$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Эта статья описывает биохимический протокол для извлечения и экспертизы дифференциальных свойств растворимости мономерной, олигомерной и агрегатируется альфа-син из больных мозгов, используя денатурирующих гель работу. Это хорошо создана методика исследования агрегированный α-син 17, 18, 20, 21 белок, который, как правило, растворимы в своей родной форме, но получить амилоидогенных или повышенные свойства агрегации с прогрессированием заболевания или с генетическими мутациями. Тем не менее, некоторые группы используют небольшие изменения в концентрациях SDS в их буферах (8% или 10% вместо 5%) 21,22, 30. ПБС анионный детергент и solubilises альфа-син олигомеров, которые могут включать мембраной формы α-син, в то время как мочевина, хаотропный реагент денатурирует нерастворимые агрегированные и фибриллярные или амилоидогенных формы альфа-син 20. В связи с этим систематическое исследование Paleologou др 31 исследовали стабильностьальфа-син олигомеров и фибрилл с различными концентрациями мочевины (6,5 - 8 м) или SDS (0,25-2%) и сообщили, что олигомеры стабильные концентрации SDS, но не с высокой концентрацией мочевины. Их ФИЛА-1 антитела, специфичные для альфа-син олигомеров и фибрилл обнаружены высокие концентрации фибрилл в 6,5 М концентрации мочевины под неденатурирующих условиях. Концентрации буфера, используемого в этом протоколе близко отражает то, что было описано в Culvenor др. (1999) 32.
Анатомические области мозга для биохимического извлечения нерастворимого альфа-син должны быть тщательно отобраны, и это должны отражать альфа-син LB и LN нагрузку в зависимости от прогрессирования заболевания 33,34. Случаи, используемые здесь, базальные ганглии образцы из неокортекса и лимбической подтипов PD отражающих поздно, и промежуточные этапы PD прогрессии в соответствии с McKeith ctriteria 34. В Queen Square мозга банка, одна половина мозгарегулярно фиксировали в формалине для гистохимических анализа, а другая половина тщательно расчлененный в различных анатомических областей и флэш-замораживали и хранили при -80 ° С морозильников для дальнейших биохимических и ДНК исследований / анализа РНК. После фиксации формалином мозгов и рассечения невропатологи, иммуногистохимии осуществляется с помощью α-син антитела и результаты архив. Кроме того, как с помощью обычных методик, рН ткани мозга измеряется по прибытии в качестве меры агональном состояния мозговой ткани. Это формирует прочную основу для качества сохранности ткани для биохимического анализа.
Наши данные показывают, что здесь есть более SDS растворяется α-син мономера в ЧР случаях по сравнению с контроля; в частности неокортекса случаи PD имеет более высокую нагрузку α-син по сравнению с различными лимбической PD. В неокортекса случаи представляют большую прогрессирование БП α-син патологии в неокортекса регионах, таких как лобной и теменной Коррешеткам 33,34. Лимбической случаи PD имеют более высокие баллы LB в базальных отделах переднего мозга / лимбической области таких областях, как миндалевидное тело, transentorhinal и поясной областей. Для содержательного данных и статистического анализа, нужно бежать по меньшей мере 4 случая из каждой группы. Точно так же мы не пытались статистический анализ данных, представленных здесь блот.
Он также должен отметить, что различные антитела могут распознавать различные формы / состав высшего порядка альфа-син олигомеров, и каждый может иметь свое собственное относительную чувствительность и предпочтения. Это видно из результатов Тонг и др. 29, где они показывают, что 4 различных альфа-син антитела (син-1, СС, онко и LB509) дают сменные результаты, по крайней мере для альфа-син олигомеров / агрегатов. Мономеры α-син были признаны аналогичными степени всеми 4 антител, хотя они могут иметь вариации в зависимости от того, находится ли антитело эпитоп α-син либо в N-терминал или Cтерминальном 29. Точно так же, специфические антитела для фосфо-синуклеина определить четкую высокого молекулярного веса α-синуклеиновых видов 20,21. В методике, описанной здесь, высоко характеризуется антитела Syn-1 был использован 19-21.
Тем не менее, важно учитывать проверки какие-либо новые антитела на Вестерн-блоттинга с помощью антител экспериментов предварительной абсорбции, а также сверхэкспрессии и нокдаун белка в клетках.
Это важно учитывать и другие варианты, которые были применены исследователями для определения небольших фрагментов альфа-син и нестабильные или тетрамерные альфа-син форм. Это может включать легкой фиксации мембраны с 0,4% PFA в PBS, чтобы сохранить усеченные формы альфа-син 35 или лечения образца гомогената с сшиватели для стабилизации тетрамеров 36.
Точная биохимическая оценка белков с использованием посмертный тиСГУП требует минимизации деградации белка ферментативный и модификации. Поэтому целесообразно использовать ткань с кратчайшие задержки посмертных и / или выберите подобранные образцы в случае когорт. Иммуногистохимия с использованием стандартных антител для α-син иммуногистохимии должны быть выполнены до начала протокола изоляции. Степень α-син патологии сильно варьирует и может меняться в зависимости от областей, выбранных. Желательно, чтобы выбрать участки с обильной патологии в качестве положительного контроля для оптимального выхода с каждого запуска. Применение ингибиторов протеазы и, если необходимо, ингибиторы фосфатазы для предотвращения нежелательного ферментативного расщепления после освобождения внутриклеточных протеаз или фосфатаз, возникающих в процессе лизиса клеток и поддержание пробы при 4 ° С имеет решающее значение.
Важно, что все образцы в пределах партии экспериментов обработаны равномерно и стабильно, чтобы избежать изменений внутри пользовательских; несколько FREСледует избегать циклов Эз-оттаивания, так как это может потенциально отказаться пост-трансляционные модификации, такие как фосфорилирование. Критическая точка иметь в виду при рассмотрении большого числа образцов, что данные иммуноблоттинга должны быть нормализованы к одному образцу, который должен работать параллельно с другими образцами всех на гелях и все данные, которые ссылаются на этот образец. Это делается для того, нормализация данных иммуноблота между несколькими пятнами. Этот метод принят в нашей недавнем исследовании 22.
Следует отметить, что для того, чтобы сохранить фоновое ECL низким блоты не следует высыхать в любой момент во время протокола вестерн-блот. Кроме того, очень длинных выдержках (> 10 мин) на Авторадиография фильмов следует избегать, поскольку это приведет к насыщению сигнала ECL и приведет к неточному количественного определения.
Это выше протокол является относительно простым техника с использованием общих лабораторных реагентов и вструментов и может быть ценным инструментом для исследования патофизиологии α-син белка в PD исследований. Эта методика не может быть продлен только с соответствующими изменениями к изучению α-син биологии в альфа-син трансгенных животных, но и для других нейродегенеративных заболеваний, показывающих аномальные вклады агрегированных белков, таких как AD, MSA, DLB, HD и frontotemporaldementias. Однако данные Вестерн-блоттинга, описанные здесь, могут также быть подтверждено с помощью иммуноферментного анализа с использованием антитела к конкретным формам альфа-син 31.