Методическая статья

Синтез информационных пептоидов и их последовательность-направленной динамической ковалентной самосборки

DOI:

10.3791/60442

⸱

6 февраля 2020 г.

 ,  , 
1Department of Chemical Engineering, University of Michigan, 2Department of Chemical Engineering, Monash University, 3Department of Materials Science and Engineering, Monash University

В этой статье

Краткое содержание

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Представлен протокол для синтеза закодированных информацией пептоидных олигомеров и для последовательной самосборки этих пептоидов в молекулярные лестницы с использованием аминов и альдегидов в качестве динамических ковалентных реактивных пар и Кислой редкой земли Льюиса металлические трифлы в качестве многоцелевых реагентов.

Аннотация

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Этот протокол представляет собой использование Льюис акисливых многоцелевых реагентов, чтобы обойти кинетическое поглощение наблюдается во время самосборки информационно-кодированных олигомерных нитей опосредовано парных динамических ковалентных взаимодействий таким образом, имитируя тепловой езды на велосипеде обычно используется для самосборки дополнительных нуклеиновой кислоты последовательностей. Первичные амин мономеры, несущие альдегид и амин кулон moieties функционируют с ортогонализации групп для использования в качестве динамических ковалентных пар реактивантных. Используя модифицированный автоматизированный синтезатор пептида, первичные мономеры амин кодируются в олиго (пептоидные) нити через синтез субмономера твердой фазы. После очистки высокопроизводительной жидкой хроматографией (HPLC) и характеристики электроспрейи ионизации масс-спектрометрии (ESI-MS), последовательность конкретных олигомеров подвергаются высокой загрузке Льюис кислой редкоземельных металлических трифле, который как депрепрегирует альдегидные moieties и влияет на реакционную пару эквилибрия, так что нити полностью dissociate. Впоследствии, часть кислоты Льюиса извлекается, что позволяет аннулирования дополнительных последовательности конкретных нитей для формирования информационно-кодированных молекулярных лестниц характеризуется матрицы при содействии лазерной дезорпации / ионизации масс-спектрометрии (MALDI-MS). Простая процедура, изложенная в настоящем докладе, обходит кинетические ловушки, обычно встречающихся в области динамической ковалентной сборки, и служит платформой для будущего дизайна надежных, сложных архитектур.

Введение

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Прогресс в самосборке, процесс, с помощью которого небольшие суб-единицы генерировать большие архитектуры через термодинамически управляемых путей, позволило улучшить контроль над макро- и надмолекулярных наноструктур, как правило, используя межмолекулярные взаимодействия, такие как укладка и водородных связей1,2,3,4. В частности, нуклеиновые кислоты (т.е. полинуклеотиды) стали удивительно универсальными наностроительными носителями, так как высокая плотность информации, обеспечиваемой спариванием базы Watson-Crick, позволяет сборку сложных, последовательно-селективных структур4,5. В то время как по своей сути низкая прочность этих переходных межмолекулярных связей позволяет переформатировать суб-единицу и коррекцию ошибок, резучивые структуры часто подвержены тепловой и механической деградации6. В отличие от динамических ковалентных взаимодействий7,8,9, класс ковалентных связей формирования реакций, которые являются обратимыми или перестроены в мягких условиях и недавно были использованы для выхода сложных макромолекулы, такие как лестницы10,11,12,13, клетки14,15,16, и стеки17, предложение сильные связи и надежные структуры. К сожалению, возможности для реорганизации и проверки ошибок уменьшается из-за относительно низких темпов перестановки этих ковалентных видов, сокращая их возможности для самостоятельной сборки в желаемые продукты18. Для решения этой кинетической захвата, катализаторы или суровые условия реакции часто используются в сочетании с простыми строительными блоками. Здесь мы сообщаем о процессе, который обходит кинетическое захват, чтобы позволить самосборке молекулярных лестниц из олигомеров, специфичных последовательности, где гибридизация направлена на информацию, закодированную в последовательности остатков олигомера.

Учитывая их синтетическую доступность, поли (N-заменители глицина) s (т.е. пептоиды) используются в качестве олигомерных прекурсоров, из которых молекулярные лестницы собраны19. Пептоиды являются структурными изомерами пептидов, в которых подчелюстные группы прикреплены к позвоночнику азота вместо того, чтобы в сочетании с углеродом20. Использование твердой фазы синтеза, точное размещение динамических ковалентных групп кулонов вдоль пептоидной цепи легко достигается, что позволяет для разработки прекурсоров олигомеров, которые могут собраться в сложные надмолекулярные структуры21.

Динамическая ковалентная перестановка иминовой связи используется в этой процедуре, так как реакция генерации имина обеспечивает удобное средство для характеристики самосборки масс-спектрометрией, поскольку каждая формируемая связь приводит к массовому сокращению на 18 г/моль22. Кроме того, равновесие между амин и альдегид реагенты и имин продукт может быть изменен путем изменения концентрации кислоты. В частности, редкоземельные металлические трифлы используются для воздействия на равновесие, и дополнительно дезащиты этилен ацетал-защищенных альдегидов23,24,25. Отметим, что скандий-трифлету уже широко используется в области динамической ковалентной самосборки, в том числе его недавний успех в содействии синтезу ковалентных органических рамок (COFs) при комнатной температуре26,27. Кроме того, контрастная растворимость последовательностей олиго (пептоид) и редкоземельный металлический трифлат обеспечивает равновесное управление посредством экстракции жидкостной жидкости. Этот процесс, о который сообщалось, использует этот контроль для обхода кинетических барьеров, препятствующих самосборке, направленной на информационную.

Протокол

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

ВНИМАНИЕ: Некоторые химические вещества, используемые в этом протоколе, являются коррозионными, легковоспламеняющимися или токсичными и должны использоваться только под химическим капотом дыма. Пожалуйста, используйте соответствующее оборудование для индивидуальной защиты и проконсультируйтесь со всеми соответствующими листами данных безопасности (SDS) перед использованием.

1. Синтез мономеров

ПРИМЕЧАНИЕ: Первичные амины были синтезированы в соответствии с опубликованными подходами.

  1. Синтез 4-(2-аминоэтил)-N-(аллилкарбонилокси)фениламин (Npam)25,28
    1. Добавьте 5,0 г (36,7 ммоль) из 4-(2-аминоэтил) анилин до 150 мл 10% уксусной кислоты (aqueous solution, v/v).
      ПРИМЕЧАНИЕ: Использование слабой кислоты позволяет селективной защиты ароматических амин, не влияя на алифатический амин из-за большой разницы в рKзначение между двумя группами.
    2. Приготовьте раствор 4,9 г (40,4 ммоль; 1,1 эквив.) аллил хлоротормат в 150 мл 1,4-диоксана.
    3. Объедините растворы в круглой нижней колбе 500 мл, оснащенной магнитным перемешиванием, и перемешайте реакционную смесь при комнатной температуре на ночь.
    4. Чтобы выработать реакцию, разбавьте 500 мл деионированной (DI) воды и промойте диэтил-эфиром (Et2O, 300 мл и 3). Откажитесь от органических фракций.
    5. Отрегулируйте вавную фазу до pH 14, добавив 2 M NaOH (ваквое решение) и извлекайте с Et2O (150 мл и 3).
    6. Смешайте органические фракции и промойте с водой DI (150 мл и 3).
    7. Сухой над Na2SO4, затем фильтр.
    8. Испаряйся до сухости при пониженном давлении.
    9. Подтвердите личность изолированного продукта, Npam, с помощью ядерной магнитно-резонансной (ЯМР) спектроскопии. Ожидать следующих результатов: 1HMR (500 МГц, CdCl3 ): 7,31 (d, J 8.0 Гц, 2H, Ar), 7,14 (d, J - 8.5 Гц, 2H, Ar), 6,65 (с, 1H, -NH-),6,04 - 5,89 (м, 1H,-CЗК2),5,36 (dq, J 17, 1,1, 1,1, 1,1, 6,1, 1,89 (м, 1H, -C ЗКК 2), 5,36 (dq, J 17, 1,1, 1,1, 1,1, 1,89 (м, 1H, -C 1H, -CH'CHH), 5.26 (dq, J - 10.5, 1.4 Гц, 1H, -CH'CHH),4.66 (dt, J- 5.8, 1.5 Гц, 2H, -CH2-CH'CH2),2.94 (t, J- 6.8 Hz, 2H, -CHz 2-NH2), 2.70 (t, J - 6.8 Гц, 2H, -CH2-Ar), 1.04 (s, 2H, -CH2-NH2). 13 Год C NMR (125 МГц, CD3OD) :154,85, 137.00, 134.98, 133.51, 129.36, 119.41, 116.92, 65.62, 59.89, 43.47, 38.72.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Продукт светло-желтый твердый и имеет общую урожайность 69%. Используйте продукт без дальнейшей очистки.
  2. Синтез 4-(1,3-диоксациклопент-2-ил)бензонитрил29,30
    1. Растворите 25 г (0,19 моль) 4-цианобензалдегида в 200 мл толуола.
    2. Добавить 42,2 мл (0,768 ммоль; 4 эквив.) этилена гликоль и 0,02 г (0,1 ммоль; 0,05 моль%) толуол -р-сульфоновая кислота к реакционной смеси.
    3. Перемешать и рефлюкс ночь на 120 градусов по Цельсию с помощью декана-Старка ловушку (т.е. азеотропной дистилляции) для удаления воды, генерируемой во время реакции.
    4. После того, как реакция будет завершена и охлаждается до комнатной температуры, добавьте 40 мл 5% NaHCO3 (w/v) водинийрастворимый раствор.
    5. Извлекайте органический слой и трижды промойте водой DI.
    6. Сухой над Na2SO4, затем фильтр.
    7. Испаряйся до сухости при пониженном давлении.
    8. Подтвердите личность изолированного продукта с помощью спектроскопии ЯМР. Ожидать следующих результатов: 1HMr (400 МГц, CDCl3 ): 7,67 (d, J 8.0, 2H), Ar), 7,59 (d, J 8,4, 2H, Ar), 5,84 (ы, 1H, CH), 4,12 - 4,03 (AABB , 4H, (CHO)2). 13 Год C NMR (100 МГц, CDCl3) :143.20, 132.34, 127.30, 118.72, 113.02, 102.56, 65.57.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Продукт белого кристаллического твердого тела и имеет общую урожайность 86%. Используйте продукт без дальнейшей очистки.
  3. Синтез 4-(1,3-диоксациклопент-2-ил)бензиламин (Npal)29
    1. Приготовьте раствор 10 г (0,057 моль) из 4-(1,3-диоксациклопент-2-yl)бензонитрил в 100 мл ангидроуса Et2O.
    2. Аккуратно добавьте 4,3 г (0,11 мл; 2 эквив.) от4 до 100 мл ангидроуса Et2O в круглую нижнюю колбу при 0 градусах Цельсия. Перемешать, чтобы создать хорошо смешанную подвеску и запечатать систему под инертной атмосферой с помощью аргона заполненный шар. Тщательно утолить этанолом любой остаточный LiAlH4 на оборудовании, используемом для взвешивания.
      ВНИМАНИЕ: Литий алюминиевый гидрид (LiAlH4) является мягким пирофором; ручка под инертным газом и защищает от влаги.
    3. Добавьте 4-(1,3-диоксациклопент-2-yl)бензонитрил раствор медленно с помощью воронки добавления или шприц насос при сохранении реакции смеси при температуре 0 градусов по Цельсию.
    4. Перемешать реакционную смесь в течение 4 ч при температуре 0 градусов по Цельсию, а затем 12 ч при комнатной температуре.
    5. После того, как реакция завершена и охлаждается до 0 градусов по Цельсию, медленно добавляйте 95% этанола (30 мл). Дальнейшее утопление путем добавления 50% этанола в воду (v/v, 20 мл). Пузырьк может быть использован для мониторинга процесса закалки.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Добавить дополнительные anhydrous Et2O по мере необходимости для поддержания адекватной скорости перемешивания.
    6. Отделить эфирный супернатант и испариться до сухости при пониженном давлении.
    7. Фильтровое масло пронизанное масло пронизано фильтром шприца 0,45 мкм.
    8. Подтвердите личность изолированного продукта, NpaI, с помощью спектроскопии ЯМР. Ожидать следующих результатов: 1HMR (400 МГц, CDCl3 ): 7,44 (д, J No 8, 2H, Ar), 7,32 (д, J 8, 2H, Ar), 5,80 (с, 1H, CH), 4,14 - 4,0 (ААЗББЗ, 4H, (CH2O)2),3,87 (ы, 2H, -C 2H2NH-2). 13 Год C NMR (100 МГц, CDCl3) :144,53, 136,53, 127.16, 126.77, 103.72, 65.39, 46.35.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Продукт желтого масла и имеет общую урожайность 70%. Используйте продукт без дальнейшей очистки.
  4. Синтез 2-(2-этиловыйтотил29,31
    1. Добавьте 20 г (0,15 мл) диэтиленглиле гликолмоноэтиловый эфир и 50 мл тетрагидрофурана (THF) в круглую нижнюю колбу с магнитным мешалкой.
    2. Охладите до 0 градусов и загерметизуйте систему под инертной атмосферой с помощью шара, наполненного аргоном.
    3. Добавить 50 мл 6 M aqueous NaOH (2 equiv.).
    4. Растворите 54 г (0,28 моль; 2 эквив.) тосилхлорида в 80 мл THF и добавьте раствор в реакционную смесь dropwise. Перемешать в течение 1 ч при 0 градусах по Цельсию.
    5. Разрешить реакционную смесь для достижения комнатной температуры и перемешать в течение еще часа.
    6. Извлеките реакционную смесь с et2O (400 мл).
    7. Вымойте органический слой с 1 M NaOH, затем с DI воды.
    8. Сухой над Na2SO4, затем фильтр.
    9. Испаряйся до сухости при пониженном давлении.
    10. Подтвердить личность изолированного продукта с помощью спектроскопии ЯМР. Ожидайте следующих результатов: 1HMr (400 МГц, CDCl3 ): 7,78 (d, J 8.0, 2H, -S-C'CH-CH),7,33 (d, J 8.5, 2H, -S-C'CH-CH),4.15 (t, J 5.0, 2H, -CH2-CH2-O-Ts), 3.68 (t, J 5.0, 2H, CH2-CH2-O-Ts), 3.60-3.42 (м, 6H, O-CH2-CH2-O-CH2-CH3),2.43 (s, 3H, 3H, C-CH3), 1.17 (t, J 7.0, 3H, O-CH2-CH3). 13 Год C NMR (100 МГц, CDCl3) :144,79, 132.95, 130.26, 129.80, 127.90, 126.95, 70.75, 69.68, 69.29, 68.61, 66.57, 21.56, 11.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Продукт бесцветная жидкость и имеет общую урожайность 98%. Используйте продукт без дальнейшей очистки.
  5. Синтез 2-(2-этиловый азид29,31
    1. Растворите 40 г (0,14 моль) из 2-(2-этоксиэтокси) этилового тосилата в 250 мл диметилформамида (DMF) в круглой нижней колбе с магнитным мешалкой. Печать системы под инертной атмосферой с помощью аргона заполненные шар.
    2. Добавьте 32 г (0,49 моль; 3,5 эквив.) NaN3 в реакционную смесь.
      ВНИМАНИЕ: Не используйте металлический шпатель при взвешивании NaN3. NaN3 может вскакить с свинцом и медью, что приводит к образованию высоковзрывных металлических азидов. Это остро токсичных и смертельным исходом при проглатывании или в контакте с кожей.
    3. Нагрейте реакционную смесь до 60 градусов и дайте ей работать в течение 36 ч. Затем охладить до комнатной температуры.
    4. Разбавить большим количеством воды (500 мл) и экстрактом с Et2O (150 мл и 3).
    5. Изолировать органический слой и выполнять вымывки воды.
    6. Сухой над Na2SO4, затем фильтр.
    7. Испаряйся до сухости при пониженном давлении.
    8. Подтвердить личность изолированного продукта с помощью спектроскопии ЯМР. Ожидайте следующих результатов: 1HMr (400 МГц, CDCl3 ): 3,64 (м, 4H, O-CH2-CH2-O), 3,58 (м, 2H, N3-CH2-CH2-O), 3.51 (q, J 7.5, 2H, O-CH2-CH3),3.38 (t, J q 5.0, 2H, N3-CH2-O), 1.19 (t, J 7.5, 3H, O-CH2-CH3). 13 Год C NMR (100 МГц, CDCl3 ): 70,70, 69,97, 69,80, 66,63, 50,60, 15,08.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Продукт желтой жидкости и имеет общую урожайность 85%. Используйте продукт без дальнейшей очистки.
  6. Синтез 2-(2-этилокситокси)этиламин (Neee)29,31
    1. Растворите 20 г (0,13 мл) 2-(2-этоксиэтокси) этиловый азид в 160 мл THF в 500 мл круглой нижней колбы с магнитным мешалкой.
    2. Добавить 40 г (0,15 моль, 1,1 эквив.) трифенилфосфина и перемешать на ночь при комнатной температуре под аргоном.
    3. Утолить реакционную смесь водой (220 мл) и дать ей перемешивать еще на один день.
    4. Вымойте результирующее раствор с толуеном, а затем дихлорметаном (DCM).
    5. Испаряйся в аравновеши под вакуумом.
    6. Подтвердите личность изолированного продукта, Neee, с помощью спектроскопии ЯМР. Ожидайте следующих результатов: 1HMR (400 МГц, CDCl3 ): 3,62-3,42 (м, 8H, NH2-CH2-CH2-O-CH2-CH2-O-CH2-CH3),2.82 (м, 2H, NH2-CH2-CH2-O), 1.48 (s, 2H, NH2),1.16 (t, J 7.5, 3H, O-CH -CH3). 13 Год C NMR (100 МГц, CDCl3) : 73,14, 70,72, 69,64, 66,45, 41,35, 15,00.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Продукт желтой жидкости и имеет общую урожайность 58%. Используйте продукт без дальнейшей очистки.

2. Твердофазный субмономерный синтез олиго (пептоидов)

ПРИМЕЧАНИЕ: Субмономерный подход к синтезу твердой фазы (SPS) был использован, поскольку он позволяет производить последовательность конкретных олигомеров с высокой эффективностью соединения. Автоматизированный пептидный синтезатор был адаптирован для быстрого генерации олиго (пептоидов). Настройки могут потребовать модификации для различных приборов.

  1. Подготовка
    1. Взвесить 0,125 г fmoc-Photolabile SS смолы (0,8 ммоль/г типичной нагрузки, 0,1 ммоль масштаба, 100-200 сетки, 1% DVB) и добавить в fritted автоматизированный синтезатор реакции судна. Вставьте сосуд в микроволновую часть синтезатора.
    2. Заполните основную бутылку растворителя DMF и бутылку дезащиты с 20% 4-метилпиперидин в DMF (v/v). Пустые отходы.
    3. Приготовьте 1 M растворы бромоацетической кислоты и N,N'-diisopropylcarbodiimide (DIC) в DMF с общими объемами 1,5 мл (количество остатков в последовательности) Дополнительные 5 мл гарантируют, что воздух не попадает в машину. Добавьте 0,47 мл уксусного ангидрида в DMF, чтобы сделать 5 мл укупорки раствор.
      ВНИМАНИЕ: DIC может вызвать серьезные повреждения глаз, раздражение кожи и сенсибилизации, а также раздражение дыхательных путей и сенсибилизации.
    4. Приготовьте 0,5 М растворы каждого первичного амина (Npam, Npal, Neee и Nma (2-метоксиэтиламин)) в N-метил-2-пирролидон (NMP), используемых для перемещения шага. Общие объемы первичных растворов амина должны составят 2,5 мл (количество остатков соответствующей первичной амина) - 2,5 мл.
    5. Добавьте все решения в многообразие автоматического синтезатора.
  2. Синтез
    ПРИМЕЧАНИЕ: Выполните с помощью автоматизированного синтезатора пептида.
    1. Набухают сречку с комнатной температурой 5 мин с 10 мл DMF. Слейте реакционный сосуд.
    2. Прижате группу Fmoc с 3 мл 20% 4-метилпиперидина раствор для 30 с при 75 градусах Цельсия и 90 с при 90 градусах Цельсия. Слейте сосуд. Повторите. Вымойте с DMF (2 мл и 2).
    3. Добавьте в сосуд 1,5 мл раствора бромоацетической кислоты и 1,5 мл раствора DIC. Нагрейте реакцию при температуре 75 градусов по Цельсию в течение 4,5 мин для выполнения бромоацетилирования реакции. Вымойте сетину (5 мл DMF No 3).
    4. Выполните реакцию смещения путем добавления 2,5 мл первичного раствора моминера в реакционный сосуд. Нагрейте при температуре 75 градусов по Цельсию в течение 4,5 мин. Вымойте сетину (5 мл DMF no 3).
    5. Повторите шаги 2.2.3. и 2.2,4. в то время как последовательно заменяя первичного амин мономер используется в шаге 2.2.4. расти олиго (пептоид) цепи в последовательности конкретных образом.
    6. После заключительного шага смещения, крышка последовательности, добавив 2,5 мл уксусного раствора ангидрида и 2 мл раствора DIC. Нагрейте при температуре 50 градусов по Цельсию в течение 2 мин. Вымойте сетину (5 мл DMF No 6).
    7. Перенесите сетовенку на фритированный стеклянный реакционный сосуд, оснащенный трехходовой стоп-стопом. Стеклянный сосуд реакции должен быть ранее силиконовые для предотвращения бисера от приливания к стенам. Силанизировать стены, заполнив сосуд 5% dichlorodimethylsilane в dichloroethane (DCE) (v/v) раствор сверху и давая ему сидеть в течение 30 мин. Слейте сосуд и мыть с DCE и метанолом. Сухой стеклянный сосуд перед использованием.
    8. Вымойте с помощью DCM (5 мл и 3), восходящей с N2 через одну руку и потянув вакуум с другой.
    9. Сухие и хранить сиську и прикрепляют сяо-олиго (пептоид) до дезащиты и расщепления.
  3. Аллок-амин дезащиты и расщепления из мисы
    1. Если мизанта хранилась более суток, возвысив на себя сезенную с 5 мл DMF в течение 10 минут. Затем процедить сосуд и добавить небольшой магнитный перемешивание бар.
    2. Добавьте 3 мл сухого DCM в стеклянный пептидный сосуд.
    3. Взвешивание 0,1 эквивалента тетракиса (трифенилфосфин)палладий (0) и 25 эквивалентов фенилсилана на Аллок-группу. Используйте зажим, чтобы позиционировать реакционный сосуд под углом над перемешать пластины так, что мизаня подвергается нежному возбуждению, оставаясь приостановлено в растворителе. Чтобы предотвратить испарение DCM, закрывай сяртовую сосуд.
    4. После 1 ч отфильтруйте раствор и промойте спомощьу dCM (3 х 5 мл).
    5. Повторите шаги 2.3.2. и 2.3,3.
    6. Промыть ресин последовательно с метанолом и DCM в два раза.
    7. Перенесите бар с ремешками с мискривкой в 20 мл.
    8. Погрузите в DMF мизины, перемешайте и расщепийте под облучением в течение 36 ч при примерно 25 mW.cm-2 с 405 нм. Небольшая часть смолы может быть расщепляется и характеризуется в ESI-MS до этого шага, чтобы обеспечить полную детекционизм Alloc амин. Если какие-либо группы Alloc остаются, повторите шаги 2.3.2 и 2.3.3.
    9. Отдельно освобожденный олиго (пептоид) от мисы через фильтр шприца. Удалите растворитель под вакуумом.
  4. Очищение и характеристика олиго (пептоидов)
    1. Восстановите пептоиды в смеси 50/50 воды/ацетонитрила.
    2. Очистка с обратной фазы подготовки HPLC (C18). Комбинат очищенных фракций, заморозить, и лиофилизации, чтобы дать небелый порошок. Порошок можно хранить для дальнейшего использования.
    3. Проанализируйте с помощью ESI-MS после очистки.
    4. Выполните масс-спектрометрию MALDI в режиме положительного иона отражательного отражения. Смешайте 2 л раствора образца (1 мМ) с 6 л смеси 10 мг матрицы No2-(4-гидроксифенилоз) бензойной кислоты (HABA)» в 200 л ацетонитрила. Пятно на тарелке образца MALDI и дайте высохнуть.
    5. Для чистоты выполните аналитический HPLC очищенного олиго (пептоидов).

3. Последовательность-селективная самосборка лестницы

  1. Самосборка путем диссоциации/экстракции/аннеалинга
    1. Приготовьте 10 мМ стоковых растворов каждой последовательности олиго (пептоид), используемой для самосборки, и 10 мМ стокового раствора скандия трифле (Sc(OTf)3) в ангидроуса ацетонитриле.
    2. К флакону объемом 3 мл, оснащенный магнитной панелью перемешивания, добавьте 20 л каждого пептоидного стокового раствора. Добавьте 1,5 eq Sc (OTf)3 на потенциальную облигацию имина из акционерного решения. Добавьте достаточное количество воды и ацетонитрила, чтобы сформировать 200 л 2% (v/v) воды/ацетонитрила раствора общего объема.
    3. Осторожно перемешать при 70 градусах по Цельсию в течение 2 ч для ацетал-дезащиты альдегида и диссоциации всех прядей.
    4. Зарядите флакон 200 л хлороформа и 2 мл воды. Встряхните осторожно.
    5. Разрешить смесь стоять (по крайней мере 15 мин) и, после полного разделения фазы, извлечь органический слой с микролитровым шприцем.
    6. Перемешать в новом флаконе при температуре 70 градусов по Цельсию для олигомерного аннулирования, как правило, 6 ч. Гибридизация лестницы также может быть выполнена при комнатной температуре, но в течение более длительного периода.
  2. Характеристика самосборных видов
    1. Выполните масс-спектрометрию MALDI-TOF на растворах реакционной смеси после шагов 3.1.3., 3.1.5.и 3.1.6. для мониторинга реакции. Если гибридизация является неполной, добавьте 1,5 eq Sc (OTf)3 на потенциальную облигацию имина из акционерного раствора и повторите шаги 3.1.3-3.1.6. до полного завершения.
    2. Высушите образец под устойчивым потоком азота и восстановите в 1 мл 2% азотной кислоты (вавеобразный раствор, v/v). Разбавить 4 и 106-сложить с водой HPLC. Определить постэкстрадционную концентрацию скандия с индуктивно йенсовыми масс-спектрометрией (ICP-MS).

Результаты

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Чтобы продемонстрировать способность закодированных информацией пептоидов проходить последовательно-селективную динамическую ковалентную самосборку в молекулярные лестницы, репрезентативная нить, H2N-Npam-Neee-Npal-Neee2-Npam-Nma, была синтезирована и гибридизирована с его дополнительной пептоидной последовательностью. Мономера Npam и Npal (характеризуется 1H NMR (500 МГц), Рисунок 1) были использованы в качестве динамических ковалентных рекатантных пар с Neee помощи растворимость окончательного самостоятельной сборки продуктов. Кроме того, включение коммерчески доступного мономера Nma позволяет продифференцирование между двумя дополнительными последовательностями. После завершения синтеза субмономера твердой фазы, Alloc-группа была удалена с Pd (PPh3)4. До и после дезащиты, части смолы были расщепляются под 405 нм света и характеризуется ESI-MS (Рисунок 2). Последовательность была очищена путем подготовки HPLC, лиофилизированы для достижения вне белого порошка, и чистота подтверждена с аналитической HPLC(Рисунок 3). Олиго (пептоид) был впоследствии гибридизирован с его дополнительной последовательности, H2N-N-Npal-Neee-Nam-Neee2-Npal, чтобы позволить себе в реестре лестница подтверждена MALDI-MS (Рисунок 4).

figure-results-1
Рисунок 1: Мономер синтетические схемы и 1H-NMR спектра. (A) Мономер синтетические схемы с реагентами и условия: i) аллил хлоротормат, 10% aqueous уксусной кислоты, 1,4-диоксан, комнатная температура, ночь; ii) этиленгликоль, толуол-р-сульфоническая кислота, толуол, рефлюкс, на ночь; iii) LiAlH4, anhydrous Et2O, 0 c для 4 ч, затем комнатная температура на 12 ч; (iv) тосилхлорид, THF, 0 КК; (v) NaN3, DMF, 60 кв.с. (vi) трифенилфосфин, THF, на ночь. (B) Мономер 1H-NMR спектра (500 МГц, CDCl3): (i) 4-(2-аминоэтил)-N-(алликарабилкси)фениламин (Npam); ii) 4-(1,3-диоксациклопент-2-ил)бензиламин (Npal); iii) 2-(2-этиксиэтокси)этиламин (Neee). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

figure-results-2
Рисунок 2: Синтез и дезащита олиго-специфического последовательности (пептоид). (A) Структуры H2N-Npam-Neee-Npal-Neee2-Npam-Nma до и после удаления группы Alloc с сопровождающим (B) массовым спектром ESI. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

figure-results-3
Рисунок 3: Очищение и характеристика закодированного информации пептоида. (A) HPLC хроматограмма очистки нити с помощью препаративного HPLC с линейным градиентом ацетонитрила (MeCN) и воды: (1) 30% MeCN, 0.1-2.1 мин; (2) 30-95% MeCN, 2.1-16.1 мин; (3) 95% MeCN, 16.1-23.1 мин; (4) 95% MeCN, 23.1-26.1 мин. Пики i и ii соответствуют низкомолекулярным побочным продуктам реакции молекулярной массы, главным образом DIC-urea, и олигомерным видам, включая желаемый продукт, соответственно. (B) Аналитическая хроматограмма HPLC и (C) ESI массовый спектр H2N-N-Npam-Neee-Npal-Neee2-Npam-Nma после лиофилизации. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

figure-results-4
Рисунок 4: Самосборка H2N-N-Npam-Neee-Npal-Neee2-Npam-Nma и его дополняют последовательность, H2N-N-Npal-Neee-Nam-Neee2-Npal. (A) Структуры двух последовательностей и результирующая сборка, управляемая последовательностью. (B) MALDI массовый спектр молекулярной лестницы после аннулирования при комнатной температуре на ночь. Массы: ожидаемый «МЗНа» 3306,7, найдено 3306.0; ожидаемый «М-1 имин»Na» 3324.7, найденный 3323.9; ожидаемый «M-2 имин»Na » 3342.7, найденный 3342.8; ожидаемый «M-2 imine »CH3OH'H» 3352.8, найдено 3352.0. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Обсуждение

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Техника здесь описывает динамическую ковалентную сборку информационно-несущих пептоидных олигомеров, где информация закодирована в последовательности их подсений групп. Использование Alloc-защищенных амина мономер в сочетании с этиленом ацетал-защищенных альдегида мономер позволяет ортогональное дезащита, что позволяет Alloc дезащиты на бисериной и ацетальной дезащиты на месте во время самосборки реакции, тем самым обеспечивая синтезированные последовательности преждевременно реагировать до олигомерной очистки и характеризации. Важно отметить, что синтез твердой фазы осуществляется с использованием фотолабильной сечения, чтобы олигомеррасщевание из бисера под УФ или фиолетовый облучение света, исключая преждевременное депротекции кислотно-лабилизованной, этилен ацетал основе защиты группы. Можно было бы рассмотреть несколько альтернативных схем дезащиты. Например, мы первоначально использовали группы защиты двойной кислоты-лабиля (Бок-амин и этилен ацеталь-альдегид) с намерением дезащиты на месте сильной кислотой, за которой следовала нейтрализация, чтобы позволить самосборке продолжить реакцию; однако этот подход привел к непосредственному порождению осадка после добавления базы. Кроме того, защита амина с фотолабильной защитной группой, 2-(2-нитрофенил)пропокскарбонил (NPPOC), была предусмотрена как альдегид может быть избирательно дезащищенных при лечении трифтороацетической кислоты (TFA) до очистки. К сожалению, на месте фотолиза группы защиты с ультрафиолетовым светом не позволяла количественной дезащиты, даже при наличии фотосенсибилизаторов и после длительных периодов облучения25. Trimethylsilylethoxycarbonyl (т.е. Теок) может быть использован в качестве группы защиты амина и подлежит расщеплению при лечении редкоземельными металлическими трифлятами; однако, количественная дезащита Теок требует гораздо более высоких редкоземельных металлических погрузок трифле, чем та, которая необходима для дезащиты этилена ацетала. Для этого протокола могут использоваться теок-амины, но концентрация кислоты Льюиса должна быть соответствующим образом скорректирована, поскольку субколичественная дезащита амина может оказаться проблематичной для более крупных самособранных структур. Алифатические функциональные группы были кратко рассмотрены, но дезащита алифатических альдегидов требует суровых условий, которые усечение пептоидных последовательностей32,33.

Включение Neee и Nma в качестве инертных остатков прокладки служить для улучшения олигомерной растворимости и позволяют легкой масс-пометки прекурсоров олигомеров, чтобы позволить себе готовые идентификации генерируемых видов масс-спектроскопии. Кроме того, с учетом "Книгэнд" конформации пептоидов, где соседние сегменты позвоночника принять противоположные вращательные состояния, чтобы сформировать линейный, твист-свободный олигомер34,35, последовательности, включающие чередующихся динамических ковалентных и инертных остатков пространства облегчает структуру, в которой реактивные группы подвески ориентированы в том же направлении. Учитывая универсальность метода субмономера, большая и разнообразная библиотека первичных аминов может быть использована для дальнейшего изменения пептоидных олигомеров, но может потребовать корректировки протокола для поддержания высокой эффективности соединения.

В то время как олиго (пептоиды) можно синтезировать вручную в стеклянном сосуде реакции19,автоматизация процесса уменьшает время для каждого добавления остатков от нескольких часов до получаса. Кроме того, автоматизация уменьшает количество отходов мономера и растворителя, особенно желательно при использовании первичных мономеров амина, которые не доступны на коммерческой уровне. Хотя расщепление Alloc от защищенных остатков амина является эффективной реакцией, окисление палладия может привести к неполной дезащите. Следовательно, предлагается проверить расщеплять часть смолы и охарактеризовать степень дезащиты с ESI-MS. Для испытательных расщеплений 30 мин под 405 нм облучения высвобождает достаточно пептоид для масс-спектрометрии. Частичная дезащита может быть ограничена с использованием анаэробных условий или повторением реакции дезащиты.

В то время как эта статья посвящена Sc(OTf)3 как многоцелевому реагенту, другие редкоземельные металлические трифляты, такие как трифляты ytterbium, были показаны для успешного посредничества в информационной сборке молекулярных лестниц. Примечательно, что Sc(OTf)3 является самым кислым Льюисом из редкоземельных металлических трифлятов; таким образом, из-за снижения каталитической способности, предоставляемой другими редкоземельными металлическими трифлятами24,36, большие эквиваленты могут потребоваться для осуществления полной этиленовой ацеталной дезащиты и диссоциации нитей. Требуемое количество эквивалентов можно определить с помощью масс-спектрометрии MALDI путем наблюдения точки, в которой нити полностью разъединяются. Диссоциация имеет решающее значение в процессе самосборки и аналогична таянию нитей нуклеиновой кислоты при поднятой температуре. Последующая извлечение катализатора позволяет формировать и срыва динамических ковалентных пар, стимулирующих сборку дуплексов, специфичных последовательности. Это постепенное аннулирование олигомерных нитей обходит кинетическое улавливание (которое, для молекулярных лестниц, может дать вне реестра видов или неправильно парных последовательностей) опытных другими методами.

Хлороформ является отличным растворителем, как фазовое разделение в хлороформ / ацетонитрил / вода тернари система, используемая здесь способствует частичной добычи Льюис кислоты, не приводя к осадкам самосборных структур37. Кроме того, хлороформ является одним из немногих растворителей, который способствует образованию имина при сохранении молекулярной растворимости лестницы. Из-за динамичного характера системы часто можно наблюдать следы вне реестра и неправильно парных дуплексов. Хотя эта система в значительной степени не зависит от небольших изменений в редкоземельных металлических концентрациях трифле при добыче, иногда недостаточная добыча катализаторов генерирует значительную часть неполной гибридизации и неспецифических олигомерных соединений. В этом случае, как правило, предпочтительнее сначала повторно разъединить с еще 1,5 эквивалентами катализатора, а затем извлечь второй раз, а не повторно извлечь немедленно, так как полная диссоциация отдельных нитей имеет жизненно важное значение для процесса. Для одновременной сборки нескольких уникальных закодированных информацией молекулярных лестниц может потребоваться увеличить концентрацию раствора редкоземельных металлических трифлопов, используемого для поддержания эквивалентов и общего объема реакции.

Хотя эти самосборки в первую очередь характеризуется масс-спектрометрии, другие методы, включая флуоресценцию резонансной передачи энергии (FRET) возможны. Ограничения включают в себя количество необходимых материалов, доступность мономеров и соотношение сигнала к шуму. Методы, требующие растворителей, таких как 1H NMR, могут дополнительно страдать от неразрешительности самособранных конструкций. Кроме того, редкоземельные концентрации металлоконструкций после экстракции могут определяться такими методами, как ICP-MS или 19F NMR с внутренним стандартом.

По мере продвижения к совершенствованию контроля над макро- и надмолекулярными наноструктурами и материалами возникает задача разработки и изготовления регулярных, но модифицируемых сборок. Протокол, описанный в настоящем докладе, обеспечивает путь к достижению таких наноструктур с помощью последовательно-селективных сборок с помощью динамических ковалентных взаимодействий.

Раскрытие информации

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Авторам нечего раскрывать.

Благодарности

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Эта работа была поддержана Министерством энергетики США, Управлением по науке, фундаментальным энергетическим наукам, в соответствии с премией #DESC0012479. S.C.L. признает поддержку Программы стипендий Национального научного фонда для аспирантов, а A.F.A. – поддержку Национальной нефтяной компании Абу-Даби (ADNOC).

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
1,4-диоксанFisher ScientificD1114Сертифицированное ACS
2-(4-гидроксифенилазо)бензойная кислота (HABA)Millipore-Sigma54793Матричное вещество для MALDI-MS; ≥ 99,5%
4-(2-аминоэтил)анилинOntario ChemicalsA207698%
4-цианобензальдегидOakwood Chemical04931799%
4-метилпиперидинTCI AmericaP0445≥ 98,0%
4-толуолсульфонилхлоридOakwood ChemicalBR170399%
50 мл Высокопроизводительные центрифужные пробиркиVWR International21008-240Центрифужные пробирки, используемые для автоматизированного синтезатора
Уксусная кислотаFisher ScientificA38-212
Ледяной уксусный ангидридFisher ScientificA10Сертифицированный ACS
ацетонитрилмиллипор-сигма34851для ВЭЖХ; Градиентный уклон; ≥ 99,9%
Полностью пластиковые шприцы Norm-JectThermo Fisher ScientificS7510-10Luer-Slip Шприц
АллилхлорформиатAcros Organics22174100097%
Бромоуксусная кислотаАльфа Аэсар A14403≥ 98,0%
ХлороформMillipore-Sigma288306безводный; 99%; Содержит 0,5-1,0% этанола в качестве стабилизатора
Chloroform-dAcros OrganicsAC320690075для ЯМР; 99,8 атома % D; Расфасован в ампулы по 0,75 мл
ДихлордиметилсиланAcros Organics1133100≥ 99,0%
дихлорэтанFisher ScientificE175Сертифицированный ACS
дихлорметанFisher ScientificD37-4Стабилизированный; Сертифицированный ACS
диэтиловый эфирAcros Organics615080010безводный; Реактив ACS
Диэтиленгликоль моноэтиловый эфирTCI AmericaE0048≥ 99,0%
этанолDecon Labs2701200 Proof; Безводный
этиленгликольFisher ScientificE178Сертифицированный
Fmoc-Фотолабильная смола SSCreoSalusSA50785100-200 меш; 1%
стеклянный пептидный сосудChemglassCG-1866-02твердофазный, Т-образный PTFE Stpk, вакуум, средняя фритта, GL 25 резьба
LC-6AD ВЭЖХ насосыShimadzu Corporation
Оборудование светодиод 405 нмThorLabsM405L2-C1405 нм светодиод для фоторасщепления пептоидов
Драйверсветодиода ThorLabsLEDD1BДрайвер для светодиодного света используется при фоторасщеплении пептоидов
Liberty Blue Автоматизированный синтезатор пептидовCEM CorporationОборудование
Гидрид лития и алюминияMillipore-Sigma199877Порошок; Марка реагента; 95%; ВНИМАНИЕ: Умеренно пирофорный, обрабатывать под инертным газом и защищать от влаги
Аналитическая колонна RP-HPLC Luna C18Phenomenex00G-4252-E0Оборудование
Luna C18 подготовительная колонка RP-HPLCPhenomenex00G-4253-P0-AXОборудование
МетанолFisher ScientificA412Сертифицированный ACS
микролитровый шприцHamilton Company80700Цементированная игла (N)
N,N'-диизопропилкарбодиимид (DIC)Oakwood ChemicalM02889≥ 99.0%; ВНИМАНИЕ: ДВС-синдром опасен для глаз, кожи при вдыхании дыхательных путей и может вызвать сенсибилизацию кожи
N,N-диметилформамидомMillipore-Sigma319937реагентом ACS; 99,8%
Азотная кислотаFisher ScientificA200-212Сертифицированный ACS плюс
газообразный азотКриогенные газыСодержание под давлением, может взорваться при нагревании
ФенилсиланOakwood ChemicalS1360097%
Prominence SPD-10A УФ/виз детекторShimadzu CorporationОборудование
p-Толуолсульфоновая кислота моногидратРеагент Millipore-Sigma402885ACS; 98,5%
Трифлат скандия(III)Дубовая древесина Химическая00934399%
Игла одноразового использованияExel International2642018G x 1 1/2″
Азид натрияOakwood Chemical09444899%; ВНИМАНИЕ: NaN<суб>3 может вступать в реакцию со свинцом и медью, что приводит к образованию взрывоопасных азидов металлов. Он остро токсичен и смертелен при проглатывании или контакте с кожей.
бикарбонат натрияFisher ScientificS233порошок; Сертифицированный
ACS гидроксид натрияFisher ScientificS318-100пеллеты; Сертифицированный ACS
сульфат натрияFisher ScientificS421-500безводный; Зернистый; Сертифицированный
шприцевой фильтр ACS 0,45 & микро; mVWR International28145-497ПТФЭ, Шприцевые фильтры с полипропиленовым корпусом
ТетрагидрофуранFisher ScientificT397Сертифицированный
Тетракис(трифенилфосфин) палладий(0)Дубовая древесина Химическая03427998%
толуолFisher ScientificT324Сертифицированный ACS
ТрифенилфосфинДубовая древесина Химическая03781899%
DVB

Ссылки

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Seeman, N. C. Nucleic acid junctions and lattices. Journal of Theoretical Biology. 99 (2), 237-247 (1982).
  2. Rothemund, P. W. K. Folding DNA to create nanoscale shapes and patterns. Nature. 440, March 297-302 (2006).
  3. Watt, A. A. R., Bothma, J. P., Meredith, P. The supramolecular structure of melanin. Soft Matter. 5 (19), 3754-3760 (2009).
  4. Tørring, T., Voigt, N. V., Nangreave, J., Yan, H., Gothelf, K. V. DNA origami: A quantum leap for self-assembly of complex structures. Chemical Society Reviews. 40 (12), 5636-5646 (2011).
  5. Wei, B., Dai, M., Yin, P. Complex shapes self-assembled from single-stranded DNA tiles. Nature. 485 (7400), 623-626 (2012).
  6. Clausen-Schaumann, H., Rief, M., Tolksdorf, C., Gaub, H. E. Mechanical stability of single DNA molecules. Biophysical Journal. 78 (4), 1997-2007 (2000).
  7. Rowan, S. J., Cantrill, S. J., Cousins, G. R. L., Sanders, J. K. M., Stoddart, J. F. Dynamic covalent chemistry. Angewandte Chemie - International Edition. 41 (6), (2002).
  8. Jin, Y., Yu, C., Denman, R. J., Zhang, W. Recent advances in dynamic covalent chemistry. Chemical Society Reviews. 42 (16), 6634-6654 (2013).
  9. Furgal, J. C., Dunn, M., Wei, T., Scott, T. F. Emerging Applications of Dynamic Covalent Chemistry from Macro- to Nanoscopic Length Scales. Dynamic Covalent Chemistry: Principles, Reactions, and Applications. , 389-434 (2017).
  10. Hartley, C. S., Elliott, E. L., Moore, J. S. Covalent assembly of molecular ladders. Journal of the American Chemical Society. 129 (15), 4512-4513 (2007).
  11. Wei, T., Furgal, J. C., Jung, J. H., Scott, T. F. Long, self-assembled molecular ladders by cooperative dynamic covalent reactions. Polymer Chemistry. 8 (3), 520-527 (2017).
  12. Dunn, M. F., Wei, T., Scott, T. F., Zuckermann, R. N. Aqueous dynamic covalent assembly of molecular ladders and grids bearing boronate ester rungs. Polymer Chemistry. (18), 2337-2343 (2019).
  13. Furgal, J. C., Van Dijck, J. M., Leguizamon, S. C., Scott, T. F. Accessing sequence specific hybrid peptoid oligomers with varied pendant group spacing. European Polymer Journal. (118), 306-311 (2019).
  14. Tozawa, T., et al. Porous organic cages. Nature Materials. 8 (12), 973-978 (2009).
  15. Tian, J., Thallapally, P. K., Dalgarno, S. J., McGrail, P. B., Atwood, J. L. Amorphous molecular organic solids for gas adsorption. Angewandte Chemie - International Edition. 48 (30), 5492-5495 (2009).
  16. Jin, Y., Wang, Q., Taynton, P., Zhang, W. Dynamic covalent chemistry approaches toward macrocycles, molecular cages, and polymers. Accounts of Chemical Research. 47 (5), 1575-1586 (2014).
  17. Ren, F., Day, K. J., Hartley, C. S. Two- and three-tiered stacked architectures by covalent assembly. Angew. Chem. Int. Ed. 55 (30), 8620-8623 (2016).
  18. Elliott, E. L., Hartley, C. S., Moore, J. S. Covalent ladder formation becomes kinetically trapped beyond four rungs. Chemical Communications. 47 (17), 5028-5030 (2011).
  19. Tran, H., Gael, S. L., Connolly, M. D., Zuckermann, R. N. Solid-phase submonomer synthesis of peptoid polymers and their self-assembly into highly-ordered nanosheets. Journal of Visualized Experiments. (57), 1-6 (2011).
  20. Zuckermann, R. N. Peptoid origins. Biopolymers. 96 (5), 545-555 (2011).
  21. Sun, J., Zuckermann, R. N. Peptoid polymers: A highly designable bioinspired material. ACS Nano. 7 (6), 4715-4732 (2013).
  22. Belowich, M. E., Stoddart, J. F. Dynamic imine chemistry. Chemical Society Reviews. 41 (6), 2003-2024 (2012).
  23. Giuseppone, N., Schmitt, J. L., Schwartz, E., Lehn, J. M. Scandium(III) catalysis of transimination reactions. Independent and constitutionally coupled reversible processes. Journal of the American Chemical Society. 127 (15), 5528-5539 (2005).
  24. Shū, K. Scandium triflate in organic synthesis. European Journal of Organic Chemistry. 1999 (1), 15-27 (1999).
  25. Wei, T., Furgal, J. C., Scott, T. F. In situ deprotection and dynamic covalent assembly using a dual role catalyst. Chemical Communications. 53 (27), 3874-3877 (2017).
  26. Matsumoto, M., et al. Rapid, low temperature formation of imine-linked covalent organic frameworks catalyzed by metal triflates. Journal of the American Chemical Society. 139 (14), 4999-5002 (2017).
  27. Ma, X., Scott, T. F. Approaches and challenges in the synthesis of three-dimensional covalent-organic frameworks. Communications Chemistry. , (2018).
  28. Perron, V., Abbott, S., Moreau, N., Lee, D., Penney, C., Zacharie, B. A method for the selective protection of aromatic amines in the presence of aliphatic amines. Synthesis. 2 (2), 283-289 (2009).
  29. Wei, T., Jung, J. H., Scott, T. F. Dynamic covalent assembly of peptoid-based ladder oligomers by vernier templating. Journal of the American Chemical Society. 137 (51), 16196-16202 (2015).
  30. Ouari, O., Chalier, F., Bonaly, R., Pucci, B., Tordo, P. Synthesis and spin-trapping behaviour of glycosylated nitrones. Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions. 2 (10), 2299-2308 (1998).
  31. Sun, J., Stone, G. M., Balsara, N. P., Zuckermann, R. N. Structure-conductivity relationship for peptoid-based PEO-mimetic polymer electrolytes. Macromolecules. 45 (12), 5151-5156 (2012).
  32. Sartori, G., Ballini, R., Bigi, F., Bosica, G., Maggi, R., Righi, P. Protection (and deprotection) of functional groups in organic synthesis by heterogeneous catalysis. Chemical Reviews. 104 (1), 199-250 (2004).
  33. Kim, S., et al. Unusual truncation of N-acylated peptoids under acidic conditions. Organic & biomolecular chemistry. 12 (28), 5222-5226 (2014).
  34. Mannige, R. V., et al. Peptoid nanosheets exhibit a new secondary-structure motif. Nature. 526 (7573), 415-420 (2015).
  35. Edison, J. R., et al. Conformations of peptoids in nanosheets result from the interplay of backbone energetics and intermolecular interactions. Proceedings of the National Academy of Sciences. 115 (22), 5647-5651 (2018).
  36. Kobayashi, S., Sugiura, M., Kitagawa, H., Lam, W. W. L. Rare-earth metal triflates in organic synthesis. Chemical Reviews. 102 (6), 2227-2302 (2002).
  37. Fujinaga, S., Hashimito, M., Tsukagoshi, K. Investigation of the composition for a ternary solvent system in tube radial distribution chromatography. Journal of Liquid Chromatography and Related Technologies. 38 (5), 600-606 (2015).

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE

Запросить разрешение

Теги

MALDI MS

Похожие статьи