$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Надежность Интер-оценщик можно оценить, используя несколько показателей. С помощью набора обучения, предоставляемого онлайн ( http://sabre.brainlab.ca ), следующие шаги рекомендуется оценивать надежность между оценщик для каждого из этапов обработки после завершения LE.
Мозг-Сайзер:
Для оценки между оценщик надежность процедур извлечения мозга, генерировать Volumetrics для каждого TIV-E масок, _TIVedit, с помощью команды
. Введите эти Volumetrics в статистической программного пакета (например, SPSS), наряду с TIVedit Volumetrics предусмотренных для каждого из обучающего множества (см. Excel / CSV-файл, предоставляемый онлайн) и рассчитать между оценщик коэффициент корреляции (ICC). Целые Volumetrics мозга для внутренних подготовленных рейтинговых агентств получим сообщили ICC = 0,99, р <0,0001 1,2. Кроме того, оценка пространственного соглашения о маскировке ТИВ можно оценить, используяС.И. 21. MATLAB код предоставляется онлайн для вычисления значений СИ между двумя рейтинговыми агентствами.
Для оценки желудочка переназначение, генерировать объемы vCSF с помощью команды
для каждого из сегментации файлов с vCSF вокселов изменено, то есть. _ seg_vcsf. Объем vCSF это значение у ряда '7 'в колонке под названием "объем". Используя те же процедуры для оценки TIV надежность между оценщик, рассчитать МУС и SI для vCSF.
Удаление ствола мозга, мозжечка и субтенториальных структур можно оценить так же, выполнив команду
на _seg_vcsf_st. Объемы, используемые для этой сегментации маски показаны на втором последнем ряду под названием «общее количество ненулевых вокселей: 'под' объема '(последняя колонка справа). Используя те же процедуры для оценки ТИВ и vCSF, рассчитать МУС и SI для этого маскировки процедуры, применяемыеповторно используя Volumetrics в файле первенствовать, предусмотренные и файлы _seg_vcsf_st.
SABRE:
В то время как ручные процедуры мозга грохот можно легко оценить с использованием стандартных показателей, выравнивание ACPC несколько сложнее. По этой причине, матричные файлы предоставляются сравнить визуально для подготовки операторов за пределами площадки. После завершения выравнивания ACPC, открыть новое окно ИТК-SNAP_sb, загрузить изображение T1, а затем загрузить матрицу для случая подготовки предоставленной на сайте, _T1_IHCpre_toACPC.mat, и визуально сравнить килевой и бортовой качки рыскания и ACPC ломтик между двумя изображениями.
Для оценки процедуры SABRE межевание, запускать
на parcellated маски, _SABREparcel_inACPC для каждого учебного случае. Введите Volumetrics для каждого региона (3-28). SABRE коды регионов предусмотрены в Интернете. Используя те же процедуры для оценки ТИВ и vCSF, рассчитать МУС для каждого региона мозга SABRE.SABRE parcellated региональных Volumetrics для внутренних подготовленных рейтинговых агентств получить данные о средних МКК = 0,98, р <0,01, со значениями ICC, начиная от 0.91-0.99 1,2.
Поражение-Seg:
Как этот компонент является завершающим этапом трубопровода LE, надежность и точность будет зависеть от предшествующих этапов.
Интер-оценщик надежность SH сегментации осуществляется с использованием региональной МУС Ш. объемов и пространственное согласие SH масок. Для оценки региональных томов SH, запускать , ввод и файл lobmask в пространстве T1-приобретения, _SABREparcel и окончательный отредактированный поражения сегментации файл, _LEedit. Используя те же процедуры для оценки SABRE Volumetrics, рассчитать МУС для объемов поражения в каждом регионе мозга SABRE. Используя те же процедуры для оценки пространственного согласие процесса маскирования ТИВ, рассчитать SI для заключительных редакцией поражения масок, _LEedit (или FLEXedit). Те же самые тесты надежности может быть выполнена на обоих PD/T2-based сегментации и FLAIR основе сегментации.
| 3D T1 | PD/T2 |
| Параметры обработки изображений | Осевая Объем СБ (S 1) SPGR | Осевая спин-эхо ФК ВЭМЗ В.Б. (чередование) |
| Пульс Ремень | | |
| TE (мс) | 5 | 30/80 |
| TR (мс) | 35 | 3000 |
| Флип обзора (°) | 35 | 90 |
| TI (мс) | N / A | N / A |
| Сканирование Диапазон | | |
| Поле зрения (см) | 22 | 20 |
| Толщина среза (мм) | 10,2 / 0 | 3/0 |
| Кол-фрагменты | 124 | 62 |
| Приобретение | | |
| Размер матрицы | 256 х 192 | 256 х 192 |
| Размер Voxel (мм) | 0,86 х 0,86 х 1,4 | 0,78 х 0,78 х 3 |
| NEX | 1 | 0.5 |
| Общее время (мин) | 11:00 | 12:00 |
Таблица 1. General Electric 1.5T Структурные МРТ параметры измерения.
| 3D T1 | PD/T2 | FLAIR |
| Параметры обработки изображений | Осевая 3D FSPGR EDR ИК Prep | Осевая 2D FSE-XL, EDR, БЫСТРО, жир СБ | Осевая T2Flair, EDR, БЫСТРО |
| Пульс Ремень | | | |
TE (мс) | 3.2 | 11.1 / 90 | 140 |
| TR (мс) | 8.1 | 2500 | 9700 |
| Флип обзора (°) | 8 ° | 90 ° | 90 ° |
| TI (мс) | 650 | N / A | 2200 |
| Сканирование Диапазон | | | |
| Поле зрения (см) | 22 | 22 | 22 |
| Толщина среза (мм) | 1 | 3 | 3 |
| Кол-фрагменты | 186 | 48 | 48 |
| Приобретение | | | |
| Размер матрицы 256 х 192 | 256 х 192 | 256 х 192 |
| Размер Voxel (мм) | 0,86 х 0,86 х 1 | 0,86 х 0,86 х 3 | 0,86 х 0,86 х 3 |
| NEX | 1 | 1 | 1 |
| Общее время (мин) | 7:20 | 6:10 | 7:20 |
Таблица 2. General Electric 3T Структурные МРТ параметры измерения.

Рисунок 1. Осевая T1 с неотредактированной общего внутричерепного хранилище (TIV) маска наложения (зеленый). Это пример использования закрытого полигона инструмента в ИТК-SNAP_sb удалить nonbrain ткани как часть ручной процедуре редактирования головного мозга- Процедура извлечения грохот в TIV.
Рисунок 2. Осевая T1 с ткани сегментации наложения. Обратите внимание, что цвета этикетки произвольны и могут быть изменены с помощью инструмента Label. Слева изображение показывает цвета по умолчанию. Средние фотографии показано, как CSF (5 = фиолетовый) переназначается vCSF (7 = пурпурный). Правое изображение показывает, как цвет WM могут быть изменены без изменения класса ткани этикетку,
то есть. Этикетка 3 = WM остается, но цвет может быть изменен на синий.

Рисунок 3. Осевая T1 с тканевой сегментации наложения (левое изображение, ГМ = желтый, WM = оранжевый, CSF = фиолетовый) (слева). Изображенные является примером ручного удаления субтенториальных структур с использованием закрытого Polygo н инструмент в ИТК-SNAP_sb (в центре) и последний сегментация тканей после удаления (справа). Как на рисунке 2, правое изображение показывает, как цвет WM могут быть изменены без изменения класса ткани этикетку, то есть. Этикетка 3 = WM остается, но цвет может быть изменен на синий.

Рисунок 4. Осевой T1 в пространстве сбора до (слева) и после (справа) выравнивание AC-PC выполняется.

Выровнены Рисунок 5. Два примера, показывающие процедуры межевание SABRE. Осевая AC-PC T1 с переменного тока (желтый), ПК (синий) и заднего края (розовый) ориентир размещения (слева). 3D поверхность оказанные T1 (справа) с сильвиевой щели (фиолетовый) и центRAL борозда (розовый) разграничение.

Рисунок 6. Осевая PD (слева) с автоматически генерируемым поражения наложения (в центре), и вручную редакцией поражения (красный) наложения (справа).

Рисунок 7. Осевая FLAIR (слева), с автоматически генерируемым поражения наложения (в центре), и вручную редакцией поражения (красный) наложения (справа).