Терапевтическое открытие в вирусно-инфицированных мозговых органоидах
Противовирусный скрининг
Существует отсутствие одобренных методов лечения многих нейротропных вирусных инфекций, что ограничивает возможности лечения, выходящие за рамки поддерживающей помощи. Органоиды мозга являются ценным инструментом для открытия новых противовирусных соединений, позволяя проводить скрининг лекарств в физиологически значимой 3D-среде, напоминающей ткани человеческого мозга. В одном из первоначальных исследований был проведён химический скрининг с высоким содержанием 1120 одобренных FDA препаратов и кандидатов на препараты против ZIKV в мозговых органоидах, похожих на плоды. Противовирусная активность оценивалась на основе пролиферации клеток и подавления инфекции ZIKV. Из всех протестированных соединений девять показали потенциал, при этом два соединения — гидробромид гиппеастрина (HH) и дигидрохлорид амодиахина (AQ) — выделялись благодаря своим сильным противовирусным эффектам, значительно снижая инфекцию, подавляя выработку вируснойРНК 17.
Несколько последующих исследований изучали соединения, воздействующие на различные стадии жизненного цикла вируса. В исследовании Ватанабэ и др. 25-гидроксихолестерин (25HC), соединение, блокирующее проникновение вируса, ингибируя слияние мембран, снизило уровень мРНК ZIKV в корковых органоидах на ~74% и снизило уровень ZIKV-положительных клеток на ~72%. Кроме того, в том же исследовании оценивались противовирусные соединения, нацеленные на рецептор AXL, экспрессируемые на нейронных прогениторных клетках. Маломолекулярный ингибитор домена тирозинкиназы AXL, R428, вызвал умеренное снижение уровня мРНК ZIKV (~41%). Однако лечение антителом к AXL не привело к значительному снижению уровня мРНКZIKV 18. Наконец, три противофлавивирусных препарата — дурамицин, ивермектин и азитромицин — были протестированы в органоидах. Дурамицин и ивермектин значительно снижали уровень мРНК ZIKV, тогда как азитромицин не проявил защитного эффекта против ZIKV, что было определено с помощью RT-qPCR ииммунокрашивки 18.
В отдельном исследовании Сюй и соавторы провели скрининг 173 соединений в качестве супрессоров активности каспазы-3, индуцируемой ZIKV, и определили эмрикасан как наиболее эффективный нейропротекторный кандидат без влияния на пролиферацию клеток в мозговых органоидах. Два дополнительных соединения, никосамид и PHA-690509, продемонстрировали значительную анти-ZIKV активность, ингибируя репликацию вируса на стадии после входа в процесс в зависимости от дозы. Кроме того, совместное лечение с эмрикасаном и PHA-690509 вызвало аддитивный эффект и сохранило жизнеспособность астроцитов после заражения ZIKV19. В другом исследовании эноксацин, усилитель РНК-интерференции (РНКи), продемонстрировал прямую противовирусную активность в клетках, способных к РНК-компетентности, и полностью предотвратил микроцефалические фенотипы, вызванные ZIKV, в мозговых органоидах, что свидетельствует о том, что усиление внутренних противовирусных путей в нейронных прогениторных клетках может представлять собой жизнеспособную терапевтическуюстратегию 20.
Петтке и др. впоследствии провели скрининг 110 структурных аналогов TH3289 в нескольких дозах в органоидах, инфицированныхZIKV 21. Два соединения, TH3289 и TH6744, показали самую сильную противовирусную активность, а самые активные — имели общий ядро бензимидазолона. Это исследование было значимым, поскольку органоидная система позволила не только быстро проводить скрининг соединений, но и механистическое наблюдение. Например, было обнаружено, что TH6744 влияет на поздние стадии жизненногоцикла ZIKV 21.
Органоиды мозга также использовались для выявления терапевтических кандидатов на заражение SARS-CoV-2. Одобренный FDA препарат против гепатита C, софосбувир, улучшил выживаемость нейронов и спас нарушенный синаптогенез у мозгов, инфицированных SARS-CoV-2, 22. Органоиды мозга также способствовали пониманию инфекции ЦНС, опосредованной HSV-1; однако скрининг на противовирусные препараты на HSV-1 в органоидных моделях остаётся ограниченным по сравнению с исследованиями ZIKV и SARS-CoV-2. Знаковое исследование с использованием нейронов, полученных из iPSC, показало, что дефицит TLR3 делает нейроны человека восприимчивыми к инфекции HSV-1, выявив специфическое для человека явление, которое модели грызунов не смоглизафиксировать 23. В последнее время Беллицзи и соавторы продемонстрировали, что кластерные регулярно перемежуточные короткие палиндромные повторы (CRISPR)-Cas9, направленные на геномные последовательности HSV-1, подавляют как первичную инфекцию, так и вирусную реактивацию в 3D-органоидных культурах, что делает редактирование генов возможной противовирусной стратегией при инфекции ЦНСгерпесвируса 24. Учитывая, что резистентность к ацикловиру является новой клинической проблемой и лечебной терапии энцефалитаHSV 25 не существует, отсутствие масштабного скрининга противовирусных соединений на HSV-1 в мозговых органоидах представляет собой значительный пробел в знаниях.
Помимо малых молекул, антисенсовые олигонуклеотиды (ASO), которые нацелены на РНК и модифицируют экспрессию генов, являются новыми терапевтическими инструментами для лечения различных заболеваний, а церебральные органоиды могут использоваться для оценки новых терапийASO 26. Учитывая полезность органоидов для исследований ASO, важные характеристики, такие как биораспределение, токсичность и терапевтическая эффективность, могут быть изучены у вирусно-инфицированных мозговых органоидов.
Одно из важнейших применений органоидов мозга — оценка нейротоксичности существующих противовирусных препаратов. Это особенно важно, поскольку широко используемые методы лечения ВИЧ доказали свою токсичность для клеток мозга как in vitro , так и in vivo27. Акай и др. продемонстрировали нейротоксичность противовирусных препаратов в первичных кортикальных культурах, содержащих микроглию, астроциты и нейроны. MAP2-положительные нейроны показали дозозависимое снижение после воздействия ритонавира и сакинавира. Лечение комбинированными антиретровирусными препаратами (cART) приводило к острой нейротоксичности, а культуры, обработанные зидовудином (AZT), демонстрировали повышенную выработку реактивных кислородных форм (ROS)28. Хотя эти результаты были получены с использованием двумерных культур, мозговые органоиды могут расширить эти исследования, предоставляя более физиологически значимую платформу для высокопроизводительного нейротоксичного скрининга индивидуальных или комбинированных антиретровирусных терапий. Для изучения механизмов, лежащих в основе антивирусно-индуцированной нейротоксичности в этих 3D-моделях, можно использовать такие методы, как морфологический анализ, функциональные анализы и транскриптомическое профилирование29.
Помимо скрининга нейротоксичности, были разработаны мозговые органоиды для изучения нейрокогнитивного расстройства, ассоциированного с ВИЧ (HAND), которое продолжает затрагивать 30–50% людей, живущих с ВИЧ, несмотря на эффективную антиретровирусную терапию (АРТ). Микроглиальные клетки являются основным резервуаром ВИЧ-1 в ЦНС, и органоидные модели сыграли ключевую роль в выяснении, как микроглиальная инфекция способствует повреждению нейронов. Конг и др. использовали церебральные органоиды, полученные из iPSC, содержащие микроглию, и наблюдали заметное увеличение экспрессии генов CCL2 и CXCL10 хемокина, а также активацию нескольких генов, стимулируемых интерфероном типа I (MX1, ISG15, ISG20, IFI27, IFITM3 и других) после заражения ВИЧ-130. Профиль экспрессии воспалительных генов распространялся на клетки наблюдателей, включая неинфицированные нейроны. Эти нейроны демонстрировали заметное снижение экспрессии транспортеров нейромедиаторов вместе с увеличением экспрессии генов, связанных с клеточным старением и гибелью клеток. Использование мозговых органоидов для исследований ВИЧ было впервые разработано Досом Рейсом и др., которые включили микроглию ВИЧ-инфицированной в человеческие мозговыеорганоиды 31. Эта модель воспроизводила низкоуровневую вирусную репликацию, обычно наблюдаемую в человеческом мозге. Включение микроглии, инфицированной ВИЧ, вызвало нейровоспалительный ответ, связанный с астроглиозом, нейродегенеративной патологией, а также дегенерацией и потерей нейронных синаптических процессов. Донадони и др . впоследствии использовали мозговые органоиды, полученные из индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток (hiPSC), содержащие микроглию и астроциты, для моделирования нейроВИЧ и оценки эффекта комбинированной антиретровирусной терапии (cART) в трёхмерной органоиднойсистеме 32. В совокупности эти исследования, основанные на органоидах, дают важные механистические знания о HAND и создают ценную модельную систему для изучения нейропротективных терапий.
В заключение, органоиды мозга представляют собой единую модельную систему для скрининга противовирусных соединений, одновременно оценивая нейротоксичные эффекты на ранних этапах разработки препарата. Идентификация эффективных противовирусных соединений — лишь первый шаг к клиническому переводу (Таблица 1). Не менее важна разработка стратегий доставки лекарств, способных доставлять терапевтические агенты в инфицированные клетки центральной нервной системы.
| Вирус | Органоидная модель | Типы ячеек | Ключевые выводы | Ограничения | Ссылка |
| ZIKV | Органоиды, похожие на плоды, полученные из hPSC | Нейронные прогениторы, нейроны | HH и AQ снизили вирусную РНК на основе скрининга 1120 соединений | Иммунных клеток нет; Фетальная стадия | 17 |
| Кортикальные органоиды | Нейронные предки | 25HC снизил инфекцию на ~74%; R428 снизил уровень мРНК ZIKV на ~41% | Сосудистых систем отсутствует | 18 |
| Органоиды мозга | Нейроны, астроциты | Эмрикасанский нейропротективный; никосамид и PHA-690509 подавляют репликацию | Без микроглии | 19 |
| Органоиды мозга | Нейронные предки | Эноксацин предотвращал микроцефалию, вызванную ZIKV, с помощью РНК | Иммунных клеток нет | 20 |
| Органоиды мозга | Нейроны | TH3289 и TH6744 (сердечник бензимидазолона) влияют на поздний жизненный цикл ZIKV | Иммунных клеток нет | 21 |
| SARS-CoV-2 | Церебральные органоиды | Нейроны | Софосбувир спас синаптогенез и выживание нейронов | Нет BBB | 22 |
| HSV-1 | Нейроны, полученные от iPSC, | Нейроны | Дефицит TLR3 делает человеческие нейроны восприимчивыми; Явление, специфичное для человека | Только двумерные нейроны | 23* |
| 3D-органоидные культуры | Нейроны | CRISPR-Cas9 подавлял первичную инфекцию и реактивацию | Ограниченное созревание | 24 |
| ВИЧ-1 | iPSC церебральные органоиды | Нейроны, микроглия | Повышение CCL2, CXCL10; активация гена интерферона типа I; Старение нейронов | Сосудистых систем отсутствует | 30 |
| Органоиды человеческого мозга с микроглией | Нейроны, микроглия | Нейровоспаление, астроглиоз, синаптическая дегенерация | Сосудистых систем отсутствует | 31 |
| hiPSC церебральные органоиды | Нейроны, микроглия, астроциты | Эффекты cART оценены в 3D-модели NeuroHIV | Модель на ранней стадии | 32 |
Таблица 1: Модели мозговых органоидов, используемые для изучения нейротропных вирусных инфекций. В этой таблице представлены изученные вирусы, органоидная модель, включенные типы клеток, ключевые выводы, ограничения и референс для репрезентативных исследований на основе органоидов мозга по инфекциям ZIKV, SARS-CoV-2, HSV-1 и ВИЧ-1.
Платформы доставки лекарств
Поиск наиболее эффективных противовирусных соединений для лечения инфекций ЦНС крайне важен, но без эффективной доставки в мозг эти соединения могут не принести терапевтической пользы. Органоиды мозга могут использоваться для оценки систем доставки лекарств на их способность проникать в нейронные ткани и доставлять противовирусные нагрузки.
Липидные наночастицы (LNP) широко используются как носители лекарств. Показано, что эти носители препаратов повышают биодоступность препаратов и обеспечивают таргетную доставку препаратов в место болезни, особенно по всемуBBB 33. Формулы на основе ЛНК на основе ЛНК успешно использовались при вакцинации противCOVID-19 34,35. Органоиды мозга могут использоваться для оценки эффективности и безопасности новых формул на основе LNP. LNP также могут быть векторизированы в ЦНС путём модификации поверхности с помощью целевых лигандов. Например, трансферрин или лактоферрин были конъюгированы с LNP для облегчения рецептор-опосредованного трансцитозирования и усиления транспорта черезBBB 36,37. В совокупности потенциальная эффективность доставки лекарств, нейротоксичность и изменения стабильности наноформулы после проникновения BBB можно исследовать у мозговыхорганоидов 38.
Помимо ЛНП, наноносители полипептидов с двойным целем также изучались как система доставки лекарств в органоидах мозга человека. Таргетированные поли(L-глутаминовая кислота) наночастицы (NP) показали отличную цитосовместимость и способность проникать в органоиды, похожие на средний мозг. Было показано, что аланин и глутатион могут эффективно направлять NPs к эндотелиумным клеткам мозга и проникать в церебральные органоиды, что приводит к доставке лекарств вмозг 39. Проницаемость полимерных наночастиц изучалась в 3D-микроваскулаторных органоидах человека, с акцентом на влияние их размера и поверхностной химии. Созданные органоиды состояли из эндотелиальных клеток, полученных на основе iPSC, астроцитов и первичных перицитов мозга. Конфокальные изображения показали, что конъюгация NP с лигандом голотрансферрином, ассоциированным с мозгом, значительно увеличивала ихпроницаемость 40.
Далее исследовались поглощение, проникновение и распределение золотых наночастиц (AuNP) в сфероидах мозга BBB. Эти сфероиды состоят из шести типов клеток мозга: нейронов, астроцитов, перицитов, эндотелиальных клеток, микроглии и олигодендроцитов. Авторы сообщили, что временная гипоксия приводила к раскрытию BBB и увеличению транспортировки AuNPs в сфероидную глубину. Наночастицы могли легко проникать в клетки иядра 41. В аналогичном исследовании с использованием той же системы сфероидной модели одновременное отслеживание кинетики проникновения наноносителей и их терапевтического освобождения полезной нагрузки оценивалось с помощью конфокальной лазерной сканирующеймикроскопии 42. В другом исследовании Парк и соавторы показали, что нейротрофический фактор (BDNF), конъюгированные с нейротрофическим фактором мозга (BDNF), успешно проникают в церебральные органоиды без значительной токсичности43.
Помимо воздействия на частицы, форма и размер наночастиц могут играть значительную роль в способности наноформулы доставлять терапевтическую нагрузку в мозг. Полистироловые сферы диаметром 200 нм, векторизированные антителами против VCAM-1, накапливались в 1,2–1,5 раза больше, чем контрольные невекторизированные NP. Интересно, что палкообразные частицы демонстрировали ещё большее накопление в 2,1–2,5 раза по сравнению с соответствующими контролями, что говорит о том, что палочкообразные частицы дают преимущество сферам в плане клеточного связывания. Церебральные органоиды могут дать подробные представления о том, как геометрия частиц может влиять на проникновение в мозг. Кроме того, влияние гипоксии и других биологически активных соединений на проницаемость BBB может быть дополнительно изучено у нейроваскулярных органоидовмозга 45,46.
Внеклеточные везикулы (EV), полученные из стволовых клеток, представляют собой биологическую альтернативу носителям синтетических лекарств, таким как LNP. Бранском и др. исследовали репаративный потенциал EV против инфекции ВИЧ-1 в человеческихнейросферах 47. В этом исследовании было показано, что электромобили, полученные из мезенхимальных стволовых клеток (MSC) и iPSC, могут естественным образом проникать в нейросферы, повышать жизнеспособность клеток и снижать экспрессию воспалительных цитокинов в нейросферах, инфицированных ВИЧ-1, что подчёркивает нейропротекторные и противовоспалительные свойства EVстволовых клеток 47. В другом исследовании Кима и др. малые внеклеточные везикулы (sEV) были модифицированы для противовирусной доставки с целью лечения инфекции SARS-CoV-248. Наноносители были загружены растворимым ACE2 (sACE2 ) посредством генетической модификации донорских клеток с помощью плазмиды, кодирующей eGFP-CD9ΔTM4-sACE2(WT), что привело к экспрессии sACE2 на поверхности sEV. Было показано, что sACE2-векторизированные sEVs защищают от WT и мутантного S-белкавируса 48. Механизм защиты может быть протестирован на мозговых органоидах, инфицированных SARS-CoV-2. Кроме того, другое исследование показало, что электромобили, выделяемые из клеток, инфицированных HSV-1, несут врождённые иммунные компоненты, такие как STING, которые могут активировать врождённые иммунные ответы в клетках-реципиентах, что приводит к мощному ингибированию репликации HSV-1. Критическое отделение EV от инфекционных вирусных частиц было достигнуто с помощью центрифугации по градиентуплотности 49.
Церебральные органоиды также могут использоваться для проверки потенциальной нейротоксичности новых наноформулировок лекарств. Например, при введении пегилированных AuNP в органоиды мозга наблюдалось значительное воспаление, опосредованное выработкой ROS. В отличие от этого, полимерные полимолочные кислотные NP демонстрировали эффективную доставку препаратов и низкую цитотоксичность благодаря медленному усваиванию и разлагаемости, что позволяло проникать в органоид мозга без вызова иммунногоответа 50. Нейротоксичность AuNP, графена и углерода также оценивалась в 3D-нейроваскулярных органоидах. Эти органоиды состояли из нейронных клеток, микроглии и поверхности эндотелиальной клетки. Эти исследования показали, что микроглия может играть ключевую роль в проницаемости и токсичности этих формул51. Кроме того, высокие концентрации NP ZnO также вызывают значительную гибель нейронов. Механизм токсичности был связан с внутриклеточным накоплением ионов цинка, что снижало уровень белка LC3B, указывая на дефектнуюаутофагию 52. В целом эти исследования показывают, что 3D-органоиды мозга могут фиксировать, как наноформулы взаимодействуют с нейронной тканью — от поглощения и проникновения до активации иммунной системы и токсичности. Успех стратегий доставки препаратов, направленных на ЦНС, в конечном итоге зависит не только от достижения целевых клеток, но и от модуляции воспалительных путей, активируемых во время инфекции, многие из которых инициируются сигналами DAMPs и PAMPs.
DAMPs и PAMPs при вирусных инфекциях
Органоиды мозга могут использоваться для изучения DAMPs и PAMPs, которые выделяются напряжёнными, повреждёнными или умирающими клетками ЦНС. DAMP включают белки теплового шока, АТФ и мочевой кислоту, тогда как PAMP — бактериальные, вирусные, грибковые и паразитические макромолекулы. Таким образом, эти молекулярные паттерны предупреждают врождённую иммунную систему и активируют несколько путей передачи сигналов в ответ на чужеродные антигены или любые признаки, часто связанные с инфекцией. Механизмы, лежащие в основе их защитного эффекта в ответ на вирусные инфекции, до конца не изучены, и детальные исследования этих процессов могут проводиться на мозговыхорганоидах 53. Освобождённые DAMPs и PAMPs связываются с большой группой рецепторов, включая рецепторы, похожие на Toll (TLR), рецепторы, похожие на NOD (NLR), рецепторы, похожие на AIM2, RIG-I-подобные рецепторы (RLR) и рецепторы лектина C-типа (CLR), которые экспрессируются на плазматической мембране иливнутриклеточно. Эти рецепторы играют ключевую роль в производстве цитокинов и интерферона в ответ на нейротропные вирусные инфекции, включая EV-71, ВИЧ-1, HSV-1, флавивирусы, вирус Западного Нила (WNV) идругие 54.
Словиковски и др. исследовали, как DAMP, хемокины и молекулы адгезии, выделяемые повреждёнными нейронными клетками, координируют проникновение лейкоцитов в ЦНС во время энцефалита флавивируса55. В частности, было выявлено, что WNV увеличивает экспрессию высоковоспалительных некроптозов и маркеров смерти клеток пироптоза, способствующих выделению DAMPs в инфицированном мозге. Когда такие молекулы, например, белок группы с высокой подвижностью box 1 (HMGB1), высвобождаются, они индуцируют несколько сигнальных путей, что приводит к CXCR4-зависимой миграции активированных моноцитов, макрофагов и дендритных клеток в инфицированныеткани 56,57. Кроме того, было показано, что DAMPs могут выделяться в ответ на инфекцию, за которыми следуют повышенная регуляция TLR и усугубляются воспаления ЦНС и повреждениятканей 58. В целом эти исследования показывают, что вирусные инфекции, по-видимому, запускают перекрывающиеся сигнальные пути DAMP-PAMP, что приводит к нейровоспалению и повреждению тканей. В совокупности мозгорганоиды, содержащие микроглию и астроциты, могут служить моделью для отслеживания иммунных каскадных ответов в человеческой нейронной ткани, особенно взаимодействия между высвобождением DAMP и нейровоспалением, опосредованным TLR.
Система комплемента является важным элементом врождённого иммунитета, который быстро реагирует на инфекции. Однако многие вирусы разработали механизмы для преодоления этойзащитной системы 59. Некоторые вирусы обходят систему комплемента, производя белки, которые связываются с компонентами комплемента и либо ингибируют, либо секвестрируют их. Это было продемонстрировано у различных вирусов, включая человеческий T-лимфотропный вирус-1 (HTLV-1), человеческий цитомегаловирус (HCMV), ВИЧ-1, обезьяний вирус 5 (SV5) и вирус паротита (MuV), которые включают в свои вирионы белки комплемента хозяина (то есть CD55/DAF, CD59, CD64 и MCP). Эти белки подавляют врождённый иммунный ответ, способствуя репликации вируса иустойчивости 60. Таким образом, мозговые органоиды могут использоваться для выявления специфических механизмов, с помощью которых вирусы избегают комплементарной системы. Растущие данные свидетельствуют о том, что DAMPs и PAMPs не только формируют начальный противовирусный ответ, но и выступают ключевыми посредниками стойкого воспаления, лежащего в основе хронических поствирусных состояний.
Роль DAMPs/PAMPs в устойчивом воспалении, вызванном вирусной инфекцией
Помимо острой воспалительной фазы, вирусные инфекции могут вызывать хроническое воздействие DAMP/PAMPs, что приводит к долгосрочным воспалительным последствиям, особенно в мозге. Церебральные органоиды могут стать мощным инструментом для изучения основных механизмов синдромов, связанных с постострой фазой инфекции.
Большинство известных на тот момент неперсистентных вирусов у человека активируют иммунные ответы в острой фазе инфекции, за которой следует ликвидация патогена. Однако в некоторых случаях у пациентов наблюдаются стойкие симптомы, которые могут отличаться от тех, что наблюдались в острой фазе, и сохраняться месяцами или даже годами. В частности, пациенты с длительным COVID-19 сообщают о хронической усталости, «мозговом тумане», лихорадке, боли и других неврологическихосложнениях 61. Кроме того, хроническое воспаление может увеличивать смертность и заболеваемость, а также риск атеротромбоза, рака и когнитивныхнарушений 62,63.
Кроме того, устойчивость вирусных белков и РНК может приводить к повышению уровня провоспалительных цитокинов, таких как TNF-α, IL-1α, IL-1β, IFN-γ и IL-6, что приводит к повреждению тканей, преждевременному старению и истощению иммунной системы64. Медленное размножение или следы вирусных компонентов могут вызвать высвобождение DAMP/PAMPs, взаимодействующих с их специфическими рецепторами, вызывая устойчивое низкоуровневоевоспаление 65. В некоторых случаях инфекция мозга HSV-1 может привести к повреждению нейронов, за которым следует энцефалит и в конечном итоге способствовать развитию нейродегенеративных заболеваний, таких как болезньАльцгеймера 66. Нарушения механизмов аутофагии могут быть основным триггером хронического воспаления у пациентов с HSV-2, при котором дефектные защитные механизмы приводят к устойчивой репликации вируса, постоянному наличию вирусных компонентов в мозге инейродегенерации 67. Эти вирусные компоненты активируют врождённые иммунные сенсоры с помощью PAMP и могут управлять сигнальными путями, чтобы обходить противовирусные эффекты врождённой иммунной активации. Важно отметить, что HCMV и вирус Эпштейна-Барра (EBV) выявляют хронические вирусные инфекции, способствующие иммунной дисфункции68,69. Длительное старение, вызванное инфекцией, также может способствовать долгосрочному воспалению, связанному с различными вирусными инфекциями. 3D-органоиды мозга с интегрированными иммунными компонентами предоставляют релевантные платформы для понимания сложных механизмов, лежащих в основе хронического воздействия DAMP/PAMPs, и их роли в долгосрочных осложнениях вирусных инфекций в ЦНС.
Ограничения и перспектива:
Несмотря на преимущества по сравнению с традиционными моделями in vitro, мозговые органоиды имеют значительные ограничения, которые необходимо учитывать для поддержки их широкого применения. В частности, у большинства органоидов отсутствуют резидентные иммунные клетки, которые являются ключевыми факторами моделирования вирусных заболеваний и понимания врождённых и адаптивных иммунных ответов во время вируснойинфекции 70. В частности, стандартные органоидные протоколы не включают микроглию — первичные иммунные клетки ЦНС и резервуар ВИЧ-1, что ограничивает моделирование нейровоспаления и вируснуюперсистентность 71. Ещё одним недостатком является неполная сложность тканей, включая отсутствие сосудистых систем, которые играют важную роль в доставке питательных веществ и кислорода, а также в распространениивирусов 72. Таким образом, рост органоидов ограничен, поскольку клетки в центре не могут получать достаточное количество питательных веществ. Кроме того, нарушается выделение метаболических отходов, что часто приводит к гипоксическому или некротическому ядру в крупных органоидах. Кроме того, органоиды не полностью воспроизводят взаимодействия между нейронами, эндотелиальными клетками и стромальными клетками, которые могут влиять на вирусную инфекцию и патогенез. Кроме того, на данном этапе развития органоиды не могут воспроизвести системные инфекции, межорганное распространение и иммунные ответы всегоорганизма 73. Ещё одним ограничением является то, что многие эпителиальные органоиды имеют ограниченную доступность для вирусной инокуляции из-за их апикальной поверхности, обращённойвнутрь. 74. В результате вирусная прививка требует микроинъекций, что приводит к вариабельности и низкой пропускной способности. Таким образом, инокуляция органоидов с разным диаметром затрудняет контроль множественности инфекций. Кроме того, многие органоиды больше напоминают ткань плода, чем взрослые органы, что может влиять на вирусный тропизм, кинетику репликации и реакциихозяина 73. Это особенно заметно в случае HSV-1, поскольку созревание нейронов влияет на процессы установления латентности и реактивации, которые органоиды стадии плода могут не полностью воспроизвести23. Далее, органоиды могут значительно различаться по составу и функции, что приводит к разным результатам, низкой воспроизводимости и необходимости множества экспериментальных репликатов. Например, органоиды могут различаться по размеру, составу клеток, архитектуре и стадии созревания. Это делает стандартизацию сложной, если не невозможной, во всехлабораториях 7,75. Наконец, высокая стоимость и ограниченная масштабируемость генерации и обслуживания органоидов остаются серьёзными препятствиями. В результате одной из главных задач является разработка высокопроизводительных платформ, совместимых с органоиднойтехнологией 74.
Несмотря на эти недостатки и ограничения, органоиды обладают значительным потенциалом для моделирования вирусных инфекций, токсикологии и открытия лекарств. Преодоление этих ограничений может значительно снизить зависимость от животных моделей и облегчить фундаментальные механистическиеисследования 76. Одним из заметных недостатков существующих моделей органоидов является их ограниченная физиологическая сложность и отсутствие разнообразного клеточного состава. Будущие разработки должны сосредоточиться на включении иммунных, нейронных, сосудистых и стромальных компонентов в органоидные модели. Это можно достичь с помощью моделей совместной культуры, интегрирующих органоиды с вышеупомянутыми типамиклеток 77,78. В частности, включение иммунных клеток позволит моделировать системные иммунные реакции и воспаление во время вирусных инфекций. Кроме того, васкуляризированные органоиды могут быть дополнительно развиты для улучшения физиологической сложности и лучшего воспроизведения в условиях in vivo 79,80. Таким образом, церебральные органоиды, включающие эндотелиальные ткани, будут способствовать исследованиям функции гематоэнцефалического барьера и доставки лекарств во время вирусныхинфекций 13,81. Кроме того, 3D-органоиды мозга могут воспроизводить несколько ключевых аспектов вирусной инфекции в мозге. Фактически, несколько органоидных моделей с сложной структурой, которые тесно представляют разные области мозга, в настоящее времяисследуются 82. Наконец, включение нейронных и стромальных компонентов ещё больше повысит верность органоидов к нативным органным системам. Воспроизводимость остаётся ещё одним серьёзным препятствием для широкого применения органоидных технологий. Поэтому создание надёжных, высоковоспроизводимых органоидов крайне важно для дальнейшей трансляции применений органоидов. Различные методы выделения клеток и посева, а также выбора матриц и растворимых факторов должны быть стандартизированы по всей области83. Стоит отметить, что состав культурной среды, плотность клеток и время посевывания могут влиять на результаты этих моделей. Поэтому были введены стратегии снижения изменчивости матрицы, включая синтетические гидрогели, состоящие из полностью определённых полимерных сетей с точно контролируемыми химическими и механическими характеристиками, как перспективнаяальтернатива 84. Эти органоиды демонстрируют минимальную вариабельность от партии к партии, что позволяет проводить контролируемые исследования. Кроме того, создание органоидных биобанков, представляющих разнообразные популяции пациентов, стало бы ценным ресурсом для поиска лекарств и идентификации биомаркеров. Новые технологии искусственного интеллекта (ИИ) становятся важными инструментами в исследованияхорганоидов 85. Дальнейшее применение этих технологий может ускорить анализ и снизить предвзятость интерпретации данных. Тем не менее, применения ИИ в этой области остаются на ранней стадии. Внедрение подходов ИИ в разработку органоидов, таких как анализ изображений с помощьюИИ 86 или прогнозная оптимизация условийкультуры 87, значительно облегчит исследования органоидов.