Стабильные микроРНК присутствуют во всех жидкостях организма, и некоторые циркулирующие микроРНК защищены от деградации путем секвестрации в небольших везикулах, называемых экзосомами. Экзосомы могут сливаться с плазматической мембраной, что приводит к переносу РНК и белков в клетку-мишень. Их биологические функции включают иммунный ответ, презентацию антигена и внутриклеточную коммуникацию. Доставка микроРНК, которые могут регулировать экспрессию генов в клетках-реципиентах через кровь, открыла новые возможности для целевого вмешательства. В дополнение к предложению стратегии доставки лекарств или терапевтических агентов РНК, экзосомное содержимое может служить биомаркерами, которые могут помочь в диагностике, определении вариантов лечения и прогноза.
Здесь мы опишем процедуру количественного анализа микроРНК и матричных РНК (мРНК) из экзосом, секретируемых в крови и средах клеточных культур. Очищенные экзосомы будут охарактеризованы с помощью вестерн-блоттинга на экзосомальные маркеры и ПЦР на мРНК, представляющие интерес. Для валидации экзосомальной морфологии и целостности будут использоваться просвечивающая электронная микроскопия (ПЭМ) и мечение иммунозолотом. Общая РНК будет очищена из этих экзосом, чтобы мы могли изучать как мРНК, так и микроРНК из одного и того же образца. После проверки целостности РНК с помощью биоанализатора мы проведем количественную ПЦР в реальном времени (qPCR) со средней пропускной способностью для идентификации экзосомальной микроРНК с использованием карт Taqman Low Density Array (TLDA) и исследований экспрессии генов для интересующих нас транскриптов.
Эти протоколы могут быть использованы для количественной оценки изменений экзосомальных микроРНК у пациентов, моделей грызунов и сред клеточных культур до и после фармакологического вмешательства. Экзосомное содержимое варьируется в зависимости от источника происхождения и физиологических условий клеток, которые секретируют экзосомы. Эти вариации могут дать представление о том, как клетки и системы справляются со стрессом или физиологическими возмущениями. Наши репрезентативные данные показывают вариации микроРНК, присутствующих в экзосомах, выделенных из крови мыши, крови человека и питательных сред для клеточных культур человека.
Здесь мы опишем процедуру количественного анализа микроРНК и матричных РНК (мРНК) из экзосом, секретируемых в крови и средах клеточных культур. Очищенные экзосомы будут охарактеризованы с помощью вестерн-блоттинга на экзосомальные маркеры и ПЦР на мРНК, представляющие интерес. Для валидации экзосомальной морфологии и целостности будут использоваться просвечивающая электронная микроскопия (ПЭМ) и мечение иммунозолотом. Общая РНК будет очищена из этих экзосом, чтобы мы могли изучать как мРНК, так и микроРНК из одного и того же образца. После проверки целостности РНК с помощью биоанализатора мы проведем количественную ПЦР в реальном времени (qPCR) со средней пропускной способностью для идентификации экзосомальной микроРНК с использованием карт Taqman Low Density Array (TLDA) и исследований экспрессии генов для интересующих нас транскриптов.
Эти протоколы могут быть использованы для количественной оценки изменений экзосомальных микроРНК у пациентов, моделей грызунов и сред клеточных культур до и после фармакологического вмешательства. Экзосомное содержимое варьируется в зависимости от источника происхождения и физиологических условий клеток, которые секретируют экзосомы. Эти вариации могут дать представление о том, как клетки и системы справляются со стрессом или физиологическими возмущениями. Наши репрезентативные данные показывают вариации микроРНК, присутствующих в экзосомах, выделенных из крови мыши, крови человека и питательных сред для клеточных культур человека