Выживание наиболее приспособленных — это дарвиновская идея о том, что индивидуумы, обладающие генами, наиболее приспособленными к окружающей среде, передадут эти гены последующимпоколениям. Это означает, что именно приспособленность определяет, выживут ли их гены. Эта более чем 150-летняя концепция, возможно, является наиболее важным фактором, определяющим успешный генный драйв у трансгенных комаров. Генные драйвы, или суперменделевская модель наследования эгоистичного генетического элемента, которая позволяет ему распространяться в популяциях, исследуются длягенетической борьбы с вредителями. В контексте борьбы с переносчиками эта стратегия направлена либо на замену членистоногих дикого типа (WT) на устойчивых к патогенам (модификация популяции), либо на их полную ликвидацию (подавление популяции)4. Тем не менее, трансгенные комары часто демонстрируют затраты на приспособленность (также называемые генетической нагрузкой) по сравнению со своими собратьями WT, что означает, что трансген будет потерян в популяциях, которые могут их превзойти. Таким образом, сопряжение трансгенов с системой генного драйва необходимо для компенсации любых затрат на приспособленность и продвижения трансгена через популяцию на уровнях, превышающих ожидаемые от типичного менделевского наследования.
Лабораторные исследования на видах комаров-переносчиков показали, что трансгены часто демонстрируют затраты на приспособленность 5,6,7. Например, Irvin et al. измеряли различные жизненные параметры у Aedes (Ae.) aegypti, сконструированных для экспрессии генов усиленного зеленого флуоресцентного белка (eGFP) или транспозазы под действием Drosophila actin 5C или синтетических промоторов 3XP3, и сравнивали их с диким типом штамма Orlando (тот же генетический фон, из которого они были получены)5. В частности, они обнаружили, что у всех трансгенных штаммов значительно сниженарепродуктивная приспособленность. В зависимости от трансгена, некоторые комары Anopheles (An.), экспрессирующие трансгены, которые ингибируют развитие паразита Plasmodium, также демонстрировали затраты на приспособленность. В частности, An. stephensi, экспрессирующий фосфолипазу пчелиного яда (PLA2) под действием конститутивных или индуцируемых кровяной мукой промоторов, откладывал значительно меньше яиц по сравнению с контролем6. Эти авторы также обнаружили, что трансгенные Anopheles, экспрессирующие другой трансген, тетрамер додекапептида SM1, не демонстрируют затрат на приспособленность, что привело их к выводу, что затраты на приспособленность, связанные с трансгеном, зависят, по крайней мере вероятно, частично, отэффекта производимого трансгенного белка. Действительно, затраты на приспособленность могут быть связаны с продуктами трансгенов, позиционными эффектами, нецелевыми эффектами, инсерционным мутагенезом или эффектами инбридингав штаммах, выращенных в лаборатории. Поэтому генные драйвы должны быть достаточно надежными, чтобы компенсировать эти затраты на приспособленность, вызванные трансгенами, а также предотвращать развитие вставок и делеций (инделов), которые блокируют сам драйв.
Затраты на развитие или репродуктивную приспособленность могут быть измерены в лабораторных исследованиях или исследованиях вклетке7, с оговоркой, что неизвестные факторы в полевых условиях также могут оказывать влияние. Тем не менее, контролируемые исследования приспособленности являются важным первым шагом при планировании или оценке выпуска генетически модифицированных комаров, таких как программа генного драйва, чтобы определить, сохранится ли трансгенная линия в последующих поколениях. Например, Hammond et al. оценено Гамбийские генные драйвы на основе CRISPR/Cas9, предназначенные для разрушения генов, необходимых для женской фертильности8. В ходе исследований в клетках, проводившихся в течение как минимум 25 поколений, авторы обнаружили, что комары обладали устойчивыми к генному драйву аллелями, которые блокировали расщепление, нацеленное на CRISPR, и восстанавливали женскую фертильность. Их усилия по моделированию показали, что фертильность у самок, гетерозиготных по генному драйву, оказывает наиболее значительное влияние на фиксацию генного драйва в смоделированныхусловиях. В том же ключе Ae. aegypti (штамм белого глаза Хиггса, HWE), сконструированный для экспрессии автономных кассет генного драйва под разными промоторами или в разных межгенных локусах, продемонстрировал различную скорость фиксации генного драйва в смоделированных популяциях9. Используя моделирование MGDrivE10 в сочетании с измеренными темпами образования инделов, материнскими эффектами и собранными в лаборатории данными о жизненных параметрах, авторы обнаружили, что приспособленность комаров наиболее сильно влияет на персистенцию генного драйва в смоделированных условиях. Затраты на приспособленность, которые с наибольшей вероятностью ухудшают эффективность генного драйва, обусловлены соматической экспрессией Cas9 (чрезмерной) или геном, который является мишенью, особенно у гетерозигот, а не самим внутренним драйвом 11,12,13,14,15,16,17.
Учитывая его значимость, приспособленность является важным фактором для способности трансгенной линии сохраняться в последующих поколениях, и его можно использовать в качестве индикатора любых физиологических эффектов, связанных с трансгеном. Например, побочные эффекты могут быть связаны с затратами на фитнес. В этом случае рекомендуется обратное скрещивание трансгенной линии в течение нескольких поколений. Кроме того, пересечение трансгенной линии с линией, отражающей популяцию поля, также может быть необходимо для исследования того, насколько хорошо трансгенная популяция может конкурировать в реальном мире. Для количественной оценки затрат на приспособленность и их сопоставимости в данной рукописи представлены простые протоколы измерения общих черт жизненного цикла комаров Ae. aegypti, с особым акцентом на затраты на приспособленность, связанные с трансгенами, чтобы такие исследования можно было легче воспроизвести. Протоколы включают плодовитость, фертильность, соотношение полов, жизнеспособность, время развития, вклад самцов и продолжительность жизни взрослого человека. Измерение длины и площади крыльев также было выбрано в качестве измерения физической формы, поскольку оно коррелирует с длиной грудной клетки18,19 и размерами тела, которые напрямую связаны с размером кровяной муки, плодовитостью и иммунитетом 20,21. Несмотря на то, что существует множество способов оценки приспособленности, эти параметры были выбраны, потому что они отражают репродуктивный успех, просты в измерении и часто упоминаются в литературе.