ЭТИМ супрессивной недавно было признано в качестве отличительной чертой рака и известен играть значительную роль в разработке, прогрессии и защита твердых опухоли рака, а также уменьшить их подверженность иммунотерапия1. ВРЕМЯ состоит из многочисленных клеточных подмножеств и фенотипы, все из которых обеспечивают критический взгляд в состояние иммунологической опухоли. Эти иммунологические подмножества может быть далее разбиты на клетки лимфоцита или миелоидной происхождения, которые вместе составляют большинство врожденного и адаптивного иммунного ответа2,3. Последние достижения в области рака иммунотерапия продемонстрировали, что иммунотерапевтических стратегии (т.е., иммунных КПП ингибиторы, химерных антигена рецепторов Т-клетки и т.д.) имеют потенциал, чтобы побудить прочный рака регрессии; Однако они по-прежнему относительно неэффективными в твердые опухоли рака4,5. Многочисленные группы показали критическое препятствие, что время может играть на успех лечения6,7, и таким образом, сохраняется необходимость точно оценить новые immunotherapies в параметре доклинические, уделяя особое внимание их возможность модулировать или преодолеть время8.
Нынешние попытки характеризовать время обычно используют либо микроскопии или проточная цитометрия наряду с антитела обозначая стратегии выявления клеточных иммунных подмножеств и их особенности9,10. Эти две стратегии обеспечивают уникально различную информацию, как микроскопии позволяет пространственных признательность сотовой подмножеств и проточной цитометрии обеспечивает высокую пропускную способность и более широкой количественная оценка клеточных изменений. Несмотря на недавние улучшения в флуоресцентные мультиплекс иммуногистохимии, оптимизации спектральных тепловизионных систем, которые теперь может поддерживать до 7 параметры, ограниченной группы размер затрудняет широкий уровень иммунной профилирования и таким образом эта техника часто зарезервировано для более сосредоточены анализы. В результате проточной цитометрии остается одним из наиболее широко используемых иммунной, методы профилирования. Несмотря на широкое использование в характеристике времени методы, используемые для обработки и окраски являются довольно переменной. Чаще всего протоколы используют опухоль отделения фермента (то есть, коллагеназы, DNase, и т.д.) и ручной диссоциации методы для достижения одной ячейки суспензий, следуют антитело пятная и анализ7. Несмотря на преимущества каждого метода многочисленные группы показали большой изменчивости, который может быть вызван через эти методы11. Это крайне затрудняет сопоставление кросс исследование профилирования микроокружения опухоли, даже при оценке той же модели мышиных опухоли. Кроме того эти методы предоставляют ограниченный потенциал для оценки опухоли сотовой и опухоли иммунной проникновения компонентов независимо друг от друга, поскольку оба компонента перемежаются после переваривания. Количество образцов затем ограничивает мультипанельные окрашивание и анализа, который становится серьезной проблемой при попытке характеризовать редкие иммунологические подмножеств (то есть, опухоль – специфичные Т-клетки)12. Более последние методы массового цитометрии, или цитометрии на время полета (CyTOF), позволяют высокой мерного фенотипического анализа сотовой подмножеств с некоторых систем, поддерживающих конструкций группа более чем 42 независимых параметров13. Несмотря на огромную мощь CyTOF технологии в иммунной профилирование он остается ограниченным из-за расходов, анализ опыта и доступ к оборудованию. Кроме того, многие протоколы CyTOF рекомендуем очистки иммунных подмножеств для улучшения соотношения сигнал шум14, и поэтому мы предлагаем, что наш метод обогащения могут быть использованы вверх по течению от CyTOF анализа для повышения качества данных.
Здесь мы описываем пищеварение микроокружения опухоли и анализа, метод, который включает в себя опухоли иммунной проникновения разделения. Цель данного метода должна позволить независимым высок объём профилирование иммунной инфильтрата опухоли и опухоли сотовой фракций для широкого характеристика микроокружения опухоли. С помощью этого метода, мы еще больше продемонстрировать важность проведения анализа всей опухоли, как модель подкожной твердых опухолей было установлено значительное пространственная неоднородность иммунологические. В целом этот метод можно более точно и последовательно сравнить между выборками потому что оно обогащает иммунной сотовой подмножеств внутри опухоли и позволяет для независимого профилирования опухолевых клеток и иммунных фракций опухоли.