$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
APTrack — это программный плагин для использования с платформой Open Ephys. Мы выбрали эту платформу, так как она с открытым исходным кодом, гибкая и дешевая в реализации. Не включая стоимость стимулятора постоянного тока, все оборудование, необходимое для начала использования плагина, можно было приобрести примерно за 5,000 долларов США на момент написания статьи. Мы надеемся, что это позволит исследователям легче внедрять APTrack в свои исследования электрофизиологии периферических нервов. Кроме того, исследователи могут свободно модифицировать программное обеспечение в соответствии со своими экспериментальными потребностями. Важно отметить, что этот инструмент впервые позволил отслеживать электрические пороги одиночных ноцицепторов С-волокна у людей.
Чем выше отношение сигнал/шум, тем лучше алгоритмы могут идентифицировать потенциалы действия. Соотношение сигнал/шум во время микронейрографии было достаточным в большинстве наших записей, но пользователи должны быть готовы к риску ухудшения сигнала с течением времени. Это особенно важно для более длительных экспериментальных протоколов, потому что, если амплитуда отслеживаемого потенциала действия падает ниже порога обнаружения, амплитуда стимуляции будет увеличена ошибочно; Это можно смягчить, если экспериментаторы будут следить за плагином, а затем при необходимости корректировать настройки. Отношение сигнал/шум улучшается с помощью полосовой фильтрации, но более крупные переходные процессы все равно могут быть ошибочно идентифицированы как потенциалы действия, если они поступят во время окна поиска. Риск неправильной идентификации переходного шума в качестве потенциала действия может быть снижен за счет сужения временного окна, в течение которого плагин ищет потенциалы действия, и оптимизации пороговых настроек. Тем не менее, все еще есть ситуации, с которыми можно столкнуться, которые препятствуют работе плагина. Спонтанная активность может вызвать трудности, если потенциалы действия большей амплитуды попадают в окно окна поиска алгоритма, поскольку они будут ошибочно идентифицированы как целевой потенциал действия. Кроме того, спонтанная активность в интересующем нейроне может означать, что электрическая стимуляция падает в течение ее рефрактерного периода, что приводит к неспособности генерировать потенциал действия. Трудности с использованием программного обеспечения также могут возникнуть, когда первичные афферентные нейроны демонстрируют триггер-флоп, в результате чего стимулируются альтернативные концевые ветви одного нейрона, что приводит к тому, что вызванный потенциал действия имеет две (или более) базовые латентности, которые являются взаимоисключающими20. Во время записи нейронов, демонстрирующих триггер с высоким отношением сигнал/шум, мы успешно выполнили отслеживание задержки и электрического порога, увеличив ширину окна поиска, чтобы инкапсулировать все потенциальные скорости проводимости, которые демонстрировал нейрон. Однако электрический порог может варьироваться в зависимости от возбуждаемой концевой ветви нейрона, что, вероятно, отчасти связано с различиями в расстоянии от места электрической стимуляции до альтернативных ноцицепторных терминалей. Возможна дополнительная работа по процессу идентификации потенциала действия, включающая, например, сопоставление шаблонов, и она может быть интегрирована в это программное обеспечение. Плагины GUI для полосовой или адаптивной фильтрации шума также могут использоваться выше по течению от APTrack в сигнальной цепи, если они будут разработаны.
Мы считаем, что определенный электрический порог - это ток, необходимый для возникновения потенциала действия в 50% случаев при заданном пользователем количестве электрических стимулов, обычно 2-10. Морфология электростимуляции составляет 0,5 мс и положительные, прямоугольные импульсы. Это не то же самое, что определить реобазу, широко используемую меру возбудимости нейронов. Плагин может быть адаптирован для определения реобазы. Тем не менее, мы преследовали более простую меру, поскольку динамические изменения возбудимости, такие как те, которые предположительно происходили во время нагрева, было бы труднее количественно оценить с помощью изменений реобазы, чем нашу оценку электрического порога.
Это программное обеспечение можно использовать как в экспериментах на людях, так и на грызунах. Это стало возможным благодаря гибкой поддержке систем электростимуляции. Программное обеспечение будет работать с любым стимулятором, который принимает аналоговое командное напряжение или может быть вручную сопряжен с шаговым двигателем. Для микронейрографии мы использовали его со стимулятором постоянного тока с маркировкой CE, который был разработан для использования в исследованиях на людях и контролировал его стимуляцию с помощью циферблата. Стимуляторы, принимающие аналоговые команды напряжения, могут быть шумными, поскольку они не отключают цепь между стимулами, а это означает, что любой гул или шум 50/60 Гц на аналоговом входе будет передаваться на запись. Стимулятор, который требует дополнительного триггерного сигнала TLL для подключения цепи, позволяя генерировать стимул при токе, аналогичном входному аналоговому напряжению, идеально подходит для использования с плагином. Это предотвращает передачу шума на запись между стимулами.
Программное обеспечение использует простой метод вверх-вниз для оценки электрического порога. Это использовалось в психофизических тестах в течение многих десятилетий25. В соответствии с методом «вверх-вниз» алгоритм отслеживания электрического порога для модуляции амплитуды стимуляции учитывает только амплитуду и реакцию предыдущей стимуляции при расчете амплитуды следующей стимуляции. Это означает, что амплитуда стимуляции будет колебаться вокруг истинного электрического порога, создавая таким образом 50% скорость срабатывания, при условии, что порог стабилен. Минимальный размер приращения или уменьшения составляет 0,01 В; это эквивалентно 0,01 мА, предполагая, что стимулятор имеет отношение входа/выхода 1 В: 1 мА и достаточное разрешение для достижения таких малых ступенчатых изменений. Плагин будет обновлять оценку электрического порога целевого потенциала действия в реальном времени каждый раз, когда он достигает 50% скорости срабатывания по сравнению с заданным пользователем количеством предыдущих стимулов (2-10). Постфактум мы рекомендуем использовать скользящее среднее амплитуды стимуляции за последние 2-10 стимулов для оценки электрического порога, и следует отметить, что эта оценка будет точной только тогда, когда скорость срабатывания относительно стабильна на уровне 50%. Как в живых, так и в постфактум оценках электрического порога существует баланс разрешения, надежности и времени для рассмотрения. Использование меньших шагов приращения и уменьшения повысит точность оценки электрического порога, но увеличит время, необходимое для нахождения нового электрического порога на начальном этапе и после возмущения. Расчет электрического порога для большего количества предыдущих стимулов обеспечит лучшую надежность, но увеличит время, необходимое для достижения точной оценки.
APTrack был разработан для использования в записях периферических нервов, в частности, для отслеживания электрических порогов С-волокон во время экспериментальных и патологических возмущений в периоды, когда задержка потенциала действия может варьироваться в зависимости от основной активности нейронов. Этот метод позволит исследовать не только возбудимость аксонов, но и потенциалы генератора ноцицепторов у здоровых добровольцев и пациентов. Мы ожидаем, что другие области электрофизиологии могут принять и адаптировать этот инструмент для использования в любом эксперименте, который требует отслеживания электрического порога активности, заблокированной стимулом. Например, это может быть легко адаптировано для оптогенетической стимуляции световыми импульсами, управляемыми APTrack. Плагин с открытым исходным кодом и доступен исследователям под лицензией GPLv3. Он построен на платформе Open Ephys, которая представляет собой адаптируемую, недорогую систему сбора данных с открытым исходным кодом. Плагин предоставляет дополнительные перехватчики для последующих плагинов для извлечения информации о потенциальном действии и предоставления дополнительных пользовательских интерфейсов или адаптивных парадигм. Плагин предоставляет простой пользовательский интерфейс для визуализации и отслеживания задержек потенциалов действий в режиме реального времени. Он также может воспроизводить предыдущие данные и визуализировать их с помощью временного растрового графика. Кроме того, он также может отслеживать задержку во время воспроизведения предыдущих данных. Хотя существуют и другие программные пакеты, доступные для отслеживания задержек в реальном времени, они не имеют открытого исходного кода и не могут выполнять отслеживание электрических порогов26,27. APTrack имеет преимущество перед традиционными методами идентификации потенциалов действия с постоянной задержкой по трассам напряжения, поскольку он использует временной растровый график для визуализации данных. Кроме того, наш опыт использования его в экспериментах с низким отношением сигнал/шум показал, что метод визуализации временного растрового графика позволяет идентифицировать потенциалы действия с постоянной задержкой, которые в противном случае могли бы быть упущены.
Отслеживание порога всего нерва является широко используемым методом оценки возбудимости аксонов13. Отслеживание однонейронного электрического порога в С-волокнах грызунов ранее использовалось для количественной оценки возбудимости ноцицепторов14, и его полезность для людей признана10,11; Однако до сих пор это не удавалось. Мы предоставляем новый инструмент с открытым исходным кодом для непосредственного измерения возбудимости отдельных ноцицепторов в электрофизиологических исследованиях периферических нервов как у грызунов, так и у человека. APTrack впервые позволяет в режиме реального времени с открытым исходным кодом отслеживать электрические пороговые значения потенциалов действия одного нейрона у людей. Мы ожидаем, что это облегчит трансляционные исследования ноцицепторов между грызунами и людьми.