Наиболее существенным отличием описанной здесь модели от ранее опубликованных моделей вагинальной прививки является использование анаэробно культивируемых бактерий, которые требуют особых соображений для получения жизнеспособного инокулята и восстановления бактерий у мышей. Конкретные шаги в приведенном выше протоколе могут незначительно варьироваться в зависимости от вида/штамма используемых бактерий, как предложено в Дополнительном файле 1. Кроме того, в этой рукописи описывается новый процедурный метод введения бактерий и вагинальных промывок, который требует меньше опыта со стороны исследователя и меньшей сдержанности для мышей. Если экспериментатора не устраивает форма сдерживания, описанная в шаге 3.2. и на этапе 3.3., мышей можно вместо этого зажимать, какописано ранее 34 , с анестезией или без нее в соответствии с экспериментальным дизайном и институциональными руководящими принципами IACUC.
Важным предостережением к использованию анаэробно культивируемых бактерий в мышиных моделях является то, что определенные шаги (например, с участием живых животных) должны выполняться за пределами анаэробной камеры. Поэтому наиболее важными шагами в этом протоколе являются те, в которых интересующие бактерии будут подвергаться воздействию аэробной среды, например, во время прививки мышей. Использование любого нового анаэроба в этой модели потребует предварительного изучения его способности сохранять жизнеспособность при воздействии кислорода (например, сравнение коЕ до и после инокуляции, как описано на этапе 2.5 и этапе 3.4.). В зависимости от степени чувствительности организма к кислороду и ПБС следует рассматривать различные способы получения инокулята (Дополнительный файл 1, этап 2.4.5.). Для прививок с использованием G. vaginalis JCP8151B мы обнаружили, что одна трубка инокулята может быть приготовлена в PBS и использована для заражения всех мышей. Если используется другая анаэробная бактерия, более чувствительная к кислороду, инокулятив может быть приготовлен в отдельных пробирках для каждой мыши, так что повторное открытие/ закрытие трубки не требуется. Аналогичным образом, если интересующий вид бактерий более привередлив / менее способен выживать в PBS , чем G. vaginalis, вместо этого можно приготовить прививку в питательных средах. Если используемая среда содержит восстановители, такие как анаэробная среда CDC, используемая для культивирования Prevotella bivia (Дополнительный файл 1, шаг 2.1. и шаг 2.2.), то бактерии также будут иметь повышенную защиту от воздействия кислорода.
Также могут быть рассмотрены альтернативные способы гомогенизации, такие как бисерное биение22,35, которое делается с закрытой крышкой трубки и, следовательно, может вводить меньше кислорода, чем ручной гомогенизатор. Кроме того, более чувствительным к кислороду организмам может потребоваться более длительное время равновесия для сред. Индикатор кислорода, такой как ресазурин, может быть использован для проверки того, что анаэробные условия были достигнуты (шаг 2.1.). Альтернативные методы, такие как анаэробные банки, могут влиять на результаты и должны быть проверены на жизнеспособность бактерий перед использованием.
Чувствительность к кислороду и привередливость экспериментального организма могут также играть роль в успешном восстановлении жизнеспособных бактерий у мыши во время промывания/гомогенизации (Дополнительный файл 1, этап 3.2. и этап 5.1.). Для высокочувствительных организмов время между приемом и покрытием лаважа может привести к потере жизнеспособности и вызвать искусственно заниженную оценку бактериальной вагинальной колонизации. Чтобы смягчить этот эффект, собранные промывания можно сразу же разбавить в свежие анаэробные питательные среды (с восстановителем). Аналогичным образом, гомогенизация органов может быть выполнена в свежих питательных средах, а не в PBS для повышения жизнеспособности бактерий, а также может быть выполнена в самой анаэробной камере, чтобы свести к минимуму воздействие кислорода.
В зависимости от цели данного эксперимента экспериментатор должен обращать внимание на контрольные группы. Чтобы проверить гипотезы, базовые показатели неинфицированных контрольных мышей, которые искусственно обрабатываются только транспортным средством, помогут установить, есть ли индукция хемокинов / цитокинов или других конкретных исходов инфекции. Используемое контрольное транспортное средство должно быть таким же, как и транспортное средство, используемое для инокуляции, поэтому, если бактерии инокулируются в питательных средах, то в качестве контроля должны использоваться неинокализованные питательные среды (Дополнительный файл 1, этап 2.4.5.).
Методы, описанные в этом протоколе, также могут быть применены к факультативным бактериям, способным расти анаэробно, но которые традиционно изучаются с использованием аэробных условий культивирования (таких как Escherichia coli или стрептококк группы B). Это может быть особенно актуально для инфекций этими организмами в участках тела, которые, как полагают, содержат низкий уровень кислорода, таких как шейка матки. Может случиться так, что факультативный организм более успешно заражает участки с меньшим количеством кислорода, когда инокулятив готовится анаэробно по сравнению с аэробным. В таком эксперименте восстановление жизнеспособных бактерий для перечисления КОЕ может не требовать анаэробных состояний.