Цель настоящего Протокола заключается в предоставляют пошаговое руководство для 3-D «печени на чипе» инфекции эксперименты с вирусом гепатита в.
Методическая статья
Цель настоящего Протокола заключается в предоставляют пошаговое руководство для 3-D «печени на чипе» инфекции эксперименты с вирусом гепатита в.
Несмотря на исключительные инфективности вируса гепатита в (HBV) в естественных условиях, где только три вирусных геномов может привести к хронизации экспериментально зараженных шимпанзе, наиболее в пробирке модели требуют нескольких сотен до тысяч вирусных геномов в ячейке чтобы инициировать переходных инфекции. Кроме того статические 2D культур первичных человеческих гепатоцитов (ПГГ) позволяют только краткосрочные исследования вследствие их быстрого дифференцировке. Здесь мы описываем 3D печени на чипе культур ПГГ, монокультур или в cocultures с другими клетками печени житель nonparenchymal. Они предлагают значительное улучшение для изучения долгосрочных HBV инфекции с физиологической принимающей ячейки ответы. Помимо содействия исследования эффективности препарата, токсикологического анализа и расследований в патогенезе, эти microfluidic культуры системы включить оценку лечебные терапии для инфекции ВГВ, направленных на ликвидацию ковалентно закрыт, циркуляр (КХЦ) ДНК. Представлен метод описывает структуры ПГГ монокультур и Сопредседатель культур клеток ПГГ/Купфера, их инфекции с очищенной ГВ и анализа принимающей ответов. Этот метод особенно применима для оценки долгосрочных последствий HBV инфекции, лечения комбинаций и патогенеза.
Исследование ГВ осложняется плохой восприимчивость систем культуры, требующие нескольких сотен до тысяч копий генома ГВ в ячейку, чтобы начать инфекции1. Кроме того основной человека гепатоцитов, как правило, исключительно хрупким и быстро дедифференцироваться во время обычных культур2. Это главным образом тем фактом, что плоские и жестких пластиковых поверхностей не имитировать естественный внеклеточных средах, в печени и общее отсутствие оксигенации культур в отсутствие microfluidic циркуляции. Обычные статические гепатоцитов культур на коллаген, покрытыми быстро дедифференцироваться и теряют их восприимчивость к инфекции HBV3. Здесь мы описываем set-up и инфекции ПГГ, выращенных в 3D печени на чипе культур, которые выгодны значительно на обычных 2D статического ПГГ культур на коллаген покрытием пластин из-за их расширенной метаболических и функциональной компетентности, содействие долгосрочные культуры по меньшей мере 40 дней4. В этой системе ПГГ являются семенами на коллаген покрытием лесов, которые постоянно увлажненную с среднего роста на поставку кислорода и питательных веществ к клеткам. Даже несмотря на то, что на основе систем альтернативной культуры для ПГГ комплекс cocultures мышиных фибробластов или 3D рост сфероидов были проверены и восприимчивы к инфекции ВГВ, используя кратности инфекции эквивалента 500 генома (GE) ГВ в клетку, 3D печень на чипе культур остаются единственным экстракорпоральное моделью системы подвержены 0,05 GE ГВ в ячейки4. Это дополнительно подкрепляется необходимость использования высоких концентраций диметилсульфоксида (ДМСО) и полиэтилен гликоль (PEG) установить ВГВ в этих культурах, который является необязательным для заражения систем 3D печени на чипе культуры 4. среди основных признаков HBV инфекции является бассейн cccDNA, который действует как транскрипционный анализ шаблон для всех de novo–производства вирионы5,6. Даже несмотря на то, что cccDNA могут быть обнаружены в обычных гепатоцитов культур7,8, остается неясным ли регулирование cccDNA и любые терапевтические подходы, направленные на его ликвидацию изъятый в частично или полностью Дедифференцированная гепатоцитов. Мы показали, что cccDNA функционально формируется в 3D печени на чипе культур, реагирует на физиологические стимулы и может быть объектом вмешательства с доступностью механизма транскрипционный анализ генома cccDNA4.
Размещать ответы на инфекции ВГВ в 3D мнемосхемы печени на чипе, те наблюдается у пациентов, инфицированных ВГВ, позволяя идентификация biomarkers для инфекции, а также терапевтического успеха. Среди уникальных особенностей печени на чипе культур является способность оценить долгосрочные принимающей ответов между ПГГ и другие nonparenchymal клетки в печени, включая4клетки Купфера, севрюга клетки9и печени синусоидального эндотелиальные клетки10,11. Это дает уникальную возможность для оценки взаимодействия клеток/клеток в сложных 3D микроокружения.
Кроме того расширенный культуры периода этой платформы облегчает оценки последовательных лекарств и их влияние на ГВ сохраняемости, которые не возможно с использованием обычных гепатоцитов культуры систем.
Этот протокол описывает как 3D печени на чипе культуры создаются для монокультур ПГГ либо cocultures ПГГ с клеток Купфера. Кроме того мы описываем производства очищенного ВГВ для исследования низкой кратности инфекции, а также последующего анализа хоста и вирусных ответов.
1. Ассамблея и уравновешивания пластин
2. оттаивания и посев гепатоцитов для монокультуры
3. оттаивания и заполнение клеток Купфера и гепатоцитов для совместного культур
4. производство вируса инфекционного гепатита B инфекции исследований
5. инфекции 3D культур с ГВ
6. Количественная оценка внеклеточного HBV ДНК
7. Количественная оценка внутриклеточных HBV Pregenomic (pg) РНК
8. иммунофлюоресценции пятнать вирусного антигена
9. человеческого альбумина ELISA
10. интерлейкина-(IL) 6 и фактор некроза опухоли (ФНО) α производства в 3D Сопредседатель культур
Мы опишем простой и универсальный платформы для долгосрочного культуры первичных человеческих клеток Купфера или гепатоцитов и их инфекции HBV. Первичных клеток человека посеян на коллаген покрытием из полистирола леса в сборке microfluidic пластины, которая постоянно perfuses клетки с среднего роста (Рисунок 1a).
ПГГ, который обычно стабильны только за ограниченное количество времени в системах обычных культуры, могут поддерживаться функционально для длительных периодов времени. Человеческого альбумина, который секретируется функциональных гепатоцитов и считается лучшим маркера для оценки печеночный метаболизм, стабильно и высоко выражается 3D культур до день 40 после заполнения (рис. 2). Для cocultures клеток Купфера функциональность и жизнеспособности могут быть оценены секрецию определенных цитокинов (например, IL6 и TNFα). Чтобы измерить производство цитокинов, (рис. 3) рекомендуется использовать средства на основе захвата обнаружения на LPS-стимуляция cocultures.
Клетки образуют печёночной microtissues, обычно в течение 3 дней после посева ПГГ, демонстрируя функциональных желчных канальцев и полная ячейка поляризации (рис. 2). Помимо сохранения их физиологических клеточный метаболизм, эти культуры становятся исключительно восприимчивыми к инфекции HBV. HBV ДНК и других вирусных маркеров, в отличие от других систем культуры, становятся легко обнаружить с 2 день после инфекции (рис. 4). Помимо секретируемые маркеров вирусной инфекции, гепатоцито содержащих подмостей могут быть извлечены из культур и используется для обнаружения вирусных антигенов иммунофлюоресценции (например, HBsAg, HBcAg) (Рисунок 4). Где обычных гепатоцитов культур требуют прививки с по крайней мере 500 HBV GE в клетки и добавлением 2% ДМСО и 4% PEG, как 0,05 HBV GE возможность инициировать инфекции в 3-D культур без требования ДМСО или ПЭГ (рис. 4).

Рисунок 1: установка 3-D печени на чипе культур. () это принципиальная схема для Ассамблеи пластину культуры с целью обеспечить создание microfluidic циркуляции. (b) этой панели отображается в увеличенном культуры скважин, включая фильтр бумага, лески и стопорное кольцо. (c) Эта группа показывает процесс уравновешивания пластины до посева культур. Следующие две панели показывают процесс заполнения для монокультур гепатоцитов (d) и (e) гепатоцитов/Купфера ячейки cocultures. (f) Эта группа показывает Стиральная шаги в средних изменений. (g) Эта группа показывает HBV инфекции настройки, включая устранение посевным материалом. С.м. = посева средний, м.м. = Средний обслуживания. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 2: печеночная microtissue формирования и гепатоцитов жизнеспособность. () Эта группа показывает продольной brightfield изображения 3D гепатоцитов монокультур, демонстрируя microtissue формирования после посева. (b) Эта группа показывает изображения иммунофлюоресценции культур для ядер (синий) и человеческого альбумина (зеленый). (c) Эта группа показывает продольной всего альбумина, а также в клетку скорректирована производства альбумина, в течение 40 дней гепатоцитов монокультур, как определяется ELISA. Данные являются среднее ± SD. Эта цифра заимствован из Ортега-Прието et al.4. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 3: функции клеток Купфера в 3-D cocultures. Эти панели показывают секрецию () IL6 и (b) TNFα в гепатоцитов монокультур и гепатоцитов/Купфера клеток cocultures 11 дней после посева в ответ экзогенно добавлен LPS на 9 день пост посева, как определено с помощью человека магнитные Luminex assay. Эта цифра заимствован из Ортега-Прието et al.4. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 4: ВГВ в печени на чипе культурах. () Эта группа показывает обнаружения микроскопия иммунофлуоресценции HBcAg (красный), HBsAg (зеленый) и ядра (синий) через 10 дней после инфицирования культур с ГВ. (b) Эта группа показывает подверженность инфекции ВГВ, с использованием различных кратности инфекции, как определяется количественную оценку HBV ДНК в supernatants культуры культур. (c) этой панели отображается количественная оценка продольных накопления HBV pgRNA относительно уборки гена RPS11. Данные являются среднее ± SD. Эта цифра заимствован из Ортега-Прието et al.4. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Трудности в поддержании долгосрочной культур ПГГ инициативе разработки нескольких моделей культуры с расширенной функциональностью и долголетия, каждой выставке дифференциального преимущества и недостатки. Сейчас широко признается, что статические 2D культур ПГГ подражая определенные аспекты биологии гепатоцитов для весьма ограниченного количества времени. Таким образом micropatterned cocultures12,13, сфероиде культур14,15, и 3D печени на чипе культур16,17 быстро заменить эти более основных систем. Особенно при изучении инфекционных заболеваний, которые эволюционировали с их принимающих стран для использования конкретной микросреды, требование для обеспечения физиологической среды подкрепляется часто сложным характером культивирования человека Тропик инфекционные заболевания, включая вирус гепатита С, ГВ и малярия.
Наиболее важным шагом в выполнении 3D печени на чипе культур является качество типов первоначально источников первичной клеток. Эти клетки должны испытываться на их возможности присоединения и только plateable ПГГ много должны использоваться для обеспечения успешного ткани формирования и создания культуры. Хотя может использоваться свежевыделенных ПГГ, их криоконсервирования обычно сложна и требует специальных под контролем курс морозильники.
В отличие от обычных 2D статического культур принимающей генетический фон является незначительным в отношении подверженности инфекции ВГВ, и все таким образом далеко протестированных гепатоцитов доноры имеют возможность установить HBV инфекции4.
Даже несмотря на то, что пациент производные HBV устанавливает инфекции 3D культур, крайне важно использовать химически осажденный PEG и сахароза подушки очищенный HBV всякий раз, когда с помощью индуцибельной HBV продюсер клеток линии для генерации вирусного инокуляты. Supernatants культуры клеток, непосредственно применяться к 3D печени на чипе культур, либо через присутствии ингибирующих факторов или вследствие несовместимости нынешних факторов роста с гепатоцитов, не легко привести к инфекции. Кроме того при выборе пациента производные вирусного инокуляты, только сыворотки должны использоваться, поскольку плазма неизбежно свертывается и забивает циркуляции microfluidic платформа культуры.
Независимо от вирусных посевные используется обеспечении клеточной жизнеспособности и дифференциации, а также обеспечение полного удаления первоначального HBV посевным материалом, является ключом к успешной долгосрочные исследования инфекции. Наиболее удобным способом для этого является выборка культур после удаления вируса посевным материалом, а также измерения уровня человеческого сывороточного альбумина на протяжении всего периода культуры. Следует отметить, аналогично для всех других описанных платформ, инфекции ВГВ, после того, как установлено, не легко распространилась на неинфицированных клеток. Базовый механизм для этого остается труднодостижимой, поскольку ВГВ в естественных условиях легко заражает большинство гепатоцитов в печени.
Что касается cocultures клеток ПГГ и Купфера желательно выполнить много испытаний для оценки IL6 и TNFα секреции в ответ на стимуляцию ПЛАСТИНОК, так как не все коммерчески доступных доноров клеток Купфера имеют равные реакции клеток Купфера.
Важно отметить, что для всех лекарств или первичной инфекции культур с ГВ, общий объем хорошо (1.4 мл), а также по состоянию на microfluidic канал (0,2 мл), должны приниматься во внимание для расчета концентраций препарата или посевным материалом. Для того чтобы обеспечить точное дозирование, один шаг Стиральная с средой, содержащей HBV или наркотиков производится для премьер microfluidic канала.
Платформа используется использует 600.000 ПГГ в колодец, который обеспечивает многослойных гепатоцитов в пределах леса. Даже несмотря на то, что можно варьировать число клеток, концентрации выбранной ячейки обеспечивает оптимальные результаты. Формат пластин имеет в общей сложности 12 леса, которые можно обновить до 36 подмостей. Однако благодаря microfluidic требования, масштабирования для более высоких хорошо чисел невозможно на сегодняшний день.
С помощью этих подходов, культур может поддерживаться с производительность оптимальное ячейки для по крайней мере 40 дней, который до сих пор, открывает беспрецедентные возможности для оценки кандидатов роман наркотиков, а так же изучение сложного взаимодействия между различными печеночных клеток население во время инфекции ВГВ.
Авторы не имеют ничего сообщать.
Эта работа финансировалась стартера грант от Европейского совета научных исследований (637304), Добро пожаловать доверять следователь премию (104771/Z/14/Z) и CN био инновации.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| <сильные>реагенты | |||
| William's E Medium, без фенола красного | GIBCO | A12176-01 | |
| Среда размораживания гепатоцитов | GIBCO | CM7500 | |
| Добавки для размораживания и покрытия первичных гепатоцитов | GIBCO | CM3000 | |
| Добавки для поддержания первичного гепатоцитарного баланса | GIBCO | CM4000 | |
| DMEM/F-12 | GIBCO | 11320-033 | |
| Усовершенствованный DMEM | GIBCO | 12491023 | |
| DPBS, без кальция, без магния | GIBCO | 14190-144 | |
| MEM Заменимые аминокислоты (NEAA) 100x | GIBCO | 11140050 | |
| пенициллин-стрептомицин (10 000 ЕД/мл) | GIBCO | 15140-122 | |
| Фетальная бычья сыворотка, происхождение из США, термоинактивированная, стерильно-фильтрованная, подходит для клеточной культуры | SIGMA | 12106C | |
| Гидрокортизон | SIGMA | H0888 | |
| Трипановый синий | Merck | T8154 | |
| Коллаген из телячьей кожи | Merck | C9791 | |
| G418 | SIGMA | G418-RO | |
| Тетрациклин | SIGMA | T3258 | |
| Полиэтиленгликоль 8000 | SIGMA | P2139 | |
| Сахароза | SIGMA | SO389 | |
| Карбонат натрия безводный | SIGMA | 451614-25G | |
| Бикарбонат натрия | SIGMA | S5761 | |
| Азид натрия | SIGMA | S2002-5G | |
| Серная кислота, 99,999% | SIGMA | 339741 | |
| 4% параформальдегид | SIGMA | 252549 | |
| Triton-X 100 | SIGMA | X100 | |
| Tween 20 | SIGMA | P1379 | |
| DAPI | SIGMA | D9564 | |
| Альбумин (человек) | SIGMA | A9731 | |
| Fisher BioReagent Бычья сыворотка альбумина, фракция V, обработанная от теплового удара | Fisher Scientific | BP9701-100 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | Invitrogen | P36930 | |
| TaqMan Universal Master Mix II, без UNG | Applied Biosystems | 4440040 | |
| SYBR Select Master Mix | Applied Biosystems | 4472903 | |
| липополисахарид из Escherichia coli K12 | InvivoGen | tlrl-eklps | |
| Название< | strong>Company | Номер в каталоге | >Комментарии |
| Комплекты/Расходные материалы | |||
| Стерильная мембрана | CN Bio innovations | LC-SC | |
| LiverChip Перфузионная клеточная культуральная пластина | CN Bio innovations | LC12 | |
| LiverChip крышка культивальной пластины | CN Bio инновации | LC-SC | |
| Стерильная круглая фильтровальная бумага | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Клеточный каркас для крепления | CN Bio инновации | LC-SC | |
| Стопорное кольцо | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Стерильный поршень | CN Bio innovations | LC-ST | |
| Dneasy набор для крови и тканей | Qiagen | 69506 | |
| Rneasy mini kit | Qiagen | 74106 | |
| Человеческий магнитный анализ Luminex | R& D Systems | ||
| 1-Step Ultra TMB-ELISA Субстрат | ThermoFisher Scientific | 34028 | |
| Набор для обратной транскрипции кДНК высокой емкости | ThermoFisher Scientific | 4368814 | |
| QIAamp Вирусная РНК Мини набор аксессуаров | Qiagen | 1048147 | содержащий носитель РНК |
| Millicell HY 5-слойная клеточная культура колба, T-1000, стерильная | Millipore (Merck) | ||
| MicroAmp Optical 384-луночный реакционный планшет с штрих-кодом | Life technologies | 4309849 | |
| MicroAmp Optical Adhesive Film | Life technologies | 4311971 | |
| прозрачные плоскодонные иммунонестерильные 96-луночные планшеты | ThermoFisher Scientific | 442404 | |
| Герметизирующая лента для 96-луночных планшетов | ThermoFisher Scientific | 15036 | |
| Быстроточные стерильные одноразовые фильтры для бутылок Nalgene с мембраной PES | ThermoFisher Scientific | 295-3345 | |
| Fisherbrand Микроскопические предметные стекла с отшлифованными краями, Twin Frost | Fisher Scientific | FB58628 | |
| Tube, тонкостенные, ультрапрозрачные, 38,5 мл, 25 x 89 мм | Beckman Coulter | 344058 | |
| Name | Company | Номер в каталоге< | >Комментарии |
| >Первичные клетки / Клеточные линии | |||
| human пластинчатые гепатоциты, транспортер квалифицированный | Thermo Fisher Scientific | HMCPTS | |
| криоконсервированные человеческие клетки Купфера | Thermo Fisher Scientific | HUKCCS | |
| HepDE19 клеточная линия | Haitao Guo (Университет Индианы, Индиана, США) | ||
| Name | Company | Каталожный номер< | strong>Комментарии |
| Primers/Probes/Standards | |||
| HBV ДНК прямой праймер | Invitrogen | 5'-GTGTCTGCGGCGTTTTATCA-3'HBV | |
| ДНК обратный праймер | Invitrogen | 5'-GACAAACGGGCAACATACCTT-3'HBV | |
| DNA зонд | Invitrogen | 5'FAM-CCTCTKCATCCTGCTGCTATGCCTCATC-3'TAMRA | |
| pgRNA прямой праймер | Invitrogen | 5'-GAGTGTGGATTCGCACTCC-3'pgRNA | |
| обратный праймер | Invitrogen | 5'-GAGGCGAGGGAGTTCTTCT-3'RPS11 | |
| прямой праймер | Invitrogen | 5'-GCCGAGACTATCTGCACTAC-3'RPS11 | |
| обратный праймер | Invitrogen | 5'-ATGTCCAGCCTCAGAACTTC-3'pCMV-HBV | |
| профессор Кристоф Сигер (Онкологический центр Фокс Чейз, Пенсильвания, США) | |||
| Name< | strong>Company | >Номер в каталоге | Comments< |
| >Antibodies | |||
| Противовирусный вирус гепатита В Ядро антиген IgG фракция (поликлональная) | DAKO | снято с производства | Lot 10102505 Антитело |
| к альбумину человека, A80-129A | Bethyl Laboratories. inc | A80-129A | |
| Антитело к альбумину человека с перекрестной адсорбцией, A80-229P | Bethyl Laboratories. inc | A80-229P | |
| козье антитело против кролика IgG (H+L) с перекрестной адсорбцией, Alexa Fluor 594 | ThermoFisher Scientific | # A-11072 | Лот |
| 1431810Name< | strong>Company< | strong>Номер в каталоге | >Комментарии |
| Оборудование | |||
| LiverChip Вакуумный насос | CN Bio innovations | LC-PN | |
| LiverChip Пневматическое подключение | CN Bio инновации | LC-PN | |
| LiverChip платформа | CN Bio инновации | LC-PN | |
| LiverChip док для мытья пластин | CN Bio инновации | ||
| автоклавируемые металлические щипцы | VWR | 232-0106 | |
| Vortex Genie 2 | Scientific industries Артикул | : SI-0236 | |
| Optima XPN-80 Ультрацентрифуга | Beckman Coulter | A95765 | |
| Heraeus Multifuge X3R Центрифуга | Thermo Scientific | 75004500 | |
| SAM-12 Медицинская всасывание Высокий вакуум Высокий расход | MGE по всему миру | SAM12/01010101 | |
| NUAIRE SERIES 5800 Инкубатор | NUAIRE | NU-5841 | |
| Автоматизированный прецизионный торге | CN Bio innovations Ручная | ||
| затяжка | CN Bio innovations | ||
| LiverChip компрессор | CN Bio Luminex | ||
| LX-200 Instrument with xPONENT 3.1 | Luminex | ||
| Многопоровый ручной магнитный сепаратор Блок | ThermoFisher Scientific | Millipore™ 40-285 | |
| FluoStar Optima Считыватель пластин | BMG Labtech | ||
| KOLVER Прецизионные электрические шуруповерты | VTECH ltd | FAB10RE/FR | |
| KOLVER Блок питания | VTECH ltd | EDU1FR | |
| BAMBI VTS75D | Воздушное оборудование | Снято с производства | |
| ПЦР в реальном времени Integra Vacuboy INTEGRA | |||