"Freeze-трещин," метод подвергая внутренние ткани нематод C. Элеганс к антител для локализации белка, демонстрируется.
Методическая статья
"Freeze-трещин," метод подвергая внутренние ткани нематод C. Элеганс к антител для локализации белка, демонстрируется.
Чтобы окрасить C. Элеганс с антителами, относительно непроницаемой кутикулы должны быть обойдены с помощью химических или механических методов. "Заморозить взлома" является одним из методов, используемое для физического тянуть кутикулу от нематод путем сжатия нематоды между двумя прикрепленных горками, замораживая их, и потянув слайды друг от друга. Freeze-крекинга обеспечивает простой и быстрый способ получить доступ к тканям без химической обработки и могут быть использованы с различными фиксаторов. Однако, это приводит к потере многих образцов и требуемое сжатие механически искажает образец. Практика требуется, чтобы максимизировать восстановление образцов с хорошей морфологией. Freeze-крекинг могут быть оптимизированы для конкретных условий фиксации, сбора проб или низкой неспецифической окрашивания, но не по всем параметрам сразу. Для антител, которые требуют очень жестких условий фиксации и терпеть химических обработок, необходимых для химически проницаемыми кутикулу, ЛЕЧЕНИИможет быть предпочтительным т интактных нематод в растворе. Если антитело требует более легкий исправление или, если оптимальные условия фиксации неизвестны, сублимационной крекинг обеспечивает очень полезный способ быстро анализе антитело и может дать определенную внутриклеточную и клеточный информации для локализации представляющим интерес антигеном.
Для определения клеточного и внутриклеточную локализацию белков, ученые традиционно помечены ткани с антителами, выбранными специфически распознавать специфические белки 1. В некоторых модельных организмов, таких как C. Элеганс, окрашивание антител часто заменяется молекулярно-генетических методов, которые быстрее дают результаты. Они включают трансформирующие организмов с конструкциями, состоящими из гена слияния между промотором и кодирования областей интересующего гена и зеленый флуоресцентный белок. Тем не менее, молекулярные методы с учетом ряда артефактов, в том числе проблем с зная истинного промотор и изменения в экспрессии конструктов на большого числа копий (обычные методы в C. Элеганс) 2,3. Поэтому окрашивание с антителами остается целью для многих ученых, изучающих функцию белка в естественных условиях.
Окрашивание ткани с антителами может быть трудно, посколькуtibodies может признать только их антиген в определенной конформации 1. Например, антитела могут распознавать только денатурированный или интактный антиген фиксированный в определенном направлении и не может распознавать антиген на месте. Проблема окрашивания антител у нематод усугубляется тем, что кутикула нематод образует относительно непроницаемый барьер, блокируя доступ антител к тканям.
Есть несколько различных методов, используемых для окрашивания антител в С. Элеганс (отзывы в нашей предыдущей работе 4). Чтобы окрасить нетронутыми "червей," методы были разработаны, чтобы заморозить и разморозить в относительно жестком фиксатором (формальдегида или глутаральдегида); циклы замораживания-оттаивания помочь взломать кутикулу, чтобы позволить быстрое проникновение закрепляющего 5. После фиксации кутикула был проницаемыми, чтобы позволить проникновение антитела; методы включали лечение с восстанавливающими агентами, коллагеназы, или обоих 5-7. Эти тreatments сохранились морфологию, но часто сводится или уничтожены признание антител. Альтернативные методы включают рассечение 8, чтобы позволить проникновение антител.
"Заморозить взлома" является одним из способов получить доступ к внутренней части полу-нетронутыми червя, чтобы антитела окрашивания 9-10. Freeze-крекинг может быть выполнена с различными условий фиксации, избегая при этом коллагеназы и сокращению процедуры. Нематоды помещают между двумя клеев слайдов, замораживают, а затем скользит разделены, в результате чего большую часть нематод на нижней стекло и большую часть кутикулы на верхнем слайде. В нижней слайд могут быть помещены в фиксаторе и весь слайд с прилипших нематод передается с помощью процедуры окрашивания антителом. Метод действительно представляет две основные трудности. Во-первых, это трудно применить правильное количество давления, необходимого, чтобы разделить нематод без серьезного деформируя их. Во-вторых, многие из червей не будет сотметка о любом слайде, и будут потеряны в фиксатора или полосканий. Тем не менее, с соответствующими слайдами и практике метод быстро дает нематод с достаточной морфологии который может быть использован с широким спектром фиксаторов и антител.
Способ может быть изменена незначительно, в зависимости от цели экспериментатора. Если окрашивание отдельных нематод нужен (например, чтобы определить, был ли изменен один трансформант окрашивание антител), а затем скользит с максимальной адгезии (но выше фона окрашивание) может быть использована, например, в лабораторных подготовлен слайдов с дополнительной полилизина (см. ниже). Для формальдегида или глутаральдегида фиксации, более высокие горки адгезии (лабораторные подготовлены Полилизиновые слайды) следует использовать, так как нематоды придерживаться более плохо с полилизином после этих записей. Если нематоды дикого типа в настоящее время фиксировали метанолом и / или ацетоном, затем слайды с низкой адгезией и ниже окрашивание фона следует использовать (коммерческая или лaboratory подготовлены слайды). Если разнообразие антител и фиксаторов используются в лаборатории, выбор слайдов могут быть получены заранее и хранить до необходимости.
После доступ к нематоде ткани был накоплен, процедуры окрашивания антител следовать стандартные методы (с более длинными инкубации, характерных для тканей, а не клеток 1,11).
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
ПРИМЕЧАНИЕ: Несколько шагов протокола представлены варианты настройки и подготовки в зависимости от конкретных условий эксперимента. Для этих случаев альтернативные шаги представлены в виде A, B, C и т.д. Протокол с альтернативными шагами изложен на рисунке 1.
1. Подготовка Polylysine покрытием Слайды
Три различных типа слайдов могут быть использованы, в зависимости от желаемого компромисса между легкостью подготовки, относительной адгезии и неспецифическое связывание антитела. Информация о подготовке альтернатив скольжения приведены ниже на стадиях 1А-1С в порядке возрастания адгезии и сложности. Слайды подготовленные этих различных методов могут быть использованы вместе для одного эксперимента.
1А. Нет подготовка слайд
Коммерчески доступные Полилизиновые покрытием слайды обеспечить низкую адгезию и низкий фон.
1B. Презентация пр.Оптимальная eparation для метанола и ацетона фиксации
Средний адгезия и низкий фон.
1С. Слайд оптимум подготовка к формальдегида фиксации
Высокая адгезия, но высокий фон.
2. Подготовка ледяной нематоды Слайды
Подготовка нематод для окрашивания, полностью промывки от бактерий, использующих метод 2А (для пластин нематод) или2B (для индивидуальных нематод).
2А. Подготовка слайдов из пластин нематод
2B. Подготовка слайдов отдельных нематод
3. Фиксация
Фиксаторы необходимы 'установить' антигена на месте в камере, либо посредством осаждения ("свет фиксации") или сшивающего ("жесткой фиксации") антиген. Фиксация может нарушить антигенностью; наиболее известные антитела лучше всего работают с определенным условиям фиксации. Для новых антител, ряд условий фиксации должны быть проверены.
Для любого фиксации, первый шаг должен сделать фосфата буферного физиологического раствора. Следующая исправить слайды с нематод для окрашивания антител с использованием метода А (светаисправить, используя метанол и ацетон) или B (труднее исправить с помощью формальдегида или глутаральдегида).
3А. Свет исправить, используя метанол-ацетон
3B. Жесткий исправить с помощью формальдегида или глутаральдегида
4. Антитела Окрашивание
Протокол окрашивания антител аналогичен стандартным протоколам для любой ткани на слайдах. Этот протокол является одинаковым для всех слайдов, независимо от препарата на этапах 1-3.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Когда черви правильно сжатый, трещины, и слегка фиксированной, практически весь червь может быть доступным для окрашивания антител (см. рисунок 2). Расположение ядер, как показано окрашивание DAPI указывает, какие части червя целы Когда черви подвергают более жесткой фиксатора, такого как формальдегид, морфология червя может быть искажено (как видно на неестественно волнистой появления Мышцы на фиг.3А-D). Другой распространенной проблемой является неравномерное фиксация или проникновени...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Протокол замораживания взлома является одним из нескольких методов окрашивания антител в С. Элеганс. Это обеспечивает относительно простой способ окрасить червей, но требует специфических реагентов и практики для достижения оптимальных результатов. Критические шаги (изложенные на рисунке 1) включают в себя: 1) подготовка слайд (см. шаги 1 и 2) ручной сжатие нематод (см. пункты 2 и 3) быстрое фиксацию (см. шаг 3). Во-первых, чтобы максимизировать сцепление нематод в слайдах, то лучше подготовить...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Автор заявляет, что у нее нет никаких конкурирующих финансовых интересов.
Финансирование было предоставлено NSF CCLI # 0633618 и университета Огайо. Некоторые штаммы были предоставлены Caenorhabditis генетический центр. Аспирант Reetobrata Басу появляется в видео.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| Горка из поли-L-лизина (марка ESCO) | Fisher | 12-545-78 | Горки марки Sigma также подходят |
| для гидробромида поли-L-лизина | Sigma | P1524 | ВАЖНО: Марка и высокая молекулярная масса полилизина критическая |
| горка с одинарной матовой кромкой | Fisher | 48312-002 | Другие бренды подходят |
| азид натрия | Sigma | S2002-25G | TOXIC, надевайте перчатки и маску во время взвешивания порошка до 10% запаса. Надевайте перчатки при пропитывании стокового раствора |
| коплина для окрашивания банки | VWR | 47751-792 | Другие бренды подходят |
| 5-слайдовая почтовая машина | Электронная микроскопия Science | 71549-01 | Одна из многих различных марок маленького держателя предметного стекла, подходит для окрашивания |
| параформальдегида | VWR | MK262159 | <сильное>ВАЖНО: Обычные растворы формалина (37% формальдегида) НЕ подходят. Либо 1) Растворите кризатлалин параформальдегид в фосфатном буфере и храните в небольших аликвотах замороженными. Или 2) купите параформальдегид класса электронной микроскопии в аликвотах. TOXIC - надеть перчатки; Утилизируйте излишки пуха раковины водой. |
| Раствор глутарового альдегида, 25% в воде | Sigma | G 5882 | <сильный>ВАЖНО: приобретите глутаральдегид класса электронной микроскопии в ампулах; TOXIC - надеть перчатки; Утилизируйте излишки пуха раковины водой. |
| Triton X-100 | VWR | EM-9410 | Другие бренды подходят |
| Bovine Serum Albumin | Fisher | ICN820451 | другие бренды подходят |
| Donkey Serum, лиофилизированная | Jackson Immunoresearch | 017-000-121 | Другие бренды подходят |
| Cy3 Donkey anti-Mouse IgG с множественной маркировкой | Jackson Immunoresearch | 715-165-150 | Эта компания рекомендуется для высококачественных многометочных (аффинно обедненных) антител. Выберите подходящий краситель и антиген (животное, используемое для получения первичных антител). |
| n-пропилгаллат | Fisher | ICN10274750 | других марок подходит |
| DAPI, 4',6'-диамидино-2-фенилиндола дигидрохлорид | Sigma | D 9542 | TOXIC. Наденьте перчатки и разложите на небольшие аликвоты и файзе, чтобы свести к минимуму воздействие |
| Ватман #1 диаметр 15 см фильтры | Fisher | 09805G | |
| Покровное стекло #1 1/2 прямоугольник 24 x 60 мм | VWR | 48393-252 | #1 1/2 толщина оптически лучшая папка |
| предметного стекла микроскопа | VWR | 48429-092 | Подходят другие бренды |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE
Запросить разрешение