Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

От быстрого флуоресценции визуализации к молекулярной диффузии Закона о живых клеточных мембран в торговом микроскоп

11.2K просмотров

DOI:

10.3791/51994

9 октября 2014 г.

В этой статье

Краткое содержание

Пространственное распределение и временная динамика белков и липидов плазматических мембран является актуальной темой в биологии. Здесь эта проблема решается с помощью пространственно-временного анализа флуктуаций изображения, который обеспечивает концептуально те же физические величины отслеживания отдельных частиц, но использует малые молекулярные метки и стандартные микроскопические установки.

Аннотация

Это становится все более очевидным, что пространственное распределение и движение мембранных компонентов, таких как липидов и белков являются ключевыми факторами в регуляции многих клеточных функций. Однако в связи с быстрым динамики и крошечных структур, вовлеченных, очень высокой пространственно-временное разрешение требуется, чтобы поймать реальное поведение молекул. Здесь мы представляем экспериментальный протокол для изучения динамики флуоресцентно меченных плазмы мембраны белков и липидов в живых клетках с высокой пространственно-временной резолюции. Следует отметить, что этот подход не требует, чтобы отслеживать каждую молекулу, но он вычисляет поведение населения, использующего все молекулы в данной области мембраны. Отправной точкой является быстрый визуализация данного региона на мембране. Впоследствии, полный пространственно-временной автокорреляционной функции рассчитывается корреляции полученных изображений на повышение временные задержки, например каждые 2, 3, N повторений. Можно показать, что ширинапика пространственных увеличивается автокорреляционной функции при увеличении времени задержки в зависимости от движения частиц за счет диффузии. Поэтому, фитинг серии функций автокорреляции позволяет извлечь фактический белка средний квадрат смещения от изображения (IMSD), здесь представлены в виде кажущегося коэффициента диффузии против среднего водоизмещения. Это дает количественную вид средних динамики одиночных молекул с нанометровой точностью. При использовании GFP-меченый вариант рецептора трансферрина (СКР) и ATTO488 меченого 1-пальмитоил-2-гидрокси-SN глицеро-3-фосфоэтаноламин (ИСЗ), то можно заметить, пространственно-временной регуляции липидного и белкового диффузии на микронных мембранных регионы в диапазоне времени микро-к-милли-второй.

Введение

Начиная с первоначального "мозаики жидкости" модели Зингера и Николсона, картина сотовой мембране постоянно обновляется в течение последних десятилетий, чтобы включить возрастающую роль цитоскелета и липидных доменов 1,2.

Первые наблюдения были получены методом флуоресцентной восстановления после фотообесцвечивания (FRAP) открытие, что значительная часть мембранных белков неподвижен 3-5. Эти пионерские исследования, хотя и очень информативным, пострадали от относительно низкого разрешения в пространстве (микрон) и время (в секундах) FRAP установок. Кроме того, будучи ансамбля измерение усреднения, FRAP не хватает в п....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

1 Система калибровки

  1. Функция рассеяния точки (PSF) калибровка
    1. Развести 10 мкл 30 нМ раствора флуоресцентного шарик (около 5 мкм) в 90 мкл дистиллированной воды, а затем разрушать ультразвуком раствора в течение 20 мин. Сокращение площади (1 см х 1 см) кусок агарозном геле (3%) и депозит 10 мкл раствора в верхней части геля. Переверните кусок геля на нижней стекле 2 см чашку Петри и выжать каплю на стекле.
    2. Включите настройки приобретения, положить образец в держатель, установить экспозицию камеры и EMgain (100 мс и 1000 хорошие параметры, но оптимизировать в соответствии с системой) и ждать камере остыть.
    3. Установите экспозицию к....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Для калибровки инструментальную талию, образ одной люминесцентной нано-шарик может быть мера, как описано в протоколе стадии 1.1. Типичный флуоресцентное изображение этих шариков представлена ​​на рисунке 1. Место распределения интенсивности по 2D-функции Гаусса отдает хорошие остатки и позволяет измерять инструментальную талию при 270 нм. Это значение хорошо согласуется с ожидаемым дифракционного предела оцененного уравнения Рэлея. Эта калибровка не является необходимым для измерения динамики частиц, н.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Одноместный отслеживания частиц (SPT) представляет собой одну из наиболее распространенных стратегий для изучения молекулярной динамики и он имеет большое преимущество измерения траектории частиц. Это, в свою очередь, позволяет зондирующего поведение даже несколько меченых частиц в сложной системе. Тем не менее, для достижения этого преимущества SPT обычно нуждается низкую плотность зонда и очень ярких этикеток. В частности, чтобы получить высокое временное разрешение (диапазон мкс) неорганический зонд обычно требуется .......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторам нечего раскрывать.

Благодарности

Эта работа частично поддерживается NIH-P41 P41-RRO3155 и NIH P50-GM076516 (грант EG), а также Fondazione Monte dei Paschi di Siena (грант FB).

....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
iXon Ultra 897AndorDU-897U-CS0
SolisAndor
CHO-K1ATCCCCL-61
ATTO 488 с маркировкой PPEATTO-TEC GmbHAD 488-151
DOPEAvanti Polar Lipids, Inc.
DOTAPAvanti Polar Lipids, Inc.890890
100x Пенициллин-стрептомицин-глутаминGibco10378-016
DMEM/F-12Gibco21331
FBSGibco10082147
HEPESGibco15630-106 
PBSGibco10010-023
SimFCS 3.0Globals Программное обеспечениепрограммное обеспечение можно скачать здесь: http://www.lfd.uci.edu/globals/
DMI6000 с модулем TIRFLeica
LAS AFLeica
Lipofectamine 2000 Lipofectamine11668019
MatlabMathWork
ImageJNIH
[header]
C-концевой GFP помеченный Рецептор трэнферринаOriGeneRG200980
АгарСигма ОлдричA5306
ХлороформСигма Олдрич528730
Латексные шарики, флуоресцентные желто-зеленые, 30 нмСигма ОлдричL5155
Ультразвуковые очистители SONICASOLTECETH S3
Чашки ПетриWillcoGWSt-3522
Импортер биоформата для Matlabhttp://www.openmicroscopy.org/site/support/bio-formats5/users/matlab/
ICS-MatLab Toolshttps://www.cellmigration.org/resource/imaging/software/ICSMATLAB_28-02-06.zip
Simulation от Matlab Tutorialhttps://www.cellmigration.org/resource/imaging/icsmatlab/ICSTutorial.html
Simulation от SimFCS Tutorialhttps://www.cellmigration.org/resource/imaging/ppt-pdf/RICS%20Simulations.ppt
850725

Ссылки

  1. Engelman, D. M. Membranes are more mosaic than fluid. Nature. 438 (7068), 578-580 (2005).
  2. Vereb, G., et al. yet structured: The cell membrane three decades after the Singer-Nicolson model. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 100 (14), 8053-8058 (1073).<....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Теги

Флуоресцентная микроскопия общего внутреннего отражениякалибровка функции распространения точкиполучение изображений флуоресцентных микросферпространственно-временная автокорреляциясреднеквадратичное смещениекажущаяся диффузивностьрецептор трансферрина с GFP-меткой