Высокое разрешение В Vivo Руководство Сегментация Протокол по населенным гиппокампа подполей Использование 3Т Магнитно-резонансная томография

Julie Winterburn; Jens C. Pruessner; Chavez Sofia; Mark M. Schira; Nancy J. Lobaugh; Aristotle N. Voineskos; M. Mallar Chakravarty

doi:10.3791/51861

Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Высокое разрешение В Vivo Руководство Сегментация Протокол по населенным гиппокампа подполей Использование 3Т Магнитно-резонансная томография

9K просмотров

⸱

DOI:

10.3791/51861

⸱

10 ноября 2015 г.

Julie Winterburn¹^,² , Jens C. Pruessner³ , Chavez Sofia⁴^,⁵ , Mark M. Schira⁶^,⁷ , Nancy J. Lobaugh⁴^,⁸ , Aristotle N. Voineskos⁵^,⁹ , M. Mallar Chakravarty¹^,²

¹Institute of Biomaterials and Biomedical Engineering, University of Toronto, ²Computational Brain Anatomy Laboratory, Douglas Institute, McGill University, ³McGill Centre for Studies in Aging, McGill University, ⁴MRI Unit, Research Imaging Centre, Campbell Family Mental Health Research Institute, Centre for Addiction and Mental Health, ⁵Department of Psychiatry, University of Toronto, ⁶School of Psychology, University of Wollongong, ⁷Neuroscience Research Australia, ⁸Department of Medicine, University of Toronto, ⁹Kimel Family Translational Imaging Genetics Research Laboratory, Research Imaging Centre, Campbell Family Mental Health Research Institute, Centre for Addiction and Mental Health

В этой статье

Краткое содержание

Целью этой рукописи является изучение гиппокампа и подполей гиппокампа с помощью МРТ. В рукописи описан протокол сегментации гиппокампа и пяти субструктур гиппокампа: cornu ammonis (CA) 1, CA2/CA3, CA4/зубчатая извилина, strata radiatum/lacunosum/moleculare и subiculum.

Аннотация

Человека гиппокамп был широко изучен в контексте памяти и нормальной функции мозга и его роль в различных нервно-психических расстройств был сильно изучал. Хотя многие исследования отображения лечения гиппокамп как единый унитарный нейроанатомической структуры, это, по сути, состоит из нескольких подполей, которые имеют сложную трехмерную геометрию. Таким образом, известно, что эти подполя выполнения специализированных функций и дифференциально затронуты через ходе различных болезненных состояний. Магнитно-резонансная (МР) визуализация может быть использован в качестве мощного инструмента для запроса морфологию гиппокампа и его подполей. Многие группы используют современное программное обеспечение и аппаратные средства визуализации (> 3T) к изображению подполей; Однако этот тип технологии может быть легко доступны в большинстве исследований и клинических центров визуализации. Чтобы удовлетворить эту потребность, эта рукопись дает подробный протокол шаг за шагом для сегментации полный передне-задний длинугиппокампа и его подполей: Корню ammonis (ЦА) 1, СА2 / СА3, СА4 / зубчатой извилине (DG), слои radiatum / lacunosum / moleculare (SR / SL / SM), и подлежащая ткань. Этот протокол был применен к пяти предметам (3F, 2М; возраст 29-57, средняя 37.). Надежность Протокол оценивается ресегментировании либо правую или левую гиппокамп каждого предмета и вычислительная перекрытие, используя каппа метрику кости в. Средняя каппа DICE (ассортимент) по пяти предметам: вся гиппокамп, 0,91 (0.90-0.92); СА1, 0,78 (0.77-0.79); СА2 / СА3, 0,64 (0.56-0.73); СА4 / зубчатая извилина, 0,83 (0.81-0.85); слои radiatum / lacunosum / moleculare, 0,71 (0.68-0.73); и подлежащая ткань 0,75 (0.72-0.78). Сегментация Протокол, представленные здесь обеспечивает другие лаборатории с надежным методом для изучения гиппокампа и гиппокампа подполей в естественных условиях, используя доступные инструменты, обычно MR.

Введение

Гиппокамп является широко изучены медиальной височной доли структура, которая связана с эпизодической памяти, пространственного навигации и других познавательных функций ^10,31. Его роль в развитии нейродегенеративных и психоневрологических расстройств, таких как болезнь Альцгеймера, шизофрении и биполярного расстройства хорошо документированы ^{4,5,18,24,30.} Цель этой рукописи является предоставление дополнительной детализации в ручной сегментации протокола, опубликованной ранее ³⁴ для гиппокампа подполей человека на высоком разрешении магнитного резонанса (МР) изображений, полученных в 3Т. Кроме того, видео компонент сопровождающих эту....