Все процедуры, связанные со сбором образцов, были выполнены в соответствии с рекомендациями института IRB.
1. Подготовка биореактора
- Изготовление форм для биореакторов
- Загрузите файл CAD (системы автоматизированного проектирования) биореактора из дополнительного файла CAD или создайте индивидуальный проект.
- Сгенерируйте траекторию движения инструмента с ЧПУ (числовым программным управлением) на основе 3D-модели с помощью программного обеспечения CAM (автоматизированное производство).
- Обрабатывайте ацетальные формы с помощью фрезерного станка с ЧПУ.
- Изготовление биореакторов
- Смешайте основание 10:1 со смесью отвердителя полидиметилсилоксана (PDMS, 77 г смеси на 4 платформы/формы).
- Поместите смесь в вакуумную камеру, закройте все клапаны, включите вакуум и дегазируйте смесь в течение не менее 30 минут, пока не останутся пузырьки воздуха. Разлейте смесь по формам и дегазируйте формы в вакуумной камере в течение 1 ч.
- Закройте формочки верхней половиной формы в правильной ориентации. Поместите стальной шестигранный стержень над центром и зажмите с обеих сторон.
- Заправьте верхнюю часть с помощью PDMS.
- Выдержать формы в духовке при температуре 65 °C не менее 4 часов.
- Выньте платформы из форм после остывания до комнатной температуры.
- Очистите устройства в ультразвуковой ванне, используя 1 час цикла мытья посуды, 400 мл 100% изопропанола и дистиллированной воды.
- Сушите в течение ночи при температуре 65 °C.
- Замочите стеклянные покровные стекла в 1% неионогенном поверхностно-активном полиоле на 30 минут, следя за тем, чтобы они не слиплись, чтобы все они были должным образом покрыты.
- Хорошо промойте дистиллированной водой и высушите в течение ночи при температуре 65 °C.
- Стеклянные покровные стекла и платформу PDMS обработать плазменным очистителем на высокой мощности с 6 л/мин кислорода в течение 1-2 минут. После обработки соедините их вместе, прижав PDMS к покровному стеклу не менее чем на 30 секунд.
- Перед добавлением ячеек склеивайте устройства в автоклаве
.
2. Построение установки для оптической стимуляции
- Используя систему кубов с клеткой 30 мм, прикрепите дихроичное зеркало с длиной волны 573 нм в центре. Соедините красный светодиод с длиной волны 627 нм (светоизлучающий диод) с длинночастотным фильтром возбуждения 594 нм и прикрепите его к верхней стороне куба так, чтобы светодиод был обращен к зеркалу. Затем прикрепите синий светодиод с длиной волны 488 нм и короткочастотным фильтром возбуждения 546 нм к соседней стороне куба так, чтобы светодиод был обращен к зеркалу, как показано на схеме на рисунке 1A.
- Прикрепите ирисовую диафрагму с кольцевым приводом к нижней части куба клетки, чтобы контролировать размер освещаемой области.
- Питание каждого светодиода осуществляется с помощью светодиодного драйвера T-Cube и управления с помощью платы Arduino Uno Rev3. Подключите боковой вход светодиодного драйвера к вилке источника питания, подключите средний выход к Arduino и подключите боковой выход непосредственно к светодиодам.
- Подключите Arduino Uno к компьютеру с помощью USB-кабеля.
- Скачать файлы с GitHub можно по ссылке (https://github.com/ofvila/NMJ-function-analysis).
- Откройте файл "Optical_Stimulation_Ramp_Arduino.ino" из папки GitHub.
- Установите начальные параметры: Steps = 30; startFrequency = 0.5; endFrequency = 3; pulseLength = 100.
- Убедитесь, что выход контакта 4 назначен драйверу синего светодиода, а выход контакта 2 назначен драйверу красного светодиода. Убедитесь, что средние провода светодиодного драйвера подключены к земле и к соответствующему контактному выходу.
- Скомпилируйте и загрузите программу "Optical_Stimulation_Ramp_Arduino.ino" в Arduino.
- Подключите каждый светодиодный драйвер к соответствующему каналу.
3. Настройка клеточной культуры (день -21-0)
- Первичные клетки скелетных мышц
- Разморозьте и разморозьте первичные скелетные миобласты (полученные из миозита Кука) максимум на шесть пассажей с использованием миотонической питательной среды (+ добавка). Поддерживайте клетки в инкубаторе при температуре 37 °C и 5%CO2.
- Меняйте носители каждые 2 дня.
- Как только клетки соберутся примерно на 60%, пропустите их, используя 0,05% трипсин-ЭДТА (1x, в течение 5 минут при 37 °C). Соберите диссоциированные клетки и добавьте свежую среду для нейтрализации трипсина.
- Раскрутите клетки при давлении 300 x g и аспирируйте надосадочную жидкость над клеточной гранулой.
- Ресуспендируйте клетки с помощью MGM и затравите 1:3 по 60 мл в трехслойной колбе.
- ChR2-hiPSC
заметка: Все клеточные линии для этой работы были созданы и использованы в соответствии с институциональными рекомендациями Колумбийского университета, штат Нью-Йорк, США. В этом протоколе ChR2-экспрессирующие ИПСК были получены путем редактирования генома CRISPR-Cas9 с использованием ранее описанных методов18, но таким же образом могут быть использованы любые стабильные оптогенетические клеточные линии (лентивирусные, piggyBac и др.). Были выбраны конститутивные промоторы, экспрессируемые как в иПСК, так и в мотонейронах (КАГ). Было обнаружено, что клетки имеют здоровые кариотипы, как отмечалось в предыдущих публикациях.
- Покройте 6-луночные планшеты 1 мл на лунку растворенной матрицей базальной мембраны, разведенной в DMEM/F12 (1:80) и инкубируйте планшеты при комнатной температуре в течение 1 ч.
- Посев iPSCs на покрытые 6-луночные планшеты 2 мл среды для культивирования клеток без питательных веществ (iPSC medium), заменяя 2 мл среды через день и проходя каждые 5-7 дней. Поддерживайте клетки в инкубаторе при температуре 37°C и 5%CO2.
- Пассирование
- Диссоциируйте стволовые клетки, инкубируя их с 1 мл реагента для высвобождения стволовых клеток, не содержащего ферментов, в течение 4 минут и механически срезая их с помощью пипетки P1000 с широким наконечником.
- Затравочные клетки в соотношении 1:24 или 1:48 в среде iPSC с 2 мкМ дигидрохлорида Y-27632 в концентрации 2 мл/лунка на покрытые 6-луночные планшеты.
4. Посев скелетной мышечной ткани (день -3)
- Выделите и подсчитайте 30 x 106 миобластов с помощью автоматического счетчика клеток.
- Ресуспендируйте миобласты в соотношении 4:1 из 3 мг/мл коллагена I и солюбилизированной матрицы базальной мембраны (800 мкл коллагеновой смеси + 200 мкл матрицы базальной мембраны для достижения конечного объема 1 мл). В качестве коллагенового компонента добавьте сопутствующий нейтрализующий агент (смесь коллагена к нейтрализующему агенту 9:1) и разбавьте смесь 1x PBS для достижения объема 800 μл.
- Добавьте по 15 мкл суспензии клеточного коллагена в каждую мышечную камеру биореактора, распределив суспензию по обоим столбам с помощью наконечника пипетки (рис. 2).
- Дайте клеточно-гелевой смеси полимеризоваться при 37 °C в течение 30 минут, а затем заполните каждую лунку биореактора 450 μL миотонической питательной среды.
- Через 3 дня (после того как гель уплотнится) начните дифференцировку миотрубки.
5. Дифференцировка миотрубки (дни 0-14)
- Начните инфузию миотрубки с переключения тканей на 450 мкл среды, вызывающей слияние (FS, Таблица 1) в течение 7 дней, меняя среду через день.
заметка: Попробуйте начать дифференцировку миотрубков в тот же день, что и дифференцировку мотонейронов от ИПСК для того, чтобы засеять мотонейроны в конце графиков дифференцировки обоих типов клеток.
- На 7-й день смените среду на 450 мкл среды созревания Ia (MMIa, табл. 1).
- На 9-й день замените на 450 мкл среды созревания Ib (MMIb, табл. 1).
- На 11-й день смените носитель на 450 мкл NbActiv4. Продолжайте менять среду каждые 2 дня, пока мотонейроны не будут засеяны (Шаг 7).
6. Дифференциация мотонейронов (дни 0-14)
- В день 0 перенесите 4 x 106 ChR2-hiPSCs в чашку Петри со сверхнизким уровнем прикрепления с 15 мл питательной среды для суспензии мотонейрона (MSCM, Таблица 1). Дополните МСКМ 3 мкМ CHIR99021, 0,2 мкМ LDN193189, 40 мкМ SB431542 гидрата и 5 мкМ Y-27632 дигидрохлорида.
- На 2-й день изолируйте нейросферы (НС) с помощью обратимого сита с концентрацией 37 мкМ и повторно поместите в 15 мл МСКМ 3 мкМ CHIR99021, 0,2 мкМ LDN193189, 40 мкМ SB431542 гидрата и 0,1 мкМ ретиноевой кислоты. После 2-го дня НС должна быть видна в чашке Петри без использования микроскопа.
- На 4-й день перенесите клетки и среду в пробирку объемом 50 мл и дайте нейросферам осесть на дно (5 минут). Аспирируйте надосадочную жидкость и ресуспендируйте клетки в 15 мл МСКМ с добавлением 0,5 мкМ SAG, 0,2 мкМ LDN193189, 40 мкМ SB431541 и 0,1 мкМ ретиноевой кислоты.
- На 7-й день повторите шаг 6.3, но ресуспендируйте клетки в 15 мл МСКМ с добавлением 0,5 мкМ SAG и 0,1 мкМ ретиноевой кислоты.
- На 9-й день повторите Шаг 6.3, но ресуспендируйте клетки в 15 мл МСКМ с добавлением 10 мкМ DAPT.
- На 11-й день повторите шаг 6.3, но повторно суспендируйте клетки в 15 мл МСКМ с добавлением 20 нг/мл BDNF и 10 нг/мл GDNF.
- На 14-й день засейте мотонейроны в платформу.
7. Посев агрегатов мотонейронов в биореакторе (день 14)
- Приготовьте гелевую смесь 4:1 из 2 мг/мл коллагена I и Matrigel (800 μл коллагеновой смеси + 200 μL Matrigel для достижения конечного объема 1 мл). В качестве коллагенового компонента добавьте сопутствующий нейтрализующий агент (смесь коллагена к нейтрализующему агенту 9:1) и разбавьте смесь 1x PBS для достижения конечного объема 800 μл.
- С помощью клеточного фильтра с длиной волны 400 нм выберите крупные нейросферы и ресуспендируйте их в гелевой смеси.
- Отсасывайте среды из резервуара и осторожно из скважины нейросферы (рисунок 2).
- Добавьте 15 мкл гелевой смеси в канал нейросферы.
- Загрузите в пипетку объемом 10 мкл 10 мкл геля, а затем выберите одну нейросферу.
- Поместите NS в канал нейросферы и убедитесь, что NS находится в камере. Медленно поднимите пипетку, выпуская оставшийся гель после осаждения НС. Если вы не уверены, что NS был правильно нанесен, проверьте его местоположение с помощью микроскопа.
- Дайте гелю полимеризоваться в течение 30 минут при 37 °C.
- В резервуары добавьте 450 мкл NbActiv4 с добавлением 20 нг/мл BDNF и 10 нг/мл GDNF.
- Меняйте среду через день, чтобы обеспечить рост аксонов от NS к мышечной ткани.
8. Одновременная оптическая стимуляция и видеозапись функции NMJ (день 24+)
- Для визуализации используйте инвертированный флуоресцентный микроскоп с научной камерой комплементарного металл-оксид-полупроводник (sCMOS).
- Установите биннинг программного обеспечения камеры на 2x2, экспозицию на 20 мс, роллинг-шаттер вкл., скорость считывания на 540 МГц, динамический диапазон: 12-бит и усиление 1, и режим сенсора: перекрытие.
- Используйте 2-кратный объектив на микроскопе для визуализации микротканей.
- Прикрепите к предметному столику микроскопа камеру с живыми клетками (37 °C, 5%CO2).
- Выберите область интереса (ROI), которая содержит иннервированную ткань скелетных тканей, чтобы свести к минимуму размер файла и время обработки.
- Поместите длинночастотный эмиссионный фильтр с длиной волны 594 нм между образцом и объективом изображения, чтобы отфильтровать импульсы синего света от камеры.
- Поместите прямоугольную 4-луночную пластину, содержащую 4 биореактора (24 ткани), в камеру с живыми клетками.
- Нажмите «Просмотр в реальном времени». Центрируйте и сфокусируйте изображение с желаемой рентабельностью инвестиций.
- Загрузите пользовательский код макроса из папки GitHub (https://github.com/ofvila/NMJ-function-analysis) для управления положением рабочей области, платой Arduino и получением видео.
- Установите выходной фильм как day_tissue group_tissue name_experiment.nd2.
- Запустите код макроса с нужными координатами X,Y, установленными на рабочей области, и получите быстрый таймлапс с 1700 кадрами со скоростью 50 кадров/с.
- После визуализации замените носитель и верните образцы в инкубатор. Подождите не менее 24 часов между сеансами получения изображений, чтобы избежать усталости тканей.