Drosophila Диски большой (DLG) является консервативный член мембраной связаны гуанилатциклазы семейства киназ лесов белков, которые помогают организовать сборку больших белковых комплексов в определенных участках плазматической мембраны. Первоначально идентифицирована как белка-супрессора опухоли, Dlg служит важным фактором, определяющим эпителия апикально-базальной полярности 1,2,3. Dlg также служит в качестве основного модуля лесов в нервно-мышечном соединении (НМС) глутаматэргических двигательных нейронов во время развития личинок 4. Dlg играет разные роли на личиночной НМС, и его pleiotropism зависит от его способности, чтобы связать с несколькими белками 5,6. Одним из таких белков является Ху-ли тай Шао (ВТСП), гомолог к adducins млекопитающих, которые в основном были описаны в отношении их роли в регулировании актин-спектринового цитоскелета 7. Ранее было показано, что Dlg и Hts может образовывать комплекс друг с другом на основе в пробирке совместно иммунопреципитации эксперименты с участием всего взрослого летать лизаты 8. Один из недостатков этих результатов, однако, является то, что они не указывают, когда это сложные формы. С использованием иммуногистохимии, распределения и Dlg Hts наблюдаются перекрываться на постсинаптической мембране личиночных НМС, но они в комплексе в этой области 8? Как показал недавно и подробно описано здесь, Пробирной Расстояние Лигирование (PLA) используется для поиска в месте связи между Dlg и Hts специально на личиночной NMJ 27.
PLA является относительно новый метод используется в основном в клеточной и тканевой культуры, которая может обнаружить белок-белковых взаимодействий в месте 9. В этом анализе, первичные антитела против двух белков, представляющих интерес обнаружены с парой видоспецифических вторичных антител, называют PLA зондов, которые конъюгированы с олигонуклеотидами (1А, В). Если два белкас находятся в непосредственной близости друг от друга (т.е. в течение нескольких десятков нанометров), расстояние между прилагаемыми НОАК зондов можно преодолеть путем гибридизации двух дополнительных олигонуклеотидов Connector (рисунок 1в). В этой конформации, свободные концы соединительных олигонуклеотидов достаточно близки, чтобы вступить в контакт друг с другом, и закрыт круглой молекула ДНК может быть сформирован на месте в лигирования (фиг 1D). Круговой молекула ДНК служит в качестве матрицы для амплификации в месте прокатки круга, который заливают в одном из олигонуклеотидов, конъюгированных с зондами PLA (рис 1E). Последовательности в пределах результате усиленного concatemeric продукта ДНК могут быть визуализированы с флуоресцентно меченных комплементарных олигонуклеотидов (фиг 1F). Поскольку усиленный ДНК остается прикрепленной к одному из датчиков PLA, субклеточном локализации взаимодействия withi белок-белокна ткани могут быть легко установлены.
Некоторые методы широко используются для обнаружения белок-белковых взаимодействий в том числе в технике пробирке, такие как совместно иммунопреципитации, выпадающие анализы и дрожжи Двугибридный анализ и методам естественных условиях, таких как Ферстер резонанс переноса энергии (FRET) и Бимолекулярные флуоресценции комплементации ( BiFC). Ловушка из методов в пробирке, что они не определить, где взаимодействие происходит эндогенно, в то время как вышеупомянутые в естественных условиях методы включают искусственный экспрессию слитых белков, которые могут не отражать родной поведение их эндогенных аналогов. Одно из главных преимуществ PLA является то, что способен определить в ткани на внутриклеточную локализацию эндогенных белков interactors, которые находятся в непосредственной близости друг от друга, и, скорее всего, образующих комплекс с степени близости, необходимой для генерирования сигнала, сравнимой с FRET и BiFC. PLA может обнаружить взаимодействие с высокой специфичностью и чувствительностью за счет сцепления распознавания антител и амплификации ДНК. Таким образом, анализ может генерировать дискретные, яркие сигналы в виде Puncta, которые показывают точное положение взаимодействия. Кроме того, почти видимые антигенов могут быть обнаружены. Наконец, PLA не относительно простой метод для выполнения, и он больше не принимает, чем стандартный иммуногистохимического процедуру для завершения. Поэтому, PLA технические преимущества по сравнению с другими анализами взаимодействия белок-белковых, которые часто сталкивается с длительным временем подготовки и обширной устранения неполадок.
Этот протокол показывает, как PLA могут быть применены к Drosophila личинок НМС с целью обнаружения эндогенных белок-белковых взаимодействий на месте. Здесь PLA осуществляется на личиночных мышц стенки тела препаратов, где Dlg и Hts показаны на самом деле существует в комплексе в постсинаптической области НМС, Народно-освободительная армия ранее не использовалась для изучения личинок НМС, и есть в настоящее время только несколько опубликованных работ, которые использовали эту пробу у дрозофилы ткани. Он выразил надежду, что в дальнейшем экспозиция НОАК сообщества дрозофилы приведет к его увеличению использования в качестве дополнительного инструмента в дополнение к другим, более часто используемые анализы белок-белкового взаимодействия.