RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Adrianna Kolberg1, Christiane Wenzel1, Thorsten Hugel1,3, Markus Gallei2, Bizan N. Balzer1,3
1Institute of Physical Chemistry,Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, 2Chair in Polymer Chemistry,Saarland University, 3Cluster of Excellence livMatS at FIT - Freiburg Center for Interactive Materials and Bioinspired Technologies,University of Freiburg
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ковалентное присоединение молекул зонда к атомной силовой микроскопии (AFM) наконечники кантилевера является важным методом для исследования их физических свойств. Это позволяет нам определить силу растяжения, силу опреснения и длину полимеров с помощью спектроскопии одной молекулы на основе AFM с высокой воспроизводимостью.
Атомная силовая микроскопия (AFM) на основе одномолекулярной силовой спектроскопии является идеальным инструментом для исследования взаимодействия между одним полимером и поверхностями. Для истинного эксперимента с одной молекулой, ковалентное вложение молекулы зонда имеет важное значение, потому что только тогда могут быть получены сотни следов силового расширения с одной и той же одной молекулой. Многие следы, в свою очередь, необходимо доказать, что одна молекула только зондируется. Кроме того, passivation имеет решающее значение для предотвращения нежелательных взаимодействий между одной молекулы зонда и AFM cantilever отзыв, а также между AFM кантилевер наконечник и основной поверхности. Представленный здесь протокол функционализации надежен и может быть легко применен к различным полимерам. Характерные события одной молекулы (т.е. растяжки и плато) обнаруживаются в следах форс-расширения. Из этих событий могут быть получены физические параметры, такие как сила растяжения, сила desorption и длина desorption. Это особенно важно для точного исследования стимулов-ответных систем на уровне одной молекулы. В качестве образцовых систем поли (этиленгликоль) (PEG), поли (N -изопропилокриламимид) (PNiPAM) и полистирола (PS) растягиваются и desorbed от SiOx (для PEG и PNiPAM) и из гидрофобных самособранных монослойных поверхностей (для PS) в адгектной среде.N
С момента своего изобретения в 1980-хгодах 1, атомной силы микроскопа (AFM) стал одним из наиболее важных методов визуализации в естественных науках с участием суб-нанометров пространственного разрешения, под-piconewton силовое разрешение и возможность измерения в различных условиях растворителя и температуры2,3,4,5,6,7.
Помимо изображения8,,9, AFM используется для выполнения одноймолекулярнойсиловой спектроскопии (SMFS), дающей представление о клеевом взаимодействии между одним полимером и поверхностями, физических свойствах одного полимера и разворачивающихся механизмов белков7,,10,,11,12,13,,14,,15,16. В регулярном эксперименте SMFS, функционализированный кончик кантилевера вводятся в контакт с поверхностью так, что полимер на AFM cantilever наконечник физиорбирует на этой поверхности. Путем втягивать кончик cantilever AFM от поверхности, изменение в отклонении cantilever AFM преобразовано в усилие водя к кривой усилия-расширения4. Физические параметры, такие как растяжения силы, силы desorption и длина desorption может быть определена как зависит от различных параметров, таких как скорость вытягивания, время пребывания на поверхности, глубина отступа в поверхность, температура, растворитель17,18 и различные поверхности, как твердые субстраты, полимерные пленки или поддерживается липидных двухслойных19,20,21,22. Кроме того, полимер может быть исследован в различных пространственных направлениях, таким образом, исследуя фрикционные свойства полимера23,,24,,25,26.
Ковалентное крепление исследуемого полимера к наконечнику кантилевера AFM имеет важное значение для таких исследований. Таким образом, высокая доходность событий одной молекулы с одним и тем же полимером, привязанным к наконечнику AFM cantilever, предотвращает любые предубеждения результатов из-за калибровки весенней константы AFM cantilever27,28, различных точек крепления29 или различных полимеров (с различной длиной контура), таких как в случае экспериментов по наноловищему30,31,32. Кроме того, взаимодействие с другими полимерами, а также усреднения эффекты могут быть широко предотвращены18,28. Для ковалентного крепления полимера к наконечнику aFM cantilever могут быть применены различные типы химических модификаций, многие из которых обобщены в книге Хермансона33. Амин и тиол основе ссылок реакций, а также нажмите химии представляют собой наиболее часто используемые методы в AFM cantilever отзыв функционализации34,35,36,37,38,39,40,41,42. Becke et al.40 показывают, как использовать 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид (EDC)/NHS химии прикрепить белок к aFM кантилевер наконечник. Тем не менее, указанные функциональные группы, как правило, перекрестные ссылки, что приводит к потере функциональности43,44. Также карбодиимиды демонстрируют склонность к быстрому гидролизу в растворе43. Группы малимид и тиол, как правило, более стабильны и не проявляют перекрестных реакций. Представленный протокол представляет собой оптимизацию ранее опубликованных протоколов, приведенных в ссылках35,,39.
Здесь представлен надежный протокол функционализации, который может быть легко приспособлен к большому количеству различных полимеров, независимо от таких свойств, как длина контура или гидрофобность. На примере были выбраны три различных полимера: гидрофильный полиэтиленгликоль (PEG) и поли(N-изопропилакриламид) (PNiPAM), а также высокой молярной массы гидрофобного полистирола (ПС). Для того, чтобы обеспечить ковалентную связывающую способность с соответствующей молекулой связующего, три полимера были выбраны для показа телехелика тиол муати в качестве функциональной конечной группы. Сама молекула связующим звеном, как правило, является коротким полимером ПЭГ с двумя активными участками, группой силана на одном конце и группой маеймида на другом конце. Первый позволяет ковалентное вложение к наконечнику кантилевера AFM, а второе является связывающей реакцией с группой тиола функционализированного полимера высокой молярной массы. Кроме того, неактивные молекулы связующих PEG служат в качестве пассивации слоя для предотвращения нежелательных взаимодействий между зондом полимера и AFM кантилевер отзыв, а также между AFM кантилевер отзыв и основной поверхности.
ПРИМЕЧАНИЕ: См. Рисунок 1 для схематического обзора.
1. Установка реагента
ПРИМЕЧАНИЕ: Полимеры, используемые для этого протокола являются: маеймид-полиэтилен гликоль-триэтоксизилан (силан-PEG-mal, 5 кДа), тиол-полиэтилен гликол-тиол (HS-PEG-SH, 35 kDa), тиол прекращается поли(N-изопропилакриламид) (PNiPAM-SH, 637 kDa) и тиол прекращается полистирол (PS-SH, 1,3 мДа).
2. Установка оборудования
ПРИМЕЧАНИЕ: Используйте пинцет и стаканы из нержавеющей стали или стекла. Используйте перевернутый пинцет для безопасного сцепления (например, модель R3 SA, имеющая низкую весеннюю константу).
3. Функционализация наконечника
ПРИМЕЧАНИЕ: Все шаги должны быть выполнены в дымовой капот, чтобы избежать вдыхания органических паров. Кроме того, перчатки, лабораторное пальто и защита глаз не требуется. Используйте нитрила или латексные перчатки для каждого шага, чтобы избежать загрязнения. Носите растворитель устойчивых перчаток при использовании толуол. Все шаги, если не указано иное, выполняются на RT. Используйте свежее оборудование и перчатки для каждого шага, чтобы избежать возможного перекрестного загрязнения.
4. Подготовка поверхности
5. Приобретение данных
ПРИМЕЧАНИЕ: Все измерения, показанные здесь, были выполнены в ультрачистой воде с помощью Cypher ES AFM с использованием стадии нагрева и охлаждения образца для изменения температуры. Как правило, все AFMs, обеспечивающие возможность измерения в жидкостях, могут быть использованы.
6. Оценка данных
ПРИМЕЧАНИЕ: Для оценки данных для выполнения следующих шагов использовалось специально написанное программное обеспечение на основе Igor Pro.
Следующие примеры показывают результаты растяжения и растяжения одной молекулы полимеров PEG, PNiPAM и PS. Все советы AFM cantilever были функционализированы с протоколом, приведенным выше. PEG и PNiPAM были измерены на SiOx с изменением температуры. Для детального обсуждения в результате температуры зависимых вытяжек кривых для PEG и PNiPAM, см Kolberg et al.18 Другой мотив силового расширения плато плато постоянной силы (например, при desorbing PS от самособранных монослойных метиловых тиол на золоте (SAM) в воде4,27,39,51).
Пример 1: Растяжка ПЭГ и ПНИПАМ в воде
Температурно-зависимое поведение растяжения в воде было измерено с помощью одного PNiPAM и PEG полимеров ковалентно связаны с AFM кантилевер наконечник на одном конце и physisorbed на поверхности SiOх на другом конце. После калибровки и экспериментов по очистке контроля (менее 2% кривых силового расширения показывают события одной молекулы), по крайней мере две силовые карты были записаны для каждого кантилевера AFM. Эксперимент, зависящий от температуры, был проведен путем записи по крайней мере одной силовой карты при каждой температуре. Когда появилось всего несколько событий растяжения, соответствующий кантилевер AFM был отброшен и следующий кантилевер AFM чипа был взят (обычно в порядке C, B, D и E MLCT-Bio-DC). По примеру, данные PEG, одно событие растяжения наблюдалось в 95 из 500 измеренных кривых форс-расширения (19%). Для PNiPAM, 252 из 600 кривых силового расширения показали растяжения картины (42%). Для лучшего сравнения кривых силового расширения была создана одна кривая для каждой температуры. Для этой цели были выбраны только те кривые с растяжением события по крайней мере до 500 pN, где конформационные колебания и эффекты растворителя незначительны, были выбраны52. Окончательное количество участков, принятых во внимание было 3 на 278 K, 7 на 298 K и 4 на 318 K для ПЭГ и 4 на 278 K, 3 на 298 K и 3 на 318 K для PNiPAM18.
Процедура генерации мастер-кривых приведена на рисунке 3. Выбранные кривые силового расширения(рисунок 3A)перемасштабируются в длину L0 (расширение силой 500 pN), см. Рисунок 3B. Пик стыковки показывает большое изменение неспецифической стычки между поверхностью и наконечником aFM cantilever, но не влияет на поведение растяжения полимера. После слияния перемасштабированных кривых силового расширения они усреднились путем биномнального сглаживания, представленного на рисунке 3C. Для этого гауссийский фильтр совмещеет данные с нормализованными коэффициентами, полученными из треугольника Паскаля на уровне, равном параметру сглаживания 2053. Наконец, мастер кривая получается для каждой температуры, как удается на рисунке 3D. Масштабирование показывает диапазон, в котором влияние температуры на поведение силового расширения наиболее выражено.
Сравнение температурного поведения PEG(A)и PNiPAM (B) можно найти на рисунке 4. Для ПЭГ наблюдалось снижение силы растяжения с повышением температуры. При повышении температуры с 278 до 318 К наблюдалось увеличение примерно на 5% перемасштабирования на 100 pN. Для PNiPAM может быть выявлен противоположный температурно-зависимый сдвиг. Снижение примерно на 1% перемасштабированного расширения на 100 pN наблюдалось, когда температура была увеличена с 278 до 328 K. Кроме того, растяжение свободной энергии может быть получено из силовых выдвижения мастер кривых путем определения области под кривой для любого данного значения силы. Это может быть использовано для извлечения энергичных и энтропических вкладов растяжения свободной энергии с помощью молекулярной динамики (MD) моделирования18.
Пример 2: Отчаяние PS с поверхности SAM в воде
Обезборки PS с поверхности SAM в воде может быть использован для определения силы и длины десонции и тем самым количественно гидрофобного взаимодействия. После калибровки, по крайней мере две карты силы были записаны в двух различных точках поверхности. Когда полимерное крепление было успешным, кривые силового расширения показали плато постоянной силы, как характерная особенность, см. Рисунок 5А и Рисунок 5C. Плато-как desorption наблюдается, когда динамика зондированных облигаций гораздо быстрее, чем потянув скорость AFM кантилевер наконечник (квази-равновесие). Силы desorption плато-как кривые форсирования сразу обеспечивают adhesion свободные энергии путем интегрировать след силы-расширения54. Они были использованы для определения электростатических, дисперсивных и гидрофобных взаимодействий, а также фрикционных свойств одиночных полимеров на поверхностях в жидкой среде22,4,,23,,51,,54,,55.
Каждое плато постоянной силы было оснащено сигмоидальной кривой для определения силы desorption и длины desorption, которые затем были построены в гистограммах. Гистограммы были оснащены гауссианским, чтобы извлечь максимальное значение и стандартное отклонение. Для лучшего обзора, сила desorption и значения длины были показаны вместе в рассеянии сюжет, как указано на рисунке 5B и рисунок 5D.
Для полистирола на SAM в воде, определенные силы десурбации соответствуют ранее полученным значениям19,23. Поскольку длина desorption коррелирует с длиной контура полимера51,распределение длины desorption может быть использовано в качестве доказательства ковалентного связывания соответствующего полимера с наконечником aFM cantilever через его функциональную конечную группу. Таким образом, длина desorption служит отпечатком пальца.
Для более чем одного полимера, прикрепленного к наконечнику aFM cantilever, каскады плато (дискретные шаги) можно наблюдать в кривых форс-расширения56. Каждое плато представляет собой опреснение полимера при другом расширении. Эксперимент, приведенный на рисунке 5C и рисунке 5D, показал типичный случай двух полимеров, прикрепленных к наконечнику кантилевера AFM в то же время. При установке окончательного разрыва можно найти бимодальное распределение по длине desorption, в то время как сила desorption показала узкое распределение. В этом случае, меньшая длина desorption может быть найдена в 90% кривых силового расширения, либо в качестве одного плато или в качестве дополнительного плато на более длинном плато, как удается на рисунке 5C. Более высокая длина desorption была найдена в 37% полученных кривых форс-расширения. Таким образом, распределение длины desorption может быть использовано для определения количества различных полимеров, прикрепленных к наконечнику aFM cantilever. В целом, узкое распределение значений длины desorption является хорошим показателем того, что один и тот же один полимер был исследован в полученных кривых форс-расширения. В то же время, суперпозиция соответствующего силы-расширения может быть использована для принятия решения о том, был ли измерен один и тот же один полимер.
После доказательства ковалентной связывания одного полимера PS, дальнейшие эксперименты с этим полимером PS могут быть выполнены из-за различных субстратов (твердая поверхность, а также полимерные пленки), условия растворителя, температура, скорость вытягивания или время пребывания.

Рисунок 1: Схематический обзор процесса функционализации наконечников. Включает в себя химическую модификацию наконечника aFM cantilever после (1)активации плазмы (2)силанизации / PEGylation и (3)полимерного крепления. Кроме того, показаны подробные химические структуры используемых полимеров, а именно PEG, PNiPAM и PS. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 2: Устранение помех в кривых силового расширения. (A) Найти силу расширения кривой показаны синусоидальной силы сигнала артефакт вдоль расширения, но не имея одной молекулы растяжения события. (B) Выберите кривую форс-расширения с одной молекулы событие, которое должно быть исправлено из синусоидального артефакта. (C) Наложить кривые для контроля, если синусоидальные артефакты кривых действительно совпадают. (D) Вычитая кривой форс-расширения (A) от (B) кривая форс-расширения с прямой базовой линией получена. Хотя пик адгезии не может быть использован для дальнейшего анализа, кривая форс-расширения теперь корректируется для артефакта, ведущего к гораздо более точным значениям силы в области события одной молекулы (здесь: 0,2 мкм расширения). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 3: Определение мастер-кривых из кривых расширения силы ПЭГ на уровне 298 K. (A)Экспериментальные данные на 298 K, используя 7 кривых силового расширения. После переквалификации в длину L0 силой 500 pN (B), кривые силового расширения могут быть объединены и усреднен биномального сглаживания получения мастер кривой(C). Перемасштабированные кривые приводятся в виде точек, в то время как мастер-кривая показана как сплошная линия. Наконец, полученные мастер кривые для различных температур можно сравнить (D). Масштабирование указывает диапазон, в котором влияние температуры на поведение силового расширения наиболее выражено. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 4: Сравнение температурно-зависимых мастер-кривых PNiPAM и PEG. Для ПЭГ увеличение перемасштабирования расширения на 100 pN (средней силы диапазона) наблюдается при повышении температуры (A), в то время как для PNiPAM противоположный температурно-зависимый сдвиг выявлено (B). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.

Рисунок 5: Анализ кривых силы расширения PS на SAM в воде. (A) Образцовая кривая форс-расширения (синий) с сигмоидальным припадком плато (фиолетовый). Кроме того, стрелки отмечают определенную силу (красную) и длину (зеленый) плато. Сила desorption и значения длины desorption полученные сигмоидальными припадками показаны в графике рассеяния и результирующей гистограммы приспособлены с Gaussian. (B) Определяется средняя сила desorption и desorption значения длины (112 и 6) pN и (659 х 7) нм, в котором 93% из силы расширения кривых показать такие отдельные события плато. (C) Образцовая кривая силы-расширения (синий) для двух полимеров, прикрепленных к наконечнику кантилевера AFM в то же время. Здесь сила desorption показывает unimodal распределение со средним значением силы (117 и 5) pN, в то время как бимодальное распределение можно найти для длины desorption, ведущей к средним значениям длины (656 и 9) нм и (1050 и 16) нм. (D) 90% пробных кривых силового расширения показывают только одно плато событий. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть большую версию этой цифры.
Авторы заявляют, что они не имеют конкурирующих финансовых интересов.
Ковалентное присоединение молекул зонда к атомной силовой микроскопии (AFM) наконечники кантилевера является важным методом для исследования их физических свойств. Это позволяет нам определить силу растяжения, силу опреснения и длину полимеров с помощью спектроскопии одной молекулы на основе AFM с высокой воспроизводимостью.
B.N.B. и T.H. признают финансирование Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, Немецкий исследовательский фонд) в рамках Стратегии передового опыта Германии - EXC-2193/1 - 390951807, gef'rdert durch умереть Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) им Rahmen дер Exzellenzstrategie де Бундес и дер Ленд - EXC-2193/1 - 390951807, и грант HU 997/1-13 (проект No 420798410). М.Г. признает частичную поддержку в рамках проекта LOEWE iNAPO со стороны Министерства высшего образования, исследований и искусств Гессена. Мы благодарим доктора Вольфганга Броннера и доктора Агне Зукаускайте из Института прикладной физики твердого тела IAF за пожертвование высококачественных кремниевых пластин с золотым покрытием.
| 1-Додекантиол (≥ 98%) | Sigma-Aldrich, США | 417364-500ML | Используется для раствора аммиака SAM |
| (30%) | Roth, Германия | CP17.2 | Используется для очистки |
| Cypher ES | Asylum Research, компания Oxford Instruments, США-AFM | ||
| Этанол (≥ 99.9%) | Roth, Германия | PO76.1 | Растворитель |
| Кремниевая пластина с золотым покрытием | Институт прикладной физики твердого тела Фраунгофера IAF, Германия-используется | для | |
| репликации компаунда высокого разрешения | SAMMicroset Products Ltd, Великобритания | 101RF | Связующее вещество |
| Раствор перекиси водорода | Sigma-Aldrich, США | H1009 | Используется для очистки |
| Igor Pro | Wavemetrics, США-Программная | среда | |
| Tetra-30-LF-PC | Diener Electronic, | Германия-Плазменная камера | |
| Малеимид-полиэтиленгликоль-триэтоксисилан | Creative PEG works, США | PHB-1923 | Линкерный полимер |
| MLCT-Bio-DC | Bruker, США | MLCT-Bio-DC | AFM кантилевер |
| Prime CZ-Si пластина, n-тип (Люминофор) TTV < 10 &; m | MicroChemicals, Германия | WSA40600250 P1314SNN1 | Кремниевая пластина |
| Purelab Chorus 1, 18.2 MΩ cm | Elga LabWater, Германия | 10034-540 | Источник сверхчистой воды |
| R3 SA | Vomm GmbH, Германия | 5803 Пустой | пинцет |
| Тиоловый конечный поли(N-изопропилакриламид) | Gallei Group, Саарландский университет, | Германия-Полимер | |
| зонда PNiPAMТиоловый полистирольный | полимер Source, Канада | P40722-SSH | PS зонд полимер |
| тиол-полиэтиленгликоль-тиол | Creative PEGВоркс, США | PSB-615 | ПЭГ зонд полимер |
| толуол (99,99%) | Fisher Chemicals | T324-500 | Растворитель |