Оценка конечного выхода зависит от уровня чистоты и количества выделенных клеток и может быть определена с помощью ОТ-кПЦР, подсчета клеток и количественного определения белка. Чистота выделенных магнитных клеток гипоталамуса была подтверждена анализом экспрессии генов CD11b, C1qa, Gad1 и GFAP с помощью ОТ-кПЦР (рис. 1). CD11b и C1qa преимущественно экспрессируются микроглией в равновесном состоянии, ЦНС16 и Gad1 и GFAP служат нейронным и астроцитарным маркером соответственно. Общая кДНК из одного гипоталамуса варьировала от 55 до 98 нг. Примечательно, что только положительная фракция проявляла экспрессию CD11b и C1qa, что указывает на отсутствие какой-либо потенциальной потери клеток микроглии в отрицательной фракции. Грунтовки приведены в таблице 2.
Кроме того, незначительные уровни нейрональных и астроцитарных маркеров гарантируют, что подавляющее большинство выделенных клеток являются микроглией, поскольку резидентные макрофаги и моноциты составляют лишь 10% от общего объема иммунных клеток здорового мозга10,11. Эти результаты доказывают эффективность магнитного отбора и открывают путь к применению ОТ-кПЦР для оценки уровней экспрессии всех генов, представляющих интерес, в свежеотсортированных микроглиальных клетках гипоталамуса. Аналогичным образом, анализ РНК-секвенирования может быть выполнен на гипоталамо-сортированной микроглии, чтобы получить всестороннее представление об их транскриптоме.
Количество выделенных клеток было определено путем подсчета клеток и составило ~15 000 клеток на гипоталамус (упомянуто в шаге протокола 4.10). Кроме того, была количественно определена концентрация белка в отсортированной микроглии, что выявило среднюю концентрацию 0,5 мкг/мкл в клетках CD11b+ , выделенных из двух объединенных гипоталамов (рис. 2). Эти знания позволяют проводить различные анализы в зависимости от минимального порога белка. Кроме того, объединяя больше гипоталами, можно достичь более высокой концентрации, расширяя область анализа потенциала. Белки, извлеченные из микроглии гипоталамуса, облегчают использование различных методов, включая иммунологические анализы AlphaLISA и анализы активности киназы.
Кроме того, описанный протокол позволяет исследователям проводить несколько анализов ex vivo , что позволяет исследовать активность микроглии и ее роль в гипоталамусе как в физиологическом, так и в патологическом контексте. Количественная оценка продукции АФК представляет собой важнейший аспект микроглиального иммунного ответа17. Таким образом, после разделения микроглия может быть обработана коммерчески доступными реагентами, которые позволяют обнаруживать АФК в живых клетках за счет проявления повышенного флуоресцентного сигнала при окислении. Микроглии, магнитно выделенной из трех объединенных гипоталамов, достаточно для обнаружения АФК с помощью FACS, как показано на рисунке 3A, хотя наши результаты показывают довольно высокую вариабельность продукции клеток АФК среди проанализированных нами условий. Примечательно, что с помощью вышеупомянутого коммерческого набора (см. Таблицу материалов) мы также смогли оценить жизнеспособность отсортированных клеток Cd11b+ благодаря окрашиванию мертвых клеток, которое демонстрирует увеличение флуоресценции при связывании ДНК. В частности, наши данные показывают, что 99% клеток являются живыми (рис. 3B). Для различения живых и мертвых клеток, а также окислительно стрессованных и нестрессовых клеток использовались стратегии стробирования на основе их флуоресцентных свойств.
Еще одной важной особенностью микроглиальной активности является фагоцитоз, динамичный и строго регулируемый процесс, который играет ключевую роль в иммунном надзоре, восстановлении тканей и общем гомеостазе центральнойнервной системы. Примечательно, что клетки Cd11b+ , отсортированные с помощью магнитно-связанных гранул, могут быть культивированы в течение 24 ч, а затем инкубированы с флуоресцентными латексными микрогранулами в различные моменты времени для оценки изменений в фагоцитарной активности в различных условиях, либо с помощью FACS, либо с помощью флуоресцентной микроскопии. Свежеотсортированная микроглия также может подвергаться воздействию флуоресцентных шариков или любого типа pHrodo-связанных частиц (например, синаптосом) непосредственно внутри пробирки, а фагоцитоз может быть оценен с помощью анализа FACS.
В частности, мы инкубировали непосредственно в пробирке, содержащей отсортированную клеточную суспензию, микроглию, выделенную из двух объединенных гипоталамов, или целый мозг с флуоресцентными латексными шариками. Микроглия, которая фагоцитировала по крайней мере одну флуоресцентную бусину, может быть отличина от нефагоцитарных клеток с помощью проточной цитометрии, поскольку фагоцитарная микроглия будет демонстрировать усиленную флуоресценцию. Для гейтинга использовали отрицательные контрольные составы, не инкубированные с бусинами. В обоих наших экспериментальных условиях (мыши, которых кормили чау-чау в сравнении с пищей с высоким содержанием жиров (HFD)) мы наблюдали очень низкий процент фагоцитарной микроглии (рис. 4A). Тем не менее, этот результат показан здесь, чтобы продемонстрировать эффективность этого метода, который, что примечательно, позволяет также дифференцировать клетки, которые фагоцитировали 1 бусину, 2 бусины, 3 бусины и так далее (рис. 4B). Наконец, все омиксные подходы могут быть применены к изолированной гипоталамической микроглии. Мы предлагаем объединить три гипоталамуса, чтобы иметь достаточное количество клеток для выполнения этих анализов.

Рисунок 1: Оценка чистоты клеток CD11b+ методом ОТ-кПЦР. Количественное определение в отсортированных клетках экспрессии мРНК интегрина CD11b, субкомпонента комплемента C1q субъединицы A C1q, декарбоксилазы глутаминовой кислоты Gad1 и глиального фибриллярного кислого белка GFAP нормализовано по уровням мРНК генов хозяйствования Eef1a1 и Sdha. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 2: Количественное определение белка из клеток гипоталамуса после сортировки клеток. Количественная оценка концентрации белка в CD11b+ и CD11b-клетках. Как CD11b+, так и CD11b-клетки лизировали в 20 мкл лизисисного буфера. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 3: Обнаружение АФК в микроглиальных живых клетках. Количественное определение (А) клеток, подвергшихся окислительному стрессу, и (В) живых клеток в популяции отсортированных Cd11b+ клеток с помощью графиков относительного контура FACS. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 4: Количественная оценка фагоцитарной активности микроглии. (A) Количественная оценка фагоцитарных клеток в клетках Cd11b+ , отсортированных из двух гипоталамов или одного мозга, с помощью графика относительного контура FACS. (B) Процентное соотношение фагоцитарных клеток в соответствии с количеством фагоцитированных гранул с помощью графика относительного контура FACS. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
| Ферментный микс 2 | | |
| Фермент А | Буфер Y | Фермент Р | |
| 10 μл | 20 μл | 50 μл | |
| Д-ПБС | Решение для удаления мусора | Наложение D-PBS |
| Структура 15-100 мг | 1000 мкл | 450 мкл | 2 мл |
Таблица 1: Приготовление диссоциационной смеси (объемы относятся к одному образцу) и градиентных слоев.
| Гены | Белок | Вперёд | Обратный |
| Итгам | Интегрин альфа М (CD11b) | CTCATCACTGCTGGCCTATACAA | GCAGCTTCATTCATCATGTCCTT |
| Сдха | Сукцинатдегидрогеназный комплекс флавопротеин субъединица А | CCCTCTCATATGTGGACATCAA | CAAGGTCTTGTCGATAACAGGT |
| С1КА | Компонент комплемента 1, субкомпонент q, альфа-полипептид | CGAGGTGTGGATCGAAAAGG | GAAGATGCTGTCGGCTTCAGT |
| Гад1 | глутаматдекарбоксилаза 1 | GACCAATCTCTGTGACTCGCTTAG | CTGGTCAGTGTATCGGAGGTCTT |
| Gfap | глиальный фибриллярный кислый белок | AGGTCCGCTTCCTGGAACA | GGGCTCCTTGGCTCGAA |
Таблица 2: Последовательности праймеров ОТ-кПЦР.
| Проточная цитометрия сортировки клеток (FACS) | Магнитно-активируемая сортировка клеток (MACS) |
| Биохимические антитела с флуоресцентной меткой | Магнитные шарики, конъюгированные с антителами |
| Дифференцировка за пределами маркеров клеточной поверхности | Дифференцировка только по маркерам клеточной поверхности |
| Значительный начальный урожай | Скромная начальная доходность |
| Медленнее, чем MACS, для одновременной обработки большого количества образцов | Быстрее, чем FACS, для одновременной обработки большого количества образцов |
| Менее щадящий, чем MACS | Мягче, чем FACS |
Таблица 3: Представление характеристик и ограничений FACS и MACS