Здесь представлен протокол для изучения фармакодинамики, потенциала стволовых клеток и дифференциации рака в эпителиальных органоидах простаты. Органоиды простаты являются андрогенов отзывчивые, трехмерные (3D) культуры, выращенные в определенной среде, которая напоминает простатический эпителий. Органоиды простаты могут быть созданы из диких и генетически модифицированных моделей мыши, доброкачественных тканей человека, и передовых рака простаты. Важно отметить, что полученные организмом пациенты очень похожи на опухоли в генетике и биологии опухолей in vivo. Кроме того, органоиды могут быть генетически манипулировать с помощью CRISPR/Cas9 и shRNA систем. Эти контролируемые генетики делают органоидную культуру привлекательной в качестве платформы для быстрого тестирования влияния генотипов и мутационных профилей на фармакологические реакции. Однако экспериментальные протоколы должны быть специально адаптированы к 3D-природе органоидных культур для получения воспроизводимых результатов. Описаны здесь подробные протоколы для выполнения посевных анализов для определения способности органоидного образования. Впоследствии, этот доклад показывает, как выполнять медикаментозное лечение и анализировать фармакологические реакции с помощью измерений жизнеспособности, изоляции белка, и изоляции РНК. Наконец, протокол описывает, как подготовить органоиды для ксенотрансплантации и последующих анализов роста in vivo с использованием подкожной прививки. Эти протоколы дают высоковоспроизводимые данные и широко применимы к системам 3D-культуры.