$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Потребность в питательных веществах для роста растений. Использование гидропоники среде роста растений (Rockwool) и питательного раствора гарантирует равномерность N. рост benthamiana и устраняет сложности (механическая, нормативные и эффективность), связанные с использованием почвы для выращивания растений. Мы выросли N. benthamiana на минеральной ваты плит, пропитанных коммерчески доступных удобрений для определения оптимальных условий для роста растений и накопления биомассы. Мы наблюдали 95-100% прорастание семян. Следует отметить, что в том числе фосфора имеет решающее значение для достижения прорастание, потому что мы обнаружили, что питательный раствор не хватает фосфора не в состоянии поддержать прорастание и рост N. Семена benthamiana (рис. 1а).
Последствия роста Agrobacterium и инфильтрации СМИ на фитосанитарной и белка производства. Мы протестировали несколько медиа условия для оптимизации эффективности тон методика агроинфильтрации для крупномасштабного производства. Бактерии (A. tumefaciens штамма GV3101), несущие pBID4-GFP конструкцию культивировали O / N в различных средах условиях (YEB, LB или AB), и либо центрифугировали и ресуспендировали в индукционной среде (ММА) (содержащего 1 × Murashige & Skoog [MS] базальной смесь солей, 10 мМ MES рН 5,6, 20 г / л сахарозы и 200 мкМ ацетосирингона) или разбавленными в Milli-Q воды до 600 0,5 до использования для растений инфильтрации. Мы заметили, что вакуум инфильтрация растений с бактериями разбавленных в воде привело к продукции белка, сравнимого с тем, которые достигаются с любым инфильтрации СМИ в предыдущих докладах 42,48. В противоположность этому, инфильтрация неразбавленным Agrobacteria выращенного в Yeb или LB СМИ привело к полному увяданию N. benthamiana оставляет менее чем 24 часа после инфильтрации, в то время как неразбавленный Agrobacteria выращенные в АБ среды не оказывает влияния на здоровье проникли растений (DATне показано). Как показано на фиг.1В, растения проникли с Agrobacterium культур, выращенных в Yeb, LB или AB медиа и разбавляли Milli-Q воды (1:5, 600 0.6-0.8 или 1:10, 600 0.3-0.4) показали никаких симптомов и не имел среднюю производство GFP из 1645, 1520 и 1839, соответственно. Agrobacteria центрифугировали и ресуспендировали в индукционной среде (ММА) не показали симптомов и никакого существенного различия в продукции белка по сравнению с Agrobacteria непосредственно разведенного в Milli-Q воды ( 1671 ± 102 и 1667 ± 131 мг / кг, соответственно). Таким образом, Milli-Q воды рекомендуется для разбавления Agrobacterium культур для растений инфильтрации и был обычно используются в наших последующих экспериментах для достижения 600 0.5.
Влияние плотности Agrobacterium подвеска клеток и времени курса по целевой выражения. Затем мы рассмотрели, если плотность бактериальных клетоквлияет на эффективность инфильтрации и уровней целевой выражения. Для этой цели, мы оценивали четыре различные плотности суспензии клеток Agrobacterium, несущие pBID4-GFP, A 600 1,0, 0,5, 0,1 и 0,05. После инфильтрации, Н. benthamiana растения были проверены для развития видно симптомов и времени ходе целевой выражения, собирая образцы в 4, 7 и 10 руб. В 4 точек на дюйм, мы наблюдали заметные различия в флуоресценции GFP среди растений проникли с различной плотностью суспензии клеток Agrobacterium (никакого выражения GFP не наблюдался при 600 0,05). В 7 руб, флуоресценция GFP был похож на заводах проникли в клеточной суспензии плотностей A 600 1.0, 0.5 и 0.1, но была ниже в растениях проникли на 600 0.05. Как показано на фиг 1С, эти данные были подтверждены с помощью Вестерн-блоттинга анализы образцов, собранных на 4 точек на дюйм, показывающие очень низкое производство белка в 600 600 1,0 (1739 мг / кг). В 7 точек на дюйм, растения не показали существенных различий в расчетной производства GFP в 600 1,0, 0,5 и 0,1 (1662, 1870 и 1890, соответственно), в то время как 600 0,05 показал снижение производства GFP (1199 мг / кг). В отличие от этого, в 10 руб не наблюдалось никаких различий в производстве GFP среди растений проникли с любой из четырех плотностей суспензии клеток (1218, 1181, 1197 и 1304).
Проникновение с альтернативными штаммов Agrobacterium. Чтобы увеличить разнообразие штаммов Agrobacterium, доступной для переходного продукции белка, мы протестировали дикого типа изолятов. Эти штаммы, выделенные из коронной желчи природных хозяев, были любезно предоставлены доктором Gelvin (Университет Пердью, Уэст-Лафайетт, штат Индиана). Чтобы изучить их полезность в переходных продукции белка, мы проникли N. benthamiana со следующими штаммами Карринь pBID4-LicKM 18: А. rhizogenes (А4) и А. tumefaciens дикого типа Нестер напрягает A348, A208 и A281 (названный AT6, AT10, и At77, соответственно), а также инженерные лабораторные штаммы А. tumefaciens GV3101, C58C1 и LBA4404. Инфильтрованного листья были собраны на 7 точек на дюйм и уровень экспрессии LicKM была оценена с помощью Вестерн-блот-анализа. Как показано на рисунке 2А, самом высоком уровне LicKM производства может быть достигнуто с штаммов GV3101, A4 и LBA4404 (~ 1750 ± 163, 1650 ± 26 и 1450 ± 117 мг / кг, соответственно), с небольшими различиями; самый низкий уровень экспрессии (~ 900 ± 102 мг / кг) с C58C1; и промежуточная продукция с AT6, AT10 и At77 (~ 1250 ± 19, 1100 ± 42 и 1200 ± 111 мг / кг, соответственно). Лихеназы ферментативная активность была продемонстрирована с помощью Zymogram анализа. Рисунок 2B показывает, что лихеназы производится в проникли тканях растений, используя любой изШтаммы Agrobacterium был ферментативно активный. Следует также отметить, что Н. benthamiana растения проникли с A4 и At77 штаммов показали патологические симптомы (задержка роста, черешок удлинения и щипцы, и листьев керлинг), в то время как с AT10 напрягать симптомы были легкими. Отсутствие симптомов не наблюдалось Н. benthamiana растений проникли с лабораторного штамма GV3101 (рис. 2С).
Проникновение альтернативных видов Nicotiana. Мы сравнили тарифы поколения биомассы и производства белка у двух видов дикого типа рода Nicotiana (Н. benthamiana и Н. мягкой древесной стружки) и в гибридных видов, N. excelsiana (Н. benthamiana × N. стружку). Из тестируемых видов, N. benthamiana, широко используемый хост для переходного производства белка с использованием Agrobacterium на основе или на основе вирусов систем экспрессии 2,34,49, достигает инфильтрации готовность в течение 4-5 недель прорастания. Необходимый период роста для генерации оптимального уровня биомассы также 4-5 недель для N. excelsiana но больше (6-7 недели) для N. Excelsior. Кроме того, междоузлий растений являются относительно короткими для N. Excelsior сравнению с другими видами Nicotiana.
Кроме того, мы наблюдали, что вакуумный инфильтрацию N. benthamiana и Н. excelsiana на 50-250 мбар в течение 60 секунд высокоэффективен для агроинфильтрации целых листьев, в то время Н. эксцельсиор трудно проникнуть из-за их более низкой сени и кожистыми листьями, даже когда был создан вакуум три раза в течение 1 мин каждый в присутствии неионных поверхностно-активных веществ, таких как Sillwet-77 или S240. Кроме того, всхожесть N. excelsiana и Н. Семена Excelsior был ~ 40-50%; в целях повышения всхожесть 90-100%, семена должны быть обрабатывали 10% BleaCH в течение 1 ч перед посевом. При тех же условиях роста, самого высокого листьев биомассы, которая может образоваться от N. excelsiana примерно в два раза выше по сравнению с N. benthamiana (табл. 1).
Производство белка был рассмотрен в N. benthamiana, Н. Excelsior и Н. excelsiana проникли с штамма GV3101 Agrobacterium, несущего pBID4-GFP. Накопление GFP был оценен в 7 руб в целых листьев проникли с помощью УФ-света с последующим вестерн-блоттинга. Фиг.3А показывает равномерное распределение GFP в N. benthamiana и Н. excelsiana и неравномерное распределение в N. Excelsior (из-за трудности проникновения всю область лист Н. стружку). 3В показывает уровень производства GFP оценкам УФ-освещением в проникших листьев, собранных из трех видов Nicotiana на 7 руб. GFP накопилсяУровень ционных была выше в N. benthamiana (~ 2,23 г / кг), чем в N. excelsiana и Н. эксцельсиор (~ 1,89 и 1,54 г / кг, соответственно). Низкий уровень продукции белка в N. Excelsior является из-за неравномерного проникновения и распространения накопленного GFP в собранной листа.
Мы заметили, что верхние листья непосредственно под воздействием света часто демонстрируют самые ранние и самые высокие уровни переходных накопления GFP (на 2-4 руб), чем листьев под навесом. Тем не менее, в наших исследованиях, накопление GFP был самым высоким в 7 точек на дюйм и был распространен равномерно по большинству листьев, за исключением uninfiltrated вновь растущих листьев, которые не проявляют накопление GFP.
Эффекты вакуумного давления и продолжительности на переходный производства белка. Вакуумной пропитки значительно увеличивает переходные уровни экспрессии по сравнению с применяемой инъекции стороне с безыгольного шприца 42 давления. Применениевакуум вызывает газы эвакуироваться из затопленного завода оставляет через устьица. Когда вакуум нарушается, и давление резко возрастает, приостановка Agrobacterium приводится в листья, чтобы заменить эвакуированных газов 50.
Для оценки влияния вакуумного давления на листьях N. benthamiana, мы проникли растения с штамма GV3101 Agrobacterium, несущего pBID4-GFP в различных вакуумных давлениях (50-400 мбар) в течение 30 или 60 секунд. Было показано, что чем сильнее вакуум (ниже 50 мбар) применяется в течение 30 или 60 сек результатов в механических повреждений проникли листьев, что приводит к ткани увядание и отмирание растений вскоре после инфильтрации (24-48 ч). С другой стороны, применение более мягкой вакууме (400 мбар) результатов в инфильтрации только 50% площади листа и снижением уровня производства GFP (303 ± 90 мг / кг) (рис. 4А). Важно отметить, что мы не наблюдали различия в производстве GFP под 50, 100 и 200 мбар (1651 ± 107, 1688 ± 40, 1594 ± 26 мг / кг, соответственно) (рис. 4А) и легкой до нет, вредные последствия для здоровья растений, когда вакуумные давление со 50-200 мбар были применены на 30 или 60 сек. Таким образом, 50-100 мбар вакуумного давления рекомендуется для проникновения экспериментов.
Влияние продолжительности вакуума на целевой выражения оценивали путем пропитки один плашмя N. benthamiana растения каждый час с 600 0,5 от GV3101, несущего pBID4 -. GFP в течение 8 часов в той же культуры Agrobacterium Фиг.4В показывает, что уровень производства GFP был похож на все время указывает до 8 часов, предполагая, что над этим Период времени Agrobacterium сохраняет свою способность начать одноцепочечной ДНК.
Влияние химической индукцией по производству белка. Некоторые растения фенольные метаболиты и сахара могут индUCE гены вирулентности А. tumefaciens 1,52. Как следствие, многие химические вещества и monosaccharaides были зарегистрированы для повышения переходных производства белка в различных видов растений. Ацетосирингона чаще всего добавляют к культурам А. tumefaciens, чтобы побудить вир оперона до агроинфильтрации 40,53-57.
Мы оценили эффект различных концентраций ацетосирингона (0, 100, 200 и 400 мкм) и глюкозы (0-4%) на временную производства GFP белка в N. benthamiana проникли с штамма GV3101 Agrobacterium, несущего pBID4 - GFP. С этой целью мы ресуспендировали Agrobacterium клеток в ММА индукционной средой, содержащей различные концентрации ацетосирингона и глюкозы в течение 1-3 часов, после чего инфильтрации. По результатам обоих визуального наблюдения (данные не показаны) и Вестерн-блот-анализа (рис. 4С), ни один из испытанной концентрациииз этих соединений вызывали значительное увеличение флуоресценции GFP или продукции белка по сравнению с контролем, где индукционные средства массовой информации не содержал ацетосирингона или глюкозы.
Влияние совместного инфильтрации глушителей подавитель на переходном производства GFP и HAC1 генов в N. benthamiana уходит. Ранее было показано, что сотрудничество экспрессию глушителей подавитель (р19 из помидоров густой вируса трюк [TBSV]) мешает посттранскрипционной молчания генов (PTGS), что приводит к усилению производства репортер белков 34.
Мы оценили эффект совместного инфильтрации N. benthamiana с ракетой-вектора, несущего ген GFP репортер (pBID4-GFP) и p19. До инфильтрации, А.Н. 600 из 0,5 разведения А. tumefaciens GV3101 культуры, несущие pBID4-GFP и p19 были соответственно смешаны в соотношении 1:1, 2:1, 3:01 и 4:01. Экспрессион глушителей подавитель контролировалась промоутера Цветная капуста мозаичного вируса 35S. Как показывают результаты Вестерн-блот-анализа на 7 точек на дюйм (фиг.5А), присутствие p19 не увеличивать или уменьшать выработку GFP в N. benthamiana, в любом соотношении этих двух Agrobacterium суспензий.
Мы также сравнили эффекты двух вирусных генов глушителей супрессоров - p23and р19 - по предупреждению PTGS для HAC1. Культуры Agrobacterium, несущие вектор запуска pBID4-HAC1 (H1N1 A/California/04/2009) и один из двух вирусных глушителей супрессоров плазмид были разбавлены до 600 0.5, смешивали в соотношении 4:1, соответственно, и совместно проникли в 4-5-недельных N. benthamiana. Суспензию А. tumefaciens, несущие pBID4 - HAC1 одна была проникли в качестве контроля. Инфильтрованного пробы листьев были собраны от 3 до 8 точек на дюйм. Эксперимент был REPEускоренные три раза и средние уровни экспрессии HAC1 определено Вестерн-блот-анализа.
Как показано на рисунке 5В, со-инфильтрации N. benthamiana с p23 или p19 привело (642 ± 157 и 764 ± 108 мг / кг, соответственно) увеличение HAC1 производства по сравнению с без использования глушителей подавитель (примерно 15-25%, соответственно) в 6 руб. Это говорит о том, что p23 и p19 являются эффективными в нашей системе. Тем не менее, следует отметить, что накопление HAC1 произошло на день раньше, когда pBID4-HAC1 был одним из проникли с p19. Таким образом, наши результаты показывают, что эффекты глушителей супрессора p19 на HAC1 и накопления GFP различны, предполагая, избирательное усиление кратковременной экспрессии и / или устойчивости некоторых белков в N. benthamiana.
Мы также отметили, что как в присутствии, так и в отсутствии глушителей подавитель уровень белка Prod HAC1ед ен ие начал сокращаться на 7 руб. Это указывает на то, что сроки снижения переходного производства белка в Н. benthamiana проникли с вектором запуска является мишенью конкретной.
Ячейка банк Agrobacterium, несущие вектор запуска оценивали каждый год в течение стабильности гена-мишени, Agrobacterium жизнеспособности и уровня накопления белка. Исходный раствор в глицерине клеточной берегу GV3101 деформации, трансформированной pBID4-HAC1, которое было сохранено при -80 ° С, как было показано, чтобы быть очень стабильным в течение более трех лет без изменений в уровне переходного производства белка в проникли N. benthamiana растения. Рисунок 5C показывает, что производство белка HAC1 оценивается вестерн-блоттинга в годы 2010, 2011, 2012 и 2013 было 670, 685, 566 и 683 мг / кг, соответственно. Средняя производство HAC1 в N. benthamiana растения было 651 ± 49,4 мг / кг.
Таблица 1. Сравнение N. benthamiana и Н. excelsiana завод по производству биомассы. 
Рисунок 1. Вестерн-блот-анализ временной экспрессии генов в N. benthamiana. (А) Шесть-недельных Н. benthamiana 1) растения, растущие в удобрений раствора, содержащего 4,8% фосфора и 2) растения, произрастающие в удобрений раствора, содержащего 0% фосфора. Двадцать пять мкг свежего веса листьев эквиваленте был загружен на полосу. (В) Сравнение производства GFP в растениях вакууме пропитывают pBID4-GFP-укрывательство Agrobacterium GV3101 Культуры, выращенные в трех различных средах: YEB, АВ и LB. GV3101 культуры выращивают O / N в Yeb или LB медиа центрифугировали при низкой скорости и ресуспендировали в индукционной среде (ММА) (ММА полосы:-1 и ММА-2 соответственно), или выращенных O / N в Yeb, LB или AB СМИ и непосредственно разбавляют до 1:05 или 1:10 с Milli-Q воды (полосы: YEB / 5 и YEB/10; AB / 5 и AB/10; LB / 5 и LB/10) (С) Сравнение. из GFP экспрессии в 4, 7 и 10 руб следующих вакуумной инфильтрации с различных концентрациях (600 из 1,0, 0,5, 0,1 и 0,05) А. tumefaciens GV3101 штамм, несущий pBID4-GFP.

Рисунок 2. Сравнение переходных производства лихеназы и активности после вакуумной инфильтрации N. benthamiana растения с Diffeарендовать штаммы Agrobacteria. Культуры штаммов Agrobacteria (GV3101, A4, At77, C58C1, AT6, AT10 и LBA4404), несущие вектор запуска pBID4-LicKM были проникли индивидуально в листьях N. benthamiana. Проникли листья были собраны на 7 точек на дюйм. (A) лихеназы производство количественно с помощью Вестерн-блоттинга. (B) Zymogram анализ демонстрирует лихеназы производства за счет ферментативной активности. (C) Эффект Agrobacterium (дикого типа A4, AT10, At77 и лабораторный штамм GV3101) инфильтрация на N. benthamiana здоровье растений в 7 руб. Двадцать пять мкг свежего веса листьев эквиваленте был загружен на полосу.

Рисунок 3. Переходные GFP выражение в листьях N. benthamiaпа, Н. excelsiana и Н. Excelsior в 7 руб после вакуумной пропитки с А. tumefaciens, несущие ракеты вектор pBID4 - GFP. (A) Визуальный осмотр экспрессии GFP под УФ-светом. (B) Вестерн-блот анализ накопления GFP.

Рисунок 4. (A) Эффекты вакуумного давления на временной экспрессии GFP и растений. Н. benthamiana растения проникли с pBID4 -. GFP под вакуумом давлениях 400, 200, 100 или 50 мбар, в вакуумной проведения времени 30 или 60 сек (В) Стабильность и инфекционность А. tumefaciens в N. benthamiana проникли с Agrobacterium GV3101 укрывательство pBID4-GFP выросли в АБ среды и разбавляют до 600 0.5. Agroinfiltration проводили путем пропитки один плашмя N. benthamiana растения каждый час в той же разбавленной культуры Agrobacterium (дорожки 0-8). (C) Влияние различных концентраций глюкозы и ацетосирингона по временной экспрессии GFP. Штамм GV3101 Agrobacterium, несущие pBID4 - GFP был выращен O / N в YEB информации, центрифугируют и повторно суспендируют с 600 A 0,5 либо в ММА, содержащей 2% глюкозу с ацетосирингона при 0, 100, 200 или 400 мкМ, или в ММА, содержащий 200 мкМ ацетосирингона с глюкозой в 0, 1, 2 или 4%. В Agrobacterium суспензии выдерживали в течение 3 ч при комнатной температуре до инфильтрации.

Рисунок 5. Влияние глушителей супрессоров на переходном производства белка в N. benthamiana уходит. () Вестерн-блот анализ из GFP белка следующее совместное проникновение pBID4-GFP и p19 в различных соотношениях. Пробы, собранные на 7 руб (25 мкг свежего веса листьев эквивалента был загружен на полосу). (Б) культура Agrobacterium проведение pBID4-HAC1 индивидуально смешивали в соотношении 4:1 с культуры, несущей р19 или р23 глушителей подавитель плазмид. Полученные в результате комбинации культур Agrobacterium пропитывают под вакуумом растений. Проникли ткани HAC1 ежедневно собирали до 8 точек на дюйм для рекомбинантного количественного белка. (С) Устойчивость банка клеток Agrobacterium. Растения проникли с той же самой партии банка клеток Agrobacterium каждый год, чтобы оценить накопление белка. Пятьдесят мкг свежего веса листьев эквиваленте был загружен на полосу. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть увеличенную версию гоявляется фигурой.