Method Article

Cryosectioning дрожжи Сообщества для экспертизы флуоресценции Patterns

DOI:

10.3791/50101

December 26th, 2012

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Мы представляем протокол для замораживания и cryosectioning дрожжей общин соблюдать внутренние модели флуоресцентные клетки. Метод основан на фиксации метанолом и октябре-вложение сохранить пространственное распределение клеток без инактивации флуоресцентных белков внутри сообщества.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Микробы, как правило, живут в общинах. Пространственной организации клеток внутри сообщества, как полагают, влияют на выживание и функционирование сообщества 1. Оптические методы секционирования, в том числе конфокальной и двухфотонной микроскопии, доказали свою полезность для наблюдения пространственной организации бактерий и архей общинами 2,3. Сочетание конфокальной микроскопии и физического срезов дрожжевых колоний показало, внутренней организации клеток 4. Тем не менее, прямых оптических срезов с помощью конфокальной или двух-фотонного микроскопа были только способны достигать нескольких слоев клеток дрожжей в глубь колонии. Это ограничение, скорее всего, из-за сильного рассеяния света из дрожжевых клеток 4.

Здесь мы представляем метод, основанный на установлении и cryosectioning получить пространственное распределение флуоресцентных клеток внутри общины Saccharomyces CEREVISIAE. Мы используем метанол в качестве закрепителясохранить пространственное распределение клеток. Исправлена ​​общины проникли с октября соединение, замороженные и cryosectioned в криостат. Флуоресценции из разделов раскрывает внутреннюю организацию флуоресцентные клетки внутри сообщества.

Примеры дрожжей общины, состоящей из штаммов выразив красного и зеленого флуоресцентного белка продемонстрировать потенциал cryosectioning метод выявления пространственного распределения флуоресцентные клетки, а также, что экспрессии генов в дрожжевых колоний 2,3. Хотя наш акцент был сделан на общины Saccharomyces CEREVISIAE тот же метод потенциально может быть применен для изучения других микробных сообществ.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Крепление дрожжи Сообщества

  1. Рост дрожжей сообщества на мембранный фильтр (например, Millipore MF мембранный фильтр; рис. 2А). Этот протокол соответствует типичным сообщество менее 2х10 8 ячеек на 6 мм в диаметре мембранный фильтр.
  2. Используйте кусок ватмана 541 фильтровальной бумаги, чтобы покрыть дно 1 см диаметра скважины (рис. 2В). Это ватмана будет использоваться в качестве носителя для передачи сообщества на более поздних стадиях. Добавить 1 мл на 100% метанола в скважины, и оставить хорошо в -20 ° C для температуры, чтобы уравновесить.
  3. Положите жидкий N 2 в сосуд Д....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Флуоресцентные изображения вертикального сечения дрожжей общин содержащие красный и зеленый, помеченные конкурентной населения 6 показаны на рисунке 3. Эти общины состоят из двух прототрофный штаммов дрожжей и их конкуренции за общие ресурсы, в том числе пространстве, приводит к столбчатым моделей 7, как показано на их вертикальных сечений. Резолюции вниз на одну ячейку может быть решен в поперечном сечении. Рисунок 3 сравнивает сечения повторных общин, полученные .......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Процедура представленные здесь предлагается способ проверить внутреннюю структуру дрожжей общин. Шаг метанола крепления делает дрожжей колонии жесткого 8 и сохраняет целостность колонии, однако, это также приводит к усадке 8, которые должны быть приняты во внимание при интерпретации результатов. Как правило, мы видим около 30% усадки в высоту колонии дрожжей, по сравнению с колониями непосредственно встроенные в октябре без фиксации 9.

Чтобы избежать усадки, .......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Нет конфликта интересов объявлены.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Мы хотели бы поблагодарить Jonathan Cooper лаборатории на Фреда Хатчинсона онкологический научный центр на разрешение использовать их криостата. Эта работа была поддержана NIH и WM Keck Foundation. BM является членом Гордона и Бетти Мур жизни Фонда исследований науки. Мы благодарны Daniel Gottschling для обмена его крепления протокол с нами.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Название реагента Компания Номер в каталоге Комментарии (по желанию)
100% метанола JT Baker 9070-01
Tissue-Tek октября соединение Andwin Научные 4583
Ватман Grade № 541 Количественные фильтровальной бумаги Ватман 1541-047
Millipore-MF мембранных фильтров Millipore HAWP04700
Криостат Leica CM 1510 S

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Tolker-Nielsen, T., Molin, S. Spatial Organization of Microbial Biofilm Communities. Microbial Ecology. 40 (2), 75-84 (2000).
  2. Moller, S., et al. In Situ Gene Expression in Mixed-Culture Biofilms: Evidence of Metabolic Inter....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Cryosectioning Yeast CommunitiesFluorescence ImagingSpatial DistributionMethanol FixingOCT EmbeddingFluorescent ProteinsYeast ColoniesFluorescence MicroscopyCommunity SectioningFluorescent Signal

Related Articles