Мы представляем протокол для динамических измерений поверхности дыхательных путей жидкого рН в условиях тонкой пленки с помощью плиты-читателя.
Методическая статья
Мы представляем протокол для динамических измерений поверхности дыхательных путей жидкого рН в условиях тонкой пленки с помощью плиты-читателя.
В последние годы важность слизистой поверхности рН в дыхательных путях была подчеркнута его способностью регулировать гидратацию поверхности дыхательных путей (ASL), вязкость слизи и активность антимикробных пептидов, ключевые параметры, связанные с врожденной защитой легких. Это имеет первостепенное значение в области хронических респираторных заболеваний, таких как муковисцидоз (КФ), где эти параметры дисрегулируются. В то время как различные группы изучали ASL pH как in vivo, так и in vitro, их методы сообщают об относительно широком диапазоне значений ASL pH и даже противоречивых выводах относительно любых различий рН между клетками, не относящимися к CF и CF. Кроме того, их протоколы не всегда предоставляют достаточно деталей для обеспечения воспроизводимости, большинство из них имеют низкую пропускную выгоду и требуют дорогостоящего оборудования или специализированных знаний для реализации, что затрудняет их создание в большинстве лабораторий. Здесь мы описываем полуавтоматический флуоресцентный анализ считывателя пластин, который позволяет в режиме реального времени измерения ASL pH в условиях тонкой пленки, которые больше напоминают ситуацию in vivo. Этот метод позволяет для стабильных измерений в течение многих часов из нескольких культур дыхательных путей одновременно и, что важно, динамические изменения в ASL рН в ответ на агонистов и ингибиторы могут контролироваться. Для достижения этой цели, ASL полностью дифференцированных первичных человеческих эпителиальных клеток дыхательных путей (hAECs) окрашены на ночь с рН-чувствительный краситель для того, чтобы для повторного абсорбции избыточной жидкости для обеспечения тонкой пленки условиях. После флуоресценции контролируется в присутствии или отсутствии агонистов, калибровка рН выполняется на месте, чтобы исправить для объема и концентрации красителя. Описанный метод обеспечивает необходимые элементы управления, чтобы сделать стабильные и воспроизводимые измерения ASL pH, которые в конечном итоге могут быть использованы в качестве платформы обнаружения наркотиков для персонализированной медицины, а также адаптированы к другим эпителиальным тканям и экспериментальным состояний, таких как воспалительные и/или модели хоста-патогена.
Эпителий дыхательных путей покрыт тонким (10 мкм) слоем жидкости, который называют поверхностной жидкостью дыхательных путей (ASL). Состав и глубина (гидратация) этого ASL жестко регулируется и контролирует эффективность очистки дыхательныхпутей смуцилерным эскалатором 1,2,3,4. В последние годы, важность ASL H /HCO3- содержание было продемонстрировано различными группами из-за его способности регулировать ASL гидратации5, воспаление дыхательных путей6 и инфекции7, 8, а также вязкость слизи 8,9. Важно отметить, что, хотя существует несколько споров, многие исследования сообщили о дисрегуляции рН дыхательных путей при хронических заболеваниях дыхательных путей, таких как астма10,11,12, ХОБЛ11, бронхиэктаз11, хронический риносинусит13,14 и муковисцидоз (CF)5,9,15,16,17, который предполагает, что методы лечения, которые восстанавливают ASL рН может быть полезным для лечения нескольких типов хронических заболеваний дыхательных путей. CF является наиболее распространенным аутосомно-рецессивным генетическим заболеванием в кавказских популяциях и связано с мутациями в гене регулятора трансмембранной проводимости CF (CFTR). Этот ген кодирует анион (HCO3- и Cl-) канал, который играет решающую роль в ионно-жидком транспорте и гомеостазе через эпителию18. Хотя CF является мультиорганной болезнью, патология легких является основной причиной заболеваемости и смертности19,20 и с учетом первичного дефекта в CF является нарушением транспортировки Cl- и HCO3-, можно предположить, что внеклеточная жидкость рН у людей с CF будет дисрегулируемым по сравнению с людьми, которые не имеют CF. Таким образом, измерение ASL рН была актуальной области исследований CF и различные группы разработали методы для измерения ASL pH в CF дыхательных путей.
In vivo, рН дыхательных путей был измерен с использованием различных методов, от микро-зондов (волоконно-оптические, золотые или мобидиевые зонды)5,21,22,23,24 до рН измерений ожидаемый материал или выдыхаемый конденсат дыхания (EBC)10,11,12,25,26,27. В области исследований CF, рН в настоящее время широко изучается в связи с его потенциальными клиническими последствиями. Теоретически, делая дыхательные пути более щелочной может увеличить бактериального убийства и улучшить муфтилиарии и гомеостаза дыхательных путей в целом. Тем не менее, исследования in vivo/ex vivo сообщают о широком диапазоне значений рН, и на сегодняшний день результаты не являются окончательными относительно наличия разницы в рН между не-CF и CF дыхательных путей. В начале 2000-х годов, различные группы сообщили рН EBC. В небольных групп, значения рН варьировались от 4,6 до 8,5, но интересно, РН EBC был найден более кислой во время обострений у людей с CF12,27. Совсем недавно, in vivo измерения ASL в человеческих и животных моделей CF сообщили противоречивые результаты16,17,21,22,23, 24 и до сих пор неясно, если CF дыхательные пути являются более кислыми, чем не-CF дыхательных путей.
Как in vivo измерения нижней ASL рН оказалось трудно из-за очень небольшого количества жидкости подкладка дыхательных путей и потенциальное присутствие слизистых плагинов в болезни, многие группы обратились к in vitro эксперименты для измерения ASL рН, в основном с использованием трех различных методологии. Первый подход использует dextran-соединенные клетки-impermeant рН-чувствительные флуоресцентные красители, которые добавляются в качестве сухого порошка, либо непосредственно в ASL или с помощью инертной жидкости называется перфторуглерод (PFC)5,8,16 , 17 Лет , 28 , 29 , 30 год , 31 год , 32. Однако, этот метод обеспечивает мало контроля над точным количеством красителя, который добавляется в культуры и представляет собой риск красителя агрегатов и большие различия в концентрации между образцами и / или экспериментов и даже в рамках одного образца . Он также, как правило, выполняется с конфокическим микроскопом, который ограничивает его применимость и во многих случаях предотвращает детальный мониторинг нескольких образцов и изменения условий записи. Второй метод, используемый для измерения ASL рН является использование рН чувствительных микроэлектродов5,15. Поэтому измерения ASL pH не зависят от концентрации флуоресцентного красителя и должны дать более надежные и воспроизводимые результаты. Тем не менее, этот метод не позволяет для динамических, в режиме реального времени измерения ASL pH, и это не легко сделать несколько показаний в различных условиях. Это также трудоемкий, сложный процесс, который требует специального оборудования (микроэлектродных изготовление/электрофизиологических записывающих устройств) и подготовки к сбору образцов для последующего измерения и калибровки рН. Кроме того, эти два метода также показали некоторые несоответствия в способности производить воспроизводимые результаты, используя pH-чувствительный метод флуоресцентного красителя, Tang et al. сообщили значения 7,35 для не-CF ASL и 7,0 для CF ASL8 в то время как в более последние бумаги из той же группы, ASL рН составил 6,9 и 6,4 для не-CF и CF, соответственно17. Аналогичным образом, микроэлектродов измерений дал значения 6,4 в не-CF ASL и 6,1 в CF ASL в исследовании с 200315 в то время как та же группа сообщила значения 6,7 для не-CF ASL и 6,45 для CF ASL в исследовании с 2013 года5. Наконец, в третьем подходе исследователи добавляют относительно большой объем слабо буферизированного раствора на апикальную (слизистую) поверхность культур, тем самым разрушая условия тонкой пленки и изменяя состав ASL, и потенциально его регулирование. рН затем измеряется либо с помощью рН-чувствительных флуоресцентных красителей33, по методу рН-стат титрации в Ussing камере13,14, или требует разбавленного ASL быть удалены из культур и рН измеряется с помощью рН электрод, анализатор или лакмусовая полоска34. Еще одной трудностью в точном измерении ASL pH является создание стандартной кривой, которая является максимально точной. Действительно, выполняются ли показания с помощью электрода, который будет измерять разницу в электрическом потенциале через смолу или с помощью рН-чувствительных флуоресцентных красителей, оба эти подхода будут затронуты местной микросредой образцов измеряется. Более конкретно, диссоциация постоянной (Kd) красителей может значительно варьироваться в зависимости от температуры, ионной силы, вязкости, а также потенциальных взаимодействий красителя с клеточными компонентами, такими как белки и потенциально слизь.
Для того, чтобы попытаться преодолеть многие из этих технических проблем, а также разработать более динамичный, простой и более высокий метод пропускной способностью, мы создали технику in vitro, которая записывает ASL pH в первичных культурах hAEC с помощью клеточного impermeant pH-чувствительного флуоресцентный краситель в стандартном коммерческом плите-читателя. Метод генерирует воспроизводимые, динамические, полуавтоматические измерения ASL pH полностью дифференцированных 3D-клеточных культур в условиях тонкой пленки. С помощью нескольких колодцев пластины читателя, это полуавтоматический опрос может сделать почти одновременные измерения рН до 24 условий более 12 ч и может контролировать эффект добавления различных агонистов или ингибиторов. В настоящем документе мы подробно описываем методологию и сообщаем репрезентативные результаты в условиях положительного и отрицательного контроля, который подтверждает технику.
Первичные не-CF (n No 3 доноров, возраст 34, 27 и 23 лет) и CF (n No 3 доноров, все F580del / F508del; возраст 40, 41, неизвестный) hAECs были добрый подарок от д-ра Скотта Х. Ранделл (Марсико Лунг институт, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл, США) и были obtai ned в соответствии с протоколом #03-1396 утвержденных Университетом Северной Каролины в Чапел-Хилл биомедицинских институциональных Обзор совета. Клетки были выращены в соответствии с ранее опубликованными методами с использованием роста и дифференциации средств массовой информации, описанные Fulcher и Randell35,36.
1. Подготовка образца
2. Фоновое измерение
3. Кинетическое измерение
4. Калибровка situ pH
5. Оценка влияния концентрации красителя и объема подвески на данные калибровки
6. Анализ данных
Описанный выше метод позволяет динамическое измерение рН ASL в 24 отдельных первичных культурах hAECs. На рисунке 1 показана схема основных ступеней и оборудования. Ночные нагруженные клетки помещаются в CO2 и температурный считыватель пластин, в котором каждые 5 минут регистрируются флуоресценция от декрен-связанных рН чувствительных и рН-нечувствительных красителей.

Рисунок 1. Схема метода измерения ASL pH. После мытья культур и выполнения фонового чтения, первичных человеческих эпителиальных клеток дыхательных путей (hAECs) ASL загружаются с dextran соединенных рН-чувствительных и рН-нечувствительной смеси красителя ночь на 37 градусов по Цельсию, 5% CO2. На следующий день пластина передаетсяна температуру и CO 2-контролируемый считыватель пластин и флуоресценция от обоих красителей регистрируется с течением времени. После эксперимента проводится калибровка на месте и анализируются данные и представлены как ASL pH с течением времени. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Во-первых, мы исследовали влияние различных объемов и концентраций красителя на количество флуоресценции и, следовательно, на соотношении 560/495. Действительно, цель добавления рН-нечувствительны к рН-чувствительный краситель, чтобы исправить для изменчивости в ASL нагрузки. Тем не менее, было важно проверить это предположение и оценить, если мы могли бы использовать стандартную кривую калибровки выполняется в отсутствие клеток в 96 хорошо пластины для всех экспериментов и типов клеток. Мы отслеживали количество флуоресценции более 1 ч в 50, 100 или 200 л калибровочных растворов (при рН 5,5, 6,5, 7 или 8), содержащих 5, 10, 20 или 40 мкг/мл красителей. Результаты представлены на рисунке 2A-C, и показывают, что для того же рН и той же концентрации красителей, сообщили pHsens / pHins коэффициент выбросов (560/495 на оси y) отличается в зависимости от объема (рисунок2A). Кроме того, при том же рН и том же объеме различные концентрации красителя обеспечивают различные значения соотношения(рисунок 2B). Таким образом, изменения в концентрации объема или красителя будут влиять на абсолютное значение рН, рассчитанное из коэффициента выбросов. На рисунке 2С показано, что время, необходимое для оживляемого температуры, составляет примерно 15-20 мин. Чтобы подтвердить влияние концентрации красителей и объема на коэффициенты выбросов, мы зафиксировали флуоресценцию от красителей, загруженных в ASL первичных не-CF и CF hAECs на месте. Затем мы выполнили калибровку и проанализировали результаты (1), генерируя одну глобальную стандартную кривую из всех образцов или (2), генерируя две независимые стандартные кривые для каждого типа клеток (не CF и CF). ASL рН от обоих типов клеток были затем построены против времени(рисунок 3A, B) и усредненный (рисунок3C). Значения ASL pH, полученные из одной глобальной стандартной кривой, показали существенную разницу между культурами, не отнесемыми к CF и CF(рисунок3A,C), в то время как ASL pH не сильно отличался между CF и non-CF hAECs, когда рН был рассчитан с независимые стандартные кривые(рисунок 3B,C). Эти результаты показывают важность создания независимых кривых калибровки для каждого эксперимента и в рамках эксперимента, для каждого донора образца, так как, когда кривые калибровки были усреднены вместе, более высокие значения соотношения pHsens/pHins были найдены в культурах CF , что указывает на более кислый рН(рисунок 3C).

Рисунок 2. Оптимизация калибровки рН в пробирке. Различные объемы растворов известных рН и содержащих различные концентрации красителя были загружены на 96 хорошо пластины и флуоресценции было зарегистрировано более 1 ч. Влияние объема (A) и концентрации красителя (B) на коэффициенты флуоресценции. Коэффициенты были построены против рН для точки времени 24 мин. (C) Наклон изменения флуоресценции был рассчитан для каждого решения и построен как функция времени (в мин). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 3. Оптимизация анализа калибровки рН на первичных hAECs на месте. (A) Представитель следы ASL рН, полученные из одной стандартной кривой усреднения данных из не-CF и CF культур. (B) Представительные следы ASL pH, полученные из независимой стандартной кривой, выполненной на культурах, не входящих в CF или CF. Каждый набор данных вычислялся по собственной кривой калибровки. (C) Оценка различий в рН ASL между культурами, не входящих в CF и CF, в зависимости от того, как была выполнена калибровка. Данные представляют собой среднее SEM от n'3 экспериментов, 2-путь ANOVA, Sidak в нескольких сравнений тест). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Для дальнейшей проверки нашей техники, мы затем требуется положительный контроль, чтобы продемонстрировать, что техника была способна обнаруживать "ожидаемые" изменения в ASL рН. Поскольку наличие более кислой ASL в клетках CF по-прежнему спорным, мы использовали агонист кампам форсколин, как положительное состояние контроля, чтобы стимулировать HCO3- секрецию через CFTR. Ожидаемые результаты показали бы форсколин-индуцированную алкалиализацию ASL в клетках non-CF которые больш были бы уменьшены или отменены в клетках CF в зависимости от суровости перегласовок. На рисунке 4A показаны репрезентативные следы ASL pH не-CF и CF клеток с течением времени, а на рисунке 4B показаны средние данные ASL pH до и после лечения форсколином в обоих типах клеток. Мы можем получить различную информацию из этих результатов. Во-первых, как уже показано на рисунке 3B,C, отдых ASL рН не отличается между не-CF и CF эпителии. Во-вторых, первые 3-4 тайм-точек после приостановки эксперимента по лечению клеток форсколином, показали значительное увеличение рН, которые восстановились в течение 15 мин. Это было связано с падением концентрации CO2 между считывателем пластин (5%) и шкаф безопасности культуры ткани (0%). Согласно уравнению Хендерсона Хассельбалха, рН 7 в 5% среде CO2 приравнивается к концентрации HCO3- 9,3 мМ. Когда клетки удаляются из считывателя пластин, снижение концентрации CO2 до 0% теоретически приведет к увеличению рН в размере 8 евро. Рисунок 4A показывает, что ASL рН увеличился до 7,8 евро, что можно объяснить промежуток времени, перепозиционируя пластину в считывателе пластины (т.е.в 5% CO2 среды). Наконец, как и предсказывалось, добавление басолатерального 10 мкм форсколина (Fsk) значительно увеличило ASL pH только в культурах, не входящих в CF. Как было показано различными группами, что существует разница в устойчивом состоянии ASL рН между CF и не-CF эпителия, мы хотели бы дальнейшего изучения очевидного отсутствия разницы рН в наших экспериментах и роль CFTR. Для этого мы предварительно инкубировали культуры, не связанные с CF, с конкретным ингибитором CFTR, CFTRinh172 (172). Как указано в разделе протокола 2.8, смесь красителя была подготовлена, как указано выше, и ингибитор был добавлен в концентрации 0,1X и 2 мкм. Согласно литературе, ASL высота не-CF клеток составляет около 10 мкм. Таким образом, в полупроницаемой опоре диаметром 6,5 мм теоретический объем ASL составляет 3,25 евро. Добавляя 3 зЛ красителя No 172 при 2 МКм, концентрация ингибитора после поглощения избыточной жидкости теоретически составит 20 мкм (1x, желаемая концентрация). Представитель следы на рисунке 4C и среднее резюме на рисунке 4D показывают, что 172 не уменьшить отдыха ASL рН, но предотвратить форколин-индуцированного увеличения ASL рН, тем самым подтверждая наши результаты, полученные от не-CF по сравнению с CF культур и дальнейшей проверки нашей техники.

Рисунок 4. Динамическое измерение рН ASL в ответ на активацию CFTR форсколином. (A) Представительследы влияния форсколина (Fsk, 10 мкм) на кинетику ASL рН с течением времени в не-CF и CF hAECs. Данные представляют собой среднее SEM от n'3 экспериментов. (B) Резюме влияния Fsk на ASL рН в non-CF и CF культур. Данные представляют собой среднее sD от n'69 не-CF культур и 35 культур CF (2-путь ANOVA, Sidak несколько сравнений тест). (C) Представительные следы влияния CFTRinh172 (172, 20 мкм) на fsk-индуцированное увеличение рН ASL в hAECs non-CF. Данные представляют собой среднее SEM от n'5 экспериментов. (D) Резюме влияния 172 на Fsk-индуцированной алкалиизации ASL в не-CF культур. Данные представляют собой среднее SEM от n'5 экспериментов (2-путь ANOVA, Sidak в нескольких сравнений тест). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Наконец, как указано в разделе протокола 6.8, темпы подкисления/щелочности могут быть рассчитаны путем установки линейной регрессии к исходным тайм-пойнтам после вмешательства. Рисунок 5A показывает, что удаление базолатерального HCO3- содержащего раствора (HCO3- KRB) и замена его буферным раствором HEPES, при отсутствии CO2,индуцированного заметного подкисления ASL. Это согласуется с отсутствием HCO3- ингибирование трансэпителиальной HCO3- секреции, что позволяет составной протонной секреции этих клеток дыхательных путей, чтобы неуклонно уменьшить ASL рН15,17. Интересно, что начальная скорость подкисления клеток, не относясь к CF, была значительно медленнее, чем у CF культур(рисунок 5B).

Рисунок 5. Динамические изменения в ASL рН в ответ на HCO3- удаление. (A) Представитель следы, показывающие влияние HCO3- удаление на кинетику ASL рН с течением времени в не-CF и CF hAECs. Первоначальные темпы подкисления были получены через склон прямой линии, установленной на 7 временных точек после HCO3- удаления. Данные представляют собой средства, полученные в рамках экспериментов n'6 и 7 на культурах, не относясь к CF и CF соответственно. (B) Резюме начальных темпов подкисления после HCO3- удаление. Данные представляют собой средства, полученные в рамках экспериментов n'6 и 7 на культурах, не относясь к CF и CF(тест Манн-Уитни). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Здесь мы предоставляем подробный протокол для динамического измерения ASL рН в первичных эпителиальных клеток дыхательных путей человека. Критические шаги включают смыв слизи с апикальной поверхности клеток, измерение и вычитание фона с использованием тех же параметров, что и в эксперименте, оптимизацию z-позиции и усиление и выполнение калибровки pH situ.
Первый шаг мытья клеток имеет решающее значение, поскольку толстый слой слизи может (i) предотвратить красители от достижения перицилятельного слоя (PCL) и (ii) задержки или предотвратить обнаружение изменений в флуоресценции в ответ на агонистов / ингибиторов. Наш метод был разработан для изучения того, как первичные hAECs модулировали активность HCO3- и Hq транспортеров в ответ на агонистов. Хотя будет интересно исследовать, как изменения в PCL рН связаны с изменениями в слизи рН, дальнейшее развитие этого протокола необходимо, в том числе использование различных молекулярных вес-декстранс для дифференциалов целевой 2 слоев и z-сканов через весь ASL.
Еще одним важным шагом этого протокола является измерение фона. Апикальная поверхность полностью дифференцированной первичной эпителии дыхательных путей редко полностью плоская, которая повлияет на световой путь и, следовательно, фон. Обеспечение того, чтобы фоновые показания выполнялись в тех же локальных точках скважин, что и во время эксперимента, имеет решающее значение для воспроизводимости и стабильности записей.
Оптимизация z-позиции и усиления являются необходимыми шагами, которые должны быть созданы для каждой различной концентрации флуоресцентного красителя, который будет использоваться. Это предотвратит высокую изменчивость межэкспериментов. После настройки наш результат обеспечивает стабильные и воспроизводимые результаты. Одной из причин этого является то, что красители добавляются на апикальной поверхности на клетках в небольшом объеме жидкости, которая легко абсорбируется эпителием, оставляя однородно помечены ASL. Другой метод для окрашивании ASL, который может быть столь же успешным, используется сухой порошок или "подвеска" в PFC. Хотя это может быть экономия времени (как эксперименты, как правило, выполняются в течение 2 ч), маловероятно, что сухие красители полностью растворить в ASL и, таким образом, может быть образуют сгустки. Таким образом, различные концентрации рН-чувствительных красителя будут найдены на поверхности эпителиальных клеток.
Калибровка pH in situ является важным шагом для получения точных, воспроизводимых результатов. Как показано и объясняется в разделе результатов, различия в объемах ASL будут влиять на количество флуоресценции и, следовательно, интерполированные значения рН(Рисунок 2 и Рисунок 3). В то время как различные группы ранее опубликовали ASL pH измерений, широкий спектр значений были получены даже между различными исследованиями, опубликованными одной и той же группой8,17. Мы считаем, что, выполняя в situ калибровки, результаты станут более воспроизводимыми. По сравнению с другими методами калибровки рН, которые используют высокий Метод калибровки K /nigericin (или нескольких ионофоров) для создания стандартной кривой28,29,30, анализа, представленного здесь, имеет преимущество, что , до тех пор, как каждый шаг выполняется в шкаф безопасности, клетки, используемые для ASL рН можно мыть, хранить и повторно использовать для других экспериментов при условии, что лечение выполняется не обратимо влияют на эпителиальные клетки.
Разработка и оптимизация этого исследования обеспечила воспроизводимые результаты, и мы считаем, что этот метод поможет другим группам с их ASL измерения рН. Тем не менее, этот метод имеет также некоторые ограничения из-за создания и тип клеток, которые используются. Мониторинг ASL рН в течение более длительного периода времени, чем представленные здесь (Зgt;8-10 ч) может оказаться трудным, как долгосрочные высокой влажности окружающей среды может повредить оборудование и тот факт, что большинство читателей пластины только предлагают возможность записи кинетических показаний в течение определенное количество времени (обычно 24 ч). Использование полностью дифференцированных первичных hAECs имеет решающее значение в том, что различные этапы дифференциации повлияет на выражение HCO3- и Hq транспортеров. Однако практически нет возможности точно контролировать объем ASL в клетках, выращенных в условиях тонкой пленки. Как указано в протоколе и разделе результатов, изменения в объеме повлияют на коэффициент флуоресценции и, к сожалению, необходимо предположить, что в клетках, выращенных из одного человека, посеянных в один и тот же день на разных полупроницаемых опорах, объемах ASL будет то же самое. В результате этого ограничения, любой агонист или ингибитор, который повлияет на секрецию или поглощение жидкости, повлияет на объем ASL и, предположительно, коэффициенты флуоресценции. Однако, по нашему анализу, кривая калибровки выполняется в конце эксперимента, поэтому мы можем предположить, что эти изменения в объеме повлияют на коэффициенты калибровки так же, как во время кинетического эксперимента. По этой причине мы советуем группам, которые были бы заинтересованы в разработке этого асссе, использовать по крайней мере 2-3 репликации на тестируемое состояние, поскольку это позволит создать стандартную кривую для каждого состояния.
Здесь мы представляем простой, полуавтоматический, анализ, который позволяет в режиме реального времени измерения слизистой поверхности рН в условиях тонкопленки. Он обладает потенциалом для изучения динамических ответов рН во многих культурах практически одновременным образом, что позволяет проводить меж- и внутридонорские сравнения. Увеличение этого метода до 96 хорошо пластины формата с использованием поляризованной системы (HTS 96 пластин)38 обеспечит еще более высокую пропускную вычисляемую как ассс открытия наркотиков. Кроме того, мы показали, как этот метод может быть использован для изучения острого влияния агонистов на ASL рН, и мы уже опубликовали, что этот метод может быть использован для изучения долгосрочного эффекта апикического ингибитора протонного насоса на CF hAECs ASL39. Как рН было показано, чтобы регулировать инфекцию, воспаление, вязкость слизи и ионного транспорта, выявление молекулярных целей, которые могут увеличить рН будет иметь важное значение в области исследований хронических заболеваний легких, и этот метод будет потенциально облегчить развитие скрининга лекарственных средств в персонализированных медицинских подходах. Наконец, поскольку дисрегуляция в кислотной основе гомеостаза играет важную роль в других заболеваниях, этот протокол может быть адаптирован, с оптимизацией шаги, к различным оборудованием (пластины считывателей) и типов клеток, таких как другие эпителиальные клетки. Внеклеточной кислотности является характеристикой рака40,41,42, и это анализ может помочь определить, как твердые опухоли производят низкий рНe или могут быть использованы в качестве низкой пропускной способностью наркотиков скрининга анализ для восстановление рН гомеостаза. Аналогичным образом, что касается хронических заболеваний дыхательных путей, то она может также служить платформой для разработки персонализированного подхода к медицине.
МБ, не связано с этой работой, не связанные с этими исследованиями, проведенными под руководством исследователей, от Pfizer и Roche Diagnostics; Плата за выступления в Ньюкаслском университете из Новартиса, Рош Диагностики и TEVA. Расходы на поездки на образовательные встречи от Boehringer Ingelheim и Vertex Pharmaceuticals.
Эта работа была поддержана двумя грантами CF Trust Strategic Research Centre (SRC003 и SRC013) и Советом по медицинским исследованиям (MRC) «Доверие к концепции гранта» (MC-PC-15030). JG была поддержана грантом Фонда медицинских исследований (MRF-091-0001-RG-GARNE). МБ была поддержана Медицинским исследовательским советом Клинического Научного Стипендия (MR/M008797/1). IH была поддержана Стипендией wellcome Trust Clinical Training Fellowship (203520/no/16/) Исследование было поддержано Национальным институтом медицинских исследований Ньюкасл биомедицинских научно-исследовательский центр, базирующийся в Ньюкасл больницы NHS Фонд Trust и Ньюкаслского университета. Высказанные мнения являются мнениями автора (ы) и не обязательно мнения ГСЗ, NIHR или Департамента здравоохранения. Первичные клетки доктора Ранделла были поддержаны грантом Фонда муковисцидоза (BOUCHE15R0) и грантом NIH (P30DK065988).
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| 0,2 & микро; м шприц фильтр | Starlab | E4780-1226 | |
| 6,5 мм Transwell с 0,4 &; m Мембранная вставка из полиэстера | пор Corning | 3470 | |
| CaCl2 | Sigma Aldrich | 21115 | |
| CFTRInh172 | RnD Systems (Tocris) | 3430 | Концентрация: 50 мМ; Конечная концентрация: 20 & микро; M |
| Costar 24-луночные прозрачные многолуночные планшеты с обработкой TC | Corning | 3524 | |
| dextran-связанный pH-нечувствительный флуоресцентный краситель: AlexaFluor488-dextran | ThermoFisher | D22910 | Стоковая концентрация: 1 мг/мл; Конечная концентрация: 0,67 мг/мл |
| pH-чувствительный флуоресцентный краситель, связанный с декстраном: pHrodo-dextran | ThermoFisher | P10361 | Стоковая концентрация: 1 мг/мл; Конечная концентрация: 0,67 мг/мл |
| D-глюкозы | Sigma Aldrich | G5767 | |
| Forskolin | RnD Systems (Tocris) | 1099 | Стоковая концентрация: 50 мМ; Конечная концентрация: 10 & микро; M |
| Greiner CELLSTAR 96 луночные пластины | Cellstar | 655180 | |
| Кассета | для влажности TECAN | 30090495 | |
| KCl | Sigma Aldrich | P9541 | |
| MES | Sigma Aldrich | M3885 | |
| MgCl2Sigma | Aldrich | M1028 | |
| NaCl | Sigma Aldrich | S9888 | |
| NaHCO3 | Sigma | Aldrich S5761 | |
| NaHepes | Sigma Aldrich | H3784 | |
| Считыватель пластин: TECAN SPARK 10M | TECAN | 30086375 | |
| Tris | Sigma Aldrich | T1503 | |
| Универсальные pH-электроды DJ 113 | VWR | 662-1385 |