$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Все эксперименты с использованием гПСК проводились в соответствии с институциональными руководящими принципами и проводились в капюшоне биобезопасности класса II с соответствующими средствами индивидуальной защиты. Все реагенты относятся к клеточной культуре, если не указано иное. Все культуры инкубируются при 37 °C, 5% CO2 в атмосфере воздуха. На всех этапах анализа могут быть собраны эмбриоидные тела или почечные органоиды, зафиксированы или подготовлены к анализу. Линии hPSC, используемые для генерации этих данных, были полностью охарактеризованы и опубликованы18.
1. Подготовка культуральных пластин
ПРИМЕЧАНИЕ: Приблизительно за 1 ч до расщепления гПСК покройте 2 х 100 мм пластины культуры тканей экстрактом матрицы базальной мембраны (BME), сертифицированным стволовыми клетками. Можно предварительно покрыть пластины, запечатать их парафиновой пленкой и хранить при 4 °C в соответствии с инструкциями производителя.
- Подготовьте 2 пластины, обработанные культурой тканей 100 мм (1 для анализа органоидов почек, 1 для поддержания клеточной линии) и коническую трубку объемом 15 мл в капюшоне биобезопасности класса II.
- Aliquot 8 мл холодной, без сыворотки Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) в коническую трубку объемом 15 мл и ~ 4 мл в каждую из 100 мм пластин, достаточно, чтобы покрыть дно каждой пластины средой.
- Возьмите из морозильной камеры 100 мкл аликвоту BME (-20 °C). Используя серологическую пипетку объемом 2 мл, возьмите ~1 мл холодного ДМЭМ из конической трубки объемом 15 мл. Медленно размораживайте аликвоту BME, осторожно пипетируя вверх и вниз холодным DMEM, избегая образования пузырьков.
ПРИМЕЧАНИЕ: Не позволяйте Аликвоте BME сидеть при комнатной температуре. Используйте немедленно.
- Переместите размороженный DMEM/BME обратно в коническую трубку объемом 15 мл с оставшимся DMEM. С серологической пипеткой объемом 10 мл осторожно перемешайте разбавленный BME, пипеткой вверх и вниз по крайней мере 8 раз, чтобы равномерно рассеять BME, избегая образования пузырьков.
- Переложите 4 мл разбавленного BME в каждую пластину с DMEM и аккуратно закрутите пластину так, чтобы BME равномерно распределился. Инкубировать покрытую пластину в течение 1 ч при комнатной температуре или 30 мин при 37 °C.
ПРИМЕЧАНИЕ: Используйте 50 мкл BME на пластину толщиной 100 мм. Использование других культуральных сред и клеточных линий hPSC может потребовать различных концентраций BME.
2. Пропускающие GPS-серверы
ПРИМЕЧАНИЕ: Для рутинной культуры hPSC проходит клеточные линии с 70-80% слиянием.
- Аспирируйте культуральную среду из пластины hPSC, подлежащей прохождению. Добавьте ~ 8 мл фосфатно-буферного физиологического раствора Dulbecco (DPBS) в пластину hPSC и осторожно закрутите, чтобы промыть клетки.
- Аспирируйте DBPS и добавьте 2 мл мягкого реагента диссоциации клеток (GCDR) на пластину 100 мм, каплю за каплей сверху, чтобы покрыть клетки.
ПРИМЕЧАНИЕ: Могут также использоваться другие диссоциационные реагенты. Отрегулируйте соответствующим образом.
- Инкубировать при комнатной температуре в течение ~6-8 мин до тех пор, пока колонии не распадутся и клетки не станут рефракционными при фазовом контрасте (рисунок 2А).
ПРИМЕЧАНИЕ: Время может варьироваться между линиями клеток. Отрегулируйте соответствующим образом.
- Во время инкубации подготовьте коническую трубку объемом 50 мл. Добавьте 16 мл среды hPSC (8 мл на пластину 100 мм) и добавьте ингибитор Rho-ассоциированной киназы (ROCKi) до конечной концентрации 5 мкМ.
- Аспирируйте DMEM из пластин, покрытых BME, и добавьте 8 мл среды hPSC плюс ROCKi к каждой пластине.
- Когда ячейки будут готовы (как описано в пункте 2.3, рисунок 2A), аспирируйте GCDR и наклоните пластину ~ 45 ° в сторону экспериментатора и соскоблите клетки с помощью подъемника клеток.
ПРИМЕЧАНИЕ: Если ячейки отсоединяются, опустите аспирирующий GCDR и продолжайте.
- Поверните пластину ~90° и снова соскоблите, чтобы поднять оставшиеся ячейки. Держите пластину ~45° и промывайте клетки 3 мл среды hPSC с помощью серологической пипетки объемом 10 мл.
- Аккуратно пипетку вверх и вниз разбить большие комочки (не более 2-3 раз) и высеять клетки в соответствующем соотношении для интересующей клеточной линии на подготовленные пластины. Поместите пластину с клетками в инкубатор и осторожно переместите пластину в восьмерки, чтобы равномерно распределить клетки.
ПРИМЕЧАНИЕ: В этом эксперименте линии hPSC были разделены в соотношении 1:5, это может варьироваться для других клеточных линий и условий. Оставьте тарелку нетронутой на ночь.
- Через ~ 24 ч осмотрите клетки на предмет прикрепления. Ищите небольшие отдельные колонии, прикрепленные к ним. Аспирировать отработанную среду и пополнить 8 мл свежей среды hPSC (без добавления ROCKi).
- Продолжайте наблюдение и кормление ежедневно, пока клетки не достигнут ~ 60% слияния, чтобы начать анализ органоидов почек (обычно достигается от 48 до 72 ч после прохождения). Колонии в идеале должны быть дискретными и не сливающимися (рисунок 2B).
ПРИМЕЧАНИЕ: Очень важно ограничить клетки не более чем 80% сливанием, чтобы сохранить их плюрипотентное состояние. Сливающиеся культуры, грубое обращение или более высокие проходы могут привести к нежелательной спонтанной дифференцировке или низкой эффективности образования органоидов почек.
3. День 0 - Настройка анализа органоидов почек
- Перед началом подготовки сред E5-ILP и stage II в соответствии с составами (таблица 1 и таблица 2).
ПРИМЕЧАНИЕ: Носитель может храниться до 14 дней при температуре 4 °C.
- Для одного анализа органоидов почек (для одной 6-луночной пластины необходима одна 100-миллиметровая культуральная пластина) приготовьте полную среду E5-ILP в конической трубке объемом 50 мл: 18 мл E5-ILP с добавлением 8 мкМ CHIR99021 (14,4 мкл), 3,3 мкМ ROCKi (6 мкл), 0,1 мМ бета-меркаптоэтанола (32,7 мкл).
- Поместите 2 мл полной среды E5-ILP в каждую скважину из 6 скважин сверхнизкой крепежной пластины.
- Промывайте HPSC при слиянии ~60 % (рисунок 2B) дважды с ~ 8 мл DPBS. Затем аспират DPBS добавляют 2 мл диспазы на пластину 100 мм, каплю за каплей покрывают клетки и инкубируют в течение 6 мин при 37 °C.
ПРИМЕЧАНИЕ: Через 6 минут края колоний начнут сворачиваться (рисунок 2C, красные стрелки), в то время как остальная часть колонии останется прикрепленной. Если это не получено через 6 мин, поместите клетки обратно в инкубатор еще на 30 с. Другие носители и матрицы hPSC могут быть несовместимы с этим таймингом. Покрытие BME на основе ламинина не совместимо с диспазой. Если BME на основе ламинина являются стандартной матрицей hPSC, покройте одну из пластин в разделе 1 BME, описанным в этом способе, которое будет использоваться для анализа органоидов почек.
- Промывочные ячейки 3x с ~10 мл DPBS. Затем аспирируйте DPBS наклоните пластину ~ 45 ° и соскоблите вниз с помощью подъемника ячейки.
ПРИМЕЧАНИЕ: Диспаза не деактивируется, поэтому ее необходимо тщательно вымыть. Не уменьшайте количество стирок.
- Промыть колонии сверху 6 мл полной среды E5-ILP с помощью серологической пипетки объемом 10 мл. Пипетки вверх и вниз осторожно, чтобы разбить любые большие колонии (обычно достаточно 2 или 3 раз).
- Распределите кластеры колоний равномерно, добавив 1 мл на лунку в 6-луночную плиту. Поместите пластину на орбитальный шейкер (настройки: орбитальный = 30, обратный = 330°, вибрация = 5° - 2 с), который помещается в инкубатор при температуре 37 °C (рисунок 2D).
ПРИМЕЧАНИЕ: Вибрационная особенность важна для адекватного распределения органоидов и предотвращения слипания.
4. День 2 - Кормление полусредним изменением
ПРИМЕЧАНИЕ: В течение 48 часов кластеры колоний образуют эмбриональные тела.
- Подготовьте полную среду: Для одной 6-луночной плиты подготовьте 12 мл среды E5-ILP + 8 мкм CHIR99021 в конической трубке объемом 15 мл.
ПРИМЕЧАНИЕ: Бета-меркаптоэтанол и ROCKi не требуются.
- Пусть эмбриоидные тела осядут в нижней части пластины, наклоните пластину ~45°, затем медленно аспирируйте среду сверху, оставьте ~1 мл на лунку.
ПРИМЕЧАНИЕ: Эмбриоидные тела на этой стадии быстро сгущаются. Не оставляйте их на > 5 мин.
- Добавить 2 мл подготовленной полной среды (раздел 4.1) на лунку. Верните тарелку обратно на шейкер.
5. День 3 - Перенос эмбриональных тел в среду II стадии
- Приготовьте коническую трубку объемом 50 мл и ДМЭМ (низкий уровень глюкозы). Пусть эмбриоидные тела осядут в нижней части пластины. Наклоните пластину ~45° и медленно аспирируйте среду сверху, оставьте ~1 мл на лунку.
- Тщательно соберите все эмбриоидные тела из каждой лунки с помощью серологической пипетки объемом 10 мл и перенесите их в коническую трубку объемом 50 мл.
- Вымойте каждую лунку, чтобы собрать оставшиеся эмбриональные тела с ~ 1 мл DMEM (низкий уровень глюкозы) и добавьте их в ту же коническую трубку объемом 50 мл.
- Оставьте эмбриональные тела оседать на дно трубки, ~5 мин. Во время ожидания добавьте 2 мл среды стадии II к каждой скважине плиты из 6 скважин. Выводите крупные эмбриоидные тела (>300 мкм) с помощью клеточного сетчатого фильтра 200 мкм (рисунок 2E).
- Используйте новую коническую трубку объемом 50 мл и поместите сверху клеточный сетчатый фильтр 200 мкм. Пипетка всех эмбриональных тел с помощью серологической пипетки объемом 10 мл осторожно над клеточным ситечком.
- Промыть клеточный ситечко дополнительным ~ 5 мл DMEM (низкий уровень глюкозы), чтобы собрать любые эмбриональные тела, застрявшие в клеточном ситечке. Позвольте эмбриоидным телам осесть на дно конической трубки.
- Когда эмбриоидные тела осядут, аспирируйте супернатант и промывайте ~ 10 мл DMEM (низкий уровень глюкозы).
- Аспирировать ДМЭМ и повторно подвешивать эмбриоидные тела в 6 мл среды II стадии.
- Перенесите эмбриоидные тела обратно в 6 лунок сверхнизкой пластины крепления, равномерно распределив их между 6 лунками.
- Выполняйте половинные изменения среды, как описано в шагах 4.2 и 4.3, через день.
ПРИМЕЧАНИЕ: Начиная с 3-го дня, эмбриоидные тела будут иметь «золотистый» и гладкий, сферический вид (рисунок 2F). С ~ дня 6 станет очевидным образование канальцев в отдельных эмбриональных телах, причем увеличение числа в течение следующих дней достигнет оптимальных чисел и роста к 14-му дню (рисунок 2G, H). Чтобы устранить случайное образование слипания, при визуальном наблюдении за почечными органоидами или очень маленькими эмбриональными телами без канальцев, отсейте органоиды <200 и крупных >500 мкм с клеточными сетчатыми фильтрами 500 и 200 мкм, как описано в шагах 5.4.1 и 5.4.2.
6. Перенос в колбу спиннера и подача
ПРИМЕЧАНИЕ: Колба спиннера может использоваться в любое время, начиная с 3-го дня, для экспериментов, требующих большого количества органоидов. Рутинная передача органоидов происходит в нашей лаборатории между днями 6-8. Пожалуйста, ознакомьтесь с разделом Обсуждение альтернатив, если оборудование недоступно.
- Перенос эмбриоидных тел в колбу спиннера объемом 125 мл с 45 мл среды II стадии. Установите скорость магнитной мешалки на 120 об/мин и поместите в инкубатор (рисунок 2I).
- Чтобы питать эмбриональные тела или почечные органоиды, дайте почечным органоидам ненадолго осесть на дно колбы спиннера. Поднимите крышку с одного бокового рычага колбы и поместите аспирационную пипетку внутрь, при этом наконечник коснется противоположной внутренней стенки.
- Медленно наклоните аспирационную пипетку вниз и аспирируйте примерно половину среды. Восполняйте 20 мл свежей среды Stage II, пипеткой ее через то же отверстие.
7. Установка 6-луночной магнитной пластины перемешивания (6MSP)
ПРИМЕЧАНИЕ: Формат 6MSP может использоваться вместо колб спиннера, если необходимо протестировать несколько условий. Используйте 6MSP для лечения соединениями или нефротоксинами. Это экономит количество среды, используемой на втором этапе, сохраняя при этом доступность питательных веществ за счет диффузии.
- Очистите овальные магнитные перемешивания в конической трубке объемом 50 мл, промыв в культуре ткани подходящее моющее средство ненадолго (если оно никогда не использовалось) или замочите > 1 ч, если предварительно использовалось.
- Кратковременно промыть 3x в стерильном DPBS.
- Промыть 1 раз в течение 5 мин в 70% этаноле, 1 раз в стерильном DPBS.
- Промыть антиадгезионным раствором и промыть 1 раз стерильным DPBS и аспиратом.
- Осторожно, используя длинные стерильные щипцы, поместите один магнитный перемешивание в каждую лунку 6-луночной пластины с эмбриональными телами или почечными органоидами.
- Поместите пластину на 6MSP и установите скорость на 120 об/мин (рисунок 2J). Поддерживать почечные органоиды с половинным средним изменением в соответствии с разделами 4.2 и 4.3.
ПРИМЕЧАНИЕ: Для того, чтобы магнитные перемешивания защелкнулись и начали вращаться, вам может потребоваться сначала кратковременно поставить уровень мощности до 100, а затем, как только они все вращатся, снизить уровень мощности до 25.