Этот протокол описывает репортерный анализ для изучения регуляции трансляции мРНК в отдельных ооцитах во время созревания in vitro.
Методическая статья
Этот протокол описывает репортерный анализ для изучения регуляции трансляции мРНК в отдельных ооцитах во время созревания in vitro.
События, связанные с созреванием ядер ооцитов, хорошо описаны. Однако гораздо меньше известно о молекулярных путях и процессах, которые происходят в цитоплазме при подготовке к оплодотворению и приобретению тотипотентности. Во время созревания ооцитов изменения в экспрессии генов зависят исключительно от трансляции и деградации материнских матричных РНК (мРНК), а не от транскрипции. Таким образом, выполнение трансляционной программы играет ключевую роль в установлении компетентности развития ооцитов для поддержания развития эмбриона. Данная работа является частью фокуса на определении программы трансляции материнской мРНК, которая происходит во время мейотического созревания и при переходе ооцитов в зиготу. В данной методе представлена стратегия исследования регуляции трансляции целевых мРНК при созревании ооцитов in vitro. Здесь репортер Ypet сливается с 3'-й нетранслируемой областью (UTR) интересуемого гена, а затем микроинъецируется в ооциты вместе с полиаденилированной мРНК, кодирующей для mCherry для контроля введенного объема. Используя покадровую микроскопию для измерения репортерного накопления, скорость трансляции рассчитывается при различных переходах во время мейотического созревания ооцитов. Здесь описаны протоколы выделения и инъекции ооцитов, покадровой записи и анализа данных с использованием репортера Ypet/interleukin-7 (IL-7)-3' UTR в качестве примера.
Полностью выращенный ооцит млекопитающего претерпевает быстрые изменения при подготовке к оплодотворению и приобретении котипотентности. Эти изменения необходимы для поддержания эмбрионального развития после оплодотворения. Хотя события, связанные с ядерным созреванием, относительно хорошо описаны, гораздо меньше известно о молекулярных процессах и путях в цитоплазме ооцитов. На заключительных стадиях созревания ооцитов ооциты транскрипционно молчат, а экспрессия генов полностью зависит от трансляции и деградации мРНК1,2. Синтез белков, критически важных для развития компетентности, поэтому опирается на программу временной трансляции долгоживущих мРНК, которые были синтезированы ранее во время роста ооцитов1,3. В рамках акцента на определении этой программы трансляции материнской мРНК, выполняемой во время мейотического созревания и при переходе ооцитов в зиготу, в статье представлена стратегия изучения активации и подавления трансляции целевых материнских мРНК в одиночных ооцитах при мейотическом созревании in vitro.
В этом методе открытая рамка чтения YPet клонируется выше 3' UTR интересуемой транскрипты. Затем мРНК, кодирующие этот репортер, микроинъецируются в ооциты вместе с полиаденилированными мРНК, кодируемыми mCherry, для контроля инъецируемого объема. Накопление репортера измеряется во время мейотического созревания ооцитов in vitro с помощью покадровой микроскопии. Накопление желтого флуоресцентного белка (YFP) и mCherry регистрируется в отдельных ооцитах, а сигналы YFP корректируются плато-уровнем совместно вводимого mCherry. После сбора данных рассчитываются скорости трансляции для различных временных интервалов во время мейотического созревания мейотических яйцеклеток in vitro путем вычисления наклона кривой, полученной путем подгонки кривой.
Этот подход предоставляет инструмент для экспериментального подтверждения изменений в трансляции выбранных эндогенных мРНК. Кроме того, этот метод облегчает характеристику регуляторных элементов, контролирующих трансляцию во время мейотического созревания ооцитов путем манипулирования цис-регуляторными элементами 3' UTR целевых мРНК4,5,6. Манипуляции с длиной поли(А) хвоста также позволяют понять активность аденилазы/моденилазы в ооцитах5. Мутагенез цис-действующих элементов или иммунопреципитация РНК может быть использован для изучения взаимодействий с родственными РНК-связывающими белками6,7. Кроме того, этот метод может быть использован для идентификации основных компонентов программы трансляции, которые имеют решающее значение для компетентности развития ооцитов, путем измерения целевой трансляции 3' UTR в моделях, связанных со снижением качества ооцитов 8,9,10. В этой методной работе представлен репрезентативный эксперимент, в котором оголенные ооциты 21-дневных мышей C57 / BL6 были микроинъецированы с репортером Ypet, слитым с 3'UTR IL-7. Описаны установка и протокол для инъекции ооцитов, покадровой записи и анализа данных.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Экспериментальные процедуры с участием животных были одобрены Институциональным комитетом по уходу за животными и их использованию Калифорнийского университета в Сан-Франциско (протокол AN182026).
1. Подготовка СМИ
2. Подготовка кодирования мРНК для Ypet-3' UTR и mCherry
3. Экспериментальная процедура
ПРИМЕЧАНИЕ: Схематический обзор микроанализии ооцитов и последующей покадровой микроскопии приведен на рисунке 1.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Оголенные профазные I-арестованные ооциты 21-дневных мышей C57/BL6 вводили репортерную смесь, содержащую мРНК, кодирующую репортера Ypet, слитую с 3'UTR IL-7 и мРНК, кодирующих mCherry. Экспрессия YFP и mCherry была зарегистрирована в 39 ооцитах, из которых 30 были зрелыми, а 9 были арестованы в профазе I в качестве отрицательного контроля. Три созревающих ооцита были исключены для анализа, потому что они либо имели задержку GVBD (N = 2), либо перемещались в чашке во время записи (N = 1). На рисунке ...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Представленный метод описывает стратегию изучения активации и подавления трансляции целевой мРНК при различных переходах при мейотическом созревании мейотического созревания ооцитов in vitro. IL-7, цитокин, высвобождаемый ооцитом, который может быть вовлечен в ооцитар-кучевую клеточную связь8,13,был выбран с целью описания этого способа. Известно, что IL-7 все чаще транслируется во время созревания ооцитов8 и позволяет хорошо визу...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Эта работа была поддержана NIH R01 GM097165, GM116926 и Юнис Кеннеди Шрайвер NICHD Национальными центрами трансляционных исследований в области репродукции и бесплодия P50 HD055764 Марко Конти. Энрико М. Далделло был поддержан стипендией Фонда Лалора, а Натасья Г. Я. Костерманс была поддержана стипендией Рубикона от Нидерландской организации научных исследований (NWO).
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| Preparation of media | |||
| Bovine Serum Albumin Powder Bioxtra | Sigma-Aldrich | SIAL-A3311 | |
| Циллостамид | EMD Millipore | 231085 | |
| MEM alpha | Gibco | 12561-056 | |
| Minimum Essential Medium Eagle | Sigma-Aldrich | M2645 | |
| Пенициллин-стрептомицин 100x раствор, стерильный фильтрованный | Genesee Scientific Corporation (GenClone) | 25-512 | |
| Бикарбонат натрия | JT-Baker | 3506-1 | |
| пируват натрия | Gibco | 11360-070 | |
| Ультрачистая дистиллированная вода | Invitrogen | 10977-015 | |
| Препарат мРНК, кодирующей YFP/3' UTR и mCherry | |||
| Agarose | Apex Biomedical | 20-102QD | |
| Карбенициллин динатриевая соль | Sigma-Aldrich | C1389-1G | |
| Набор для клонирования Choo-Choo McLab | CCK-20 | ||
| CutSmart Buffer (10x) | Новый Англия Биолабс | B7204 | |
| Краситель для загрузки ДНК (6 шт) | Thermo Scientific | R0611 | |
| Раствор дНТП Новая | Англия Биолабс | N0447S | |
| DpnI | New England Biolabs | R0176 | |
| GeneRuler 1 kb DNA ladder | Thermo Fisher | SM1333 | |
| LB Агаровые пластины с 100 & микро; г/мл Карбенициллин, Текнова | Teknova | L1010 | |
| LB Medium (капсулы) | MP Biomedicals | 3002-021 | |
| MEGAclear Transcription Clean-Up Kit | Life Technologies | AM1908 | |
| MfeI-HF фермент рестрикции | New England Biolabs | R3589 | |
| mMESSAGE mMACHINE T7 Transcription Kit | Invitrogen | AM1344 | |
| Phusion High Fidelity DNA полимераза | New England Biolabs | M0530 | |
| Poly(A) Хвостохранилище | Invitrogen | AM1350 | |
| QIAprep Spin Miniprep Kit | Qiagen | 27106 | |
| QIAquick Набор для экстракции геля | Qiagen | 28704 | |
| S.O.C. medium | Thermo Fisher | 15544034 | |
| TAE buffer | Apex Biomedical | 20-193 | |
| Сверхчистый раствор бромида этидия | Life Technologies | 15585011 | |
| Oocyte collection | |||
| Аспиратор в сборе для калиброванных микропипеток | Sigma-Aldrich | A5177-5EA | |
| Калиброванные микропипетки | Drummond Scientific Company | 2-000-025 | |
| PMSG-5000 | Mybiosource | MBS142665 | |
| игла PrecisionGlide 26 г x 1/2 | BD | 305111 | |
| шприц 1 мл | BD | 309659 | |
| Oocyte micro-injection | |||
| 35 мм Чашка | No. 0 Покровный лист | Диаметр стекла 20 мм | Непокрытый | MatTek | P35G-0-20-C | Для покадровой микроскопии |
| Боросиликатное стекло с нитью накала | Sutter Instrument | BF100-78-10 | |
| Масло для культивирования эмбрионов | Irvine Scientific | 9305 | |
| Чашка Петри | Falcon | 351006 | Для микроинъекций |
| Чашка для культуры тканей Falcon | 353001 | Для инкубации ооцитов | |
| VacuTip Holding Capillarary | Eppendorf | 5195000036 | |
| Software | |||
| Biorender | BioRender | Preparation of Figure 1S | |
| MetaMorph, версия 7.8.13.0 | Молекулярные приборы | Для покадровой микроскопии, анализа трансляции 3' UTR |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Запросить разрешение на повторное использование текста или иллюстраций этой статьи JoVE
Запросить разрешение