ATAC требует успешного внедрения нескольких методов для успешной нейромодуляции конкретных нейронных цепей, включая точное нацеливание под контролем МРТ, FUS-BBBO и гистологическую оценку экспрессии генов. Компоненты, пригодные для 3D-печати, были разработаны для упрощения нацеливания на небольшие структуры мозга с помощью FUS-BBBO под визуальным контролем.
Проведение фокусированного ультразвука под контролем МРТ (МРТФУЗ) сопряжено с рядом проблем. Во-первых, типичная катушка МРТ имеет ограниченное пространство, которое предназначено только для размещения образца, а не ультразвукового оборудования. Большие отверстия МРТ увеличивают стоимость оборудования и снижают качество изображения, так как сигнал связан с коэффициентом заполнения катушки32. Следовательно, любое оборудование FUS, размещенное поверх изображения животного в МРТ, поставит под угрозу качество изображения. Во-вторых, разработка устройств, совместимых с МРТ, сложна и дорога. Материалы, совместимые с МРТ, должны быть диамагнитными, иметь низкую склонность к созданию вихревых токов при радиочастотном облучении и иметь низкую магнитную восприимчивость в сильных магнитных полях. В любом проводящем материале создание вихревых токов или его магнитная восприимчивость также отрицательно сказываются на качестве изображения. Наконец, доступные МРТ-совместимые материалы имеют более низкие модули Юнга и долговечность, чем металлы, обычно используемые в производстве аппаратов точного наведения, например, стереотаксических рамок. Двигатели, используемые для регулировки положения, должны быть совместимы с МРТ и располагаться за пределами отверстия МРТ из-за их размера. Эти двигатели должны быть подключены на расстоянии от датчика внутри отверстия МРТ с использованием материалов, совместимых с МРТ. Проблемы пластиковой деформации, отсутствие достаточного пространства внутри канала ствола для реализации компонентов прочного размера и недостаточное пространство для изменения положения прицеливания по всему мозгу повлияли на точность прицеливания в предыдущих работах.
Для решения этих проблем было принято решение о проведении визуализации в МРТ и введении FUS-BBBO вне сканера. Чтобы обеспечить МРТ-наведение, мышей поместили внутрь напечатанного на 3D-принтере фиксатора, который имел видимую для МРТ направляющую, которую можно было использовать для локализации структур мозга мыши как в МРТ, так и в пространстве координат стереотаксиса. Поскольку и череп мыши, и направляющая для наведения надежно прикреплены к держателям ушных планок (рис. 1, а, б), руководство по наведению может быть использовано для корреляции пространственных координат в изображении МРТ и обнуления стереотаксических инструментов. Фиксатор не имеет движущихся частей и не содержит датчика, что позволило сделать его прочным и достаточно маленьким для размещения внутри МРТ, а также устранило помехи сигнала от электроники датчика. Пространство внутри направляющей по наведению было выдолблено, так как на МРТ видна напечатанная на 3D-принтере опора для некоторых материалов (рис. 1c). Отверстия в сборке были введены для обеспечения калибровки стереотаксиса (рис. 3). Ультразвуковой преобразователь был прикреплен к электрододержателю стереотаксиса, и наведение осуществлялось, как описано в разделе 4 (рис. 1d). Преобразователь должен поддерживаться по всей длине корпусом ушных планок, предотвращая любое отклонение от плоскости уровня. Наведение в дорсо-вентральном направлении может быть достигнуто с помощью фазовых сдвигов в кольцевой решетке.
Практическая точность наведения определяется ультразвуковой фокусировкой и затуханием черепа. Процедура FUS-BBBO была подробно описана на крысах11 и была реализована на ряде других модельных организмов 23,33,34 и на людях 16,17. Зависимость между размером фокуса ультразвука обратно пропорциональна частоте, где более высокие частоты могут привести к более точной подаче. Однако затухание черепа увеличивается с частотами35, что может привести к нагреву черепа и повреждению кортикальных областей. Точная стратегия таргетинга будет зависеть от участка мозга. Участки, где в ткани мозга помещается половина максимального давления во всю ширину, позволяют предсказуемо и безопасно открывать ГЭБ во многих структурах мозга, таких как полосатое тело, средний мозг и гиппокамп. Области, расположенные вблизи основания мозга, представляют особую проблему у мышей. Мозг мыши имеет размеры примерно 8-10 мм в дорсо-вентральном направлении, что сопоставимо с половиной максимального размера многих коммерчески доступных датчиков. Следовательно, нацеливание на нижнюю часть черепа может привести к отражению ультразвука от костей и воздуха, присутствующего в ушных каналах, во рту или трахее, что может привести к непредсказуемым картинам высокого и низкого давления36. Некоторые из этих давлений могут пересекать порог инерционной кавитации, который, как было показано, вызывает кровотечение и повреждение тканей37. Для нацеливания на области, расположенные вблизи основания черепа, может быть предпочтительнее использовать интерсекциональный ATAC7, где интерсекционная генетика38 используется для ограничения экспрессии генов меньшей областью, чем та, на которую нацелен пучок FUS. В опубликованном примере интерсекционального ATAC трансгенное животное, экспрессирующее фермент редактирования генов (Cre38) в дофаминергических клетках, было направлено ультразвуком в подсекцию области, содержащей дофаминергические клетки. Наконец, ФУЗИ может воздействовать на кортикальные области, но дифракция и отражение ультразвука могут приводить к неравномерным профилям давления. Этот протокол не охватывает нацеливание на области коры головного мозга, так как он будет сильно зависеть от используемого вида; тем не менее, было обнаружено некоторое нацеливание на кору головного мозга над гиппокампом 7 (например, рис.7), что указывает на то, что, по крайней мере, у мышей, это возможно.
Выбор хемогенетического активатора и дозировка будут зависеть от конкретных потребностей эксперимента. В ряде исследований, в том числе в одном из исследований авторов7, не было выявлено значимого неспецифического ответа39,40, в то время как более высокие дозы (например, 10 мг/кг) могут вызывать побочные эффекты, по крайней мере, в некоторых случаях41. Однако, как и во всех поведенческих экспериментах, надлежащий контроль31 имеет важное значение из-за потенциальной нецелевой активности CNO и его метаболитов42. Такой контроль может включать введение CNO и физиологического раствора животным, экспрессирующим DREADD, и введение CNO животным дикого типа, или, в некоторых конкретных случаях, сравнение ипси- и контралатеральных участков мозга, которые, соответственно, экспрессируют и не экспрессируют хемогенетические рецепторы. Кроме того, недавние исследования выявили ряд новых агонистов DREADD с улучшенной специфичностью28,29,43. Другие хемогенетические рецепторы 5,25,44 также могут быть использованы в сочетании с процедурой ATAC.
Гистологическая оценка экспрессии генов необходима посмертно для каждого животного. Небольшая часть животных демонстрирует плохую экспрессию генов после FUS-BBBO7. Кроме того, необходимо показать пространственную точность и специфичность экспрессии генов, так как возможно неправильное нацеливание. Следует отметить, что некоторые ААВ могут демонстрировать ретроградную или антероградную способность к отслеживанию45 и могут вызывать трансфекцию вдали от участка, на который направлено ультразвуковое исследование, несмотря на точное ультразвуковое наведение. Если экспрессируемый хемогенетический рецептор сливается с флуорофором или совместно экспрессирует его, визуализации флуорофора в срезах ткани может быть достаточно для оценки локализации и интенсивности экспрессии. Тем не менее, многие флуоресцентные белки повреждаются в процессе фиксации тканей, и иммуноокрашивание для белка mCherry, которое часто используется с DREADD, дало лучший сигнал в предыдущих исследованиях7. Наконец, из-за плотности нейронов в определенных частях мозга (например, в слое зернистых клеток в гиппокампе), использование ядерно-локализованных флуорофоров, экспрессируемых при IRES, в отличие от слияний, для подсчета клеток может быть полезным, поскольку ядра могут быть легко сегментированы и окрашены ядерными красителями, такими как DAPI или TO-PRO-3. Для оценки нейромодуляции с помощью окрашивания c-Fos необходимо выполнить ядерное контрокрашивание и подсчет положительных ядер c-Fos, а не какого-либо флуоресцентного сигнала. В некоторых случаях клеточный мусор может проявлять флуоресценцию и искажать измерения положительных клеток.
Ограничения доставки лекарств и генов с помощью FUS-BBBO включают более низкое разрешение, чем при инвазивных внутричерепных инъекциях, и необходимость введения большего количества инъекционных препаратов или вирусных векторов. Кроме того, в то время как прямая инъекция в мозг приводит к исключительной доставке в место инъекции, FUS-BBBO использует внутривенный путь, что приводит к возможной доставке в периферические ткани. К ограничениям использования хемогенетики для нейромодуляции относится медленная временная шкала, которая может быть неадекватна некоторым поведенческим протоколам, требующим быстрых изменений интенсивности нейромодуляции.