Здесь мы представляем подробный протокол для assay на основе ячеек сократимости, с помощью дрозофилы линии клетки культуры ткани (S2R + клеток), проходит II сужение миозин-мышцы в ответ на туман сигнализации. Этот assay полезен для расследования туман путь, а также механизмов, которые регулируют миозин-мышцы II сократимости.
Культивирование клеток соображения:
Условия, при которых S2R + поддерживаются клетки имеет решающее значение для достижения надежных данных из этого анализа. При планировании выполнения пробирного сократимости, он лучше всего поддерживать S2R + клеток в щит и пел м3 насекомых среде. Хотя S2R + клетки могут процветать в других СМИ культуры клеток насекомых (например, SF900 или Шнейдера насекомых средний), они часто теряют их отзывчивость туман. S2R + клетки, которые имеют высокий проход число, как правило более чем 20-25 проходы, начинают терять чувствительность к интерференции. Это лучше всего использовать клетки рано проход для всех экспериментов. Еще одним важным аспектом для RNAi истощения экспериментов является выбор надлежащего контроля. Общие негативные элементы включают dsRNA ориентации EGFP или pBlueScript, ни из которых имеют гомологичностью к лету генома. Ориентация белков в тумане пути (Ро, Республика Корея и т.д.), который, при истощении, предотвратить активацию миозин-мышечной сократительную, также являются полезными элементами управления. S2:FOG-Myc клетки может быть сохранен в среде культуры альтернативного клеток например дополнена 100 единиц/мл пенициллина, 100 мкг/мл стрептомицина, SF900 и 0,25 амфотерицин B. Примечание что FBS не требуется при культивировании клеток в SF900. Плотность клеток также является критическим компонентом для всех аспектов дрозофилы клетки культуры ткани. В отличие от клеток млекопитающих культуры ткани, дрозофила-производных тканевой культуры клетки процветать лучший под более высокой плотности клеток (плотность не ниже чем 5 x 105 клеток/мл). Однако при выполнении этот assay, важно что клетки не покрытием на кон A-покрытая прозрачным дном блюда выше 80% слияния, как количественная оценка контракт по сравнению с не контракт клеток станет чрезвычайно утомительно.
Важнейшие аспекты и альтернативные подходы сотовой сократимости пробирного:
Производство туман, лигандом, вызывающее миозин-мышцы II сократимости, является ключевым компонентом этот assay. Туман ген кодирует белок 730 аминокислот с прогнозируемым молекулярной массой ~ 78 кДа26. Гидропатия анализ показал стрейч 12 гидрофобные остатков в туман в амино terminus который мог бы функционировать как последовательность сигнала секрецию. Кроме того кодирующая последовательность содержит несколько сайтов для потенциальных гликозилирования, N и O, связанных, далее заявил, что туман секретируемые белки26. В поддержку этого туман локализована в секреторные пузырьки в предполагаемого эпидермальных клеток, претерпевает апикального сужения16. Туман-Myc выражение были наведены на добавление сульфата меди на носитель, и антитела против тумана или Myc признали 150-kD белка от питательной среды заготавливаемым от индуцированного культур, но не от индуцированного СМИ от клеток S2 не хватает туман-Myc конструкции. Это молекулярный вес был выше, чем прогнозируемый молекулярный вес 80-kD тумана и свидетельствует о том, что механизма секреторных клеток S2 могут glycosylate белка до экзоцитоз. Из-за потенциальной изменчивости в тумане очистки желательно пользоваться той же партии туман кондиционером СМИ для всех экспериментов. Составляя больших серий концентрированный тумана-Myc средств массовой информации будет способствовать поддержанию согласованности всей раундов экспериментов.
Успех этот assay зависит также уверенно выявления клеток, которые претерпели сужения. Хотя свёрнутые клетки можно наблюдать микроскопии флуоресцирования, путем пятнать актина и миозина-мышцы II, самый надежный способ выявить и количественно свёрнутые клетки является через фазово контрастной или DIC микроскопии. Точное количество может быть достигнуто с помощью 20 X - 40 кратном на большинстве стандартных легких микроскопы. Хотя протокол написан здесь использует прозрачным дном блюда, assay может также выполняться с помощью стандартных coverslips 1.5 стекла покрытые кон а. Добавление туман может быть сделано в 35 мм культуры ткани на coverslip размещены на парафина, с тем чтобы ограничить количество туман, используемых для каждого пробирного. Качество фиксации является критически важным компонентом assay, как плохо фиксированные клетки могут привести к ложным положительным результатам. С помощью фиксации свежие решения и убедившись, что никогда не сухие клетки однажды фиксированной приведет к более надежные результаты. Наконец важно считать большое количество клеток. Как правило не лечить только 30% - 50% или клетки RNAi лечение управления сжимают после перфузии туман. Однако есть базальный уровень сужения, которое происходит в S2R + клеток, поэтому большое количество клеток, чтобы обеспечить любое изменение доли свёрнутые клеток из-за лечения. Кроме того истощение некоторых белков, участвующих в регуляции миозин-мышцы II сократимости может привести к гипер сократимость, даже в отсутствие туман. Здесь представлены данные из более чем 3600 клетки, которые были подсчитаны в три последовательных RNAi лечения с использованием той же партии туман кондиционером СМИ.
Применения клеточных сократимости пробирного:
Этот assay сократимости, в сочетании с RNAi скрининг методы, предлагает мощную систему для изучения клеток сигнализации, морфогенез и клеточных сократимости. Ранее он был использован для идентификации одного из двух туман Сопредседатель рецепторов21. Целевой экран 138 G-белок-рецепторы (GPCR) истощается RNAi в S2R + клеток, и ее способность реагировать на туман был assayed как описано в протоколе, представленные здесь. Из 138 GPCR, единый, ранее uncharacterized гена, теперь известный как туман, была раскрыта. Дальнейшее расследование функция туман продемонстрировал, что не только она требуется для туман индуцированных клеточных сократимости S2R + клеток, но также важно для гаструляция в разработке дрозофилы21. Кроме того чтобы продемонстрировать, что Рик-8, нестандартные ГЭФ, является также компонентом в тумане сигнальный путь27был использован этот assay. Серия экспериментов RNAi воспроизводится, в сочетании с Пробирной сократительной способности продемонстрировал, что Рик-8 взаимодействует с Gα12/13 Субблок Cta и функций для локализации в ячейке, которая имеет решающее значение для туман индуцированных клеточных сократимости31 .
Культура ткани дрозофилы хорошо подходит для новичков, как клетки легко поддерживается при комнатной температуре, не требуют CO2 или буферизировать клетки культуры среднего и надежны, до тех пор, как надлежащее клетки культуры плотности сохраняются. Assay сотовой сократимости была успешно проведена секцией лаборатории курса биологии undergraduate ячейки, где студенты имели практически нет опыта с культивирования клеток или микроскопии. Assay сотовой сократимости, представленные здесь представляет собой мощный инструмент на основе ячеек, которые могут быть использованы в открытие гена, или допросить туман, сигнальный путь, помогая нам лучше понять процессы развития, такие как апикального сужения и -мышцы миозин II сократительной способности, в целом.