Этот протокол требует набор доноров для сыворотки и РБК быть использованы для паразита культуры, и ВИЧ (+) и неинфицированных доноров для выделения РВМС. Институциональные Обзор платы должен одобрить все исследования и все доноры должны предоставить информированное согласие до ничьей крови.
ВНИМАНИЕ: Работа с образцами крови человека и паразитов малярии человека требует мер предосторожности. Всегда носите пальто лаборатории, перчатки и работу в шкафу биобезопасности уровня 2. В случае случайного чрескожного контакта с человеческой малярии, сообщают здоровью и безопасности для профилактического лечения. Дополнительное рассмотрение безопасности также должны быть введены в действие для работы с ВИЧ (+) крови. Носите назад закрытия халат. Двухместный перчатки (верхняя перчатки должны быть латекс). Выполните все обращения в шкафу биобезопасности уровня 2. Не используйте стакан или острые предметы. Не используйте аспиратор. Поместите все загрязненные предметы в растворе хлорной извести или virox в течение как минимум 1 часа перед утилизацией.Вымойте все поверхности с virox и УФ в течение 1 часа следующего использования. Обратите внимание, что каждое учреждение будет иметь свои специфические правила биобезопасности, которые должны быть соблюдены. Обо всех аварийных воздействий на ВИЧ-инфицированной крови для здоровья и безопасности для оценки и рассмотрения возможных профилактики после контакта.
Примечание: Различные штаммы P. существуют паразиты малярии тропической. ITG был использован для этих экспериментов, но различные штаммы могут быть использованы. Отличные инструкции по замораживания и оттаивания малярийного плазмодия паразитов доступны на веб-сайте MR4 13.
1. Создание RPMI-A для малярийного паразита культуры
- Сделать RPMI-0 путем смешивания 950 мл DDH 2 O, 1 пакет RPMI-1640 порошка, 6 г HEPES, 2 г бикарбоната натрия и 1,35 мг гипоксантина.
- Оттепель инактивированной нагреванием человеческую сыворотку из двух разных доноров. AB доноры лучше, но любой может быть использован, если паразиты выращивают в типа Oкрасные кровяные клетки (РБК). Обратить трубки перемешать. Если сыворотка содержит твердых частиц или толстый спин на 2000 оборотов в минуту, а затем отфильтровать жидкую часть с помощью блока 0,45 мкм фильтра.
- Использование блок фильтров фильтр 0,2 мкм 180 мл RPMI-0, 20 мл сыворотки крови человека (10 мл из каждого донора) и 0,5 мл 10 мг / мл гентамицина.
Примечание: Человеческая сыворотка может засорить фильтр так, может потребоваться более чем один блок фильтра. - Этикетка среды RPMI бутылку с-А, дату и источник сыворотке. Охладите до необходимости. RPMI-А может превратить облачно, когда в холодильнике. Это нормально, но увеличение облачность знак загрязнения.
Примечание: Паразит рост может варьироваться в разных доноров сыворотки. Это хорошая идея, чтобы проверить все человеческие сыворотки партий для хорошего роста паразита перед использованием.
2. Подготовка человека эритроциты Parasite культуры
Примечание: Доноры должны быть типа О.
- Соберите 7-10 мл крови в кислотно-читскорость-декстрозы (ACD) трубы. Написать идентификатор и дату сбора на этикетке донора.
- Магазин крови на 4 о С до тех пор, пока это необходимо. Используйте кровь для паразитов культур в течение 1 месяца.
- Протрите верхнюю часть трубы с 70% этанола. Осторожно снимите пробку и выбросить. Передача кровь в 15 мл пробирку. Спин в течение 3 мин при 1000 х г. Удалить плазму аспирации.
- Приостановка RBC с равным объемом теплой средой RPMI-0. Спин течение 5 мин при 1000 х г. Удалить слой светлого сгустка крови путем аспирации, ресуспендируют в 5 мл среды RPMI-0 и повторить промывочной еще 2 раза.
- Удалить супернатант и добавить достаточно RPMI-A с получением смеси, что составляет 50% по объему RBC.
- Хранить при 4 ° С до тех пор, пока это необходимо.
3. Поддержание паразита культур
- Предварительно теплой среде RPMI-А 37 о С.
- Поместите размороженные паразитов (см MR4 протокол процедуры оттаивания) в колбе Т25 с 5 мл RPMI-A и 75 мкл человеческого промывают RBC для гематокрита ~ 3%.Примечание: Гематокрит измеряет объем эритроцитов по сравнению с общим объемом. Для вычисления гематокрита измерения объема упакованных эритроцитов в общем объеме среды плюс RBC. Предположим, что размороженные паразиты будут способствовать 75 мкл РБК. При добавлении 150 мкл RBC складе (что эквивалентно добавлению 75 мкл упакованной RBC) в колбу есть в общей сложности 150 мкл RBC в 5 мл среды, которая равна гематокрита на 3% (150 мкл / 5000 мкл × 100% = 3%).
- Газ колбу в течение 30 сек с паразитом газовой смеси (1% O 2, 3% СО 2, N 2 баланса). Печать и поместить колбу широкой стороной вниз в 37 ° С инкубатор, чтобы позволить наибольшей площади поверхности для газообмена.
- Чтобы изменить среду и проверить паразитемией (должно быть сделано в день), тщательно перемещать колбу, чтобы не беспокоить слой РБК. Используя стерильный неподсоединённого пипетки Пастера оттянуть культуральной среды, не нарушая слой крови.
- Чтобы проверить годовыхrasitemia, удалить образец 10 мкл из слоя крови, поместить его на предметное стекло и с помощью второго предметного стекла создают тонкую пленку крови. Разрешить слайд высохнуть.
- Место 4 мл свежей RPMI-A в колбу, осторожно перемешать, газ в течение 30 сек, и в инкубаторе место при 37 ° С.
- Пятно слайд, используя окрашивания комплект Hema3 в соответствии с протоколом производителя.
- Для оптимального окрашивания, падение слайды в фиксирующем растворе в течение 10 сек, раствор для меня 10 сек, и решение II в течение 30 сек. Промыть в воде и оставить сушиться слайды.
- Рассчитать паразитемии путем подсчета количества PfRBC (окрашенных темно-фиолетовый) по сравнению с общим количеством РБК (окрашенных розовый). Граф в общей сложности 300 ячеек для обеспечения точности.
- При паразиты достигли паразитемии 5%, расширить культуры в колбу Т75, используя 40 мл RPMI-A, и 500 мкл RBC.
4. Паразит Синхронизация
Примечание: За день до тон экспериментировать, синхронизировать паразита культуры обработкой аланин. Только паразиты кольцо этап и неинфицированных РБК выживет это лечение. Синхронизация аланин даст вам чистого трофозоита культуры на следующий день, что может быть использовано в со-культуры экспериментов. Убедитесь, чтобы начать с паразитами культуре, содержащей большинство кольцо стадии паразитов.
- Готовят раствор аланина путем смешивания 8,01 г аланина (300 мм) и 0,365 г трис (10 мМ) в 300 мл DDH 2 O. Принесите рН до 7,4. Фильтр стерилизовать с помощью блока 0,2 мкм фильтра.
- Предварительно теплый раствор аланин до 37 ° С.
- Спин вниз культуру паразитов (5 мин х 1000 XG), и удалить среду.
- Ресуспендируют осадок в 19 томах аланин раствора (1 мл упакованы РБК 19 мл аланин решение). Инкубируют в течение 15 мин при комнатной температуре.
- Спин 5 мин х 1000 х г. Аспирируйте супернатант. Стирать в RPMI-0 раз. Аспирируйте супернатант и ресуспендируют в RPMI-A и отрегулируйте уровень гематокрита в ~ 3%. га колбу и возвращения к 37 о С.
Примечание: совместное культивирование экспериментов минимум паразитемии 5% трофозоиты необходимо, с добавлением 10% паразитемии считать оптимальной.
5. Паразит РБК Подготовка к сокультуры экспериментов
- Используйте соотношение 3 PfRBC на PBMC в со-культуры экспериментов, чтобы вызвать воспалительную реакцию. Чтобы вычислить общее PfRBC, количественно паразитемии путем тонкого мазка крови, как описано в 3.5, и гематокрита путем подсчета количества эритроцитов на мл культуры паразита с помощью гемоцитометра.
Количество PfRBC =% паразитемии х общая РБК / мл х мл культуры. Например: 10 мл культуры в 10 х 10 6 RBC / мл и 10% паразитемии равна 0,1 × 10 6 / мл х 10 мл = 10 х 10 6 PfRBC. - Спин паразита культуру в течение 5 мин при 1000 мкг (RT). Аспирируйте среднего, и ресуспендируют в 6 х 10 6 PfRBC на мл в RPMI-S + (500 мл RPMI-1640 с добавлением L-глютамина и HEPES, 10% теплаинактивированной ФБС, 1,5 мл гентамицина, 5 мл 100 мМ пирувата натрия, 5 мл 10 мМ MEM заменимых аминокислот, 5 мл 5 мМ -меркаптоэтанол).
- Возьмите под свой контроль крови (неинфицированных РБК от того же донора, используемого для поддержания паразита культуры), рассчитать гематокрита и ресуспендируют в среде RPMI-S +, в то же число РБК в мл как паразита культуры.
6. Выделение человеческого мононуклеарных клеток периферической крови (РВМС)
- Сбор венозной крови в пробирки с гепарином натрия (зеленый вверху) как с хронической ВИЧ (+), донора и ВИЧ (-) контроля. Не используйте ЭДТА в качестве антикоагулянта, как хелатирующий кальция действия ЭДТА влияет функцию клеток. На среднем ожидали между 5-10 х 10 6 PBMC за 10 мл крови. Для типичного эксперимента собрать 30 мл крови от каждого донора. Объем крови необходимо будет корректироваться в соответствии с экспериментальными требованиям.
- Как быстро, как это возможно, и, безусловно, в течение часа крови собираются,удалить кровь из труб и поместить в полиэтиленовый 50 мл пробирку. Моноциты, в частности, будут активированы и придерживаться стекла, поэтому очень важно, что при использовании сбора крови трубки стекла клетки удаляют как можно быстрее.
- Спин кровь на 1000 мкг в течение 15 мин и собирают плазму (это может быть использовано для других исследований, необходимых при - если не этот шаг может быть пропущен). Развести крови в равном объеме холодного DPBS.
- Поместите 15 мл РТ фиколлом в 50 мл трубки. Медленно, с использованием стерильных пластиковых пипетки передачи, слой крови / DPBS решение за фиколлом без смешивания. Максимум 25 мл крови раствора / DPBS можно наложить на каждые 15 мл Ficoll.
- Спин градиенты в течение 30 мин при комнатной температуре при 600 х г в. Убедитесь, что параметр "нет тормоза" на.
- Как только клетки развернулся, искать интерфейса между двумя фазами. Это то, где РВМС. Используя стерильный пластиковый передачи пипетки собирать РВМС из интерфейса (смРисунок 1). Свести к минимуму загрязнение РБК.
- Поместите собранные клетки в 50 мл пробирки, с не более чем 20 мл на пробирку. Топ труба до 50 мл стерильной холодной DPBS.
- Спин клеток в течение 10 мин при 4 ° С при 300 х г в.
- Удалите супернатант, ресуспендируют осадок в 5 мл стерильного холодного DPBS и объединить все клетки от того же донора в одной пробирке. Долить до 50 мл стерильной DPBS, и повторите шаги мыть еще 2 раза.
- Ресуспендируют клеток в 10 мл RPMI-S + среды.
- Удаление 20 мкл аликвоты и смешать с 20 мкл трипанового синего. Внесите 10 мкл в гемоцитометра и посчитать живые клетки (клетки, которые не взяли на себя синюю краску - все синие клетки мертвы). Использование гемоцитометра для подсчета количества клеток в растворе следующим образом.
Примечание: гемоцитометра имеет сетку заданных размеров, так что площадь, занимаемая линий известно. - Убедитесь, что гемоцитометре чист. Поместите покровное над countiнг площадь. Нагрузка 10 мкл раствора клеточной путем размещения пипетки в одну из скважин клиновидных. Площадь под покровным заполнит под действием капиллярных сил.
- Поместите загруженный гемоцитометра под микроскопом. Полный сетка гемоцитометре содержит 9 квадратов 1 мм 2 каждый. Граф все клетки в каждой большой площади. Если слишком много клетки присутствуют, разбавить раствор дополнительно и пересчет.
- Рассчитать концентрацию клеток следующим образом: Всего клеток / мл = (общий объем клетки подсчитывали / # квадратов) х разведение фактора X 10000 клеток / мл, например, (500 клеток / 5 квадратов) х коэффициент разбавления 20 х 10000 клеток / мл = 20 Всего х 10 6 клеток.
- Регулировка среде до конечной концентрации 10 х 10 6 на мл (RPMI-S + среда).
7. Малярия / ВИЧ-инфекцией Культура
- Пластина 100 мкл изолированных МКПК и 400 мкл RPMI-S + среды в 24-луночный планшет (1 × 10 6 РВМС на лунку). Обеспечиватьчто скважины задаются в трех экземплярах: 3 скважины для неинфицированных РБК, 3 скважины с PfRBC, 3 скважины со средним и 3 скважины с PMA / Ionomycin. Это и для ВИЧ (+) и ВИЧ (-) образец.
- Для PfRBC скважин, место 3 х 10 6 PfRBC в каждом из скважин (500 мкл паразита культуры, подготовленные в 5,2).
- Для неинфицированных эритроцитов скважин, размещать 500 мкл культуры неинфицированных эритроцитов, полученного в 5,3 в каждую лунку.
- Для средних скважин, размещать 500 мкл RPMI-S + среды, в каждую из лунок.
- Для PMA / иономицином скважин, приготовить раствор РМА / иономицином (2,5 мкг / мл, 250 мкг / мл соответственно). Поместите 500 мкл этого раствора в каждую лунку.
Примечание: В мощными стимуляторами секреции цитокинов Т-клеток, РМА и Ionomycin используют в качестве положительного контроля, чтобы обеспечить клетки являются функциональными. - Место пластины в 37 о С в 5% СО 2 инкубатора.
- Дополнительно: использовать лишние клетки для анализа фенотипической помощью проточной цитометрии или магазин в RNСтабилизация решение для будущего анализа экспрессии мРНК.
8. Выявление малярией иммунного ответа
Примечание: Выполните сокультуры эксперименты до тех пор, как 4 дня. Нет среднего изменения не требуются в течение этого времени. Оптимальная точка времени будет зависеть от типа клеток, представляющих интерес и на поставленный вопрос. Инкубационный из 12-48 ч является оптимальным для моноцитарных ответов на PfRBCs, в то время как ответы лимфоцитов были лучше всего наблюдать в 72-96 ч. Моменты времени необходимо будет оптимизирован на основе экспериментальных вопрос. Короткие периоды (2-4 ч) может использоваться, если взаимодействие между неповрежденной PfRBC и МНПК представляет интерес.
- Спин пластины при 300 мкг в течение 3 мин для осаждения клеток. Собирают 700 мкл супернатанта культуры из каждой лунки.
- Спин супернатант при 1000 мкг в течение 5 мин, чтобы очистить от мусора.
- Алиготе очищается супернатант как нужно, этикетки, и замораживание при температуре ниже -20 ° С до анализа секретируемых факторов не должно быть Перфоrmed.
- Анализ ответов цитокинов / хемокинов по ELISA или шарик массива (следовать предложенные протоколы производителя).
- Сбор клеток, оставшихся в плите в растворе РНК стабилизации и использовать для анализа экспрессии мРНК путем количественной ПЦР в реальном времени 14-16.
9. внутриклеточного проточной цитометрии для сотовых конкретных Ccytokine ответы с помощью РВМС культивируют совместно с Р. тропической Зараженный РБК
Примечание: Как указано выше, длина совместного культивирования будет зависеть от типа клеток, представляющих интерес. Если Вы заинтересованы в моноцитарных ответов на PfRBC более короткий инкубационный период необходим. Времена будет больше времени для врожденные реакции лимфоцитов γδ Т-клеток, NK-клетки, NKT клетки), и больше сих пор для CD4 и CD8 Т-клеток. Оптимизация потребуется.
- 6-8 ч до анализа добавить 1 мкл 1,000x брефелдин А для всех скважин. Верните пластину 37 ° С инкубатор. После 6-8 ч incubвания, место пластины на льду в течение 15 мин.
- Удалить клеток из скважин используя энергичные пипетирования и поместить их в маркированные microcentifuge труб. Зачистка может потребоваться удалить моноциты.
- Побочные клетки в течение 5 мин при 1000 х г. Удалить супернатантами. Ресуспендируют клеток в 500 мкл буфера проточной цитометрии (1x DPBS, 2% инактивированной ФБС тепла, 0,02% азида натрия).
- Разделить клетки таким образом, что каждый образец имеет: одну трубку для полного окрашивания антител (240 мкл) и одну трубку для окрашивания флуоресцентной минус один (предприятие) контрольным антителом (240 мкл). Бассейн небольшое количество каждого образца (20 мкл) для неокрашенной проточной цитометрии контроля (это будет использоваться в создании проточного цитометра).
- Спин клетки в течение 5 мин при 500 х г в. Удалить супернатантами.
- Инкубируйте клетки с неконъюгированного анти-CD16 человека / CD32 (5 мкг / мл) в 50 мкл буфера проточной цитометрии в течение 15 мин при 4 ° С, чтобы блокировать рецепторы Fc.
- Добавить 1 мл буфера проточной цитометрии в каждую пробирку. Спин CEзаполняет течение 5 мин при 500 х г в. Удалить супернатантами.
- Ресуспендируют клеток в 50 мкл буфера проточной цитометрии с предварительно титруют концентрации флуорофора-сопряженных антител к желаемым маркеров клеточной поверхности. Премикс раствор достаточно антитела для всех образцов, окрашенных. Инкубируйте клетки при 4 ° С в течение 20 мин. Защита от light.Note: Сумма каждого антитела должны быть оптимизированы. Мы регулярно окрашивать для CD56, CD3, γδ, CD4, CD8, CD14. Титруют объемы этих антител показаны в Таблице 1.
- Добавить 1 мл буфера проточной цитометрии в каждую пробирку. Спин клетки в течение 5 мин при 500 х г в. Удалить супернатантами.
- Добавить 100 мкл cytofix / Cytoperm решения в каждую пробирку. Инкубируйте клетки в течение 20 мин при 4 ° С. Защищать от света.
- Добавить 1 мл Пермь / промывочного буфера (при условии, как 10x концентрата - разбавить до 1x, используя DDH 2 O) в каждую пробирку. Спин клетки в течение 5 мин при 500 х г в. Удалить супернатантами.
- Добавить 100 мкмл Перми буфер / помыть управления Предприятие окрашивания антител труб и смешать ресуспендировать клетки.
- Добавить 100 мкл Пермь / промывочного буфера с заранее титруют концентрации флуорофорных-сопряженных антител к желаемым внутриклеточных маркеров (т.е., цитокинов / хемокинов) до полного окрашивания антител труб.
Примечание: Количество каждого антитела должны быть оптимизированы. Мы регулярно окрашивать с анти-ФНО и анти-IFN, антител. Титруют объемы этих антител показаны в Таблице 1. - Выдержите все трубы в течение 30 мин при 4 ° С. Защищать от света.
- Добавить 1 мл Пермь / Wash буфера в каждую пробирку. Спин клетки в течение 5 мин при 500 х г в. Удалить супернатантами.
- Ресуспендируют клеток в 300 мкл буфера проточной цитометрии с 1% параформальдегида. Пусть сидят в течение как минимум 15 мин, чтобы нейтрализовать ВИЧ.
- Подготовка одного антитела окрашенных образцов с использованием компенсации бусы, которые будут использоваться для компенсации, установленной на проточном цитометре. Тип компенсациишарики будут зависеть от используемых антител (т.е.., против мышиного Ig, анти-крысиного / хомяка Ig). Вихревые шарики. Добавьте одну каплю шариков на антитела. Добавить равное количество антител, которые используются для окрашивания. Добавить 200 мкл буфера проточной цитометрии. Они теперь готовы к использованию. Там нет необходимости мыть шарики.
- Приобретение образцов на проточном цитометре, как можно скорее и в течение 24 часов для достижения наилучших результатов. Тандем красители чувствительны к диссоциации с хранения, поэтому мы рекомендуем немедленно приобретение, если это возможно.