Здесь мы внедряем метод секвенирования полупроводников для предимплантационного генетического тестирования на анеуплоидию (PGT-A) с преимуществами короткого оборота времени, низкой стоимости и высокой пропускной способности.
Методическая статья
* These authors contributed equally
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| ПЦР-пробирки, 0,2 мл | Axygen | PCR-02D-C | |
| UltraPure 0,5M EDTA, pH 8,0 | ThermoFisher | 15575020 | |
| PBS, pH 7,4, Ca2+ и Mg2+ свободный | ThermoFisher | 10010023 | |
| 1,0 М раствор NaOH (1,0N) | SIGMA-ALDRICH | S2567 | For Melt-off solution. Молекулярные |
| пробирки Eppendorf LoBind, 1,5 мл | Fisher Scientific | 13-698-791 | |
| Набор библиотеки ионов плюс фрагментов | ThermoFisher | 4471252 | |
| ELGA PURELAB Flex 3 Система очистки воды или<бр/> эквивалент 18 MΩ система для воды | ThermoFisher | 4474524 | |
| Ion Plus Fragment Library Kit | ThermoFisher | 4471252 | |
| Буфер для амплификации PicoPLEX WGA | Rubicon Genomics | R30050 | Может быть заменен на систему амплификации ДНК SurePlex, номер в каталоге: PR-40-415101-03. |
| Фермент амплификации PicoPLEX WGA | Rubicon Genomics | R30050 | Может быть заменен на систему амплификации ДНК SurePlex, каталожный номер: PR-40-415101-03. |
| Усилительная пластина Ion OneTouch В | комплекте: расходные материалы Ion OneTouch 2 (артикул A26367). Расширенный компонент набора в листе 5 | ||
| Ion PI Буфер | |||
| MyOne Решение | |||
| Биоанализатор Agilent 2100 Agilent | G2939AA | ||
| Ion OneTouch Breaking Solution (черный колпачок) | В комплекте: Ion PI Hi? Q OT2 Solutions 200 (Артикул A26429). Расширенный компонент набора в листе 5 | ||
| Dynabeads MyOne Streptavidin C1 | ThermoFisher | 65001 | |
| PicoPLEX WGA Cell Extraction buffer | Rubicon Genomics | R30050 | Это может быть заменено на систему амплификации ДНК SurePlex, каталожный номер: PR-40-415101-00. |
| Фермент экстракции клеток PicoPLEX WGA | Rubicon Genomics | R30050 | Его можно заменить на систему амплификации ДНК SurePlex, номер по каталогу: PR-40-415101-03. |
| Ion PI Chip Kit v3 | ThermoFisher | A26771 | |
| Ion Chip Minifuge, 230 В | ThermoFisher | 4479673 | |
| Ion PI dATP | ThermoFisher | A26772 | |
| Ion PI dCTP | ThermoFisher | A26772 | |
| Ion PI dGTP | ThermoFisher | A26772 | |
| Комплект библиотеки фрагментов Ion Plus | ThermoFisher | 4471252 | |
| Набор библиотеки фрагментов Ion Plus | ThermoFisher | 4471252 | |
| ThermoQ– Сухая ванна с температурой | TAMAR | HB-T2-A | |
| NEBNext dsDNA Fragmentase | New England Biolabs | M0348L | |
| NEBNext dsDNA Fragmentase | New England Biolabs | M0348L | |
| Ion PI dTTP | ThermoFisher | A26772 | |
| Ion OneTouch 2 Instrument | ThermoFisher | INS1005527 | ThermoFisher Каталожный номер: 4474778. |
| Комплект библиотеки фрагментов Ion Plus | ThermoFisher | 4471252 | |
| Ion One Touch ES | ThermoFisher | 8441-22 | Номер в каталоге: 4469495. Расширенный компонент комплекта в Листе 5 |
| Этанол | SIGMA-ALDRICH | 51976 | Может быть заменен абсолютным этанолом любого марки молекулярного качества. |
| PicoPLEX WGA Экстракционный буфер для разбавления фермента | Rubicon Genomics | R30050 | Его можно заменить на систему амплификации ДНК SurePlex, каталожный номер: PR-40-415101-01. |
| Буфер для разведения фермента PicoPLEX WGA Rubicon | Genomics | R30050 | Его можно заменить на систему амплификации ДНК SurePlex, номер по каталогу: PR-40-415101-02. |
| Флуориметр Qubit 3.0 | ThermoFisher | Q33216 | Эта модель была заменена на Флуориметр Qubit 4, Каталожный номер: Q33226. |
| Набор для анализа Qubit ds DNA HS | ThermoFisher | M2002-02 | |
| Пробирки для анализа кубитов | ThermoFisher | Q32856 | |
| Ion PI Пенообразующий раствор | ThermoFisher | A26772 | |
| Индекс для штрихкодирования библиотек | BaseCare | это индекс собственного приготовления. Пользователи могут приобрести коммерческий продукт в комплектах адаптеров для штрих-кодов ThermoFisher Ion Xpress (кат. No 4474517) | |
| Загрузочный буфер Ion PI | ThermoFisher | A26772 | |
| Solid(TM) Buffer Kit-1X Low TE Buffer | ThermoFisher | 4389764 | |
| Agencour AMPure XP Комплект | Beckman Coulter | A63880 | |
| DynaMag-2 магнит (магнитная стойка) | ThermoFisher | 12321D | |
| Ion PI Master Mix PCR буфер | |||
| Микроцентрифуга Sorvall Legend Micro | 17 | 75002430 | |
| Ion Plus Fragment Library | Kit ThermoFisher | 4471252 | |
| Вода без нуклеазы | ThermoFisher | AM9922 | Может быть заменена на другую марку. |
| PicoPLEX WGA Вода без нуклеазы | Rubicon Genomics | R30050 | Может быть заменена на систему амплификации ДНК SurePlex, номер по каталогу: PR-40-415101-03. |
| Бутылка с маслом | Ion OneTouch Ion PI Привет? Q OT2 Solutions 200 (Артикул A26429). Расширенный компонент набора на листе 5 | ||
| Набор библиотеки ионов плюс фрагментов | ThermoFisher | 4471252 | Расширенный компонент набора на листе 3 |
| двухцепочечный стандарт | Это подготовленный внутри компании стандарт ДНК для калибровки кубита перед количественной оценкой библиотеки. | ||
| Буфер предварительной амплификации PicoPLEX WGA | Rubicon Genomics | R30050 | Его можно заменить на систему амплификации ДНК SurePlex, номер в каталоге: PR-40-415101-03. |
| Фермент предамплификации PicoPLEX WGA | Rubicon Genomics | R30050 | Его можно заменить на систему амплификации ДНК SurePlex, номер в каталоге: PR-40-415101-03. |
| Библиотека Amplification Primer Mix | ThermoFisher | 4471252 | Расширенный компонент комплекта на листе 3 |
| Реакционный фильтр | Расширенный компонент на листе 5 | ||
| Recovery Router | Расширенный комплект на листе 5 | ||
| Recovery Tubes | Расширенный комплект на листе 5 | ||
| Решение | ISP для ресуспензии | ||
| Ионный протон | ThermoFisher | DA8600 | Эта модель импортирована компанией Da An Gene Co., Ltd. Университета Сунь Ятсена из компании ThermoFisher и была сертифицирована Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов Китая для клинического применения. Каталожный номер в ThermoFisher - 4476610. |
| Ион ПИ Привет? Q Секвенирование полимеразы | ThermoFisher | A26772 | |
| Ion PI Sequencing Primer | |||
| сервер для секвенсора | Lenovo | T260 | |
| Ion PI Sphere Particles | |||
| Platinum PCR SuperMix High Fidelity | ThermoFisher | 4471252 | |
| Nalgene 25 мм Шприцевые фильтры | ThermoFisher | 724-2045 | Размер пор: 0,45 мкм. Специально для водных жидкостей. |
| Ион ПИ Привет? Q W2 Раствор | ThermoFisher | A26772 | |
| Ion PI 1X W3 Раствор | ThermoFisher | A26772 | |
| Ion OneTouch Wash Solution C1 | |||
| The Ion PGM Hi? Q View Секвенирование | ThermoFisher | A30044 | Расширенный компонент набора на листе 2 |
| Ion Plus Fragment Library | Kit ThermoFisher | 4471252 | Расширенный компонент на листе 3 |
| Ion PI Hi-Q Sequencing 200 Kit (1 прогон секвенирования на инициализацию) | ThermoFisher | A26772 | Расширенный компонент на листе 4 |
| Ion PI Hi? Q OT2 200 Kit | ThermoFisher | A26434 | Расширенный компонент комплекта в листе 5 |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE
Запросить разрешение