Листы эпителиальных клеток покрывают внешнюю поверхность всех многоклеточных, выстилают внутренние органы и делят тело животного на отдельные отсеки. Эпителий также отделяет внутреннее тело от внешней среды и защищает его от повреждений и инфекций. Следовательно, появление эпителиальных слоев было существенной частью эволюции многоклеточных животных, а эпителиальные слои наблюдаются у всех животных от позвоночных до большинства базальных многоклеточных1. Эпителий некоторых органов представляет собой единый монослой, например, в воздушных мешочках легких, кровеносных сосудах и кишечнике2, а также в эпидермисе беспозвоночных, таких как планарии и книдарии3. В других тканях, таких как кожа4 и роговица5 позвоночных, эпителий стратифицирован, что означает, что есть несколько слоев эпителиальных клеток2. Во всех случаях самый базальный эпителиальный слой прикрепляется к базальной мембране, белковому листу, который образует специализированную область внеклеточного матрикса (ECM)6,7,8.
Разрывы в эпителии должны быть быстро восстановлены, чтобы воссоздать непрерывный эпителиальный лист. Повреждение эпителия происходит во время естественных процессов, таких как отшелушивание эпителиальных клеток в кишечнике,9,10 а также в результате воспаления или физической травмы. Когда одна эпителиальная клетка повреждена, она должна либо восстановиться, либо быть устранена, чтобы позволить окружающим клеткам прикреплиться друг к другу и закрыть отверстие11,12. В ранах, превышающих размер одной клетки, эпителиальные клетки должны двигаться, чтобы достичь друг друга и восстановить лист13. Это может быть достигнуто путем распространения клеток, если промежутки малы или может потребоваться миграция эпителиальных клеток с краев раны, чтобы закрыть раневую щель; Этот последний процесс называется реэпителизацией14,15. В эмбриональных тканях эпителиальные клетки распространяются и мигрируют к закрытым ранам или вытягиваются через щель за счет сокращения актомиозиновых кабелей, которые образуются между клетками на краю раны, в механизме, напоминающем кошельковую нить16. Во многих тканях взрослого человека реэпителизация включает миграцию когерентных клеточных листов, где клетки сохраняют свои соединения с соседними клетками14,17,18. В других тканях клеточные связи демонтируются, и эпителиальные клетки ведут себя больше как мезенхимальные клетки, перемещаясь скоординированным, но независимым образом в область раны во время повторной эпителизации 14,19,20,21.
Движения эпителиальных клеток регулируются сложными взаимодействиями между мигрирующими клетками, а также между клетками и ECM. Несмотря на то, что существует огромное количество экспериментальной литературы, посвященной механизмам раневой активации эпителиальных клеток и последующей миграции, многое еще предстоит открыть. Например, первоначальный сигнал, который активирует эпителиальные клетки для миграции в ответ на рану, не был окончательно идентифицирован 22, и не до конца понятно, как актин перераспределяется для создания ламеллиподий на стороне эпителиальных клеток, ближайших к ране 22,23,24,25,26,27. Коллективная миграция клеток требует, чтобы информация от клеток в ране передавалась клеткам дистальнее раны, и путь связи до сих пор неясен28. Ячейка: клеточные соединения и ячейка: ECM насадки должны быть разобраны и преобразованы по мере того, как ячейки в листе перестраиваются, но регулирование этого процесса плохо изучено14,29. Достижение прогресса в этих и других связанных с ними вопросах важно не только как фундаментальная биологическая проблема, но и из-за клинической значимости правильного заживления ран. Заболевания, которые нарушают способность эпителиальных клеток правильно мигрировать, приводят к хроническим ранам; примером может служить генетическое заболевание буллезный эпидермолиз, при котором гены, участвующие в прикреплении эпителиальных клеток к ECM, мутируют, в результате чего кожа становится хрупкой, которая шелушится и покрывается волдырями. Реэпителизация также нарушается в естественно стареющих тканях30,31. Поэтому лучшее понимание имеет важное значение для разработки вмешательств для улучшения результатов заживления ран.
Миграция эпителиальных клеток при заживлении ран была изучена с использованием как подходов in vitro, так и модельных организмов. Большинство исследований заживления ран и механизмов миграции клеток было проведено в культуре тканей, где монослои одного типа эпителиальных клеток выращиваются на субстрате, замещающем ECM. Клеточные монослои либо царапают, либо выращивают с помощью трафаретов для создания промежутков определенных форм и размеров, а затем наблюдают32,33,34. Модель in vitro позволяет идеально визуализировать поведение клеток, а также дает возможность изменять качества субстрата, подвергать клетки воздействию лекарств и абиотических и биотических факторов, а также трансфицировать клетки конструкциями, которые экспрессируют или подавляют различные интересующие гены. Однако этот редукционистский подход может не охватить некоторые важные параметры, участвующие в поведении эпителиальных клеток в контексте in vivo, включая связь между различными типами клеток и сигнальные события, которые происходят в ECM11. Модели in vivo обеспечивают аутентичный контекст раны с несколькими типами клеток, перекрывающимися сигнальными путями и сложным ECM35. Одной из таких моделей для исследований заживления ран является мышь19, в которой последние достижения позволили исследователям наблюдать эпидермальные клетки во время заживления ран на всю толщину у живых животных36. Однако мышь и другие системы in vivo создают проблемы для изучения реэпителизации. Во-первых, большое преимущество наблюдения за поведением клеток в естественном контексте уравновешивается сложностью временно перекрывающихся событий, которые происходят во время заживления ран позвоночных, включая свертывание крови, рекрутирование иммунных клеток и воспаление, рекрутирование фибробластов и дедифференцировку клеток, реваскуляризацию и ремоделирование ECM. Кроме того, непрозрачные ткани затрудняют визуализацию. Системы эпидермиса личинок дрозофилы и рыбок данио-рерио 37,38 преодолели некоторые из этих трудностей из-за их относительной простоты39.
Наша лаборатория недавно представила новую модель для изучения заживления эпителиальных ран: форма медузы (медузы) гидрозоя книдария Clytia hemisphaerica (Clytia)40. Clytia является новым модельным организмом с полностью секвенированным и аннотированным геномом41, транскриптомом 42 одноклеточной РНКseq и протоколами модификации генома (мутагенез и трансгенез)43,44,45. Книдарии являются одной из старейших сохранившихся линий с эпителиальными слоями, поэтому понимание заживления ран книдария дает представление о предковых путях, которые обеспечивали целостность эпителия. Для тех путей, которые были сохранены на протяжении всего древа жизни, Clytia предлагает захватывающую новую систему для изучения динамики эпителиальных клеток и функциональной регуляции заживления ран in vivo.
Эпителий, покрывающий верхнюю поверхность Clytia medusa (exumbrella), представляет собой монослой прозрачных плоских эпителиальных клеток шириной примерно 50 мкм и толщиной 1-2 мкм (рис. 1). Они прикреплены к ECM, называемому мезоглеей — «желе» медузы. Мезоглея композиционно сходна с ECM, обнаруженным у других животных 46,47,48, включая позвоночных, имеет базальную мембрану 40 и полностью прозрачна. Эпителиальный слой у Clytia medusa можно легко поцарапать или ранить (см. Ниже). Простота и прозрачность эпителия и ECM позволяют получать изображения клеток и их движений во время заживления с высоким разрешением. Недавно Kamran et al. подробно охарактеризовали заживление небольших ран в эпителии Clytia40. Было продемонстрировано, что заживление у Clytia происходит за счет ползания клеток на основе ламеллиподий, распространения клеток и коллективной миграции клеток, а также закрытия кошельковых нитей, что более типично для эмбриональных систем (хотя ранее наблюдалось в структурах взрослых животных, таких как роговица49). Заживление ран Clytia происходит чрезвычайно быстро, как это было замечено в других системах, у которых отсутствует воспалительная реакция40,50. Заживление зонтика Clytia полностью зависит от движений существующих эпителиальных клеток — ни одна клетка не размножается и не мигрирует через ECM к месту раны (Дополнительный фильм 1). Все эти данные свидетельствуют о том, что Clytia является полезной модельной системой для изучения заживления эпителиальных ран. Действительно, легкость визуализации эпителиальных клеток в Clytia во время заживления ран привела к открытию, что ламеллиподии эпителиальных клеток расширяются и распространяются по областям открытого ECM до тех пор, пока есть неповрежденная базальная мембрана; Если базальная мембрана повреждена, эпителиальное заживление переключается на механизм40 кисетной струны. Это была первая демонстрация механизма, лежащего в основе решения о закрытии с помощью ползания на основе ламелиподий по сравнению с закрытием кошелька, что подчеркивает важность специфических взаимодействий клеток: ECM в заживлении и наблюдении за клетками в их естественном контексте.
Ниже описаны протоколы для создания и визуализации одноклеточных микроран, небольших ран, которые закрываются в основном за счет распространения клеток, и больших ран, для закрытия которых требуется коллективная миграция клеток. Кроме того, описан протокол введения малых молекул в ECM и эпителиальные клетки, что позволяет экспериментально возмущать предполагаемые регуляторные пути заживления ран.