Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Колонизация мышиным pks+ Escherichia coli при невоспалительных условиях

353 просмотров

⸱

DOI:

10.3791/70204

⸱

10 марта 2026 г.

 , 
1Nutrition and Microbiome Laboratory, Institut du Cancer de Montréal, Centre de recherche du Centre hospitalier de l’Université de Montréal (CRCHUM), 2Department of Medicine, Faculty of Medicine, Université de Montréal

В этой статье

Краткое содержание

Этот протокол описывает необходимые шаги для колонизации мышей с pks+ Escherichia coli в невоспалительных условиях, а также неинвазивные методы валидации колонизации и оценки расширения pks+ E. coli в фекалиях.

Аннотация

pks+ Escherichia coli всё чаще связана с развитием колоректального рака (CRC), особенно среди быстро растущей группы молодых пациентов с ранним началом КРК. Штаммы pks+ E. coli производят генотоксин колибактин, известный тем, что вызывает разрывы двухцепочечной ДНК и мутации в путях пролиферации и дифференцировки клеток, связанных с CRC. В этой статье подробно описан метод колонизации pks+ E. coli у мышей в невоспалительных условиях — от приготовления бактериального инокулума до подтверждения колонизации. После ночной инкубации штам pks+ E . coli E. coli NC101 вводится мышам с антибиотиками через оральный гаваж. Колонизация в кале оценивается путем количественного определения количества грамотрицательных колониообразующих единиц (CFU), ферментирующих лактозу, а также количественной амплификации ПЦР. С помощью этого протокола было показано, что после успешной колонизации мышей C57BL/6 E. coli NC101 добавка пищевыми волокнами инулином способствовала росту pks+ E. coli, что отражается в увеличении восстановления CFU, большей концентрации семейства Enterobacteriaceae и повышении уровня clbP Джин. В итоге эта модель позволяет изучать профилактические и терапевтические методы, направленные на ключевой патобионт, участвующий в разработке CRC.

Введение

Известно, что микробиота кишечника играет значительную роль в состоянии здоровья и заболеваниях хозяина, включая микробный дисбиоз кишечника, то есть чрезмерный рост некоторых потенциально патогенных бактерий (патобионтов), что является отличительной чертой ряда заболеваний, включая сердечно-сосудистые заболевания, воспалительные заболевания кишечника (ВЗК) ирак 1. pks+ Escherichia coli — это патобионт, который обогащается образцами тканей толстой кишки у пациентов сВЗК 2 и колоректальным раком (CRC)3 по сравнению со здоровыми пациентами. Проопухологенная активность pks+ E. coli связана с экспрессией кластера гена поликетидсинтазы (pks) и выработкой генотоксинаколибактина 4. Колибактин транслокационируется в ядро эпителиальных клеток толстой кишки, что приводит к образованию двухцепочечныхразрывов ДНК 5 и мутациям в ключевых путях, связанных с CRC,6. Колонизация pks+ E. coli способствует возникновениюопухоли 7 ипрогрессированию 3 в доклинических моделях колитно-ассоциированного CRC (CAC). В последнее время мутагенез, индуцированный колибактином, был связан с ранним началом CRC 8,9. Частота раннего начала КРК, возникающая у лиц младше 50 лет, растёт в последние десятилетия, с потенциалом обратить текущее общее снижение частотыКРК 9.

Роль pks+ E. coli в развитии CRC, а также в других аспектах здоровья хозяина, опосредованных микробиотой, продолжает выясняться. Кроме того, показано, что на экспрессию гена pks влияет несколько факторов, включаявоспаление 10, концентрации люминальногожелеза 11 и диетическиефакторы 12,13, что открывает двери для вмешательств, направленных на микробиоту. Здесь описан метод колонизации кишечника pks+ E. coli с помощью орального гаважа у мышей с использованием мышиного штамма штамма pks+ E. coli NC101 (E. coli NC101). Другие модели оценивали влияние E. coli NC101 на воспаление и канцерогенез у мышей без микробов (GF), моноколонизированных с помощью орального гаважа и ректальногомазка 3, в генетически чувствительных (IL-10-/-) моделяхколита 3,14, а также в химически индуцированных моделях воспаления толстой кишки и нарушения барьеракишечника 15. Однако экономически эффективная колонизация pks+ E. coli также может быть получена в невоспалительных условиях у мышей без специфических патогенов (SPF), предварительно обработанных антибиотиками, чтобы создать нишу для колонизации ирасширения 14,16,17. Также представлены различные методы обнаружения и количественной оценки pks+ E. coli в фекалиях мышей, включая количественную амплификацию гена clbP с помощью ПЦР (qPCR), qPCR-оценку численности семейства Enterobacteriaceae и восстановление колониообразующих единиц (CFU) на агарных средах МакКонки, специфичных для грамотрицательных бактерий, ферментирующих лактозу. Эти методы могут использоваться взаимозаменяемо или совместно для подтверждения наличия pks+ E. coli и выработки колибактина в целях валидации или для оценки различий в расширении pks+ E. coli в ответ на вмешательства, направленные на микробиоту.

Здесь этот протокол используется для оценки влияния пищевого инулина на колонизацию и расширение pks+ E. coli с помощью qPCR и восстановления CFU. Инулин — пребиотик, который способствует росту полезных видов Bifidobacterium и Lactobacillus в кишечнике, а также увеличивает выработку короткоцепочечных жирных кислот, играющих важную роль в гомеостазекишечника 18. Однако было показано, что инулин также способствует росту pks+ E. coli и выработке колибактина, что приводит к увеличению опухологенеза в модели аденоматозного полипоза coli (Apc)Min/+ CRC, леченной с помощью DSS. В данном эксперименте оценивается расширение pks+ E. coli в ответ на пищевой инулин в модели мышей без воспаления или нарушения барьера кишечника.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

Все процедуры проводились в соответствии с руководящими принципами Канадского совета по уходу за животными после утверждения Институционального комитета по уходу за животными Центра исследований больницы Университета Монреаля (CRCHUM). Семинедельные мыши были получены из коммерческого источника и акклиматизированы в течение недели перед началом эксперимента. Схематическое представление этого метода представлено на рисунке 1. Детали животных, реагентов и оборудования, использованных в этом исследовании, приведены в Таблице материалов.

figure-protocol-1
Рисунок 1: Схема подготовки и колонизации pks+ E.coli . День (D)-4: За четыре дня до гаваджа начните принимать антибиотики мышам. D-1: за 24 часа до гава, удалите антибиотики. Подготовьте культуру pks+ E. coli для ночной инкубации. D0: Подготовьте бактериальный инокулум pks+ E. coli . Введите мышам pks+ E. coli или средство для контроля средств (физиологический раствор) перорально после подготовки инокулума. D7+ Собирать фекалии мышей для обнаружения и количественной оценки колонизации pks+ E. coli . Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы увидеть увеличенную версию этой фигуры.

1. Лечение антибиотиками

  1. Разбавьте ампициллин, колистин и стрептомицин в стерильной питьевой воде до конечной концентрации 1 мг/мл для ампициллина, 1 мг/мл для колистина и 5 мг/мл для стрептомицина.
  2. Разрешите ad libitum доступ к антибиотикам в питьевой воде в течение 3 дней.
  3. Удалите антибиотики и восстановите доступ к стерильной воде на 24-часовой период промывки перед затаыванием вакциной E. coli NC101.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Для каждого эксперимента нужно готовить свежим раствором антибиотика. Необходимо контролировать достаточное потребление антибиотика. При необходимости в воду можно добавить подсластитель.

2. Подготовка инокулюма E. coli NC101 (до n = 12 мышей)

ПРИМЕЧАНИЕ: Шаги 2.1-2.8 следует выполнять с использованием асептической техники.

  1. Приготовьте и автоклавайте бульон Лизогенезы (LB).
  2. Разведите E. coli NC101 из глицерилового запаса на пластину LB агара с помощью стерильной инокуляционной петли. Инкубировать ночь при 37 °C.
  3. Инокулировать 5 мл стерильного бульона LB в культурной трубке с одной колонией из пластины ЛБ агара с помощью инокуляционной петли. Инкубировать ночью при 37 °C в настольной инкубационной шейкере при 150 об/мин.
  4. Центрифугуйте культивационную трубку при 1500 г на 5 минут при комнатной температуре.
  5. Удалите и отбрасывайте супернатант, избегая бактериальных гранул, которые будут выглядеть в виде белоснежного отложения у основания трубки.
  6. Суспензировать бактериальную гранулу в 5 мл 0,9% стерильного физиологического раствора.
  7. Мойте, повторяя шаги с 4 по 6.
  8. Измерьте оптическую плотность на 600 нм (OD 600) с помощью ячеточного плотномера и отрегулируйтеOD 600 до 0,625 (~1 x 108 CFU/мышь) с помощью стерильного физиологического раствора.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Чтобы избежать бактериального загрязнения бульона на этапе 3, инкубировать отдельную трубку 2-3 мл стерильного бульона LB на ночь. После ночной инкубации бульон должен оставаться прозрачным, что указывает на отсутствие бактериального загрязнения. Если начальныйOD 600 меньше 0,625, повторите шаги с 4 по 6, используя меньший объём для повторного взвешивания гранулы. Для обеспечения точной дозировки E. coli NC101 последовательное разбавление жидкости для гаважа следует покрыть и культурировать на ночь. Количество CFU для каждого разбавления может использоваться для оценки начального количества CFU в бактериальной суспензии.

3. Оральная индукция E. coli NC101

  1. Аккуратно перемешайте бактериальный инокулум для равномерного распределения бактерий.
  2. Поставьте иглу для гаваджа на шприц объемом 1 мл и наполните 0,2 мл бактериального инокулума, удаляя пузырьки воздуха.
  3. Вынимите мышь из клетки и аккуратно, но твёрдо сжимайте её, обхватывая кожу от ушей до лопаток, используя подушечку большого пальца и боковую часть указательного пальца. Закрепите хвост средним или безымянным пальцем той же руки.
  4. Держите мышь в вертикальном положении и вводите иглу для гаважа сбоку рта. Скользите кончиком иглы вдоль нёба рта и в пищевод и желудок, аккуратно отодвинув голову мыши назад, чтобы удлинить шею. Если ощущается сопротивление, уберите иглу для вставки. При необходимости заново сжимайте мышь перед повторной попыткой.
  5. Медленно вводите бактериальный инокулум (0,2 мл) и вытягивайте иглу, следуя тому же углу, что и при введении.
  6. Верните мышь в клетку и приступайте к оставшимся мышам.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Бактериальный инокулум следует вводить как можно скорее после подготовки. Контрольные мыши должны получать 0,2 мл 0,9% стерильного физиологического раствора (транспортного средства). Соответствующая длина, габарит и диаметр шарика иглы должны определяться исходя из среднего веса мышей в каждом эксперименте. Проверьте дыхание и активность мыши через 5 минут и до выхода из приведения. Если наблюдается затруднённое дыхание/дыхательная недостаточность, усыпьте мышь согласно утверждённому протоколу. Оральная гаважа должна выполняться только квалифицированным научным сотрудником. Неправильное выполнение орального гаважа может привести к серьёзным осложнениям или смерти из-за перфорации пищевода или инъекции жидкости в лёгкие. При выполнении опытных научных сотрудников смертность при этой процедуре не ожидается. Мыши, используемые для этого эксперимента, должны содержаться в условиях SPF. Для предотвращения загрязнения между клетками следует использовать отдельные вентиляционные клетки, а мышей — в биологическом защитном шкафе. Перед открытием каждой клетки руки и наружная часть крышки следует протереть соответствующим дезинфицирующим средством (например, ускоренной перекисью водорода). Требования к СИЗ для управления мышами, используемые в этом протоколе, включают халат (одноразовый или многоразовый) и перчатки. Дополнительные средства индивидуальной защиты могут потребоваться в учреждении хозяев животных. Все манипуляции с контрольными мышами должны выполняться сначала.

4. Сбор образцов фекалий

  1. Соберите фекальную гранулу каждой мыши в микроцентрифугную трубку объемом 1,5 мл, сжимая мышь загривком, как описано в шаге 3.3. Мышь должна немедленно испражняться. Или положите мышь в чистую пустую клетку и подождите до 30 минут, пока произойдёт дефект.
  2. Заморозьте образец, поместив пробирку в жидкий азот. Храните образец при -80 °C до дальнейшего анализа.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Обнаружение clbA или количественная оценка clbP в кале с помощью ПЦР в реальном времени следует провести до начала эксперимента, чтобы убедиться, что мыши не колонизированы pks+ E. coli. Для поддержания колонизации дольше одной недели может потребоваться повторяющаяся бактериальная врождённость без предварительного введения антибиотиков (шаги 2.1-3.6), в зависимости от экспериментальных условий. Количественная оценка E. coli NC101 в кале с помощью восстановления КФУ или ПЦР в реальном времени следует проводить как минимум раз в неделю на протяжении всего эксперимента при первом внедрении этого протокола для оптимизации частоты дозирования.

5. Экстракция ДНК из фекальных бактерий

  1. Извлекайте бактериальную ДНК из собранных образцов кала с помощью набора для экстракции ДНК согласно инструкциям производителя.
  2. Измерьте концентрацию ДНК с помощью спектрофотометра и отрегулируйте концентрацию ДНК на 5 нг/мкл.

6. Подтверждение колонизации путем обнаружения генов clbA и E. coli 16S

  1. Проведите одновременную амплификацию генов рибосомной РНК (рРНК) clbA и E. coli 16S (дополнительная таблица 1) с помощью ПЦР с использованием соответствующего мастер-микса и инструмента для ПЦР согласно инструкциям производителя.
  2. Визуализировать гены clbA и E. coli 16S у мышей, колонизированных E. coli NC101, с помощью агарозного гелевого электрофореза, как было описаноранее 19. Неколонизированные мыши должны не иметь полосу clbA .

7. Количественная оценка E. coli NC101 методом восстановления с помощью CFU

ПРИМЕЧАНИЕ: Выполните шаги 7.1-7.7 с использованием асептической техники.

  1. Взвешивайте пустую микроцентрифугную трубку объёмом 1,5 мл.
  2. Добавьте примерно 20 мг кала в микроцентрифуговую пробирку объёмом 1,5 мл и запишите вес пробирки с добавленным образцом.
  3. Добавьте 200 мкл 0,9% стерильного физиологического раствора в каждую трубку.
  4. Подождите 10-15 минут, пока стул размягчит при комнатной температуре, и закрутите каждую трубку по 5 минут на максимальной скорости, чтобы получить однородную подвеску. Будут видны мелкие частицы неперевариваемой пищи.
  5. Перенесите 100 мкл каждой суспензии в агарную пластину МакКонки и равномерно распределите гомогенат с помощью L-образного распределителя.
  6. Инкубировать тарелки ночью при 37 °C.
  7. Посчитайте количество розовых колоний и нормализуйте по массе каждой фекалийной гранулы и объёму покрытия.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Агар МакКонки выбирает грамотрицательные бактерии. Кроме того, бактерии, способные ферментировать лактозу (например , E. coli), образуют розовые колонии, а те, кто не может — бесцветные или жёлтые колонии. Для целей этого протокола должны учитываться только розовые колонии. Если количество колонии слишком высокое для подсчёта, можно провести серийное разбавление исходного гомогената с использованием 0,9% стерильного физиологического раствора. Учитывайте коэффициент разбавления при расчёте количества колоний на образец.
    Вес гранулы = вес пробирки микроцентрифуги с образцом гранулы — вес пустой пробирки микроцентрифуги.

8. Количественная оценка гена clbP

  1. Проведите амплификацию генов clbP и универсального рРНК 16S (дополнительная таблица 1) с помощью количественной ПЦР с использованием соответствующего мастер-микса и инструмента для проведения ПЦР в реальном времени согласно инструкциям производителя.

9. Количественная оценка Enterobacteriaceae

  1. Выполнить амплификацию генов Enterobacteriaceae и универсальной РНК 16S (дополнительно) с помощью количественной ПЦР с использованием соответствующего мастер-микса и инструмента для ПЦР в реальном времени.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Амплификация и визуализация генов clbA и E. coli 16S в фекалиях в конечной точке с помощью ПЦР и электрофореза с помощью гель-электрофореза показали, что хотя оба гена были видны у мышей, колонизированных E. coli NC101, у контрольных мышей был виден только ген E. coli 16S, что подтверждает, что E . coli NC101 отсутствует (рисунок 2B).

Как иожидалось 15, колонизир...

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Проканцерогенные эффекты pks+E. coli, производящих колибактин, недавно связывают как с ростом ранней стадииCRC-9, так и с внедрением «западной»диеты 12 — факторов, которые продолжат формировать тенденции CRC в ближайшие десятилетия. Большинство моделей колонизации pks+ E. coli представлены в контексте рака, ассоциированного с колитом, что не позволяет охарактеризовать pks+ E. coli в невоспалительных условиях. Этот...

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

У авторов нет конфликта интересов, которые можно было бы заявлять.

Благодарности

Эта работа была профинансирована грантом Канадских институтов исследований здравоохранения [CIHR, грант CSV-198232]. Мы благодарим животноводческое учреждение CRCHUM. Фигурки создавались с помощью BioRender.com.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
0,9% стерильного физиологического раствораБакстерJF7634
10% индивидуальная диета с инулиномТекладTD.240286Репрезентативные результаты
50 ppm FeS04 (без клетчатки) индивидуальная диетаТекладTD.120515Репрезентативные результаты
Самки B6 в возрасте 8-12 недельЛаборатории Чарльз-РиверC57BL/6Репрезентативные результаты 
Ампициллин соль натрия Wisent Inc400-110 XG
Настольная центрифугаФишер Сайентифик75004381
Измеритель плотности ячеекBiochrom80-2116-30
Культивная трубка, 13 млСарштедт62.515.006
EcNC101Н/ДН/ДПодарен доктором Кристианом Джобином, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл;
Стрелка с гаваджем, 38 мм x 22 GГарвардский аппарат Канады34-024Больше недоступен — потенциальная альтернатива доступна в Instech Labs (FTP-22-38) 
Инкубационный орбитальный шейкерVWR980153
Инокуляционная петляФишер Сайентифик22-363-595
L-образный распредительФишер Сайентифик14-665-230
Лизогенический бульон Wisent Inc800-060 LGДобавьте 35 г порошка LB 1 л воды. Автоклав перед использованием.
Лизогенный бульон агар Wisent Inc800-011 LGДобавьте 35 г порошка LB 1 л воды. Автоклав перед использованием.
Агар МакКонкиБектон Дикинсон211387Добавьте 50 г порошка MacConkey в 1 литр воды. Автоклав перед использованием. 
Набор для экстракции микробной ДНКЦягэн47016
Микробиологический инкубаторФишер Сайентифик150152633
Микроцентрифугальная трубка, 1,5 мл UltiDent Scientific73-M150-C
ПЦР-ротор — генные ленточные трубки UltiDent Scientific73-V100-RG
Чашка ПетриСарштедт82.1472.001
Реальный ПЦР SYBR Green Master MixThermoFisher A25742
Термический циклер ПЦР в реальном времениИсследования КорбеттаRG-3000A
Трубка с крышкой, 15 млСарштедт62.554.502
натрий колистаймта Фрезениус КабиC309306
Соль сульфата стрептомицинаМиллипор СигмаS9137
Туберкулиновая скользящая трубка, 1 млБектон Дикинсон309659
ВихрьФишер Сайентифик12-812

Ссылки

  1. Hou, K., et al. Microbiota in health and diseases. Signal Transduct Target Ther. 7 (1), 135(2022).
  2. Martin, H. M., et al. Enhanced Escherichia coli adherence and invasion in Crohn's disease and colon cancer. Gastroenterology. 127 (1), 80-93 (2004).
  3. Arthur, J. C., et al. Intestinal Inflammation targets cancer-inducing activity of the microbiota. Science. 338 (6103), 120-123 (2012).
  4. Nougayrède, J. -P., et al. Escherichia coli Induces DNA double-strand breaks in eukaryotic cells. Science. 313 (5788), 848-851 (2006).
  5. Dziubańska-Kusibab, P. J., et al. Colibactin DNA-damage signature indicates mutational impact in colorectal cancer. Nat Med. 26 (7), 1063-1069 (2020).
  6. Iftekhar, A., et al. Genomic aberrations after short-term exposure to colibactin-producing E. coli transform primary colon epithelial cells. Nature Commun. 12 (1), 1003(2021).
  7. Yang, Y., Gharaibeh, R. Z., Newsome, R. C., Jobin, C. Amending microbiota by targeting intestinal inflammation with TNF blockade attenuates development of colorectal cancer. Nat Cancer. 1 (7), 723-734 (2020).
  8. Rosendahl Huber, A., et al. Improved detection of colibactin-induced mutations by genotoxic E. coli in organoids and colorectal cancer. Cancer Cell. 42 (3), 487-496.e6 (2024).
  9. Díaz-Gay, M., et al. Geographic and age variations in mutational processes in colorectal cancer. Nature. 643 (8070), 230-240 (2025).
  10. Arthur, J. C., et al. Microbial genomic analysis reveals the essential role of inflammation in bacteria-induced colorectal cancer. Nat Commun. 5 (1), 4724(2014).
  11. Tronnet, S., et al. High iron supply inhibits the synthesis of the genotoxin colibactin by pathogenic Escherichia coli through a non-canonical Fur/RyhB-mediated pathway. Pathog Dis. 75 (5), ftx066(2017).
  12. Arima, K., et al. Western-style diet, pks Island-carrying Escherichia coli, and colorectal cancer: Analyses from two large prospective cohort studies. Gastroenterology. 163 (4), 862-874 (2022).
  13. Oliero, M., et al. Oligosaccharides increase the genotoxic effect of colibactin produced by pks+ Escherichia coli strains. BMC Cancer. 21 (1), 172(2021).
  14. Thakur, B. K., et al. Dietary fibre counters the oncogenic potential of colibactin-producing Escherichia coli in colorectal cancer. Nat Microbiol. 10 (4), 855-870 (2025).
  15. Oliero, M., et al. Inulin impacts tumorigenesis promotion by colibactin-producing Escherichia coli in ApcMin/+ mice. Front Microbiol. 14, 067505(2023).
  16. Jans, M., et al. Colibactin-driven colon cancer requires adhesin-mediated epithelial binding. Nature. 635 (8038), 472-480 (2024).
  17. Devaux, A., et al. L-serine promotes pro-carcinogenic effects of colibactin-producing E. coli. Gut Microbes. 17 (1), 2515480(2025).
  18. Li, L. L., et al. Inulin with different degrees of polymerization protects against diet-induced endotoxemia and inflammation in association with gut microbiota regulation in mice. Sci Rep. 10 (1), 978(2020).
  19. Lee, P. Y., Costumbrado, J., Hsu, C. Y., Kim, Y. H. Agarose gel electrophoresis for the separation of DNA fragments. J Vis Exp. (62), e3923(2012).
  20. Oliero, M., et al. Putrescine supplementation limits the expansion of pks+ Escherichia coli and tumor development in the colon. Cancer Res Commun. 4 (7), 1777-1792 (2024).
  21. Jans, M., Vereecke, L. Physiological drivers of pks+ E. coli in colorectal cancer. Trends Microbiol. , (2025).
  22. Lavelle, A., et al. Baseline microbiota composition modulates antibiotic-mediated effects on the gut microbiota and host. Microbiome. 7 (1), 111(2019).
  23. Russell, A., et al. Reduced housing density improves statistical power of murine gut microbiota studies. Cell Rep. 39 (6), 110783(2022).
  24. Turner, P. V., Brabb, T., Pekow, C., Vasbinder, M. A. Administration of substances to laboratory animals: Routes of administration and factors to consider. J Am Assoc Lab Anim Sci. 50 (5), 600-613 (2011).
  25. Harnack, C., et al. Short-term mucosal disruption enables colibactin-producing E. coli to cause long-term perturbation of colonic homeostasis. Gut Microbes. 15 (1), 2233689(2023).
  26. Gurbatri, C. R., et al. Engineering tumor-colonizing E. coli Nissle 1917 for detection and treatment of colorectal neoplasia. Nat Commun. 15 (1), 646(2024).
  27. Yang, S., et al. Surface expression of antitoxin on engineered bacteria neutralizes genotoxic colibactin in the gut. Nat Microbiol. 11 (1), 53-66 (2026).
  28. Tronnet, S., et al. The Genotoxin colibactin shapes gut microbiota in mice. mSphere. 5 (4), (2020).
  29. Condamine, B., et al. Strain phylogroup and environmental constraints shape Escherichia coli dynamics and diversity over a 20-year human gut time series. ISME J. 19 (1), (2024).
  30. Cougnoux, A., et al. Bacterial genotoxin colibactin promotes colon tumour growth by inducing a senescence-associated secretory phenotype. Gut. 63 (12), 1932(2014).
  31. Oliero, M., et al. Prevalence of pks + bacteria and enterotoxigenic Bacteroides fragilis in patients with colorectal cancer. Gut Pathog. 14 (1), 51(2022).
  32. Chen, J., et al. A commensal-encoded genotoxin drives restriction of Vibrio cholerae colonization and host gut microbiome remodeling. PNAS. 119 (11), e2121180119(2022).

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Теги

Enterobacteriaceae
Колонизация мышиным pks+ Escherichia coli при невоспалительных условиях
Связаться с нами
Порекомендовать библиотеке

Конфиденциальность

Условия использования

Политики

© 2026 MyJoVE Corporation. Все права защищены.