RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Здесь представлен протокол имитировать вход бактериальных Производные соединений после нарушения кишечный барьер. Низкая доза сублетальных липополисахарида системно вводили мышей, которые наблюдали за 24 ч после инъекции. Выражение провоспалительных цитокинов был определен в нескольких точках времени в селезенке, печени и кишечника.
Кишечного эпителия барьер отделяет хост от микрофлору, которая обычно переносится или игнорируется. Нарушение этого барьера приводит к входу бактерий или бактерии производные продукты в узле, доступ к хост циркуляции и внутренних органов, ведущих к неконтролируемой воспаление как наблюдается в пациентах с воспалительным заболеванием кишечника (IBD), что характеризуется повышенной проницаемости кишечного эпителия.
Чтобы имитировать вход бактериальных Производные соединений в хозяина, эндотоксемия модель была принята в котором липополисахарида (LPS), компонент внешней клеточной стенки грамположительных бактерий, вводили в мышей. В этом исследовании внутрибрюшинно вводили сублетальных доз ПЛАСТИНОК и мышей были впоследствии наблюдение за 8 ч, используя счет болезни. Кроме того выражение, которое уровни воспалительных цитокинов ИЛ 6, Il1b и Tnfa были проанализированы в селезенке, печени и кишечника ПЦР в разных временных точках пост LPS инъекций. Эта модель может быть полезна для исследования, с участием расследования иммунных реакций после вторжения микроорганизмов или бактериальной производные продукты, вызванные нарушением барьер тела поверхностей.
Кишечнике человека колонизировали с большой консорциум микроорганизмов, образует микробиоты, который разработал взаимовыгодные отношения с принимающей страны в ходе эволюции. В этой связи принимающей предоставляет безопасную нишу для микробиоты, тогда как микробиоты обеспечивает витаминов, питательных пищеварение и защиты от патогенных микроорганизмов на хост, где микробиоты проживает1. Когда нарушается этот выгодные отношения между принимающей и микрофлору, могут развиваться заболеваний, таких как воспалительные заболевания кишечника (IBD). IBD является многофакторной хроническим воспалительным заболеванием кишечника, вызванных генетических и экологических факторов, которые происходят в двух основных формах, болезнь (CD) крона и язвенного колита (UC). Несмотря на сходство между двумя формами IBD они характеризуются некоторые различия в местонахождение и характер воспалительных изменений. CD является рецидивирующего Трансмуральное воспалительных расстройство, которое потенциально может распространяться на любую часть желудочно-кишечного тракта, в то время как UC является не Трансмуральное и ограничивается толстой кишки. Кроме того мутации в нуклеотидных-олигомеризации домена содержащих белок 2 (NOD2), рецептор признание шаблон (ПРР), которая признает muramyl дипептид (ПРУ), компонент клеточной стенки наиболее грамположительных и - отрицательных бактерий, является связанные с CD2. Кроме того Escherichia coli (E. coli), Listeria и стрептококки и их продукты были найдены внутри макрофагов в CD пациентов, которые вступили узел после того, как барьер нарушение3. Когда бактерии или их продукции введите хост во время разработки CD, иммунная система развивается реакции, ведущие к производству циркулирующих антител анти-бактериальное4. Возможно наиболее убедительные доказательства для роли микрофлору в патогенезе IBD проистекает из моделей мышей. Когда животные лечатся антибиотиками, или когда мыши находятся в стерильных условиях (GF), тяжести заболевания уменьшается в большинстве колит моделей, таких как в Ил-10-/ мышей, которые не развиваются колит в GF зал5,6. Кроме того колит также тревожит состав микрофлору, которая характеризуется несбалансированный состав и снижение богатство, называется дисбактериозом7. Следствием IBD может быть повышенной проницаемости кишечника, которые могут привести к входу микробов и микробных производные продукты в хозяина.
В животных применение декстран сульфат натрия (DSS) индуцирует кишечного эпителия нарушение приводит к повышенной проницаемости эпителиальных барьер8. Портал LPS концентрации повышаются в животных с DSS колит9. Интересно, что животные не хватает C тип Лектин рецептор конкретных внутриклеточных адгезии молекулы-3 захвата nonintegrin связанных с гомолога 1 (знак-R1) защищены от DSS колит и LPS-индуцированной эндотоксемии10. Для дальнейшего распространения в хозяина, бактерии или бактерии производные продукты должны пройти сосудов барьер11, брюшной полости, в которой расположен маленький и большой intestine, брыжеечный лимфатических узлов и/или печени12. Чтобы уменьшить сложность этой системы, был использован определенных бактериальных производные соединения. LPS, которые вызывает эндотоксемии после внутрибрюшинного (и.п.) или внутривенно (и.в.) инъекций13 было впрыснуто в мышей, изучение выражение интерлейкинов Il6 и Ilb и цитокина Tnfa в ответ на ЛПС.
LPS является патоген связанные молекулярные шаблон (PAMP) выраженный компонент клеточной стенки грамположительных бактерий, который состоит из липидов A (главный PAMP в структуре ПЛАСТИНОК), олигосахариды ядро и O боковой цепи14. Толл подобный рецептор 4 (TLR4), выраженные дендритные клетки, макрофаги и эпителиальных клеток признает LPS15, что требует совместного рецепторов для соответствующую привязку. Острая фаза LPS-привязки протеин (LBP) связывает LPS сформировать комплекс, который передает LPS в кластер дифференцировки 14 (CD14), glycosylphosphatidylinositol якорь мембранный белок. CD14 далее челноков LPS лимфоцитов антигеном 96, или также известный как MD-2, который связан с внеклеточного домена TLR4. Связывание LPS в MD-2 облегчает Димеризация TLR4/MD-2 побудить конформационные изменения набора молекул внутриклеточных адаптер для активации течению сигнальный путь14, который включает миелоидного дифференциации первичной ответ гена 88 (MyD88) - зависит от пути и МДП домена содержащих вызывая адаптер интерферона β (TRIF) - зависимых путь16. Признание LPS, TLR4 затем активирует NF-κB путь и Индуцирует экспрессию провоспалительных цитокинов, таких как TNFα, IL-6 и IL-1β17.
В частности когда LPS впрыскивается в животных, концентрация ПЛАСТИНОК для животных, генетический фон животного и диета должна рассматриваться. Высокие концентрации LPS приводит к септический шок, характеризуется гипотензии и несколько орган неудач и наконец до смерти18. Мышей менее чувствительны к ЛПС, по сравнению с людьми, где концентрации LPS между 2-4 нг/кг веса тела (BW) способны вызвать цитокинов шторм19. Для мышей летальной дозы (ЛД50), которая вызывает смерть в половине мышей колеблется от20 10-25 мг/кг массы тела в зависимости от штамма мыши используется. Для часто используемых мыши штаммов, C57Bl/6 и BALB/c, смертельная доза 50% (ЛД50) – 10 мг/кг массы тела. В отличие от штаммов C3H/HeJ и C57BL/10ScCr защищены от ПЛАСТИНОК индуцированной эндотоксемии, который из-за мутации в Tlr421. Следовательно Tlr4-недостаточным мышей, hyporesponsive для инъекций с ПЛАСТИНОК22. Другие генетически модифицированные мыши линии, такие как PARP1/мышей23 устойчивы к LPS-индуцированной токсический шок.
Описанная модель мыши здесь использует сублетальных дозы LPS, ведении системно для имитации последствий распространения ПЛАСТИНОК после нарушения барьер тела поверхностей. Выбранной LPS концентрации (2 мг/кг массы тела) не вызывает смертности в C56Bl/6 мышей, но индуцированных релиз провоспалительных цитокинов.
Мышей были разведены и хранятся в определенных условиях возбудителя бесплатно (SPF) в объекте животных Департамента биомедицины, Университет Базеля (Базель, Швейцария). Все мыши эксперименты были проведены в соответствии с швейцарских федеральных и кантональных правил (номер 2816 [кантона Базель-Штадт] животных протокол).
1. Приготовление раствора LPS
2. внутрибрюшинного введения ПЛАСТИНОК для мышей
3. контролировать мышей
4. ткань выборки для извлечения рибонуклеиновой кислоты (РНК) и гомогенизации
5. РНК добыча из ткани
Примечание: РНК изоляции реагентов, хлороформе и спиртов считаются опасными материалами. Выполняйте извлечение RNA под химические вытяжки. Использование сертифицированных бесплатно РНКазы реагенты и оборудование для поддержания свободной РНКазы среды.
6. пищеварение оставшихся ДНК
7. Обратная транскрипция
8. Количественная ПЦР (ПЦР)
Для имитации последствий для принимающей страны после входа бактерий или бактериальной производные продукты, возникающая после нарушения кишечного барьера, LPS вводили мышей C57Bl/6 в сублетальных доз (2 мкг/г веса тела). Каждый мыши контролируется и забил за возникновение эндотоксемии с параметрами, перечисленных в протоколе, которая включает внешний вид мышей, деятельность животных, состояние глаз и частота дыхания и качества (Таблица 1) . Животных наблюдались клинические признаки заболевания, который достиг 6-10 ч после инъекции ПЛАСТИНОК и восстановлены в течение 24 ч (рис. 1). Отдельные мышей были пожертвовать 2 h, 4 h и 8 ч после инъекции ПЛАСТИНОК. Куски ткани были собраны из селезенки, печени и кишечника. РНК был изолирован от этих органов и обратной транскрипции cDNA. CDNA был использован как шаблон для ПЦР для определения уровней выражение Il6 (рисунок 2A) Il1b (рис. 2B), TNFa (рис. 2 c) и Il10 (Рисунок 2D) с праймерами для ПЦР перечисленные в таблице 6. Проявление ИЛ 6 пик 2 ч после инъекции в селезенке и толстой кишки и 4 ч после инъекции в печени. Выражение Il1b, TNFa, и Il10 пика 4 ч после инъекции в селезенке, печени и кишечника. В течение 8 ч после инъекции проявление ИЛ 6, Il1b, TNFa и Il10 вернулся в базовых уровней.

Рисунок 1: LPS инъекции (2 мкг/г веса тела) индуцированной клинических признаков, эндотоксемии в C57Bl/6mice. После инъекции 2 мкг/г веса тела LPS, отдельные мышей были проверены с Оценка болезнь, представлены в таблице 1, которая включает внешний вид и активность животных, открывая их глаза и их частота дыхания и качества каждые 2 ч для 12 h и 24 h кормовой ER LPS инъекций. Оценка по болезни (ось y) были смыты соответствующих времени (ось x). Средний ± SD для 4-5 мышей в каждый момент времени представлена. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 2: LPS инъекции (2 мкг/г веса тела) Индуцирует экспрессию провоспалительных цитокинов в мышей C57Bl/6. Мышей были введены с 2 мкг/г веса тела ПЛАСТИНОК и уровни выражения Il6 (A), (B) Il1b , Tnfa (C) и (D) Il10 были проанализированы ПЦР в селезенке, печени и кишечника в назначенное время очков после инъекции. Уровни цитокина выражения были нормализованы по выражению Gapdh. Средний ±, проявленную SD для 4-5 мышей в каждый момент времени. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Таблица 1: болезнь Оценка лист для мониторинга мышей C57Bl/6 после инъекции LPS. Параметры, которые контролируются после инъекции ПЛАСТИНОК. Животные были контролироваться каждые 2 ч после инъекции в течение 12 ч, и оценки были даны для каждого отдельного параметра, перечисленных в таблице. Окончательная оценка для каждого животного представляет собой сумму всех индивидуальных очков. Это адаптированный ссылки24. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
| Сумма | Реагент |
| 2 мкл/образец | 10 x буфер RT |
| 0,8 мкл/образец | 25 x deoxynucleotide (dNTP) микс (100 мм) |
| 1 мкл/образец | RT случайных праймеров |
| 4.2 мкл/образец | Нуклеаза свободной воды |
Таблица 2: Реагенты используются для подготовки мастер смесь для обратной транскрипции.
| Температура | Время |
| 25 ° C | 10 мин |
| 37 ° C | 120 мин |
| 37 ° C | 5 мин |
| 4 ° C | удерживайте |
Таблица 3: Термоциклер параметры, используемые для обратной транскрипции.
| Сумма | Реагент |
| 5 мкл/хорошо | 2 x Мастер микс |
| 0,05 мкл/хорошо | Ссылка краска |
| 500 Нм финал/хорошо | Форвард грунтовка |
| 500 Нм финал/хорошо | Обратный грунтовка |
| между 10 и 100 нг/Ну, мы использовали 40 нг/хорошо | шаблон cDNA, разводили буфером для разбавления проб шаблон (1/100 разбавления этого буфера была в свободной от нуклеиназы воды и используется для разбавления cDNA шаблона). Разбавление шаблон в этом буфере позволяет визуализировать скважин, где шаблон добавляется в качестве реакции изменения цвета от синего до зеленого |
| Нуклеаза свободной воды, чтобы окончательный объем 10 мкл/хорошо | Нуклеаза свободной воды |
Таблица 4: Описание реакции PCR.
| Температура | Время | |
| 95 ° C | 2 мин | |
| 95 ° C | 5 s | 40 циклов |
| 60 ° C | 20 s | |
| 95 ° C | 15 s | плавления кривой analaysis |
| 60 ° C | 1 мин | |
| 95 ° C | 15 s |
Таблица 5: Термоциклер параметры, используемые для ПЦР.
| Грунтовка | Последовательность | Температура плавления | Длина продукта |
| ИЛ 6 F | TCG КЛЯП GCT TAA TTA CAC ГПТ TTC T | 60,3 | 94 bp |
| Il6-R | GCATCATCGTTGTTCATACAATCA | 58.2 | |
| Il1b-F | TGTGAAATGCCACCTTTTGA | 56,1 | 94 bp |
| Il1b-R | GTCAAAGGTTTGGAAGCAG | 57,2 | |
| Il10-F | ATCGATTTCTCCCCTGTGAA | 56,2 | 108 bp |
| Il10-R | TGTCAAATTCATTCATGGCCT | 56,1 | |
| Tnfa-F | CCACCACGCTCTTCTGTCTAC | 60,4 | 103 bp |
| Tnfa-R | AGGGTCTGGGCCATAGAACT | 60 | |
| GAPDH-F | CATCAAGAAGGTGGTGAAGC | 56,7 | 199 bp |
| GAPDH-R | CCTGTTGCTGTAGCCGTATT | 58 |
Таблица 6: используется в реакции ПЦР праймеры. Последовательность грунтовки используется для ПЦР для выявления цитокины мыши и уборки гена Gapdh.
Авторы не имеют ничего сообщать.
Здесь представлен протокол имитировать вход бактериальных Производные соединений после нарушения кишечный барьер. Низкая доза сублетальных липополисахарида системно вводили мышей, которые наблюдали за 24 ч после инъекции. Выражение провоспалительных цитокинов был определен в нескольких точках времени в селезенке, печени и кишечника.
JHN поддерживается Швейцарским национальным фондом (SNSF 310030_146290).
| DreamTaq Green PCR Master Mix (2x) | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, США | K1081 | |
| High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit, | Applied Biosystems, Фостер-Сити, Калифорния, США | 4368813 | |
| набор ДНКазы без РНКазы, | Qiagen, Hilden, Германия | 79254 | |
| LPS Escherichia coli O111:B4 | Invivogen, Сан-Диего, Калифорния, США. | tlrl-eblps | |
| Omnican 50 Одноразовый инсулиновый шприц | B. Braun Melsungen, Мельзунген, Германия | 9151125 | |
| Биоанализатор 2100 | Agilent Technologie, Санта-Клара, США | не применимо | |
| Центрифуга 5430 | Eppendorf, Гамбург, Германия | не применимо | |
| Центрифуга Mikro 220R | Hettich, Кирхленгерн, Германия | не применимо | |
| Инструменты для вскрытия | Aesculap, Туттлинген, Германия | не применимо | |
| Fast-Prep-24 5G Sample Preparation System | M.P. Biomedicals, Санта-Ана, Калифорния, США | NanoDrop | |
| ND-1000 | NanoDrop Products, Уилмингтон, Германия, США | не применимо | |
| TRI Reagent | Zymo Research, Ирвайн, Калифорния, США | R2050-1 |