Наш опыт работы с этим протоколом в течение последних 10 лет привели к выявлению критических методологических вопросов. Во-первых, быстрое рассечение мозга в чашке Петри на дробленый лед является важным для поддержания качества подготовки. Во-вторых, необходимо понимать, что ткани ультразвуком короче для головного миндалины по сравнению с другими типами тканей, таких как сердце (10 сек) или почек (20 сек). В-третьих, большое внимание должно быть принято, чтобы тщательно перемешать субстрат перед добавлением его к образцам. Мы столкнулись переменных сигналов, когда смешивание последовательность была недостаточной. В-четвертых, не было пузырей должен присутствовать в кварцевую кювету при чтении образцы. В противном случае, сигнал может быть изменен.
Мы внесли изменения в последние несколько лет, чтобы увеличить воспроизводимость результатов: увеличение объема субстрата, чтобы избежать объем менее 1 мкл. Тем не менее, небольшие изменения могут возникать между последовательными анализами, и по крайней мере 3 контрольные образцы должны быть использованы дляуправления изменениями. Флуоресцентные меры этих элементов управления в среднем и средняя установлен на 100%. Флуоресцентные меры экспериментальных образцов трансформируются в процентах от контрольных образцов.
Другим ограничением метода является то, что только часть ткани используется, и, следовательно, активность каспазы-3 может быть недооценен. Действительно, временное окно апоптоза коротка в любой данной клетке и может быть пропустил, хотя это происходит в соседних областей во время отбора проб 1,4,15. Обратное также возможно: апоптоз может быть особенно интенсивным в частях ткани, в результате чего завышению каспазы-3. Мы рекомендуем использовать оставшиеся ткани (миндалины) для дополнительных методов, таких как TUNEL анализов или отношение Вах / Bcl2 (см введение).
Спектрофлюориметре имеет по крайней мере два преимущества перед Вестерн-блоттинга. Во-первых, непосредственно создает количественные данные. Во-вторых, он измеряет ферментативный AСам, а не белка или РНК выражение, которое может быть не связан, и известно, что экспрессия белка может быть увеличена без изменения ферментативной активности ctivity. Кроме того, спектрофлюориметре может быть выполнена на другие ткани или разных видов животных и могут быть приспособлены для других подтипов каспаз, с различными субстратами, так что безопасные сравнения могут быть сделаны.
В заключение, этот документ демонстрирует использование спектрофлюориметре измерить активность каспазы-3 в миндалине, что свидетельствует, что апоптоза в этой области лимбической системы через 3 дня после инфаркта миокарда.