Все эксперименты проводятся следующие протоколы утвержденные Институциональные уходу и использованию животных комитета в Колледже Уильяма и Мэри. Стадии развития, указанные в данном протоколе в соответствии с Nieuwkoop и Фабера 46.
1. Диссекция
- Разрешить среду клеточной культуры и Кальций Магний Бесплатные Средний (CMF), чтобы уравновесить до комнатной температуры. Вам также понадобится 0,1 X Марка изменения Рингера (MMR) рН 7.4-7.6.
- Стерилизовать следующих пунктов путем применения ультрафиолетового света в течение 30 мин в ламинарный поток клетку капот культуры. (Спрей каждого пункта с 70% этанола до размещения в капюшоне.)
- 35 мм пластиковых чашках Петри.
- 60 мм пластиковые чашки Петри.
- 35 мм блюд поверхности Nunclon.
- Пробирки на 1,5 мл микроцентрифуге.
- p1000 микропипетки (1.000 мкл пипетки).
- Аэрозоль устойчивы p1000 советы (1.000 мкл аэрозоля микропипетки устойчивы советов).
- Алкогольустойчивыми пера.
- Изобразительное диссекции.
- * 15 мл конические пробирки (только для визуализации активности кальция).
- * Только для визуализации кальция деятельности.
- Как только капот УФ стерилизовать и решения имеют доведены до комнатной температуры, включите ламинарного потока воздуха в капюшоне, спрей вниз перчатки и средства массовой информации бутылками с 70% этанола и место средств массовой информации бутылок в капюшоне.
- Внутри капота подготовить следующие с p1000 микропипетки для каждой пластине клеток, обеспечение соответствующей маркировки.
- Один 60 мм пластиковые чашки Петри, содержащую 10 мл клеточной культуры Medium - Dissection плиты.
- Один 35 мм поверхности посуды Nunclon, содержащий 2 мл клеточной культуры Medium - Культура плиты. (Посуда пластиковая Nunclon в дальнейшем не рассматриваются с любыми клеями.)
- Одна пустая 1,5 мл микроцентрифужных трубы эксплантов Диссоциация Tube.
- * Один 15 мл коническую соколпробирку, содержащую 15 мл клеточной культуры Medium. Для вымывания избыточного Fluo4-AM, когда изображение кальция деятельности.
- Внутри капот, подготовить следующие с p1000 микропипетки для каждого рассечения сессии (более одного сетчатки можно разрезать за один сеанс).
- Один 35 мм пластиковые чашки Петри, содержащие 2 мл CMF - эксплантов Промыть пластины.
- Один 35 мм пластиковые чашки Петри, содержащие 2 мл CMF - эксплантов Диссоциация плиты.
- Вне капотом подготовить следующие:
- Один 60 мм пластиковые чашки Петри на пластину клеток, содержащих 10 мл 0,1 X MMR - Проведение плиты.
- Один 60 мм пластиковые чашки Петри на пластину клеток, содержащих 10 мл 0,1 X MMR - братьев и сестер плиты.
- Один 60 мм пластиковые чашки Петри на вскрытие сессии, содержащий 10 мл 0,1 X MMR + 0,5 мг / мл MS-222 (Tricaine) - обезболивание плиты.
- Добавить 40 мкл 5% трипсина в CMF к пластине эксплантов диссоциации (в результате 0,1% раствора трипсина), вихрем перемешать и отставить в сторону.
- Если рассечение эмбриона, который моложе этапе 30, добавить 10 мг коллагеназы B к Dissection плиты (в результате 1 мг / мл раствора коллагеназы B), водоворот, чтобы растворить и отложите в сторону.
- Выберите эмбриона нужного этапа, переход к крепежной пластины с нестерильных передачи пипетки, и удалить желточной оболочки (если эмбрион еще не вылупились) с использованием тонких щипцов.
- Передача нескольких одинаково постановке эмбрионов Sibling Тарелка с нестерильных передачи пипетки.
- Если эмбрион стадии 25 или ранее, перейдем непосредственно с рассечением, в противном случае передать эмбрион обезболивания Тарелка с нестерильных передачи пипетки и позволяют эмбриона сидеть до движение и ответ на раздражители прекращается. Это может занятьс точностью до минуты.
- Продолжайте диссекцию (рис. 2) под рассекает область (4X цели, 10X окуляров).
Для стадии эмбриона 25 или моложе:
- Перенос эмбрионов в Dissection Тарелка с нестерильных передачи пипетки.
- Использование двух пар тонких щипцов, чтобы midsagittal разреза на брюшной стороне зародыша, начиная с заднего конца и вплоть до цемента железы в передней части зародыша.
- Аккуратно откройте эмбриона, держа Ваш края разреза и распространение влево и вправо. В результате эмбрион с спинной стороне, обращенной в Dissection плиты, и с вентральной эктодермы распространять, открывая энтодермы и мезодермы внутрь.
- Начните снимать энтодермы и мезодермы (рис. 2А и 2В). Первый и самый большой слой этой ткани очень "пушистые" по внешнему виду скрупные клетки и мало очевидных организации.
- После удаления этого слоя, сомитов и хорды станет видимым. Для лучшего контраста, переместить эмбриона в отдельный 60 мм пластиковые чашки Петри, содержащую 10 мл клеточной среде Культура и 100 мкл 1% раствора сульфата нильского голубого (в воде) в течение 2-3 мин до передачи обратно в Dissection плиты. Это пятно эктодермы, сомитов, а хорды для облегчения идентификации и ориентации.
- Ориентируясь на передней части эмбриона, осторожно удалите хорды и мезодермы оставшиеся подвергая мозг и глазные пузыри (рис. 2С).
- Как только мозг и глазные пузыри полностью разоблачена, используйте щипцы, чтобы разорвать нервной трубки и основного эктодермы только позади мозга.
- Включите эту часть (мозг и глазные пузыри) над тем, что эктодерма находится на вершине.
- Забота, чтобы не повредить основные оптические пузырьки, вновь тщательнопереместить эктодермы (рис. 2D).
- Наконец, с помощью пинцета, отделить глазные пузыри от мозга (рис. 2D и 2E).
Для эмбрионами старше этап 25:
- В то время как эмбрион в анестезии плиты, удалите брюшной части эмбриона с пинцета.
- Для лучшего контраста, переместить эмбриона 60 мм пластиковые чашки Петри, содержащую 10 мл 0,1 X MMR и 100 мкл 1% сульфат нильского голубого в течение 2-3 мин до передачи в Dissection плиты. Это пятно эктодермы синий.
- После того как в Dissection плиты, отступить эктодермы вышележащих сетчатки (или глазной пузырь для эмбрионов на стадии 26-30) (рис. 2F и 2G). Если Нил синий сульфат был использован, эктодермы будет окрашен в голубой цвет, но основной ткани сетчатки не будет.
- Удалить сетчатки или зрительного пузырька тщательно лrceps (рис. 2Н, 2I и 2J). Это полезно для хранения эмбриона в месте с одной парой щипцов и удаления сетчатки или зрительного пузырька с другом.
2. Диссоциации тканей и клеток Покрытие
Важное примечание - При передаче тканей, не позволяют сетчатки или зрительного пузырька коснуться любого воздушно-жидкостной границы, если это происходит, клетки лизируются.
- После глазной пузырь или сетчатки были расчленены, аккуратно перенести на эксплантов Промыть пластины с p100 микропипетки использованием аэрозолей устойчивы советы и позволить сидеть в течение 30 сек.
- Передача 80 мкл 0,1% трипсина в CMF из эксплантов плиты Диссоциация к трубе эксплантов диссоциации.
- С помощью микропипетки p100 и аэрозольного устойчивы советов, передает сетчатка или зрительный пузырек из эксплантов Промыть пластины в эксплантов Dissociatiна трубы, избегая передачи эксплантов промыть раствором.
- Дайте ткани диссоциировать в метро эксплантов Диссоциация в течение 1 часа при комнатной температуре. Один сетчатки был использован на пластину, однако отметим, что можно использовать более одного пластины при желании увеличить количество клеток на чашку.
- Для пластины клетки, сначала медленно удалить 40 мкл раствора от станции метро эксплантов диссоциации и выбросить помощью микропипетки p100 и аэрозольного устойчивы советы. Использование p100 набор до 40 мкл и аэрозолей устойчивы советов, передает клеток (теперь, когда ткань имеет диссоциированных) к культуре плиты. При аспирации клеток на тарелку, пипетка медленно и удерживает клетки на небольшой площади в центре пластины.
Примечание: Если несколько изображений клеток, которые должны быть приняты в течение всего эксперимента, прикрепить сетку (Cellattice) к нижней плиты культуры с небольшой каплей суперклея. Это позволит изображениями одинаковых клеток в одинаковой ориентации должны быть приняты в различных точках в порядке.
- Разрешить клетки, чтобы сидеть спокойно, по крайней мере 1 час присоединиться к Nunclon пластины. По истечении этого времени, они должны относиться очень осторожно, или они могли оторваться.
- Культуры клеток к желаемой стадии, наблюдая за братом эмбрионов, которые выращиваются при той же температуре, как клетки. Если живые клетки, которые не используются для дальнейших манипуляций, они могут быть зафиксировано в решении MEMFA в это время.
Важное примечание: Большинство наших экспериментов фиксируются в течение 6 ч посеве клеток. Продолжительность жизни клеток в культуре зависит от стадии, на которой ткань была расчленена и количество желтка еще присутствует в клетках, клетки расчлененный от младшего (нейрулы этапов) оставаться здоровым в культуре в течение 5-6 дней, в то время как клетки, приобретенные у старший эмбрионов (плавание головастиковэтапов) будет оставаться жизнеспособными в культуре в течение 2-3 дней.
3. Кальций изображений 47-49
Этот протокол используется кальций-чувствительных Fluo4-AM и конфокальной микроскопии в количественном кальция переходные процессы в отдельных клетках. Все шаги, используя Fluo4-AM должна быть выполнена в защищенном от света, как Fluo4-AM является чувствительной к свету. Все промывки должны быть добавлены или удалены с помощью p1000 микропипетки и аэрозолей устойчивые советы. Пипетирование должно быть сделано медленно и к краю пластины, чтобы избежать нарушения клеток. СМИ не изменилось, потому что культурах, как правило, установлен в течение 6 часов, чтобы быть расчленены. Для более долгосрочных культуры, средств массовой информации следует менять ежедневно.
- Fluo4-AM хранится при температуре -20 ° C, и мы предлагаем хранении в 5 мкл аликвоты. Перед использованием таять 5 мкл аликвоты Fluo4-AM вдали от света и добавить 2 мкл Pluronic F-127 для этого аликвоты.
- После культивирования клеток в течение необходимого количества времени (по крайней мере,1 час), удалите 1 мл среды культуры клеток из культуры плиты. Добавьте к этому Fluo4-AM и Pluronic, смешивая осторожным пипетированием.
- Медленно перенести все это решение обратно к краю плиты культуры клеток для включения в образ и оставлять клеток в этом растворе в покое на 1 час, чтобы поглотить Fluo4-AM.
- Чтобы вымыть лишний Fluo4-АМ из среды культуры клеток, выполните следующие серии стирки:
- Удалить 1 мл среды от пластины.
- Добавьте 3 мл свежей среды культуры клеток (от 15 мл коническую трубку) к плите.
- Выполните два дополнительных моет, каждый раз, медленно удаляя 3 мл раствора из пластин и добавлением 3 мл свежей среды для культивирования клеток.
- Клетки должны теперь быть в 4 мл клеточной культуральной среде и содержат Fluo4-AM. Fluo4-AM ферментативно расщепляют раз внутри клетки, не давая ему диффундирующего из клетки или в любой мембраносвязанных отсеков.
- Перед загрузкой пластин на сцену конфокальной микроскопии для визуализации, проведите вертикальную красную линию с постоянным маркером на блюде, держа крышку, чтобы предотвратить маркер частицы загрязняющих культуры. Вертикальная линия вниз стороне чашки Петри (основание чашки Петри, а не на крышке). Его целью является, чтобы указать ориентацию культуры пластины по отношению к полю зрения, так что точной ориентации и выравнивание отдельных клеток может быть восстановлен на более позднем этапе.
- Пластина готова к загрузке на этапе конфокальной микроскопии для визуализации. Визуализация клеток с использованием ярких параметры поля на лазерной сканирующей конфокальной микроскопии (цель 20X). Найти площадь плотных клеток, которые не содержат сгустки, желательно с поля зрения, которая содержит большое количество сетки на покровное Cellatice, чтобы найти то же самое поле зрения легче позже, когда изображение культуру после того, как в сиТу гибридизации. До изображений, сосредоточиться вниз по культуре и принять яркое изображение поля сетки ниже клетки для записи местоположения и ориентации культуры клеток. Это позволяет перестройки клеток для последующего анализа.
- Поднимите фокальной плоскости и захватить яркое поле изображения клеток до начала кальция изображения (рис. 3А).
- Как только центр плоскости клетки находится в фокусе, плита готова для работы с изображениями кальция деятельности. Настройки будут меняться в зависимости от микроскопа и приложения. Мы изображений клеток с использованием аргона 488 нм лазер для 1, 2, или 12 часов со следующими параметрами:
- 1 час изображения:
- Argon 488 нм лазер сканирует на 4% своей максимальной мощности 30 мВт.
- Сканирование раз в 4 сек (900 сканирований в час).
- 2 часа изображений:
- Argon 488 нм лазер сканирует на 4% своей максимальной мощности 30 мВт.
- Сканирование раз8 сек (450 сканирований в час).
- 12 ч. изображения:
- Argon 488 нм лазер сканирует на уровне 2% от максимальной мощности 30 мВт.
- Сканирование раз в 48 сек (75 сканирований в час).
Эти параметры будут приводить в набор из 900 фотографий кадр для каждого периода времени. Кальций деятельности могут быть записаны путем анализа флуоресценции уровней за время курса изображения (рис. 3В) с использованием приложений обработки изображений, такие как ImageJ 50.
4. Фиксация клеток
- После обработки изображений, клетки могут быть исправлены в течение 30 минут, удаляя 3 мл раствора из пластин и добавлением 1 мл 2X MEMFA на оставшиеся 1 мл культуральной среды.
- После фиксации удалить MEMFA и обезвоживает клетки с серии 5 минут моет, каждый объемом 1 мл:
- 25% этанола в 1X фосфатным буферным раствором (PBS).
- 50% этанола в 1X PBS.
- 75% этанола в SDD H 2 O (стерильной деионизированной дистиллированной воды).
- Заменить последний мыть с 1 мл 100% этанола и хранят пластины при температуре -20 ° C.
Примечание: Метанол может также использоваться для этих моет и для хранения.
5. Флуоресцентный в гибридизация (FISH)
Культуры могут быть проанализированы, используя стандартный протокол рыбы Xenopus, как описано 51 с модификациями для культуры клеток, как это изложено Андерсон Лаборатория 52. Изменения в Anderson Лаборатории протокола, перечислены ниже. Все промывки проводятся на 35-мм пластин Nunclon в объеме примерно 1 мл, если не указано иное. Решения, как определено в Sive и др. 53. Если не указано иное.
Важное замечание: не используйте флуоресцеина-меченных РНК-зондов при выполнении в гибридизация на клетки, отображаемого накальция деятельности. Anti-флуоресцеина антитела будут связываться с остаточным Fluo4-AM в клетках и может привести к позитивным сигналом для всех клеток в культуре.
День 1: пермеабилизации и гибридизация
- Регидратация моет должно быть этапным для обезвоживания растворителя, используемого для хранения. Для наших экспериментов, моет были отнесены к этанолу в 1X PBS.
- После регидратации, мыть клетки еще три раза в 1X PBS в течение 5 мин каждый при комнатной температуре.
- Смешайте 25 мл 0,1 М триэтаноламина (рН 8,0) с 62,5 мкл уксусного ангидрида в трубке Сокол и быстро перемешать до полного рассеяны, как описано в Anderson Лаборатория 52 протоколов. Инкубируют культуры в этой смеси в течение 10 мин при комнатной температуре. После уксусного ангидрида лечения, мыть клетки 1X солевой цитрат натрия (SSC) в течение 5 мин при комнатной температуре.
- Удалить последней промывки SSC и заменить 0,2 М HCl (в SDD H 2 O) в течение 10 мин до permeabilize клеток.
- Промойте HCl с двумя промывками в 1X PBS в течение 5 мин.
- Prehybridize в ISH буфера при 60 ° C в дрожащей водяной бане в течение как минимум 6 часов, но не prehybridize ночь, так как это сильно уменьшает сигнал.
- Гибридизации в течение ночи при 60 ° С в течение 8-14 ч в 750 мкл разведенного зонда (1:250 разведение от зонда очищенный). Очищенный диапазоне концентраций от зонда 1.0-1.5 мкг / мкл.
День 2: Удаление зонда Unbound и антител Инкубационный
- Снимите датчик и промыть культур в течение 5 мин в 0,2 X SSC при 60 ° C. Стирать в свежих 0.2X SSC в течение 1 часа при 60 ° C.
- Удалить культур из водяной бани и дать им возможность адаптироваться к комнатной температуре в течение 5 мин.
- Промыть в 0.2X SSC при комнатной температуре в течение 5 мин.
- Промойте в течение 15 мин в 1X PBS с 0,1% Triton-X-100 (PBT).
- Для инактивации эндогенной пероксидазы, мыться в течение 1 ч в 2% H 2 O 2 решения в PBT.
- Промыть 15 мин стирка в 1X Трис буферном растворе с 0,1% Tween 20 (TBST).
- Блок в 2% блокирующий реагент в Малеиновый буфера кислота (МАБ) в течение 1 часа при комнатной температуре. Мы обнаружили, что этот метод блокирования увеличивает чувствительность по сравнению с предыдущими методами блокировки в 20% овечьей сыворотки в PBT.
- Инкубируют культуры в 1 мл 2% блокирующий реагент в МАБ содержащие 1:1000 разведение POD-конъюгированных антител в течение ночи при 4 ° C.
День 3: Удаление несвязанных антител и флуоресцентного развития
- Удалите раствор антител и промыть 3 раза в TBST в течение 5 мин при комнатной температуре.
- Промойте 4 раза в TBST в течение 15 мин при комнатной температуре непрерывно качалки на медленной скорости.
- Мыть два раза в PBT при комнатной температуре в течение 10 мин.
- Применить 750 мкл 1:200 флуоресцеином tyramide или 1:25 Cy3 tyramide разводят в PBT. Выдержите в течение 5 мин при комнатной температуре и добавляют 2,5 мкл 0,3% H 2 O 2. Рок в течение 40 мин, чтобы сигнал развиваться.
- Мойте по крайней мере 4 раза в течение 15 минут в каждом из TBST при комнатной температуре с качалки.
- Как только сигнал полностью разработана, мыться в течение 5 мин в 1X PBT.
- Исправить в 1X MEMFA в течение 1 часа при комнатной температуре и хранят в 1X PBS при 4 ° C.
6. Изображение FISH результаты и сотрудничеству регистрации данных кальция изображений
- После завершения рыбы, тарелки культуре клеток загружаются чтобы определить, какие клетки отображения положительный сигнал флуоресценции для данного датчика. Используйте Cellattice покровное, чтобы найти точное поле зрения изучались в процессе кальция изображений и выравнивания пластин с ориентацией рамки кальция изображения.
- Фокус в центре плоскости клетки и принять одно высокое разрешение изображения с помощью гелий-неоновый гелий-неоновый лазер 543 нм при 15% от максимальной мощности 1 мВт (рис. 3).
- В оригинале 900 кадров набор изображений, полученных из протокола изображений кальция,идентифицировать отдельные клетки регионах, представляющих интерес (РИ) с помощью программы обработки изображений (такие, как ImageJ 50). Извлечение ROI флуоресценции данных в виде набора точек данных, представляющих времени флуоресценции пары значений (рис. 4).
- Наложение изображений FISH результаты с выявленными трансформирования из кальция изображения (рис. 3D).
- Регистрация каждого ROI как положительную для зонда, негативный для зонда, или неизвестные - в случае, если ячейку, соответствующую рентабельность не может быть найдено в поле зрения рыбы изображения.
- Процесс ROI флуоресценции данных с использованием статистических сценарии анализа (как она была задумана через MATLAB или других языков программирования), чтобы сравнить уровни кальция деятельности среди различных расчлененных этапов (рис. 5А и 5С) или клеток, позитивных для различных зондов FISH (рис. 5В и 5D). Все скрипты, используемые в нашей лаборатории находятся в свободном доступе по запросу.