Биолюминесцентная визуализация — это прорывной метод, который позволяет обнаружить ген отчета с помощью видимого и инфракрасного спектра электромагнитного излучения. Таким образом, нет необходимости в радиоактивных метках для отслеживания образца35. BLI подходит для моделей грызунов и других мелких видов. Он очень полезен для доклинических исследований, потому что он безопаснее и позволяет проводить несколько раундов изображения, вызывая минимальный дискомфорт у животных. Кроме того, визуализация in vivo очень гибкая благодаря возможности сочетания биолюминесценции, флуоресценции и других методов, таких как позитронно-эмиссионная томография36.
Оптическое изображение управляется оптическими физическими свойствами, такими как поглощение и рассеяние. Все ткани по-разному поглощают и рассеивают свет различных длин волн37. Одним из важнейших шагов является выбор репортерного гена без учета длины волны, излучаемой светом, производимым химической реакцией. В то время как уровень экспрессии репортерного гена может быть высоким in vitro в биолюминесцентных анализах, те же уровни экспрессии могут быть не достигнуты при переходе к условиям in vivo. В этом протоколе мы использовали оптимизированную версию кодона Photinus pyralis luciferase (PpyRE9H)38 для трипаносоматид9, которая излучает свет с длиной волны 617 нм, что является одним из наиболее подходящих для исследований in vivo 39. Длины волн длиннее 600 нм меньше поглощаются и рассеиваются эндогенными хромофорами тела, особенно гемоглобином и меланином. Таким образом, красный свет может передаваться через несколько сантиметров ткани, что позволяет фотонам достигать ПЗС-камеры даже изнутри висцеральных тканей 39,40.
Одной из проблем, вызывающих озабоченность в условиях визуализации, является отсутствие всестороннего понимания их функции и эффектов. Биннинг, метод предварительной обработки, объединяет информацию, полученную смежными детекторами, в более крупный пиксель. Этот процесс улучшает соотношение сигнал/шум, снижая фоновый шум и повышая чувствительность. Однако это снижает точность пространственного разрешения, в результате чего изображение становится пикселизированным41,42. Этот компромисс является важным фактором в вашей стратегии визуализации.
Основанное на профиле целевого продукта и профиле целевого кандидата для болезни Шагаса34, экспериментальное исследование сосредоточено на чувствительности к обнаружению T. cruzi и помогает установить, может ли новый препарат-кандидат достичь стерильного излечения (что выражается в отсутствии рецидива после нескольких раундов иммуносупрессии). Поэтому мы выполняем BLI, используя самый высокий коэффициент биннинга без перенасыщения изображения. Когда изображение перенасыщено, выполняется новое получение данных с использованием более низкого коэффициента биннинга. В ходе анализа применяется математическая коррекция к изображениям, для которых требовалось разное биннингование. Таким образом, окончательные данные должны быть представлены с использованием того же биннинга. В таблице 1 показаны различные значения, полученные при применении различных коэффициентов биннинга в одном и том же изображении и ROI.
Таблица 1: Влияние настроек биннинга на количественную оценку BLI. Количественная оценка трех ROI на изображении острой модели (d13) и хронической модели (d118), проанализированных в различных биннинг-факторах. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать эту таблицу.
В связи с текущим сценарием болезни Шагаса в клиниках, усилия по разработке лекарств направлены на полную ликвидацию паразитов (паразитологическое лечение)27,34. Таким образом, доклинический протокол in vivo включает подходы, которые преодолевают ограничения технической чувствительности BLI. Одним из подходов является лечение мышей циклофосфамидом для снижения иммунного ответа, который контролирует паразитарную нагрузку. Другая стратегия заключается в уменьшении глубины тканей и удалении слоев мышц, кожи и меха, которые препятствуют световому пути к камере. С помощью процедуры ex vivo могут быть обнаружены небольшие биолюминесцентные пятна, выявляющие очаги паразитов ниже порога in vivo BLI, как показано на рисунке 5C, in ex vivo результат мыши, обработанной Posa.
Разработка пилотного эксперимента для оценки самой модели и динамики инфекции имеет решающее значение для проведения точного эксперимента по оценке эффективности противопаразитарных препаратов. Таким образом, исследователь сможет заранее определить правильные настройки BLI и время инфекции. В исследовательском эксперименте одним из инструментов, который может быть полезен для определения настроек съемки, является «Автоэкспозиция». С помощью этого инструмента исследователь устанавливает приоритет трех настроек (Время экспозиции, Биннинг и F/Ступень) для получения наилучшего возможного изображения. В частности, исследователь должен убедиться, что изображения получены в динамическом диапазоне ПЗС-камеры, без перенасыщения или недодержки, которые могут быть проверены с помощью минимального и максимального пределов шкалы и функции автоэкспозиции (меню «Редактирование » > «Настройки » > вкладке «Получение » > вкладке «Автоэкспозиция»). В этом протоколе диафрагма камеры была установлена на максимальное значение (F/Stop: 1), а также были определены различные времена экспозиции и коэффициенты биннинга для моделей острого и хронического состояния. Эти настройки обеспечивают предсказуемость времени для одновременного выполнения различных раундов изображения. Учитывая, что репортерный метод основан на ферментативной реакции, как биораспределение субстрата в организме мыши, так и кинетика люциферазы влияют на биолюминесцентный сигнал и, таким образом, на количественную оценку инфекции (рис. 1В). Следовательно, получение изображений в различные моменты ферментативной кинетики приводит к вариабельности данных, которую невозможно учесть или скорректировать, и влияет на расчет общего потока (фотонов в секунду) или излучения (фотонов в секунду 2 см2 / стерадиан). Кроме того, инфекция T. cruzi демонстрирует динамическое пространственное позиционирование у мышей (различные участки и ткани, глубина и паразитарная нагрузка). Следовательно, установление значения количества для получения может пропустить более слабые источники сигнала (малое количество паразитов в определенном месте глубже в ткани), если другой более сильный источник сигнала соответствует определенным критериям автовоздействия.
Хитрой функцией программного обеспечения Living Image является отображение полученного изображения в автоматической цветовой шкале. Не существует возможности предварительной установки масштаба для автоматического отображения совершенно нового полученного изображения в соответствии с выбранными значениями масштаба (см. шаг протокола 6.2). Эта ситуация вынуждает исследователя вручную поочередно изменять изображения на выбранные максимальные и минимальные значения. Как следствие, неопытные и плохо обученные пользователи не имеют надлежащего считывания данных во время сеанса сбора данных, и они могут ввести данные в заблуждение или потерять важную информацию в этот момент времени. Для этого полезен пилотный эксперимент.
Один из наиболее распространенных вопросов о дизайне эксперимента с доказательством концепции заключается в том, как выбрать продолжительность лечения и дозу. Для новых химических соединений эти параметры обычно определяются активностью и селективностью соединения in vitro в сочетании с данными, полученными в результате исследований метаболизма и фармакокинетики лекарственных препаратов (DMPK) и переносимости, проведенных до тестирования эффективности in vivo. Таким образом, после идентификации соединений, способных избирательно убивать паразита внутри клеток, первые эксперименты ADME (абсорбция, распределение, метаболизм и экскреция) проводятся in vitro для оценки растворимости соединений в воде, проницаемости клеток и метаболической стабильности, а также других параметров. Если соединения демонстрируют хороший баланс свойств in vitro (обычно определяемых в профилях кандидатов-мишеней), то эти кандидаты переходят к исследованиям фармакокинетики (ФК) in vivo на здоровых мышах, которые определяют экспозицию соединения в крови (и, возможно, также в тканях) и дают общее представление о переносимости при различных уровнях дозы. 34,43. В идеале, целью оценки ФК при большинстве инфекционных заболеваний является определение возможности достижения концентраций в свободной плазме крови (с поправкой на связывание с белками плазмы), превышающих концентрации EC50/EC90 44 - эффективной концентрации, которая убивает или, по крайней мере, подавляет рост 50% или 90% паразитов, соответственно, в течение достаточно длительного периода времени. Если при определенном уровне дозы достигнута достаточная экспозиция, то этот режим может быть использован во время исследований эффективности с использованием модели BLI Шагаса. Для исследований по изменению положения препарата должны быть доступны данные по ФК in vitro и in vivo. Хорошим началом для перепрофилирования лекарств являются химические базы данных, такие как PubChem45, которые предоставляют признанные данные, которые могут быть преобразованы на мышей с использованием аллометрического шкалирования46 для оценки безопасных и нетоксичных схем лечения, подлежащих тестированию. Однако это не всегда так. Исследования фармакокинетики до сих пор остаются недооцененной областью в академической науке, и лишь немногие фармацевтические компании публикуют свои результаты по фармаколинии. Научное сообщество, занимающееся разработкой лекарственных средств, рекомендует включать оценку фармакокинетики in vivo вместе с анализами эффективности лекарств (фармакодинамика)47. Таким образом, доклиническая визуализация совместима с измерениями соединений одновременно, и этот подход повышает надежность данных.
Кроме того, на протяжении всего эксперимента контролируется обращение с мышами, их вес и состояние здоровья. Признаки токсичности и побочные эффекты, такие как сгорбление, дрожь, потеря равновесия, нежелание двигаться, нежелание есть или пить, прострация или любые другие аномалии, присутствующие в группе или при отдельных состояниях мышей, должны быть зарегистрированы и сообщены в доклинических исследованиях. Одной из целей оптической визуализации является обеспечение благополучия животных. Таким образом, гуманные конечные точки должны применяться у мышей с болевыми признаками, описанными в шкале Гримасы48. Кроме того, мышей еженедельно взвешивали во время получения BLI и, чаще, во время дозирования препарата и лечения CTX. В соответствии с правилами защиты животных, мыши, которые теряют более 20% массы тела, должны быть немедленно гуманно усыплены.
Биолюминесцентная модель T. cruzi в настоящее время является современной экспериментальной моделью для открытия и разработки новых методов лечения болезни Шагаса. Модель, которая воспроизводит ключевые особенности инфекции T. cruzi и болезни Шагаса49, что позволяет проводить мониторинг паразитемии в режиме реального времени и дифференцировать соединения с различными профилями эффективности, связанными с известными способами действия. BLI — это метод, который повышает ассертивность при выявлении инфицированных тканей. Это позволяет использовать точный выбор инфицированных тканей в широком спектре подходов, включая все классические методы, уже примененные в исследовании T. cruzi 50,51. Кроме того, это позволяет исследователям изучать передовые технологии и разрабатывать новые33. Кроме того, BLI обеспечивает улучшение благополучия животных и более рациональное использование в соответствии с принципами 3R10,35, все сразу.
Несколько исследовательских групп, специализирующихся на забытых тропических болезнях, работают в странах, где нет устройств визуализации in vivo. Чтобы преодолеть сложившийся сценарий, новые международные сети, такие как Global BioImaging и связанные с ними консорциумы, продвигают действия по обеспечению открытого доступа к основным объектам визуализации и улучшению подготовки персонала и ученых в области визуализации52,53. Эти инициативы, наряду с дружественными пользовательскими протоколами, подобными этому, могут обеспечить условия демократизации передовых технологий для всех исследователей. Реализация этого метода в доклинической разработке лекарств обеспечила надежное считывание эффективности и прогностическую ценность клинического исхода, способствуя разработке лекарств от болезни Шагаса.