$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
fPhycobiliproteins являются водорастворимый пигмент белковых комплексов, которые представляют собой основные компоненты светособирающего антенн в прокариотических цианобактерий (синезеленых) и несколько эукариотические таксоны (Glaucophyta, Rhodophyta и криптофитов)1. Они возникают главным образом как супрамолекулярные комплексы, называется phycobilisomes, и обычно они прикреплены к поверхности фотосинтетических мембран на стороне стромы, за исключением криптофитов, где фикобилипротеинов локализованы в тилакоидов люмен2. Были определены четыре вида фикобилипротеинов до Дата: аллофикоцианин основных и периферийных фикоцианин, фикоэритрин и Фикоэритроцианин1. Как основной светособирающих комплексов phycobilisomes представляют собой один из важнейших факторов производительности массовой культуры водорослей и цианобактерий. Доказано, что phycobilisomes усечение может повысить накопления биомассы под сильный свет3. С другой стороны под скромным или низкой освещенности, антенна усечения привело темпы роста и биомассы накопления сокращение3,4. Фикобилипротеинов коммерчески используются красители пищевые, фармацевтических препаратов и пищевых добавок, в косметической промышленности, а также флуоресценции зондов с приложениями в проточной цитометрии, флуоресцентного иммуноанализа и микроскопии флуоресцирования5.
Этот протокол фокусируется на количественное определение фикобилипротеинов в модели цианобактерии Synechocystis. Цианобактерии являются ранние oxygenic фотосинтетических автотрофы; они формировании биосферы земли более 2,4 миллиарда лет6. Они играют решающую роль в глобальных биогеохимических циклах, азота, углерода, кислорода и других элементов. Среди цианобактерий, одноклеточные штамм Synechocystis получила уникальное положение, поскольку он был первым цианобактерии с весь геном последовательности7,8, это естественно трансформер экзогенной ДНК9, и Он выполняет стабильным и относительно быстрый рост10,11. В Synechocystis, основной компонент антенна, аллофикоцианин, ассоциируется с составной мембранных белков и прилагаемый фикоцианина расположен на периферии тилакоидной мембраны.
Несколько методов для извлечения phycobiliprotein и количественной оценки сравниваются в рамках настоящего Протокола. Процедура окончательного извлечения был успешно применен Synechocystis, а также другие цианобактерий штаммов, включая Arthrospira Cyanothece sp., Synechococcuselongatus, спирулина sp., СП.и Nostoc sp. и он был также успешно применяется для красных водорослей порфиридиума cruentum. Таким образом метод, разработанный в этом протоколе может рассматриваться как универсальный метод для извлечения phycobiliprotein. Даже несмотря на то, что некоторые из методов испытания извлечения привело к повышению урожайности общего белка, здесь описывается процедура извлечения условии высоким phycobiliprotein дает вместе с наименьшим содержанием остатков хлорофилла в Экстракт Phycobiliprotein. Для правильной фикоцианина и аллофикоцианин спектрофотометрические количественной оценки необходимо уменьшить содержание хлорофилла .
Спектры поглощения phycobiliprotein может значительно различаться между различными водоросли и цианобактерии видов12,13,14,,1516,17 и даже среди нескольких штаммов одного цианобактерий рода18. Таким образом конкретные длинах волн и поглощения коэффициенты, используемые для определения фикоцианина и аллофикоцианин в Synechocystis не применяются обычно для других штаммов. Кроме того Synechocystis не содержат фикоэритрин и Фикоэритроцианин, которые могут быть найдены в некоторых других водорослей и цианобактерий. Для целей определения фикобилипротеинов штаммов Synechocystisпомимо рекомендуется оценить спектрофотометрические уравнения для каждого штамма индивидуально.
Хотя протокол содержит два больше шагов (на ночь паром для лиофильной сушки сотовой окатышей и извлечения протеина 1 час), общее рабочее время для количественной оценки фикобилипротеинов не более 2 часов.