Все процедуры на животных выполнялись в соответствии с Руководством по уходу и использованию экспериментальных животных, которое изложено Канадским советом по уходу за животными. Эксперименты проводились в соответствии с протоколом, утвержденным Комитетом по уходу за животными и их использованию Университетской сети здравоохранения в Торонто, Канада.
1. Ориентир на инокуляцию опухоли
ПРИМЕЧАНИЕ: «Ориентирование» относится к процессу маркировки кожи мыши для указания места, куда следует ввести опухолевые клетки для оптимизации размещения DSFC. Эту процедуру межевания следует сделать в тот же день или за 1 день до прививки. Иммунокомпрометированный НОД. Для этой работы использовалась мышь Cg-Rag1tm1Mom Il2rgtm1Wjl/SzJ (NRG).
- Обезболите мышь, используя 5% изофлуран для индукции и 2% изофлуран для поддержания (скорость потока кислорода установлена на 0,5 л/мин). Поддерживайте температуру тела, положив мышь на грелку, завернутую в автоклавный хирургический коврик.
- Подготовьте мышь к инокуляции опухолевых клеток путем бритья с последующим нанесением лечебного крема для эпиляции. Тщательно удалите крем для эпиляции через 30-60 с с помощью влажного стерилизованного бумажного полотенца. Наносите ветеринарную смазку для глаз для предотвращения сухости.
- Продезинфицируйте кожу спиртовым тампоном.
- Аккуратно расправьте тело мыши и приподнимите кожу вдоль корешка мыши. С помощью хирургического маркера нарисуйте одну точку с одной стороны мыши в центре тентовой кожи. Точка должна располагаться примерно в центре грудного отдела позвоночника мыши.
ПРИМЕЧАНИЕ: Это будет желаемое расположение опухоли.
2. Посев опухоли
ПРИМЕЧАНИЕ: В этом исследовании мы используем клеточную линию рака поджелудочной железы человека (BxPC3). Также могут быть использованы другие клеточные линии; Тем не менее, конкретные этапы культивирования клеток могут варьироваться в зависимости от клеточных линий. Обратитесь к инструкциям, прилагаемым к ячейкам, для внесения изменений в приведенную ниже процедуру.
- Выращивайте клетки за 2 недели до инокуляции с использованием полной питательной среды (среда Roswell Park Memorial Institute 1640 с 10% фетальной бычьей сыворотки и 1% пенициллина/стрептомицина) в колбе объемом 75 мл при 37 °C и 5%CO2. Убедитесь, что клетки поддерживаются в фазе экспоненциального роста.
ПРИМЕЧАНИЕ: Количество пассажей должно быть ограничено до 10-15 раз, а колба объемом 75 мл должна содержать около 6 миллионов клеток (~70% слияния) на момент инокуляции.
- Отсадите среду и промойте клетки 5 мл фосфатно-солевого буфера (PBS) без кальция или магния.
- Добавьте 5 мл агента для диссоциации клеток и инкубируйте при 37 °C и 5%CO2 в течение 6-7 минут. Подтвердите отделение клеток с помощью микроскопа и добавьте 5 мл полной питательной среды.
ПРИМЕЧАНИЕ: Осторожное постукивание по боковой стороне колбы может помочь отсоединить ячейки.
- Переложите суспензию в центрифужную пробирку объемом 15 мл и центрифугируйте при давлении 500 × г в течение 5 минут для гранулирования клеток. Аспирируйте среду и ресуспендируйте клетки в 5 мл полной питательной среды.
- Определите концентрацию клеток и общее количество клеток с помощью гемоцитометра.
- Центрифугируйте при 500 × г в течение 5 мин для гранулирования ячеек и аспирации среды.
- Основываясь на общем количестве клеток, полученном на шаге 2.5, добавьте соответствующее количество полной питательной среды, чтобы достичь концентрации,
где n — общее количество мышей, подлежащих инокуляции. Повторно суспендируйте клетки.
ПРИМЕЧАНИЕ: Целевое количество клеток, подлежащих инокуляции на одну мышь, составляет 250 000.
- Перелейте 1,5 мл, содержащий 250 000 клеток × n, в микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл. Центрифугируйте микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл при давлении 500 × г в течение 5 минут и отаскуйте среду.
ПРИМЕЧАНИЕ: Любую избыточную суспензию клеток можно хранить в водяной бане, нагретой до 37 °C, чтобы при необходимости использовать ее для дополнительных прививок.
- Ресуспендируйте клетки в 10 μл × n PBS. Поместите клетки на лед, чтобы охладить суспензию.
ПРИМЕЧАНИЕ: После того, как клетки были охлаждены на льду, их необходимо ввести мышке в течение 20 минут.
- Добавьте 10 μL × n растворенной базальной мембраны с помощью охлажденных наконечников для пипеток. Загрузите охлажденные иглы инсулина 29-го калибра по 20 мкл каждой из клеточных суспензий. Держите шприцы на льду.
- Обезболите мышь, используя 5% изофлуран для индукции и 2% изофлуран для поддержания (скорость потока кислорода установлена на 0,5 л/мин).
- Поместите мышь на грелку, завернутую в стерилизованный хирургический коврик.
- Продезинфицируйте кожу в месте инъекции спиртовым тампоном.
- Введите иглу на ~1 см до точки ориентира и перемещайте иглу под кожу, пока она не окажется на ориентире. Расположите скошенную сторону иглы вверх и введите 20 мкл клеточной суспензии.
- Подождите 45 с, чтобы растворилизированная базальная мембрана затвердела, прежде чем извлекать шприц.
- Извлеките мышь из наркоза, подождите, пока мышь начнет передвигаться, и верните ее в клетку вместе с другими мышами.
- Ежедневно контролируйте опухоль путем пальпации и позволяйте опухоли расти в течение 4 недель или до тех пор, пока опухоль не достигнет 4-8 мм в диаметре. Усыпьте мышь при наличии любого из следующих условий: размер опухоли превышает 1,5 см, изъязвленная опухоль или любые признаки системного заболевания (вялость, потеря веса более 20% от нормальной массы тела, нарушение передвижения, неспособность регулировать температуру тела, анорексия, сгорбленная осанка, видимые признаки боли (мимика и т. д.) или обезвоживание).
3. Хирургия оконной камеры
ПРИМЕЧАНИЕ: DSFC состоит из четырех деталей, напечатанных на 3D-принтере, как показано на рисунке 1. Схемы каждой детали включены в Дополнительный файл 1. На всех деталях нанесена печать из биосовместимой прозрачной пластиковой смолы. Главный узел оконной камеры состоит из трех частей (Рисунок 1A-C) с дополнительным реперным маркерным кольцом (Рисунок 1D), которое может быть прикреплено во время МРТ или КТ.

Рисунок 1: Схема спинной оконной камеры. Главная оконная камера состоит из трех частей. Во-первых, (A) передняя рамка пришивается под кожей мыши и содержит стеклянную покровную крышку, прикрепленную с помощью клея, отверждаемого ультрафиолетовым излучением. (B) Задняя рама пришивается к передней раме с внешней стороны обшивки. (C) Опорный зажим крепится к нижней части задней рамы и удерживает DSFC в вертикальном положении на корпусе мыши. (D) Реперное маркерное кольцо содержит семь «отверстий», куда могут быть вставлены реперные маркеры. Реперное габаритное кольцо может быть прикреплено к передней раме DSFC с помощью трех опорных стоек. (E) Показан полный узел DSFC с реперным маркерным кольцом. Масштабные линейки = 1 см (A-D, внизу слева; E). Аббревиатура: DSFC = спинная оконная камера. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
- Введите 1 мг/кг 0,6 мг/мл бупренорфина с пролонгированным высвобождением подкожно за 1-3 ч до операции. Убедитесь, что размер и вес мыши достаточны для того, чтобы выдерживать DSFC без сужения грудной клетки.
- Стерилизуйте основные детали оконной камеры (рис. 1А-В) в жидком дезинфицирующем средстве высокого уровня в течение 12 мин с последующим замачиванием в изопропиловом спирте не менее чем на 5 мин.
- Обезболите мышь, используя 5% изофлуран для индукции и 2% изофлуран для поддержания (скорость потока кислорода установлена на 0,5 л/мин).
- Переложите мышь на стерильный хирургический коврик с грелкой под ним.
- Побрейте мышь и нанесите лечебный крем для эпиляции, если волосы присутствуют. Через 30-60 с удалите крем для эпиляции, используя стерильные влажные бумажные полотенца.
- Наносите ветеринарную смазку для глаз для предотвращения сухости. Наносите повторно каждые 30 минут или по мере необходимости на протяжении всей операции.
- Продезинфицируйте кожу, нанеся 7,5% повидон-йодный скраб и смов 70% изопропиловым спиртом. Дайте коже высохнуть на воздухе.
- Нанесите на кожу 10% раствор повидон-йода и дайте ей высохнуть на воздухе (рисунок 2А).
- Замените хирургический коврик на новый стерилизованный коврик.
- Убедитесь, что мышь достигла хирургической плоскости анестезии, зажав палец ноги.
- Поднимите кожу мыши вдоль позвоночника и ищите опухоль, растущую на одной из двух боковых складок кожи. Поместите заднюю рамку DSFC (рисунок 2B) на ту же сторону кожи, на которой растет опухоль, убедившись, что опухоль находится в центре кадра.
- Добавьте по три шва к каждому из трех верхних отверстий DSFC и хирургического шаблона, чтобы зафиксировать положение задней рамы (рис. 2B).
- Вставьте три иглы через заднюю раму DSFC в отверстия, содержащие прокладки (рис. 2B).
ПРИМЕЧАНИЕ: На задней раме DSFC есть три «прокладки» для поддержания зазора между передней и задней рамами, чтобы гарантировать, что кровоток не ограничивается тканями внутри DSFC. Распорки видны на рисунке 1B.
- С помощью хирургического маркера отметьте шесть точек, в которых с обеих сторон кожи будут расположены прокладки задней рамы DSFC (точки 1-6 на рисунке 2C,D).
ПРИМЕЧАНИЕ: Вставленные иглы следует использовать в качестве ориентира для точного расположения этих точек.
- Нарисуйте круг диаметром 1 см, чтобы обозначить кожу, которая будет снята на стороне, противоположной задней раме (рисунок 2D).
- Удалите иглы и заднюю рамку с кожи, разрезав швы.
- Вырежьте отверстие диаметром 1 см в коже, отмеченное на шаге 3.15, хирургическими микроножницами (рисунок 2E).
- Наложите временный шов, чтобы закрепить все части оконной камеры на коже. Введите шов через точку 4, через верхнее отверстие передней рамки DSFC, а затем через точку 1 на противоположной стороне мыши (рисунок 2F и шаги 1-2 на дополнительном рисунке S1).
- Проденьте шов через верхнюю опорную стойку задней рамы, а затем обратно через опорную стойку на задней раме, которая находится ближе всего к головке мыши (рисунок 2F).
- Введите шов через точку 2. Затем проденьте шов через соответствующее отверстие в передней раме (Рисунок 2G и шаг 3 на Дополнительном рисунке S1).
- С внутренней стороны кожи проденьте шов через точку 6, как показано на рисунке 2H , и выполните шаги 3-4 на дополнительном рисунке S1.
- Проденьте шов через точку 5, как показано на рисунке 2I , и шаг 4 на дополнительном рисунке S1.
- Проведите шов через переднюю раму, точку 3, а затем через заднюю раму, как показано на рисунке 2J и шаг 5 на дополнительном рисунке S1.
- Проведите шов обратно через точку 1, переднюю раму DSFC, а затем через точку 4, как показано на рисунке 2K и шаг 6 на дополнительном рисунке S1.
- Затяните всю сборку этим швом и проденьте переднюю раму под кожу через отверстие, созданное на шаге 3.17 (Рисунок 2L,M).
- Свяжите два конца этого шва вместе и обрежьте лишнюю веревку.
- Выполните постоянные швы через отверстия по периметру передней и задней рам DSFC. Сшите две рамы вместе, как показано на рисунке 2N и дополнительном рисунке S2.
- Разрежьте и снимите временный шов.
- Прикрепите опорный зажим к задней раме DSFC, вставив его в выступ из задней рамы (Рисунок 2O).
ПРИМЕЧАНИЕ: Изображение мыши через 2 недели после операции показано на рисунке 2P, Q. Поддерживающий зажим используется для удержания DSFC в вертикальном положении на мыши, чтобы уменьшить напряжение кожи и дискомфорт.
- Введите 5 мг/кг массы тела мелоксикам, нестероидный противовоспалительный препарат, подкожно для уменьшения боли и воспаления.
- Извлеките мышь из наркоза, подождите, пока мышь станет амбулаторной, и верните ее в клетку.
- Проверяйте мышь через 2-3 ч после операции, а затем ежедневно в течение как минимум 1 недели. Учитывайте конечную точку, достигнутую через 2 месяца после операции в оконной камере, или если выполняются какие-либо из условий, описанных на шаге 2.17 (в зависимости от того, что произойдет раньше).

Рисунок 2: Хирургическая процедура DSFC. (A) Мышь подготавливается к операции путем удаления волос и дезинфекции кожи. Подкожная опухоль обозначается стрелкой. (B) Задняя рама устанавливается в соответствующее положение и фиксируется тремя шприцами, а также временными швами, прикрепленными к черному хирургическому шаблону. (К,Г) Места расположения распорок (точки 1-6) и отверстия отмечены с обеих сторон обшивки. (E) Кожица удаляется. (Ф-К) Временный шов продевается через два слоя кожи, переднюю и заднюю рамы DSFC для фиксации всех частей вместе. (Л,М) Временный шов затягивается, а передняя рама вставляется под кожу. (N) Восемь постоянных швов накладываются для фиксации DSFC. (O) Наконец, временный шов снимается, и прикрепляется поддерживающий зажим. (,К) Одна и та же мышь показана через 2 недели после операции с обеих сторон. Аббревиатура: DSFC = спинная оконная камера. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
4. Оптическая визуализация
- Дайте мыши зажить и воспаление уменьшится в течение как минимум 5 дней после операции перед визуализацией.
- Обезболите мышь, используя 5% изофлуран для индукции и 2% изофлуран для поддержания (скорость потока кислорода установлена на 0,5 л/мин).
- Наносите ветеринарную смазку для глаз для предотвращения сухости. Наносите повторно каждые 30 минут или по мере необходимости.
- Закрепите мышь в сцене визуализации с помощью насадки для газовой анестезии, как показано на дополнительном рисунке S3.
- Получение светлопольного микроскопического изображения с широким полем зрения (>ширина 1,5 см). Убедитесь, что углубления реперного маркера на передней рамке DSFC видны.
ПРИМЕЧАНИЕ: По периметру стекла на передней раме имеется семь углублений, которые совпадают с семью ячейками реперных маркеров на креплении реперного маркерного кольца. Эти углубления видны на рисунке 1А.
- В тот же день получите микрососудистое изображение с использованием метода прижизненной микроскопии по выбору. Для этого используйте тот же столик визуализации, что и на шаге 4.4 (дополнительный рисунок S3). Извлеките мышь из наркоза, подождите, пока мышь станет амбулаторной, и верните ее в клетку.
ПРИМЕЧАНИЕ: Мы используем спекл-вариационную оптическую когерентную томографию (svOCT) для получения 3D-изображений микрососудов с высоким разрешением.
5. Магнитно-резонансная томография
- Поместите клетку для мыши под тепловую лампу, чтобы согреть мышей примерно на 15 минут, прежде чем обезболить мышь.
ПРИМЕЧАНИЕ: Согревание способствует расширению сосудов, что способствует установке катетера в хвостовую вену.
- Обезболите мышь, используя 5% изофлуран для индукции и 2% изофлуран для поддержания (скорость потока кислорода установлена на 0,5 л/мин).
- Запишите вес мыши с помощью электронных весов для правильного дозирования препарата.
ПРИМЕЧАНИЕ: Для точного измерения массы тела обязательно вычтите вес узла DSFC (0,83 г).
- Поместите мышь на ложе для МРТ и нанесите ветеринарную смазку для глаз, чтобы предотвратить сухость.
- Поддерживайте температуру тела мыши с помощью водонагревателя и насосной системы.
- Поместите подушку для мониторинга дыхания под диафрагму мыши и поддерживайте скорость 30 ± 5 вдохов/мин.
- При использовании контрастного вещества введите иглу бабочки 27 г в хвостовую вену с прикрепленной микротрубкой (30 мкл мертвого объема предварительно заполнено 1% раствором герапина и физиологического раствора). Закрепите иглу и микротрубку на ложе для МРТ с помощью хирургической ленты.
- Закрепите оконную камеру с помощью напечатанного на 3D-принтере «иммобилизационного устройства», как показано на рисунке 3.
- С помощью иглы 18 G введите ветеринарную глазную смазку в семь трубок на реперном маркере МРТ.
- Прикрепите реперный маркер к DSFC, совместив три квадратных соединителя с тремя стойками, выступающими из передней рамы (рис. 3).
- Подсоедините катетер хвостовой вены к линии подачи лекарства и шприц к автоматическому насосу. Вставьте кровать в доклинический МРТ-сканер мощностью 7 Тесла.
- Получение корональных и аксиальных Т2-взвешенных (T2w) изображений для визуализации плоскости оконной камеры (время эха TE = 25 мс; время повторения TR = 2 500 мс; поле зрения 40 x 40 мм с матрицей 64 x 64 для разрешения в плоскости 0,5 x 0,5 мм; толщина среза 0,5 мм; 25 с). Прописать сагиттальный Т2-взвешенный набор (TE = 25 мс; TR = 2 500 мс; поле зрения 32 x 32 мм с матрицей 128 x 128 для разрешения в плоскости 0,25 x 0,25 мм; не менее 11 визуализирующих срезов; толщина среза 0,5 мм; 87 с), который затем поворачивается в плоскость DSFC и реперных маркеров на основе коронального и аксиального видов, как показано на рисунке 4. Итеративно переориентируйте и расположите сагиттальный набор до тех пор, пока срезы визуализации не будут полностью выровнены таким образом, чтобы срез 5 полностью содержал тканевый сигнал в DSFC, а срез 6 не содержал тканевый сигнал в DSFC.
- Выполните микрососудистую визуализацию с использованием выбранного метода микрососудистой МРТ.
ПРИМЕЧАНИЕ: Для получения микрососудистых МРТ срезы реперных маркеров не нуждаются в визуализации, поскольку изображения получены в той же системе отсчета, что и регистрационные изображения T2w.- Получите все данные, описанные в шагах 5.12 и 5.13, в поле зрения 32 x 32 мм с матрицей 64 x 64 с разрешением 0,5 x 0,5 мм в плоскости. Для всех исследований МРТ используйте согласованные РЧ-импульсы для улучшения геометрической согласованности в сквозной плоскости (возбуждение sinc; перефокусировка sinc3; полоса пропускания 2 484 Гц).
- Для визуализации DCE:
- Если требуется измерение концентрации гадолиния, получите карты T1 с использованием изображений 2D-RARE, полученных с переменным временем повторения (TE = 7 мс; РЕДКИЙ МНОЖИТЕЛЬ = 2; TR = 350, 500, 750, 1000, 1500, 2500 и 4000 мс; 8 мин 28 с).
- Выполнение визуализации временных рядов с использованием изображений 2D RARE (TE = 8,1 мс; РЕДКИЙ МНОЖИТЕЛЬ = 2; TR = 200 мс; угол откидывания = 90°; временное разрешение = 12,8 с; 188 повторений; общее время мониторинга = 40 мин 6 с).
- Введите гадобутрол в дозе 0,75 ммоль/кг массы тела в течение 10 с через хвостовую вену после завершения пяти повторений изображений с помощью автоматизированного МР-совместимого шприцевого насоса.
- Для МРТ IVIM:
- Выполнение диффузионно-взвешенной визуализации со следующими B-значениями: 0, 20, 40, 60, 80, 100, 150, 200, 400, 600, 800, 1 000 с/мм2 с тремя средними значениями B = 0 с/мм2 и изотропной выборкой (TE = 16 мс; TR = 800 мс; длительность градиента = 2,2 мс; градиентное разделение = 9 мс; 61 мин).
ПРИМЕЧАНИЕ: Диффузионно-взвешенная визуализация получается с использованием 2D-преобразования Фурье, а не с подверженной искажениям эхо-планарной визуализации, чтобы обеспечить геометрическую согласованность сигналов опухоли и окружающих тканей в DSFC на всех наборах изображений и с изображениями прижизненной микроскопии.
- Извлеките мышь из наркоза, подождите, пока мышь станет амбулаторной, и верните ее в клетку.

Рисунок 3: Установка для МРТ-визуализации DSFC. (A) Вид сбоку и (B) сверху мыши на ложе для МРТ с закрепленным и обездвиженным DSFC. Мышь имеет катетер в хвостовой вене для введения контрастного вещества, а реперное кольцо прикреплено к передней раме DSFC. Сокращения: DSFC = спинная оконная камера; МРТ = магнитно-резонансная томография. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 4: Расположение срезов МРТ относительно реперных маркеров и оконной камеры. (A) Схема DSFC с прикреплением кольца реперных маркеров с 11 наложенными срезами МРТ. Необходимо получить несколько Т2-взвешенных изображений, чтобы убедиться, что срезы правильно выровнены с DSFC и тканью. (В,В) Правильное позиционирование 11 срезов по отношению к ткани в DSFC с разных ориентаций. (D) Срез 5 является наиболее поверхностным срезом, на котором будет проводиться анализ корреляции интермодальности. (E) Срез 6 не содержит сигнала ткани, указывающего на то, что он правильно выровнен с DSFC. (F) Наконец, 7 реперных знаков четко видны в срезе 9. Масштабные линейки = 5 мм. Буква «X» на оси указывает на то, что ось уходит внутрь страницы, а круг указывает на то, что ось выходит за пределы страницы. Сокращения: DSFC = спинная оконная камера; МРТ = магнитно-резонансная томография. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
6. Совместная регистрация МРТ с прижизненной микроскопией
- В MATLAB откройте файл Multimodal_Image_Register.m, содержащийся в Дополнительном файле 2.
- В рабочую область загрузите микрососудистое изображение (рисунок 5A), изображение светлопольной микроскопии (рисунок 5B) и данные микрососудистой МРТ (карты параметров IVIM и/или DCE MRI).
- Нажмите кнопку «Выполнить ».
- С помощью всплывающего средства поиска файлов перейдите к файлу, содержащему срезы МРТ T2w.
- Выберите до четырех срезов МРТ T2w, на которых четко отображаются реперные маркеры (рис. 5C).
- Будет отображен пользовательский интерфейс, показывающий микроскопическое изображение (Рисунок 5B) и усредненные по глубине срезы МРТ T2w (Рисунок 5C). Поместите точку на каждый из семи реперных маркеров на изображении МРТ и сопоставьте их с соответствующей точкой на микроскопическом изображении (реперные знаки углубляются по периметру стекла на передней раме DSFC), как показано зелеными точками на рисунке 5B, C.
- Закройте окно.
- Рисунок, содержащий наложенные изображения МРТ и микроскопии, поможет оценить качество регистрации между двумя наборами данных. Если регистрация адекватна, продолжайте код, набрав y, затем нажмите enter в командном окне. В противном случае повторите этот шаг, введя n в командном окне и нажав Enter.
ПРИМЕЧАНИЕ: Успешная совмещение набора данных МРТ с микроскопическим изображением означает, что семь ярких реперных маркеров из набора данных МРТ центрированы и полностью содержатся в соответствующих углублениях на передней рамке DSFC.
- Будет отображен пользовательский интерфейс, показывающий микроскопическое изображение (рисунок 5B) и набор данных микрососудистой визуализации svOCT (рисунок 5A). Выберите не менее трех микрососудистых ориентиров на микрососудистом изображении svOCT и соответствующие точки на микроскопическом изображении, как показано синими точками на рисунке 5A, B.
- Закройте окно.
- Рисунок, содержащий наложенные изображения svOCT и микроскопии, поможет оценить качество совместной регистрации между двумя наборами данных. Если регистрация адекватна, продолжайте код, набрав y, затем нажмите enter в командном окне. В противном случае повторите этот шаг, введя n в командном окне и нажав Enter.
ПРИМЕЧАНИЕ: Успешная совмещение набора данных svOCT с микроскопическим изображением означает, что сосуды из обоих наборов данных идеально накладываются друг на друга.
- Закройте окно.
- После этого появится совместно зарегистрированное микроскопическое изображение. Контурируйте опухоль на этом изображении.
- Закройте окно.
- Затем будут отображены несколько рисунков: набор микрососудистых данных svOCT (рисунок 5D), совместное микроскопическое изображение (рисунок 5E) и совместно зарегистрированные карты параметров МРТ (рисунок 5F). Сохраните карты для последующего анализа.
ПРИМЕЧАНИЕ: Отображаемые карты МРТ ограничены контуром опухоли, нарисованным пользователем (Рисунок 5F).

Рисунок 5: Мультимодальная точечная корегистрация. (A) Набор данных микрососудистых svOCT с цветовой глубиной; масштабная линейка = 1 мм. (B) Светлопольное микроскопическое изображение оконной камеры; масштабная линейка = 2 мм. (C) Среднее значение срезов МРТ T2w 8-11, показывающих семь реперных маркеров, содержащихся в реперном маркерном кольце; масштабная линейка = 5 мм. (C) Во-первых, «движущийся» набор данных МРТ T2w регистрируется совместно с «фиксированным» изображением светлопольной микроскопии с использованием введенных пользователем зеленых маркеров на обоих наборах изображений. Затем «движущееся» изображение светлопольной микроскопии и совместное зарегистрированное изображение МРТ регистрируются в «фиксированном наборе данных svOCT» с использованием синих маркеров в точках А и В. Окончательный совместно зарегистрированный набор данных включает в себя (D) svOCT, (E) изображение светлопольной микроскопии и (F) функциональную карту параметров МРТ. Черные воксели в F находятся вне опухоли и поэтому не учитываются при анализе. Для D-F масштабная линейка = 1 мм. Сокращения: svOCT = спекл-дисперсионная оптическая когерентная томография; МРТ = магнитно-резонансная томография. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.