Разработка пластины на основе культуры клеток платформы роботов штока.
Спрос на ИПСК растет в связи с их полезности в развитии наркотиков и регенеративной медицины. Тем не менее, масштабируемое производство сосредоточено на суспензионной культуре 32 в относительно сложного оборудования, что исключает многие исследователи и отклоняется от установленных прилипшие методов культивирования. Вместо радикально изменить проверенным пластины на основе стволовых клеток методы культивирования, такие как переключение на суспензионной культуре или с помощью микроносителю, мы сосредоточились на миниатюризации и автоматизации наших существующих методов прилипшие IPSC культуры. Первая цель была, чтобы автоматизировать кормление и пассажей, чтобы нормализовать весь процесс культуры. Платформа способна быстрого расширения с существующей технологии также требуется. Для достижения этих целей метод был разработан, чтобы культура стволовых клеток в 96-луночного планшета, использующие автоматизированную систему обработки жидкости (рисунок 1). Протocols разработанные здесь с наливных робота для кормления и прохождения не требуют шаг центрифугирования или непрерывный мониторинг техником. Эти протоколы были разработаны с двумя фидерными линиями свободных IPSC; один полученный из фибробластов, а другой из жировых клеток на 33.
Управляется компьютером системы обработки жидкости (1А) состоит из платформы, которая движется спереди и сзади. Кровать имеет девять, примерно 5 х 3,3 дюйма пронумерованные углублений зажимы, чтобы использовать стандартные пластины культуры клеток, хранилища жидких и других пользовательских аппаратных давления. Головка движется пипетки слева направо (перпендикулярно движению постели), а также вверх и вниз. Вместе с постели, пипетка головка может быть запрограммирован, чтобы удалить или поставить носитель в любом месте на кровати после получения наконечники из многоразового стойки. При необходимости каждая из 96 скважин может храниться отдельно, чтобы исключить перекрестное загрязнение. В настоящей конфигурации, от 0 до200 мкл сред могут быть перемещены с помощью каждого наконечника пипетки головы, но и другие диапазоны объема возможны в зависимости от размера наконечника.
При пассажей стволовых клеток в стандартных плит, ферментативного или химического разложения, как правило, требуется инкубации при 37 ° С. Первоначальное тестирование подтвердили диссоциации с протеолитической и коллагенолитического диссоциации реагента или реагента на основе EDTA, выполняемой лучше при 37 ° С, чем РТ как в момент диссоциации и однородности размера колоний, производимого для наших двух 96-луночных линий Ipsc (данные не показаны). Для автоматизации процесса разделения и избежать перемещения плиты и из инкубаторов, наклонных, температура контролируется пандусы, которые принимают и воспроизводимо положение стандартные культуральные планшеты были построены (рис 1А). Когда пандусы нагревали до 37 ° С, протеолитической и коллагенолитического диссоциации реагента или ЭДТК диссоциации ИПСК из 96-луночных планшетах была сравнима с пластин, помещенных в 37 ° С в инкубаторе (п данныхOT показано). Наклонные пандусы также используется для того, чтобы советы пипетки, чтобы собрать содержимое всей скважины (менее 5 мкл остаточного объема), достигнув нижней точки в скважине, тогда как стремление от плоской пластины оставил остаточный объем примерно 10-15 мкл, в результате в гибели клеток. Наклонный скат также позволило скважины для стирки (растирают) с извлечением носители в верхней части наклонной хорошо и собрать его в нижней части.
Роботизированная культивирование стволовых клеток в формате 96-луночного планшета; кормления и пассажи.
Культура ИПСК с помощью роботизированной системы обработки жидкости состоит из двух фаз; проход и кормление. При колонии готов прохода, она разделяется в заданном соотношении, чтобы отобрать новый пластину, которая затем подается через регулярные промежутки времени, пока он не будет готов к прохождению раз (Фигура 1В). Замороженные или не 96-а культуры могут быть запущены в формате 96-луночного и сразу ввести проход / каналЦикл. Клетки, которые не используются для поддержания колонии, которое большинство из пластины, собирают для других целей и представляют собой производственную составляющую этой системы.
Кормление 96-луночных культивируемых ИПСК осуществляется, когда некоторые или все среду удаляют после периода культуры и хранение в резервуар с отходами. Затем свежий СМИ аликвоты в одной тарелке. Робот может использовать новые советы и медиа корыта, чтобы отделить каждую лунку для полностью настраиваемый кормления, в том числе смешивания кондиционированной среды с новыми медиа.
Типичный проход стволовых клеток требует метод диссоциации и часто стадии центрифугирования. Протоколы, описанные здесь, стремится к нормализации диссоциации и устранить центрифугирования. Протокол проход начинается, когда робот обеспечивает диссоциации реагента в 96-луночных планшетах, установленный на 37 ° C наклонных скатов. После установленного времени, диссоциированные клетки собирают со стиральной действия, где пользователь имеет CONTROл на позиции, повторение, объема и скорости растиранием. Фермент время, скорость растирание и количество повторений Растирание было достаточно, чтобы варьировать размер диссоциирует колонии и однородность (рисунок 2), но каждый параметр регулируется, чтобы соответствовать требованиям данной ячейки линии. Этот контроль удаляет изменчивость введенную техников, которые пипеткой с различной скоростью, позиций и повторений. После диссоциированные клетки собирают и объедин ют в резервуаре свежей средой, они распределены на новый пластины. Чтобы избежать центрифугирования и посева проблемы с деградацией субстрата или гибели клеток из-за ферментов действие, диссоциация реагента разбавляют до точки минимума приемлемого диссоциации, в результате надежной посева. Эта методика была эффективна для протеолитических и коллагенолитического диссоциации реагента в mTeSR1 среды 34, которая имеет относительно высокое содержание белка, но также эффективны в малых средах белка, как основные виды 8 35 , оба из которых являются совместимыми с этой системой (данные E8 не показан).
Управление плотность посева стволовых клеток после прохождения имеет первостепенное значение для повседневной и успешной культуры стволовых клеток. Сеялки слишком низко или высоко может привести к внематочной дифференциации и потери плюрипотентности в дополнение к вызывая нерегулярные интервалы проход. Типичный культура стволовых клеток зависит от соотношения расщепления, где одну лунку 6-луночного планшета в используется для семян весь новый 6-луночный планшет (1: 6) разделения. С наливных робота это соотношение можно регулировать, чтобы удовлетворить потребности пользователя (например, 1: 6, 1: 9, 1:12 и т.д.), и это имеет наибольшее влияние на отрезке прохождения. Робот может собрать меньше, чем один столбец, один весь столбец (8 лунок), или более чем одну колонку в зависимости от потребностей пользователя, которые должны быть определены опытным путем. Жировой и фибробластов, полученных иПСК поддерживается регулярный три дня кормления график с переходом на четвертый день, когда раскол 1:12, В этом случае одна колонка была собрана и использована, чтобы отобрать одну новую 96-луночного планшета, создавая 1:12 раскол с каждым циклом (фиг.3А). Остальные 11 скважин были тогда доступны для последующих применений. Для сбора этих 11 эксплуатационных скважин, протокол проход, за исключением клетки на хранение в корыто для коллекции. Альтернативно, клетки можно оставить на пластине и использовали непосредственно.
Для достижения устойчивого плотность посева пассажа к пассажу, не считая, и поддерживать обычный распорядок дня расщепления, наши протоколы требуют разделения же заданное число столбцов при колонии в идеальном плотности для прохождения. Чтобы помочь пользователю определить надлежащую плотность для прохода, ряд изображений был сгенерирован, показывающий диапазон плотностей с идеальной плотности выделенного канала (фиг.3В). Чтобы определить, когда проход, техник осматривает их пластину и сравнивает его с масштабом плотности изображения. Идеял Плотность чтобы проход был определен из культуры фибробластов жировой и полученные ИПСК и обнаружили, что, когда пространство между большинстве колоний было около 25% от диаметра смежной колонии. Важно, что колонии быть равномерно распределены. Это количество разделения колоний коррелирует с максимальной желательной плотности, так как один дополнительный цикл подачи приведет колоний прикосновения, которая является триггером для эктопической дифференцировке.
Необходимо протокол, разработанный здесь обращается, как начать культуру в формате 96-луночного и как сбросить культуры после проблемы плотности. Когда новая культура начинается, лучше плотность посева и количество циклов вскармливания перед пассирования неизвестны. Чтобы обеспечить полезную плотность после посева, робот распределяет существующие или размороженные клетки через 96-луночный планшет в серийное разведение (фиг.4А). Пример результатов такого градиента показано на рисунке 4В-E. После нескольких кормленияциклы, некоторые столбцы подойти к идеальной плотности разделить, после чего техник использует робота, чтобы отобрать равномерно разбавленный пластины, чтобы начать регулярные культуры. Этот протокол градиент плотности был также использован для восстановления регулярные интервалы прохождения и колонии однородность неправильной пластины. Если проход с задержкой или пропустил, плотность поселения и размер стать слишком высокой, в то время как, если проход слишком рано, плотность поселения является слишком низким и отдельные колонии может стать слишком большой, не будучи равномерно распределены по хорошо. Протокол градиент плотности решает эти проблемы и позволяет пользователю перезагрузить, выбирая идеально посеянных набор скважин.
Два IPSC линии остались плюрипотентные после 3 месяцев роботизированной культуры.
Обслуживание стволовых клеток плюрипотентности может оказать негативное воздействие на условия культивирования 36,37. Чтобы оценить полученный ли жировой и фибробластов IPSC линий (IPSC-F-IPSC, соответственно) поддерживается pluripotency при культивировании робота в 96-луночных планшетах в течение длительного периода времени, эти две линии культивировали на наливных робота, как описано выше, в течение 3 месяцев и затем маркеров плюрипотентности были исследованы. За этот период обе линии пассируют с протеолитическим и коллагенолитического диссоциации реагента больше, чем в 20 раз без центрифугирования. Фиксированные 96-луночные планшеты из-IPSC и F-IPSC линий, окрашенных в Oct4 и Nanog выставлены ядерной накопление этих маркеров, а SSEA-4 был замечен на поверхности клетки (рис 5А-L). Это согласуется с предыдущими сообщениями для плюрипотентных ИПСК 38 - 41. Counterstaining с DAPI не выявили каких-либо дополнительных клеток, которые не были и положительные для трех маркеров плюрипотентности. Хромосомные аномалии, как правило, наблюдается в течение стволовых клеток культуры 42,43, но не может влиять на распределение маркеров плюрипотентности, показанными на фиг.5А-L. КАнализ показал, aryotype оба робота пассировать линии IPSC было 46 хромосомы нормальные, предлагая метод роботизированная культура не ввести хромосомной нестабильности за пределы того, что может произойти, как правило (рис 5M-N).
Чтобы исследовать экспрессию гена установлено стволовыми клетками маркеров 1,41,44,45 в робота культивируемых линий Ipsc, тотальную РНК собирали параллельно окрашивания и анализа кариотипа. Оба 96-луночного планшета IPSC линии были подобные выражения плюрипотентности маркеров NANOG, POU5F1 и Rex1 тогда кардиомиоциты, дифференцированные из каждой строки не сделал, и не отдельный линию фибробластов кожи человека (HDFS) (Рисунок 6). Кардиомиоциты, полученные из обеих линий были MYL7 положительным в то время как HDFS и стволовых клеток не выражают MYL7. Обе линии IPSC были дифференцированы в кардиомиоциты с малой молекулы, Wnt техника путь манипуляции описаны недавно 46 . При окраске, кардиомиоциты из обеих линий были cTnT положительным с образованием прозрачного саркомера (рис 7). Дифференцировка в кардиомиоциты в формате 96-луночного был успешным в более чем 80% скважин (данные не показаны). Вместе эти данные показывают, 3 месяца и более 20 пассажей роботизированной культуры привело к хромосомным нормальные клетки, проявляющие программу транскрипции в соответствии с плюрипотентности, которые были также способны дифференцироваться в кардиомиоциты.

Рисунок 1. Обзор робота стволовых клеток культуры оборудования и типичной рутины культуры IPSC. () Роботизированная система обработки жидкости показан с типичной планировкой кровать для 96-и стволовых клеток культуру. Новые стерильные наконечники пипетки (Советы), съемный контейнер наконечник отходов (отходов), мульти-а автоклавируемый лоток для держать необходимые жидкие реагенты (Жидкости), 96-луночные планшеты позиционируются д поддерживается на контролируемой температурой, наклонный пандус (96-луночные планшеты), 8-канальный роботов пипетки голову, что движется влево / вправо и вверх / вниз (пипеткой головой). Пластина крышки проведения стойку (PLHR). Кровать номера позиции, показанные ниже в таблице. (Б) Роботизированная IPSC культура имеет две фазы: подачу и прохождение. Цикл производства клеток начинается, когда колония пластина готова к прохождению. Пользователь выбирает нужный коэффициент для прохода на семена и робот новая группа 96-луночных планшетах затем снова подается через регулярные промежутки времени, пока готовый к проходу. Когда пластины готовы к прохождению, большинство из каждой пластины не использовали для засева последующие колонии пластины и для других целей, таким образом, представляя фазу производства системы. Замороженные или существующие клеточные линии могут быть введены в любое время и сохранить в цикле подачи / прохода. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
e_content "FO: держать-together.within-страницу =" всегда ">
Рисунок 2. Robotic жидкие параметры обработки могут быть использованы для управления Ipsc колонии диссоциации характеристики. Каждый представитель изображение показывает фибробластов происходит иПСК диссоциируют после указанной обработки, все еще суспендируют в 96-луночных. (Верхний ряд, -
С) Фермент Время, нет растирание. Фибробластов, полученных иПСК, выращенные в 96-луночных планшетах были подвергнуты увеличения времени протеолитического и коллагенолитического диссоциации диссоциации реагента и не роботизированной растиранием проводили. (Средний ряд,
D -
F) Скорость Растирание, в 3 минутах фермент. Клетки подвергали воздействию трех минут протеолитических и коллагенолитического лечения диссоциации реагента, а затем ростовую среду 175 мкл наносили в каждую лунку и пипеткой вверх и вниз один раз в указанном размере. мкл / сек = мкл рэ секунду. (Нижний ряд,
G -
I) Растирание Повторения, 3-й фермент, 160 мкл / сек. Клетки подвергаются протеолитической и коллагенолитической диссоциации реагента в течение 3 минут, 175 мкл среды для выращивания применялась, затем растирали в 160 мкл / сек для указанного количества повторений.
Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры. 
Рисунок 3. Типичные жировой и фибробластов IPSC схема обслуживания колонии и ряд изображений плотности колонии, чтобы определить, когда отрывок поддерживать регулярный цикл загрузки / проход. () Начиная с жировой или фибробластов 96-а колония IPSC готов к прохождению, один столбец клеток пассируют на роботе, без центрифугированием и разбавляют12 новых столбцов, которые кормили через определенные промежутки времени после этого до плиты не был готов к прохождению снова. Для производства клеток, столбцы, не используемые для поддержания колонии пересевали и собирают для последующего использования. Любое количество столбцов может быть пассировать контролировать скорость расширения. (B), чтобы определить, когда проход, серия снимков плотности захватили каждые 24 ч была предоставлена пользователям. В верхней красной коробке (в пределах 72 ч после первоначального посева) колония не достаточно плотной, чтобы проход и должны быть накормлены. Когда плотность соответствует показанному на зеленом поле (при ~ 96 часов), колония находится на идеальном плотности для прохождения. 120 ч колонии слишком плотное, чтобы прохода и этот сценарий следует избегать. Последнее может быть решена с плотностью посева градиента, но рутинной культуры в этой плотности не рекомендуется. Белый бар равен 200 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большие VERSIна этой фигуре.

Рисунок 4. 96-а Система роботизированной культуры позволяет начать культур из замороженных или активных клеточных линий и выполнить посева градиент. (А) Раствор элемента изготавливают пользователем из замороженного клеточного складе или после уборки активное культуру и помещают на роботе. Затем роботизированная система выполняет последовательный протокол разбавления для распределения исходного раствора ячейки вдоль 96-луночного планшета с градиентом плотности распределенной по столбцам. (В - Е) Примеры плотности клеток от четырех из двенадцати колонн от А, 48 ч после посева протокола градиента плотности. Белые линии составит 225 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть увеличенную версию этогофигура.

Рисунок 5. Плюрипотентность сохраняется в течение жировой и фибробластов, полученных IPSC линий в течение 96-и роботизированной культуры на 22 (жировой) или 23 (фибробластов) проходы (~ 3 месяца). (- Л) Жировая и фибробластов происходит IPSC клеточные линии с помощью робота кормят и пассируют, как описано в тексте без центрифугирования в 96-луночных планшетах в течение 22 или 23 пассажей затем фиксировали и окрашивали для маркеров плюрипотентности Oct4, Nanog, или Ssea4 с DAPI контрастирующая. Белый бар равен 100 мкм. (М - Н). Параллельные культур, которые описаны в А были представлены для анализа кариотипа который показал нормальное дополнение из 46 хромосом Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенное вариант ое этой фигуры.

Фигура 6. Жировая (96-а) и фибробластов (96-F), полученный иПСК культивировали в течение более 20 пассажей в 96-луночный формат поддерживается робота экспрессию генов плюрипотентности и дифференцироваться в кардиомиоциты. Общее мРНК экстрагировали из обоих робота культивируемых линий Ipsc а также кардиомиоциты отличаются от обеих линий (CM-A = жировой IPSC, полученных кардиомиоцитов, СМ-F фибробластов IPSC получены кардиомиоциты, собранные через 14 дней после индукции дифференциации) и используется для RT-PCR, чтобы исследовать маркеров плюрипотентности NANOG, POU5F1, Rex1, кардиомиоцитов маркера MYL7 и контроль загрузки GAPDH. Человека кожные фибробласты (HDF) были также собраны и использованы в качестве, некардиомиоцитов контроля без IPSC. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 7. фибробластов и жировой получены иПСК поддерживается способностью дифференцироваться в кардиомиоциты после длительного 96-луночного культурального роботов (- Н). Жировая и фибробластов иПСК культивировали в 96-луночных робота формате более 20 пассажей дифференцировались в кардиомиоциты , 14 дней после индукции дифференциации, 96-луночного планшета связан кардиомиоциты диссоциируют и повторно наносят на низкой плотности на стеклах для иммунной окраски тропонина Т (красный), F-актин (зеленый) и ядер (синий). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть крупная версия этой фигуры.
p_upload / 52755 / 52755fig8.jpg "/>
Рисунок 8. Расширение пластины культуру 96-луночного стволовых клеток. Масштабирование производства стволовых клеток зависит от количества пластин, используемых на семена последующего группу пластин. Пользователь может либо сохранить один уровень производства путем пересева такое же количество пластин в каждой разделенной или возможность расширения производства путем посева больше пластин. Например, в цикле 0, один 96-луночный планшет пассируют до двенадцати новых пластин (цикл 1), создавая 12 кратное увеличение. Эта скорость может быть сохранена, если один из двенадцати пластин пассируют на новый набор из двенадцати пластин (цикл 1 до 2), или расширяется пассажей несколько пластин (цикл 2 до 3). Во время прохождения, либо пластины не используются для поддержания колонии доступны для последующих применений. Таким образом, пассажей 12 пластин обычно может дать больше, чем 144 пластин в двух местах: 12 для обслуживания колонии и 132 для других целей."> Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

9. Эффективность 96-луночные культуральные пластины, основанного на производство клеток значительно превышает ручной культивирование. Как показано на рисунке 8, одна пластина может быть пассируют, чтобы отобрать двенадцать пластины, которые затем могут быть пассировать до 144 пластин. Это скорость расширения может быть достигнуто двумя сплит возможностей. Техник требуется около 3,5 минут, чтобы прокормить одного 6-луночный планшет в то время как они проводят около 30 сек с одним 96-луночного планшета для изучения его на микроскоп и поместить его на роботе. Если техник проведения 144 пластин, они будут тратить около 1,2 HR обработки пластин при кормлении с роботом, тогда как ручной культуры потребуется специальный 8 ч, чтобы накормить. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы противМЭН большую версию этой фигуры.