Недавно биологи-инфекционисты использовали культуры, полученные из стволовых клеток, чтобы удовлетворить потребность в новых и лучших моделях для изучения взаимодействия хозяина и патогена. Были использованы три клеточных источника: эмбриональные стволовые клетки (ESC), индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (iPSC) или взрослые стволовые клетки. В данной работе описывается культура органоидов желудка мыши и человека, полученных из взрослых стволовых клеток, и используется для лечения желудочного патогена Helicobacter pylori. Желудочные железы человека выделяют из резекционного материала, засеивают в базальную матрицу и внедряют в среду, содержащую факторы роста эпидермальный фактор роста (EGF), R-спондин, Noggin, Wnt, фактор роста фибробластов (FGF) 10, гастрин и бета-ингибитор трансформирующего фактора роста (TGF). В этих условиях желудочные железы разрастаются в трехмерные органоиды, содержащие 4 линии желудка. Органоиды расширяются бесконечно и могут быть заморожены и разморожены так же, как клеточные линии. Для исследования инфекций бактерии микроинъецируются в просвет органоидов. Зараженные органоиды обрабатываются для визуализации. Описанные методы могут быть адаптированы к другим органоидам и инфекциям другими бактериями, вирусами или паразитами. Это позволяет изучать индуцированные инфекцией изменения в первичных клетках.