$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Anopheles arabiensis, Anopheles coluzzii и Anopheles gambiae являются основными векторами, ответственные за передачу малярии в Африке 1. Эти три вида морфологически неотличимы 2 и может быть выделен только молекулярного анализа 3-9. Кроме того, есть много вниз по течению анализы регулярно проводимые чтобы помочь эпидемиологические и популяционные генетики исследований. Они включают в себя (1) определяют генотип анализ для видообразования островов 10-12 (2) генотипирование анализа признания, не синонимичные ОНП в 1014-м аминокислоты кодона положение гена пара (сопротивление нокдаун, или KDR, SNP) 13 -18 (3) обнаружения паразита ПЦР 19-23, и (4) Скрининг на хост-специфической ДНК в популяции комаров midguts 24,25.
Мы разработали анализ с несколькими обнаружения (MDA), который сочетает в себе все эти анализы в одном мультиплексной реакции с цельюalyzing эпидемиологически важных характеристик переносчиками малярии в Африке. MDA анализ включает в себя несколько маркеров для выявления (1) видов (A. arabiensis, А. gambiae, А. coluzzii, или другая информация (ни один из трех)), (2) устойчивости к инсектицидам, представленных в КДР ОНП (как L1014F и L1014S) (3) Наличие двух крупных малярийных паразитов, Plasmodium тропической и П. трехдневной, и (4) Источник крови одного птичьего гриппа и шесть хозяев млекопитающих.
Традиционно эти анализы были проведены в отдельных полимеразной цепной реакции. Когда все эти анализы сделаны с использованием обычной платформы ПЦР, что требует проведения реакции ПЦР 8-10 анализов и сопровождающих гель электрофореза шаги. Каждый человек ПЦР от подготовки к документированию результатов занимает 4-5 ч, в то время как метод MDA, представленные здесь занимает около 5 ч в совокупности. Это эквивалентно 90% экономии затрат на оплату труда в одиночку. MDA, представленные здесь стоит $ 5по образцу генотип все 33 ОНП. Это значительно дешевле, чем одиночных геля агарозы на основе анализа, который стоит около $ 1,50 за образец. Анализы выявления всех особенностей, охватываемые MDA потребует минимум 8-10 отдельных геля агарозы на основе анализов по цене $ 12-15 за образец. Кроме того, MDA значительно снижает вероятность получения ложно положительный или отрицательный, используя, по крайней мере три маркера для каждого паразита или источника Обнаружение хоста.
Платформа мы использовали не ограничивается переносчиков малярии, но может быть использован в широком спектре приложений, таких как медицине, ветеринарии, а также основной биологии 26-28. Углубленные исследования Ассоциации или популяционной генетики исследования с привлечением большого (в порядке 100s) число образцов требуют экономически эффективных анализов скрининга для одновременного нескольких маркеров. Большинство исследований, которые используют два или более отдельных ПЦР могли бы реализовать MDA для более быстрых результатов при меньших затратах.