После того, как соответствующие реагенты, настройки микроскопа, и эксперименты калибровки настроены, этот метод относительно прост в исполнении. Критические шаги включают: мечение Candida с S-1 , чтобы гарантировать , что нет перегрузки красителя, калибровки и анализа изображения.
S-1 , представляет собой реагент подходит для более щелочных рН среды, что особенно важно для нейтрофилов 21 , но ограничивает его использование в определенных типах клеток. Для получения более кислых сред, такие как макрофаг фагосомы, Snarf-4, или S-4, больше подходит из - за его более низкий рКа 22. Кроме того, для более точных показаний цитоплазматических, то лучше использовать S-4, в качестве стандартной кривой для S-1 показывает , что коэффициенты флуоресценции начинают плато ниже рН 6 (рисунок 3). Другие красители, такие, как 2' , 7'-бис- (2-карбоксиэтил) -5- (и-6) -Carboxyfluorescein (BCECF) или pHrodo Красный также может быть более подходящим в продолжениевнутр, что, как ожидается, будет кислым. Однако цитоплазма окрашивание еще необходимо для правильной идентификации фагосом , содержащих Candida.
Важной особенностью показателя рН phagosomal является то, что она не необратимо изменяется при реактивной среде phagosomal. S-1, кажется, быть устойчивым к нейтрофильной среде. Об этом свидетельствует Левин и др. 5 (см Дополнительное видео 4 из ссылки 5) , которые демонстрируют фагоцитоз и последующее высвобождение S-1-меченых Candida частицы на Hvcn1 - / - нейтрофилы. Когда фагоцитозу, частица превращается из желтого / оранжевого до красного (нейтрального до щелочного рН), но когда частица высвобождается нейтрофилов, он возвращается к своему первоначальному цвету.
Важно отметить некоторые ограничения, связанные с использованием S-1. Тот факт, что этот краситель имеет два спектров излучения, позволяющие логометрический МЭСurement является преимуществом, но специальное оборудование необходимо для получения изображений; микроскоп, использованный для экспериментов должны иметь возможность записывать два изображения одновременно или с незначительной временной задержкой. Авторы полагают, что исследователь пытается этот протокол имеет опыт работы с помощью конфокальной микроскопии, или имеет доступ к квалифицированному специалисту. Мы не можем перечислить все конкретные параметры микроскопа, как они будут отличаться для каждого микроскопа и должны быть оптимизированы исследователем. Ацетоксиметил эфир, конъюгированный с S-1, что позволяет краситель диффундировать в цитоплазме клеток разрушается под действием неспецифических эстераз в цитоплазме клеток с образованием молекулы флуоресцентного. Эстеразы, такие как щелочной фосфатазы, присутствуют в человеческой сыворотке и эмбриональной телячьей сыворотки, которые используются для дополнения среды для культивирования клеток. Соответственно, среда, в которой клетки загружаются с S-1-AM (раздел 4.5) не должны содержать сыворотку. Это может оказаться сложным, если с использованием клеток, которые требуют более питательной RICч среды для поддержания их чем сбалансированного солевого раствора, используемого в данном протоколе. Аналогичным образом, другие компоненты, флуоресцентные средние, такие как феноловый красный, могут создавать помехи измерений S-1.
Столбики ошибок на рисунке 3 , показывают , что есть некоторые различия в измерениях коэффициента при каждом значении рН. Подходящее количество повторений каждого эксперимента (по крайней мере, п = 3), и как много отдельных измерений в каждом отдельно взятом эксперименте необходимы, чтобы преодолеть между вакуолярной вариацией. Таким образом , целесообразно измерять рН по меньшей мере , 100 фагосом для каждого условия и столько phagosomal областей , которые , как представляются, содержат только один Кандид. В фагосомах быть измерены количественным должен быть те, которые полностью поглотили частицу кандидоза (т.е. те , полностью окруженная цитоплазмами). Для смягчения от случайных смещений в отборе клеток / фагосом для количественного определения, все анализы должны выполняться во времяслеп к условиям эксперимента.
Здесь мы описали выделение нейтрофилов путем осаждени с применением декстрана цельной крови с последующим центрифугированием слоя плазмы через градиент плотности. Мы используем эту технику, так как он быстро и эффективно производит чистую (> 95%) популяцию нейтрофилов, хотя существует и другие методы, доступные, например, всего центрифугирование крови через другие градиент плотности формулы или отрицательную селекцию нейтрофилов с использованием специализированных наборов с антителами или магнитными бусы. Однако, последние могут быть слишком дорогими для большинства групп, которые изолируют нейтрофилы обычно. Кроме того, мы используем антикоагулянт гепарин в крови собирающих трубки, в то время как другие исследователи могут быть более привыкли использовать этилендиаминтетрауксусную кислоту (ЭДТА) или кислый цитрат натрия (ACD). Поскольку существует много различных методов, чтобы выбрать из, это до личных предпочтений исследователя.
Более того,при выделении и манипулирования нейтрофилы они должны быть обработаны с некоторой осторожностью, чтобы избежать чрезмерной активации. Предупредительные шаги включают в себя: только с помощью пластиковой посуды, без стекла; фильтр-стерилизовать все буфера, чтобы удалить загрязняющий эндотоксин; когда спиннинг нейтрофилы убедитесь, что центрифуга хорошо сбалансирована, чтобы избежать чрезмерных вибраций; ограничить настолько, насколько это возможно, время нейтрофилы остаются в осадке после центрифугирования; не выдерживают нейтрофилов в растворе более чем на 5 × 10 6 / мл; и выполнить эксперимент, как можно скорее после выделения.
Этот метод может быть адаптирован для измерения изменений в области рНа и phagosomal с течением времени с помощью набора нагретой ступени до 37 ° С на микроскопе и принимая снимки один раз каждые 30-60 лет с той же позиции, как описано для этапов калибровки. Это также может теоретически быть адаптирован для более высокой пропускной способностью экспериментов, например, в 96-луночные планшеты, а также для проточной цитометрии экспериментов, где S-1 можетбыть использованы в качестве индикатора рН 23. Однако, в этих условиях, акцент на индивидуальной активности клеток заменяются более глобальным влиянием на популяции клеток.
Этот метод призван обеспечить относительно простой экспериментальной установки, на которой отдельные исследователи могут адаптироваться в соответствии с их областью интереса. Исследователи могут хотеть исследовать нейтрофильных phagosomal рН и в то же время площадь измерения движения других ионов, например, внутриклеточной концентрации кальция. Есть несколько флуоресцентных Са 2+ показателей легко доступны для конфокальной микроскопии, таких как индо-1, который также имеет двойственные спектры излучения при 400 и 475 нме 24. Эти длины волн излучения не перекрываются с спектров излучения S-1, но длина волны возбуждения находится в ультрафиолетовой (УФ) части спектра, которые могут быть вредными для клеток, и УФ-лазер не обычным явлением на всех микроскопах. Исчерпывающий обзор различных показателейизмерения внутриклеточного кальция поток покрывается Такахаши и др. 25 и Хиллсон и др. 26.
В заключение, существуют другие методы , доступные для измерения рН phagosomal с использованием различных флуоресцентных красителей , как Нунеш и др. показали , 13, а также другие группы 27, 28. Другие исследователи также использовали S-1 для измерения цитозольного рН 29 или рН phagosomal 14. Тем не менее, этот протокол является уникальным в измерении одновременно рН как цитозоль и фагосомы, что обеспечивает возможность наблюдать изменения в phagosomal площади поперечного сечения и различать дикого типа и Hvcn1 - / - нейтрофилы мыши, и нейтрофилы человека с и без работая NADPH оксидазы.