток/мл.
- Удалите блокирующий раствор с оставшейся 96-луночной пластины (фагоцитозной пластины), перевернув пластину и удалив излишки жидкости с листа полотенцесушителя.
- Добавьте 100 мкл в каждую лунку клеточной суспензии THP-1, приготовленной в 3.3.4, и поместите ее обратно в инкубатор для клеточных культур (рис. 3C).
- По истечении времени инкубации антител/плазмы/сыворотки добавьте 170 мкл в лунку питательной среды для паразитов. Вращайте пластину при температуре 500 x g в течение 3 минут при комнатной температуре и удалите надосадочную жидкость, перебросив пластину над подходящим контейнером для отходов.
- Опсонизированные ИЭ промыть еще два раза, используя 200 мкл на лунку питательной среды для паразитов, вращая планшет при 500 х г в течение 3 мин при комнатной температуре. Надосадочную жидкость с первой стирки можно удалить, щелкнув пластиной. Осторожно удалите надосадочную жидкость из второй промывки, используя многоканальную пипетку, чтобы убедиться, что весь объем промывочного средства удален. Не тревожьте гранулы.
- Наконец, повторно суспендируйте опсонизированные ИЭ в 100 мкл предварительно подогретой среды для культивирования клеток THP-1. Перенесите 50 мкл опсонизированной суспензии ИЭ в каждую лунку в планшете для фагоцитоза. Поскольку общее количество ИЭ составляет 100 мкл, каждое разведение антитела/сыворотки может быть выполнено в двух экземплярах в фагоцитозной пластине (рис. 3D)
заметка: Количество IE и клеток THP-1, используемых в анализе, соответствует соотношению 10:1.
- Инкубировать в течение 40 минут в темноте при температуре 37 °C, 5% углекислого газа (CO2).
заметка: Не допускайте развития фагоцитоза более 40 минут.
- Остановите фагоцитоз центрифугированием при 4 °C (500 x g, 5 мин) и выбросьте надосадочную жидкость, щелкнув планшетом. Добавьте 150 μЛ раствора лизинга хлорида аммония комнатной температуры (Таблица материалов) и перемешайте с помощью пипетирования, инкубируйте ровно 3 мин.<бр/>
заметка: На этом этапе эритроциты, которые не были фагоцитированы клетками THP-1, будут лизироваться.
- Остановите лизис, добавив 100 мкл ледяного 2% FBS в PBS. Поверните пластину при температуре 4 °C (500 x g в течение 3 минут) и удалите надосадочную жидкость, проведя пластиной по соответствующему контейнеру для отходов.
- Промойте три раза, используя 200 μL на лунку ледяного 2% FBS в PBS, вращая пластину при температуре 4°C (500 x g в течение 3 минут). После окончательной промывки повторно суспендируйте в 200 мкл ледяного 2% FBS в PBS и немедленно проанализируйте с помощью проточной цитометрии.
заметка: В предыдущих публикациях использовалась фиксация клеток в 2% параформальдегиде до проточной цитометрии31, но представленные здесь результаты были получены сразу после завершения анализа. Откладывать получение данных проточной цитометрии путем хранения планшета при температуре 4°C не рекомендуется, так как процент клеток EtBr+ THP-1 быстро распадается (рис. 4).
4. Получение и анализ проточной цитометрии
ПРИМЕЧАНИЕ: Можно использовать любой проточный цитометр, поддерживающий формат 96-луночных планшетов и имеющий соответствующие лазеры/фильтры для измерения флуоресценции EtBr.
- Для получения данных затвор на ячейках THP-1 с использованием графика линейного прямого рассеяния (FSC) в сравнении с линейным боковым рассеянием (SSC) с использованием скважин, в которые не были добавлены IE (рисунок 2A), и получение данных о 10 000 событий на этом затворе.
- Измерьте интенсивность флуоресценции для EtBr (FL3-Log) на вентиле THP-1 с помощью гистограммы.
- Для стробирования сначала затвор на ячейках THP-1 на графике плотности FSC в зависимости от SSC, используя лунки, в которые не были добавлены IE (рисунок 5A). Затем установите положительный вентиль на гистограмме FL3 (EtBr), используя ячейки THP-1 (без добавления IE) и неопсонизированный контроль (рисунок 5B).
- Скопируйте эти ворота во всех других образцах, протестированных в той же пластине, и определите процент EtBr-положительных клеток THP-1 (THP-1 клеток, которые фагоцитировали хотя бы один ИЭ). Для каждого из протестированных образцов фагоцитоз может быть представлен в виде абсолютных значений (процент клеток EtBr+ THP-1) или в виде относительного фагоцитоза, рассчитанного в процентном соотношении с использованием положительного контроля в качестве максимума.